Research Article
BibTex RIS Cite

Bir Üniversite Hastanesine Gönderilen İdrar Kültürlerinde Üreyen İzolatların Dağılımı ve Antimikrobiyal Duyarlılık Profilinin İncelenmesi

Year 2020, Volume: 10 Issue: 4, 677 - 683, 15.12.2020
https://doi.org/10.31832/smj.802643

Abstract

Amaç: Bu çalışmada Sütçü İmam Üniversitesi Tıp Fakültesi’nde idrar örneklerinden izole edilen bakteriler ve bu bakterilerin antibiyotik direnç durumlarını belirlemeyi amaçladık.
Gereç ve Yöntemler: Ocak 2018-Ocak 2019 tarihleri arasında Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarına gönderilen 2447 orta akım idrar örneği çalışmaya alındı. Üreyen bakterilerin tanımlanması ve antibiyotik duyarlılık testleri konvansiyonel ve otomatize sistemlerle (Phoenix BD, USA) çalışıldı. Antibiyogram verileri EUCAST (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing) önerileri doğrultusunda değerlendirildi.
Bulgular: En sık izole edilen bakteriler E. coli 1323 (%54,10), Klebsiella spp. 427 (%17,40), E. faecalis 164 (%6,70), E. faecium 117 (%4,80), Pseudomonas spp. 92 (%3,80), S. agalactiae 82 (%3,30), Enterobacter spp. 64 (%2,60), A. baumannii 48 (%2), Proteus spp. 47 (%1,90), S. aureus 29 (%1,20), B. cephacia 24 (%1), Citrobacter spp. 12 (%0,50), M. morganii 11 (%0,40), S. marcescens 7 (%0,30) idi. E. coli için en düşük direnç amikasin (%0.60), Klebsiella spp. için en düşük direnç imipeneme (%9) karşı bulundu. P. aeruginosa, Enterobacter spp. ve A. baumanii izolatlarında kolistin direnci sırasıyla; %5,10 , %1,50 ve %2,10 idi. E. faecalis ve E. faecium için direnç oranları sırasıyla; vankomisin %1,80 ve % 16,70; teikoplanin %1,80 ve % 19,10; linezolid %1,20 ve %2,60 olarak saptandı. S. aureus’ta oksasilin direnci %51,90 olarak saptandı. S.agalactiae’de penisilin direnci saptanmadı.
Sonuç: İdrar yolu enfeksiyon etkenlerinin antibiyotik direnç oranları merkezlere göre değişiklik göstermektedir. Bu yüzden her merkez kendi bölgesindeki enfeksiyon etkeni izolatların dağılımını ve antibiyotik direnç profilini belirlemeli ve tedavi protokollerini bu sonuçlara göre düzenlemelidir.

