Pandemi Dönemindeki Yara Enfeksiyon Etkenlerinin ve Antibiyotik Duyarlılıklarının Pandemi Öncesi ile Karşılaştırılması

Year 2023, Volume: 13 Issue: 2, 321 - 328, 30.06.2023

Oya Akkaya

https://doi.org/10.31832/smj.1266829

Cited By: 1

Abstract

Amaç: Pandemi öncesi (PÖ) ve pandemi dönemi (PD) yara enfeksiyon etkenleri ve antibiyotik direnç profillerini karşılaştırmak.
Gereç ve Yöntemler: Ocak 2019-Aralık 2021 tarihleri arasında yara sürüntü örneklerinde üreyen bakteriler ve antibiyotik direnç oranları retrospektif olarak kaydedilmiştir. Bu sonuçlar PÖ (Ocak 2019 -Haziran 2020; n = 684) ve PD (Haziran 2020- Aralık 2021; n = 255) arasında karşılaştırılmıştır.
Bulgular: Yara yeri enfeksiyonlarının kliniklere göre dağılımı şu şekildeydi: PÖ grubunda %27 ile yoğun bakımlar, %15 genel cerrahi servisi ve %13 enfeksiyon kliniği; PD grubunda %29 yoğun bakımlar, %24 COVID servisi ve %12 genel cerrahi servisi. Patojen sıklıkları, PÖ grubunda %19 E.coli, %16 S.aureus, %12 P.aeruginosa, %11 K.pneumoniae ve %10 A.baumannii iken, PD grubunda ise sırasıyla %22, %19, %9, %14, %10 olmuştur. PÖ grubunda S.aureus suşlarının %28’i metisilin dirençli iken, PD grubunda bu oran %35 olmuştur (p = 0,328). Meropeneme dirençli K.pneumoniae sıklığı PÖ'de %47’den PD'de %53’e yükselmiştir (p = 0,693).
Sonuç: COVID-19 PD’de yara enfeksiyonlarında etken olan bakteri tiplerinin değişmediği, ama bazı antibiyotiklere direnç oranlarının hafif düzeyde arttığı gözlenmiştir. Pandemide antibiyotiklerin gereğinden çok ve uygunsuz kullanımı, çoklu ilaç direcine sahip gram negatif bakterilerin artışının sebebi olabilir.

Aim: to compare the infectious agents and antibiotic resistance profiles of wound samples obtained during the pre-pandemic period (PP) and pandemic period (PD).
Materials and Methods: We retrospectively recorded the rates of bacteria grown in wound swab samples and antibiotic resistance between January 2019 and December 2021. These results were compared between the PP (January 2019 - June 2020; n=684) and PD (June 2020 - December 2021; n=255) periods.
Results: The distribution of wound infections according to clinics was as follows: in the PP, 27% were in intensive care units (ICU), 15% were in general surgery, and 13% were in infection clinics; in the PD, 29% were in ICU, 24% were in COVID service, and 12% were in general surgery. The pathogen frequencies were 19% for E.coli, 16% for S.aureus, 12% for P.aeruginosa, 11% for K.pneumoniae, and 10% for A baumannii in the PP, while they were 22%, 19%, 9%, 14%, and 10%, respectively, in the PD. While 28% of S aureus strains were methicillin-resistant in the PP, it was 35% in the PD (p=0.328). The incidence of meropenem-resistant K.pneumoniae increased from 47% in the PP to 53% in the PD (p=0.693).
Conclusion: Our study showed that the types of bacteria causing wound infections did not change significantly during the COVID-19 pandemic period, but there was a slight increase in resistance rates to some antibiotics. The increase in multi-drug resistant gram-negative bacteria may be attributed to the excessive and inappropriate use of antibiotics during the pandemic.

