Escherichia coli’de Yenibileşenli İnterferon beta Salgılanmasında Sinyal Peptidi Kullanımı Üzerine bir Derleme
Abstract
: Rekombinant
interferon beta (rİFN-β) proteini çeşitlerinden rİFN-β1a ve rİFN-β1b üretimi
için benzer süreçler ile ökaryotik ve prokaryotik ekspresyon sistemleri
kullanılmaktadır. Ökaryotik ekspresyon sistemleri ile üretilen rİFN-β1a’nın
saflaştırılmasında zorlukların yaşanması ve biyolojik aktivitesinin etkilenmesi
bu süreçler ile rekombinant protein üretimini güçleştirmektedir. Prokaryotik
ekspresyon sistemlerinin kullanıldığı rİFN-β1b üretiminde ise saflaştırma ve
aktivite sorunlarının daha az gerçekleştiği belirlenmiştir. Prokaryotik
bakterilerden Escherichia coli’de
bulunan ürün salgılama özelliğinin daha iyi kullanılması, bu sistemin rİFN-β1b
üretiminde daha fazla tercih edileceğini göstermektedir. Rekombinant
proteinlerin üretildikleri konakçı hücreden dışarı salgılatılacak şekilde yapı
tasarlanması durumunda, saflaştırma sırasında E. coli konakçı hücreler parçalanmayacağından ürün saflaştırma
işlemlerini kolaylaştıracağı öngörülmektedir. Tip I ve tip II salgılama
sistemine sahip olan E. coli’nin
rİFN-β1b proteinlerinin üretiminde kullanımı, bu konakçıda üretilen rİFN-β1b’nin
hücre dışına salgılatılmasında saflaştırma ve aktivite sorunlarını azaltacağı,
ayrıca rİFN-β1b’nin konakçı hücreye yapacağı toksik etkininde ortadan kalkacağı
tahmin edilmektedir. Bu amaçla E. coli
üretim sistemindeki dezavantajları gidermek için Sec sinyal peptidi olan PelB
sinyal peptidine ilave olarak Tat tipi sinyal peptidi olan DmsA sinyal
peptidi’nin pET22b ifade vektörüne aktarılmasıyla rİFN-β1b proteinlerinin hücre
dışına salgılatılması işlemi gibi çeşitli yaklaşımlar tasarlanmaktadır. Bu
derlemede, İFN’ların özelliklerine, rİFN-β’nın klinik uygulamalarına ve
rİFN-β1b üretim yöntemleri ile ilgili yapılmış araştırmalara dayalı bilgi ve ve
rİFN-β1b’nin E. coli konakçı
hücrelerinde üretilmesi sürecinde sinyal peptidlerinin kullanımı ile ilgili
bilgilere dikkat çekilmiştir.
Keywords
References
- Allen J, Feng P, Patkar A, Haney KL, Chew L Sengchanthalangsy LLP (2015). Method for producing soluble recombinant interferon protein without denaturing. US20160032345A1.
- Beladiya C, Tripathy RK, Bajaj P, Aggarwal G, Pande AH (2015). Expression, purification and immobilization of recombinant AiiA enzyme onto magnetic nanoparticles. Protein Expression and Purification 113: 56-62. DOI: 10.1016/j.pep.2015.04.014
- Binet R, Létoffé S, Ghigo JM, Delepelaire P, Wandersman C (1997). Protein secretion by gram-negative bacterial ABC exporters–a review. Gene 192: 7-11. PMID: 9224868
- Chelbi-Alix, M.K., Wietzerbin, J. (2007). “IFN, a growing cytokine family: 50 years of IFN research”, Biochimie, 89, 713-718. DOI: 10.1016/j.biochi.2007.05.001
- Chevaliez S, Pawlotsky JM (2009). Interferons and Their Use in Persistent Viral Infections. In: Kräusslich HG, Bartenschlager R. (eds) Antiviral strategies. Handbook of Experimental Pharmacol 189 Springer Berlin Heidelberg. e-ISBN 978-3-540-79086-0
- Choi JH, Lee SY (2004). Secretory and extracellular production of recombinant proteins using Escherichia coli. Appl Microbiol and Biotech 64: 625-635. DOI: 10.1007/s00253-004-1559-9
- Cianciotto NP (2005). Type II secretion: a protein secretion system for all seasons. Trends in Microbiol 13(12): 581-588. DOI: 10.1016/j.tim.2005.09.005
- Conradt HS, Egge H, Peter-Katalinic J, Reiser W, Siklosi T, Schaper K (1987). Structure of the carbohydrate moiety of human IFN-ß secreted by a recombinant Chinese hamster ovary cell line. J of Biological Chem 262: 14600-14605.
Details
Primary Language
Turkish
Subjects
Structural Biology
Journal Section
Review
Publication Date
April 30, 2019
Submission Date
August 18, 2018
Acceptance Date
November 1, 2018
Published in Issue
Year 2019 Volume: 45 Number: 1