References

  • 1. Kandemir Ö, Uğuz M, Taşdelen B. Hastane kökenli üropatojen Escherichia Coli suşlarının ampirik tedavisinde sık kullanılan antibiyotiklere yıllar içinde gelişen direnç oranlarındaki değişim. FLORA 2009;14(4):170-174.
  • 2. Tekin A, Deveci Ö, Dal T, Tekin R, Özekinci T, Dayan S. Ayaktan ve yatan hastalarda izole edilen mikroorganizmaların antibiyotiklerin in vitro etkinliği, ANKEM Derg 2012;26(2):61-8. http://dx.doi.org/10.5222/ankem.2012.061
  • 3. Alpay Y, Yavuz MT, Aslan T, Büyükzengin B. Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz Pozitif Escherichia Coli ile oluşan komplike olmayan üriner sistem infeksiyonlarının tedavisinde oral antibiyotikler Karbapenemlere alternatif olabilir mi? ANKEM Derg 2017;31(3):85-91.
  • 4. Duran H, Çeken N, Kula Atik T. İdrar kültüründen izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının antibiyotik direnç oranları: Dört yıllık analiz. ANKEM Derg. 2020;34(2):41-7. 5. Russell DB. Roth NJ. Urinary tract infections in men in a primary care population. Aust Fam Physicians 2001; 30:177-9. PMid:11280121
  • 6. Sobel JD, Kaye D. Urinary tract infections. In: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R eds. Principles and Practice of Infectious Diseases. New York: Churcill Livingstone, 2000:773.
  • 7. Kolaylı F. Üriner sistem enfeksiyonlarında etken patogenez ve mikrobiyolojik tanı. Turkiye Klinikleri J Urology-Special Topics. 2010;3(3):8-18.
  • 8. Guidelines on urological infections. European Association of Urology 2014. İnternet adresi: http://www.uroweb.org/gls/pdf/19%20Urological%20infections_LR.pdf. Erişim tarihi: 29.05.2014
  • 9. Akata F. Üriner sistem infeksiyonlarında uygun antibiyotik kullanımı. Klinik Dergisi 2001; 14: 114-123
  • 10. Gupta K, Hooton TM, Naber KG, Wullt B, Colgan R, Miller LG, et al. International clinical practice guidelines for the treatment of acute uncomplicated cystitis and pyelonephritis in women: A 2010 update by the Infectious Diseases Society of America and the European Society for Microbiology and Infectious Diseases. Clin Infect Dis 2011; 52(5): 103-20.
  • 11. Duman Y, Bozkurt İ, Tekerekoğlu MS. Investigation of Antibiotic Resistance and ESBLPresence of Community-Acquired Escherichia coli Strains, Isolated from UTI in Afşin State Hospital. Med Sci, 2014; 3(3): 1408-18.
  • 12. Saraçoğlu KT, Fidan V, Pekel Ö, Saraçoğlu A, Kalkandelen S, Arpalı E. İdrar kültürlerinde izole edilen bakterilerin antibiyotik duyarlılıkları. J Clin Exp Invest 2013; 4(3): 356-359.
  • 13. Zengin K, Tanık S, Albayrak S, Kaba M, Pirinççi N. Van Bölgesi’ndeki üriner sistem enfeksiyon etkenleri ve antibiyotik duyarlılıkları. Bozok Tıp Derg 2014; 4(1); 1-5.
  • 14. Sağlam H.S, Öğütlü A, Demiray V, Karabay O. Üriner enfeksiyonlarda toplum kökenli Escherichia coli’nin yeri ve gelişen antibiyotik direnci. Nobel Medicus 2012; 8(1): 67-8.
  • 15. Aktaş SÇ, Gençer S, Batırel A, Hacıseyitoğlu D, Özer S. CLSI ve EUCAST Önerilerine Göre Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz Üreten Escherichia coli İdrar İzolatlarında Fosfomisin Duyarlılığı. Mikrobiyol Bul 2014; 48(4): 545-55.
  • 16. Aykan ŞB, Çiftci İH. Türkiye’de idrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli suşlarinin antibiyotiklere direnç durumu: bir meta-analiz. Mikrobiyol Bul 2013; 47(4): 603-8.
  • 17. Aytaç Ö, Mumcuoğlu İ, Çetin F, Aksoy A, Aksu N. Erişkin hastalarda toplum kaynaklı üriner sistem enfeksiyonlarından izole edilen Escherichia coli suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının yıllara göre değişimi (2010-2014). Turk Hij Den Biyol Derg 2015; 72(4): 273-80.
  • 18. Dağlar D, Demirbakan H, Yıldırım Ç, Öztüek F, Özcan A, Sipen N et al. İdrar örneklerinden izole edilen bakteriler ve antibiyotiklere duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2005(3);35:189-94.
  • 19. Yılmaz E, Özakın C, Sınırtaş M, Gedikoğlu S. Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi Bakteriyoloji Laboratuvarı'nda 1999-2002 yılları arasında idrar örneklerinden izole edilen mikro organizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları. İnfeksiyon Dergisi 2005;19(1):91-6.
  • 20. Ece Terek G, Tunçel Başoğlu M. Bir üniversite hastanesine gönderilen idrar kültürlerinde üreyen izolatların dağılımı ve antimikrobiyal duyarlılık profilinin incelenmesi. Ege Tıp Dergisi / Ege Journal of Medicine 2013;52(3):136-140
  • 21. Demirtürk N, Demirdal T, EldemirT, İnce R, Altındiş M. İdrar örneklerinden izole edilen bakterilerin antibiyotiklere duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2005;35(2):275-8
  • 22. Dündar D, Willke A, Sönmez T.G. İdrar yolu infeksiyonu etkenleri ve antibiyotik duyarlılıkları. Klimik Derg 2008; 21: 7-11
  • 23. Pullukçu H, Taşbakan M, Aydemir Ş ve ark. İdrar kültürlerinden soyutlanan bakteriler ve çeşitli antibiyotiklere in-vitro duyarlılıklarının değerlendirilmesi, Ankem Derg 2006; 20:26-30.
  • 24. Temiz H, Özbek E, Vural DG, Özekinci T. Klebsiella İzolatlarının Antimikrobiyal Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2015;45:68-74.
  • 25. Terzi HA, Karakeçe E, Çiftci İH. Klebsiella spp. izolatlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirmesi. ACU Sağlık Bil 2013;4:68-71.
  • 26. Albayrak N, Kaya Ş. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının genişlemiş spektrumlu beta laktamaz üretimleri ve antibiyotik direnç oranları. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2009; 39: 16-21
  • 27. Yıldırım M. Enterokoklar ve enterokoklarla gelişen infeksiyonlar. Düzce Tıp Dergisi 2007; 2:46-52.
  • 28. Yamazhan T. Vankomisine dirençli enterokoklar. Direncin önlenmesi ve kontrol. 2. EKMUD Bilimsel Platformu Kitabı, 11-14 Mart 2009, Antalya: 49-52.
  • 29. Gülcan A, Aslantürk A, Gülcan E. İdrar kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve in vitro antibiyotik duyarlılık durumları. Abant Tıp Derg 2012; 1(3): 61-7.
Year 2020, Volume: 10 Issue: 4, 677 - 683, 15.12.2020
https://doi.org/10.31832/smj.802643