Keywords

Antimikrobiyal duyarlılık, yara enfeksiyonları, COVID-19

Supporting Institution

YOK

Project Number

23.05.2022 tarihinde 2022/027 no.lu etik kurul kararı

References

• Avcıoglu F, Behçet M, Karabörk S, Kurtoğlu MG. Yara örneklerinden izole edilen mikroorganizmaların antimikrobiyal direnç oranları - Üç yıllık değerlendirme. Düzce Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Dergisi 2019;9(3):110-4.
• Almeida GCM, dos Santos MM, Lima NGM., Cidral TA, Melo MCN, Lima KC. Prevalence and factors associated with wound colonization by Staphylococcus spp. and Staphylococcus aureus in hospitalized patients in inland northeastern Brazil: A cross-sectional study. BMC Infect Dis 2014;14(1):328.
• Hassan MA, Abd El-Aziz S, Elbadry HM, Samy A., Tamer TM. Prevalence, antimicrobial resistance profile, and characterization of multi-drug resistant bacteria from various infected wounds in North Egypt. Saudi J Biol Sci 2022;29(4): 2978-2988.
• Guo M, Gao M, Gao J, ZhangT, Jin X, Fan J, et al. Identifying risk factors for secondary infection post-SARS-CoV-2 infection in patients with severe and critical COVID-19. Front Immunol 2021;12:715023.
• Erdal B, Keskin B, Altıntaş N, Kiraz N. COVID-19 hastalarında sekonder enfeksiyonlar ve literatürün gözden geçirilmesi: üniversite hastanesinde yapılan retrospektif bir çalışma. ANKEM Dergisi 2022;36(2):64-73.
• Tao F, Tang X, Tao H, Luo Y, Cao H, Xiang W. Surgical treatment of diabetic foot ulcers during the COVID-19 pandemic in China. J Diabetes Complications 2020;34(9):107622.
• Singh H, Kaur H, Singh K, Sen C.K. Cutaneous manifestations of COVID-19: a systematic review. Adv Wound Care (New Rochelle) 2021;10(2):51-80.
• Alshaikh FS, Godman B, Sindi O.N., Seaton RA., Kurdi A. Prevalence of bacterial coinfection and patterns of antibiotics prescribing in patients with COVID-19: A systematic review and meta-analysis. PloS One 2022;17(8):e0272375.
• Aydemir O, Aydemir Y, Şahin EO, Şahin F, Koroglu M, Erdem AF. Secondary bacterial infections in patients with coronavirus disease-2019 associated pneumonia. Rev Assoc Med Bra 2022;68:142-6.
• Upreti N, Rayamajhee B, Sherchan SP, Choudhari MK, Banjara M.R. Prevalence of methicillin resistant Staphylococcus aureus, multidrug resistant and extended spectrum β-lactamase producing gram negative bacilli causing wound infections at a tertiary care hospital of Nepal. Antimicrob Resist Infect Control 2018;7:121.
• Klinik Mikrobiyoloji Uzmanlık Derneği (KLİMUD) Klinik Örnekten Sonuç Raporuna Uygulama Rehberi 2015. https://www.klimud.org/public/uploads/files/deri-deri-ekleri-yumusak-doku-ornekleri-goz-ornekleri.pdf.
• EUCAST. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing, Clinical breakpoints 2021. https://www.eucast.org/clinical_breakpoints
• Davarcı I, Koçoğlu ME, Barlas N, Samastı M. Yara kültürlerinden izole edilen bakterilerin antimikrobiyal duyarlılıkları: üç yıllık değerlendirme. Ankem Derg 2018;32(2):53-61.
• Tanrıverdi Y, Torun E, Bilgin K, Birinci A. Yara yeri örneklerinden izole edilen etkenler ve antibiyotik direnç profilleri. Düzce Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Dergisi 2021;11(2):123-8.
• Erdem F, Ünal N, Bankir M. SARS-CoV-2 PCR pozitif hastalarda bakteriyel enfeksiyonlar ve antibiyotik direnci. Harran Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi 2022;19(2):333-7.
• Budhiraja S, Tarai B, Jain D, Aggarwal M, Indrayan A, Das P. Secondary infections modify the overall course of hospitalized patients with COVID-19: A retrospective study from a network of hospitals across North India. IJID Regions 2022;3:44-53.
• Jo JH, Harkins CP, Schwardt NH, Portill JA, NISC Comparative Sequencing Program, Zimmerman MD, et al. Alterations of human skin microbiome and expansion of antimicrobial resistance after systemic antibiotics. Sci Transl Med 2021;13(625):eabd8077.
• Karadag A, Sengul T. Challenges faced by doctors and nurses in wound care management during the COVID-19 pandemic in Turkey and their views on telehealth. J Tissue Viability 2021;30(4):484-8.
• Özker E, Erkin A, Aslan HM, Kurtoğlu T, Çayır MÇ, Akay T. Wound treatment strategies during COVID-19 pandemic: An expert opinion. Turk J Vasc Surg, 2021;30(2):167-73.
• Guo L, Xu H, Yue Z. Antibiotic resistance pattern of Pseudomonas aeruginosa wound isolates among Chinese burn patients: A systematic review and meta analysis. Asian Pac J Trop Med 2022;15(1):17-25.
• Savcı Ü, Alıç T, Güreser AS, Özkan AT. Ortopedik cerrahi sonrası yara enfeksiyonları: Mikroorganizmaların dağılımları ve direnç durumları. Ortadoğu Tıp Dergisi 2018;10(4):492-7.
• Yıldırım AM, Çarkçı HA, Yılmaz M, Toraman ZA. Yanık ve yara örneklerınden izole edılen mıkroorganızma türlerının belirlenmesi ve antimikrobiyal duyarlılıklarının araştırılması. Kocatepe Tıp Dergisi 2019;20:26-32.1.
• Pantvaidya G, Joshi S, Nayak P, Kannan S, DeSouza A, Poddar P. Surgical Site Infections in patients undergoing major oncological surgery during the COVID‐19 pandemic (SCION): A propensity‐matched analysis. J Surg Oncol 2022;125(3):327-35.