Review

Escherichia coli’de Yenibileşenli İnterferon beta Salgılanmasında Sinyal Peptidi Kullanımı Üzerine bir Derleme

Volume: 45 Number: 1 April 30, 2019
EN TR

Escherichia coli’de Yenibileşenli İnterferon beta Salgılanmasında Sinyal Peptidi Kullanımı Üzerine bir Derleme

Abstract

: Rekombinant interferon beta (rİFN-β) proteini çeşitlerinden rİFN-β1a ve rİFN-β1b üretimi için benzer süreçler ile ökaryotik ve prokaryotik ekspresyon sistemleri kullanılmaktadır. Ökaryotik ekspresyon sistemleri ile üretilen rİFN-β1a’nın saflaştırılmasında zorlukların yaşanması ve biyolojik aktivitesinin etkilenmesi bu süreçler ile rekombinant protein üretimini güçleştirmektedir. Prokaryotik ekspresyon sistemlerinin kullanıldığı rİFN-β1b üretiminde ise saflaştırma ve aktivite sorunlarının daha az gerçekleştiği belirlenmiştir. Prokaryotik bakterilerden Escherichia coli’de bulunan ürün salgılama özelliğinin daha iyi kullanılması, bu sistemin rİFN-β1b üretiminde daha fazla tercih edileceğini göstermektedir. Rekombinant proteinlerin üretildikleri konakçı hücreden dışarı salgılatılacak şekilde yapı tasarlanması durumunda, saflaştırma sırasında E. coli konakçı hücreler parçalanmayacağından ürün saflaştırma işlemlerini kolaylaştıracağı öngörülmektedir. Tip I ve tip II salgılama sistemine sahip olan E. coli’nin rİFN-β1b proteinlerinin üretiminde kullanımı, bu konakçıda üretilen rİFN-β1b’nin hücre dışına salgılatılmasında saflaştırma ve aktivite sorunlarını azaltacağı, ayrıca rİFN-β1b’nin konakçı hücreye yapacağı toksik etkininde ortadan kalkacağı tahmin edilmektedir. Bu amaçla E. coli üretim sistemindeki dezavantajları gidermek için Sec sinyal peptidi olan PelB sinyal peptidine ilave olarak Tat tipi sinyal peptidi olan DmsA sinyal peptidi’nin pET22b ifade vektörüne aktarılmasıyla rİFN-β1b proteinlerinin hücre dışına salgılatılması işlemi gibi çeşitli yaklaşımlar tasarlanmaktadır. Bu derlemede, İFN’ların özelliklerine, rİFN-β’nın klinik uygulamalarına ve rİFN-β1b üretim yöntemleri ile ilgili yapılmış araştırmalara dayalı bilgi ve ve rİFN-β1b’nin E. coli konakçı hücrelerinde üretilmesi sürecinde sinyal peptidlerinin kullanımı ile ilgili bilgilere dikkat çekilmiştir.

Keywords

References

  1. Allen J, Feng P, Patkar A, Haney KL, Chew L Sengchanthalangsy LLP (2015). Method for producing soluble recombinant interferon protein without denaturing. US20160032345A1.
  2. Beladiya C, Tripathy RK, Bajaj P, Aggarwal G, Pande AH (2015). Expression, purification and immobilization of recombinant AiiA enzyme onto magnetic nanoparticles. Protein Expression and Purification 113: 56-62. DOI: 10.1016/j.pep.2015.04.014
  3. Binet R, Létoffé S, Ghigo JM, Delepelaire P, Wandersman C (1997). Protein secretion by gram-negative bacterial ABC exporters–a review. Gene 192: 7-11. PMID: 9224868
  4. Chelbi-Alix, M.K., Wietzerbin, J. (2007). “IFN, a growing cytokine family: 50 years of IFN research”, Biochimie, 89, 713-718. DOI: 10.1016/j.biochi.2007.05.001
  5. Chevaliez S, Pawlotsky JM (2009). Interferons and Their Use in Persistent Viral Infections. In: Kräusslich HG, Bartenschlager R. (eds) Antiviral strategies. Handbook of Experimental Pharmacol 189 Springer Berlin Heidelberg. e-ISBN 978-3-540-79086-0
  6. Choi JH, Lee SY (2004). Secretory and extracellular production of recombinant proteins using Escherichia coli. Appl Microbiol and Biotech 64: 625-635. DOI: 10.1007/s00253-004-1559-9
  7. Cianciotto NP (2005). Type II secretion: a protein secretion system for all seasons. Trends in Microbiol 13(12): 581-588. DOI: 10.1016/j.tim.2005.09.005
  8. Conradt HS, Egge H, Peter-Katalinic J, Reiser W, Siklosi T, Schaper K (1987). Structure of the carbohydrate moiety of human IFN-ß secreted by a recombinant Chinese hamster ovary cell line. J of Biological Chem 262: 14600-14605.