Abstract

References

  • 1. Kandemir Ö, Uğuz M, Taşdelen B. Hastane kökenli üropatojen Escherichia Coli suşlarının ampirik tedavisinde sık kullanılan antibiyotiklere yıllar içinde gelişen direnç oranlarındaki değişim. FLORA 2009;14(4):170-174.
  • 2. Tekin A, Deveci Ö, Dal T, Tekin R, Özekinci T, Dayan S. Ayaktan ve yatan hastalarda izole edilen mikroorganizmaların antibiyotiklerin in vitro etkinliği, ANKEM Derg 2012;26(2):61-8. http://dx.doi.org/10.5222/ankem.2012.061
  • 3. Alpay Y, Yavuz MT, Aslan T, Büyükzengin B. Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz Pozitif Escherichia Coli ile oluşan komplike olmayan üriner sistem infeksiyonlarının tedavisinde oral antibiyotikler Karbapenemlere alternatif olabilir mi? ANKEM Derg 2017;31(3):85-91.
  • 4. Duran H, Çeken N, Kula Atik T. İdrar kültüründen izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının antibiyotik direnç oranları: Dört yıllık analiz. ANKEM Derg. 2020;34(2):41-7. 5. Russell DB. Roth NJ. Urinary tract infections in men in a primary care population. Aust Fam Physicians 2001; 30:177-9. PMid:11280121
  • 6. Sobel JD, Kaye D. Urinary tract infections. In: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R eds. Principles and Practice of Infectious Diseases. New York: Churcill Livingstone, 2000:773.
  • 7. Kolaylı F. Üriner sistem enfeksiyonlarında etken patogenez ve mikrobiyolojik tanı. Turkiye Klinikleri J Urology-Special Topics. 2010;3(3):8-18.
  • 8. Guidelines on urological infections. European Association of Urology 2014. İnternet adresi: http://www.uroweb.org/gls/pdf/19%20Urological%20infections_LR.pdf. Erişim tarihi: 29.05.2014
  • 9. Akata F. Üriner sistem infeksiyonlarında uygun antibiyotik kullanımı. Klinik Dergisi 2001; 14: 114-123
  • 10. Gupta K, Hooton TM, Naber KG, Wullt B, Colgan R, Miller LG, et al. International clinical practice guidelines for the treatment of acute uncomplicated cystitis and pyelonephritis in women: A 2010 update by the Infectious Diseases Society of America and the European Society for Microbiology and Infectious Diseases. Clin Infect Dis 2011; 52(5): 103-20.
  • 11. Duman Y, Bozkurt İ, Tekerekoğlu MS. Investigation of Antibiotic Resistance and ESBLPresence of Community-Acquired Escherichia coli Strains, Isolated from UTI in Afşin State Hospital. Med Sci, 2014; 3(3): 1408-18.
  • 12. Saraçoğlu KT, Fidan V, Pekel Ö, Saraçoğlu A, Kalkandelen S, Arpalı E. İdrar kültürlerinde izole edilen bakterilerin antibiyotik duyarlılıkları. J Clin Exp Invest 2013; 4(3): 356-359.
  • 13. Zengin K, Tanık S, Albayrak S, Kaba M, Pirinççi N. Van Bölgesi’ndeki üriner sistem enfeksiyon etkenleri ve antibiyotik duyarlılıkları. Bozok Tıp Derg 2014; 4(1); 1-5.
  • 14. Sağlam H.S, Öğütlü A, Demiray V, Karabay O. Üriner enfeksiyonlarda toplum kökenli Escherichia coli’nin yeri ve gelişen antibiyotik direnci. Nobel Medicus 2012; 8(1): 67-8.
  • 15. Aktaş SÇ, Gençer S, Batırel A, Hacıseyitoğlu D, Özer S. CLSI ve EUCAST Önerilerine Göre Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz Üreten Escherichia coli İdrar İzolatlarında Fosfomisin Duyarlılığı. Mikrobiyol Bul 2014; 48(4): 545-55.
  • 16. Aykan ŞB, Çiftci İH. Türkiye’de idrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli suşlarinin antibiyotiklere direnç durumu: bir meta-analiz. Mikrobiyol Bul 2013; 47(4): 603-8.
  • 17. Aytaç Ö, Mumcuoğlu İ, Çetin F, Aksoy A, Aksu N. Erişkin hastalarda toplum kaynaklı üriner sistem enfeksiyonlarından izole edilen Escherichia coli suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının yıllara göre değişimi (2010-2014). Turk Hij Den Biyol Derg 2015; 72(4): 273-80.
  • 18. Dağlar D, Demirbakan H, Yıldırım Ç, Öztüek F, Özcan A, Sipen N et al. İdrar örneklerinden izole edilen bakteriler ve antibiyotiklere duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2005(3);35:189-94.
  • 19. Yılmaz E, Özakın C, Sınırtaş M, Gedikoğlu S. Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi Bakteriyoloji Laboratuvarı'nda 1999-2002 yılları arasında idrar örneklerinden izole edilen mikro organizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları. İnfeksiyon Dergisi 2005;19(1):91-6.
  • 20. Ece Terek G, Tunçel Başoğlu M. Bir üniversite hastanesine gönderilen idrar kültürlerinde üreyen izolatların dağılımı ve antimikrobiyal duyarlılık profilinin incelenmesi. Ege Tıp Dergisi / Ege Journal of Medicine 2013;52(3):136-140
  • 21. Demirtürk N, Demirdal T, EldemirT, İnce R, Altındiş M. İdrar örneklerinden izole edilen bakterilerin antibiyotiklere duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2005;35(2):275-8
  • 22. Dündar D, Willke A, Sönmez T.G. İdrar yolu infeksiyonu etkenleri ve antibiyotik duyarlılıkları. Klimik Derg 2008; 21: 7-11
  • 23. Pullukçu H, Taşbakan M, Aydemir Ş ve ark. İdrar kültürlerinden soyutlanan bakteriler ve çeşitli antibiyotiklere in-vitro duyarlılıklarının değerlendirilmesi, Ankem Derg 2006; 20:26-30.
  • 24. Temiz H, Özbek E, Vural DG, Özekinci T. Klebsiella İzolatlarının Antimikrobiyal Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2015;45:68-74.
  • 25. Terzi HA, Karakeçe E, Çiftci İH. Klebsiella spp. izolatlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirmesi. ACU Sağlık Bil 2013;4:68-71.
  • 26. Albayrak N, Kaya Ş. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının genişlemiş spektrumlu beta laktamaz üretimleri ve antibiyotik direnç oranları. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2009; 39: 16-21
  • 27. Yıldırım M. Enterokoklar ve enterokoklarla gelişen infeksiyonlar. Düzce Tıp Dergisi 2007; 2:46-52.
  • 28. Yamazhan T. Vankomisine dirençli enterokoklar. Direncin önlenmesi ve kontrol. 2. EKMUD Bilimsel Platformu Kitabı, 11-14 Mart 2009, Antalya: 49-52.
  • 29. Gülcan A, Aslantürk A, Gülcan E. İdrar kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve in vitro antibiyotik duyarlılık durumları. Abant Tıp Derg 2012; 1(3): 61-7.
There are 28 citations in total.

Details

Primary Language Turkish
Subjects Health Care Administration
Journal Section Articles
Authors

Merve Çilburunoğlu 0000-0001-8627-7366

Özlem Kirişci 0000-0003-4784-8183

Hacer Yerlikaya 0000-0002-6347-5527

Hacer Uğurlu 0000-0001-6126-5502

Murat Aral 0000-0002-3576-4380

Gürkan Muratdağı 0000-0002-9629-3973

Publication Date December 15, 2020
Submission Date September 30, 2020
Published in Issue Year 2020 Volume: 10 Issue: 4

Cite

AMA Çilburunoğlu M, Kirişci Ö, Yerlikaya H, Uğurlu H, Aral M, Muratdağı G. Bir Üniversite Hastanesine Gönderilen İdrar Kültürlerinde Üreyen İzolatların Dağılımı ve Antimikrobiyal Duyarlılık Profilinin İncelenmesi. Sakarya Tıp Dergisi. December 2020;10(4):677-683. doi:10.31832/smj.802643

30703

The published articles in SMJ are licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.