Details

Primary Language

Turkish

Subjects

Structural Biology

Journal Section

Review

Authors

Publication Date

April 30, 2019

Submission Date

August 18, 2018

Acceptance Date

November 1, 2018

Published in Issue

Year 2019 Volume: 45 Number: 1

APA
Öztürk, M., & Ermurat, Y. (2019). Escherichia coli’de Yenibileşenli İnterferon beta Salgılanmasında Sinyal Peptidi Kullanımı Üzerine bir Derleme. Selcuk University Journal of Science Faculty, 45(1), 10-21. https://izlik.org/JA32FY32GR
AMA
1.Öztürk M, Ermurat Y. Escherichia coli’de Yenibileşenli İnterferon beta Salgılanmasında Sinyal Peptidi Kullanımı Üzerine bir Derleme. Selcuk University Journal of Science Faculty. 2019;45(1):10-21. https://izlik.org/JA32FY32GR
Chicago
Öztürk, Mehmet, and Yakup Ermurat. 2019. “Escherichia Coli’de Yenibileşenli İnterferon Beta Salgılanmasında Sinyal Peptidi Kullanımı Üzerine Bir Derleme”. Selcuk University Journal of Science Faculty 45 (1): 10-21. https://izlik.org/JA32FY32GR.
EndNote
Öztürk M, Ermurat Y (April 1, 2019) Escherichia coli’de Yenibileşenli İnterferon beta Salgılanmasında Sinyal Peptidi Kullanımı Üzerine bir Derleme. Selcuk University Journal of Science Faculty 45 1 10–21.
IEEE
[1]M. Öztürk and Y. Ermurat, “Escherichia coli’de Yenibileşenli İnterferon beta Salgılanmasında Sinyal Peptidi Kullanımı Üzerine bir Derleme”, Selcuk University Journal of Science Faculty, vol. 45, no. 1, pp. 10–21, Apr. 2019, [Online]. Available: https://izlik.org/JA32FY32GR
ISNAD
Öztürk, Mehmet - Ermurat, Yakup. “Escherichia Coli’de Yenibileşenli İnterferon Beta Salgılanmasında Sinyal Peptidi Kullanımı Üzerine Bir Derleme”. Selcuk University Journal of Science Faculty 45/1 (April 1, 2019): 10-21. https://izlik.org/JA32FY32GR.
JAMA
1.Öztürk M, Ermurat Y. Escherichia coli’de Yenibileşenli İnterferon beta Salgılanmasında Sinyal Peptidi Kullanımı Üzerine bir Derleme. Selcuk University Journal of Science Faculty. 2019;45:10–21.
MLA
Öztürk, Mehmet, and Yakup Ermurat. “Escherichia Coli’de Yenibileşenli İnterferon Beta Salgılanmasında Sinyal Peptidi Kullanımı Üzerine Bir Derleme”. Selcuk University Journal of Science Faculty, vol. 45, no. 1, Apr. 2019, pp. 10-21, https://izlik.org/JA32FY32GR.
Vancouver
1.Mehmet Öztürk, Yakup Ermurat. Escherichia coli’de Yenibileşenli İnterferon beta Salgılanmasında Sinyal Peptidi Kullanımı Üzerine bir Derleme. Selcuk University Journal of Science Faculty [Internet]. 2019 Apr. 1;45(1):10-21. Available from: https://izlik.org/JA32FY32GR

Journal Owner: On behalf of Selçuk University Faculty of Science, Rector Prof. Dr. Hüseyin YILMAZ
Selcuk University Journal of Science Faculty accepts articles in Turkish and English with original results in basic sciences and other applied sciences. The journal may also include compilations containing current innovations.

It was first published in 1981 as "S.Ü. Fen-Edebiyat Fakültesi Dergisi" and was published under this name until 1984 (Number 1-4).
In 1984, its name was changed to "S.Ü. Fen-Edeb. Fak. Fen Dergisi" and it was published under this name as of the 5th issue.
When the Faculty of Letters and Sciences was separated into the Faculty of Science and the Faculty of Letters with the decision of the Council of Ministers numbered 2008/4344 published in the Official Gazette dated 3 December 2008 and numbered 27073, it has been published as "Selcuk University Journal of Science Faculty" between 2009-2025. 
It has been scanned in DergiPark since 2016.

88x31.png

Selcuk Journal of Science is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0) License.