Türkiye’de mikrobiyoloji laboratuvarlarının kültür ve antibiyotik duyarlılık testi performans değerlendirmesi ve Ulusal Antimikrobiyal Direnç Sürveyans Sistemine veri sağlayacak laboratuvarların seçimi: Anket uygulaması

Volume: 72 Number: 3 September 1, 2015
  • Murat Duman
  • Nilay Çöplü
  • Dilber Aktaş
  • Hüsniye Şimşek
  • Gül Bahar Erdem
  • İpek Mumcuoğlu
TR EN

Türkiye’de mikrobiyoloji laboratuvarlarının kültür ve antibiyotik duyarlılık testi performans değerlendirmesi ve Ulusal Antimikrobiyal Direnç Sürveyans Sistemine veri sağlayacak laboratuvarların seçimi: Anket uygulaması

Abstract

Amaç: Antimikrobial direnç sorununun artmakta olması nedeniyle ülkemizde Ulusal Antimikrobiyal Direnç Sürveyans Sistemi UAMDSS kurulma çalışmaları başlatılmıştır. UAMDDS’ye dahil olacak laboratuvarların sisteme güvenilir veri sağlayabilmesi önemlidir. Bu amaçla ülkedeki mikrobiyoloji laboratuvarlarının kültür ve antibiyotik duyarlılık testleri ADT yapabilme kapasitelerini değerlendiren bir anket uygulaması yapılmıştır. Yöntem: Bu çalışma 2009-2010 yılları arasında yapılmış olup mikrobiyoloji laboratuvarlarının kültür ve ADT yapabilme kapasitelerine odaklanan 90 soru içermektedir. Anket formları T.C. Sağlık Bakanlığı tarafından mikrobiyoloji uzmanı bulunduğu bilgisine ulaşılan kamuya bağlı 354 hastanenin tıbbi mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilmiştir. Sonuçlar SPSS 18,0 istatistik programı kullanılarak değerlendirilmiştir. Bulgular: Ankete %70,5’i devlet hastanesi, %16,5’i eğitim ve araştırma hastanesi ve %13’ü üniversite hastanesi olmak üzere 322 laboratuvar cevap vermiştir. Birinci basamak sisteme dahil olma kriterleri olan; mikrobiyoloji uzmanı bulunması %99,1 , bakteriyoloji bölümü olması %97,5 ve kan kültürü çalışılması %83,6 sorularının her üçüne de evet cevabı veren 259 %80,4 laboratuvar ileri değerlendirmeye alınmıştır. İkinci aşama olan skor çalışmasında kullanılan sorular ve bu sorulara verilen cevap yüzdeleri şöyledir: i Escherichia coli ortalama: 74,7 , Klebsiella spp. ortalama: 22,9 , Staphylococcus aureus ortalama: 19,6 , Pseudomonas aeruginosa ortalama: 19,5 , Enterococcus spp. ortalama: 16,1 ve Streptococcus pneumoniae ortalama: 3,7 , için uygulanan aylık ADT sayısının ortalama değerlerinin üzerinde olması, ii klinik olarak anlamlı kabul edilen mikroorganizmalara veya izole edilen hastada klinik olarak önemli kabul edilen mikroorganizmalara kan izolatları için sırasıyla %49,2 ve %30,2; BOS izolatları için sırasıyla %88,7 ve %75,5 ADT uygulaması, iii ADT için standart uygulama prosedürünün olması %81,6 , iv iç kalite kontrol sonuçlarının gözden geçiriliyor olması %82,2 , v ADT için standart yöntemlerden herhangi birinin kullanılıyor olması %95,8 , vi ADT sonuçlarının yorumu için standart rehber kullanılması %94,2 vii sonuçların tutarlılığının değerlendirilmesi %96,9 şeklindedir. 259 laboratuvardan 173’ü skor belirleme sorularının tümüne cevap vermiş olup, bu laboratuvarların skor değerleri 4-7; 8-11 ve 12-15 olacak şekilde gruplandırılmıştır. Laboratuvarlardan 43/173 %24,8 ’ünün 12-15 skor grubuna dahil olduğu görülmüştür. Üniversite hastaneleri ve eğitim ve araştırma hastanelerinin büyük bir kısmı 12-15 arası skor puanı alırken sırasıyla %64,9 ve %53,3’ü , devlet hastanelerinin büyük bir bölümünün 4-7 %50 ve 8-11 %47,2 arası skor puanı aldığı belirlenmiştir. Sonuç: UAMDSS için katılımcı laboratuvar belirlerken; skor değerinin yüksek olması, Türkiye İstatistikî Bölge Birimleri Sınıflandırması’na göre belirlenen 12 bölgeye olabildiğince eşit dağılması ve üniversite, eğitim araştırma ve devlet hastanelerini içerecek şekilde olması dikkate alınmıştır. Buna göre UAMDSS’ye güvenilir veri sağlayabilecek katılımcı 78 laboratuvar seçilmiştir.

Keywords

References

  1. 1. Napoli C, Lemieux C, Jorgensen R. Introduction of a chimeric chalcone synthase gene into Petunia result in supression of homologous revesible co-supression of homologous genes in trans. The Plant Cell, 1990; 2: 279-89.
  2. 2. Jorgensen RA, Cluster PD, English J, Que Q, Napoli CA. Chalgone synthase cosupression phenotypes in petunia flovers: comparison of sense vs. antisense constructs and single-copy vs.complex T-DNA sequences. Plant Mol Biol, 1996; 32(5): 957-73.
  3. 3. Fire A, Xu S, Montgomery MK, Kostas SA, Driver SE, Mello CC. Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans. Nature, 1998; 391 (6669): 806-11.
  4. 4. DaneholtB. Advanced Information: RNA interference. The Nobel Prize in Physiology or Medicine. Archived from the original. Retrieved, 2007.
  5. 5. Zamore PD, Tuschl T, Sharp PA, Bartel DP. RNAi: double-stranded RNA directs the ATPdependent cleavage of mRNA at 21 to 23 nucleotide intervals. Cell, 2000; 101: 25-33.
  6. 6. Allshire R. RNAi and heterochromatin–a hushedup affair. Science, 2002; 297: 1818-9.
  7. 7. Vaucheret H. Post-transcriptional small RNA pathways in plants: mechanism and regulations. Genes Dev, 2006; 20: 759-71.
  8. 8. Zhao T. A complex system of small RNAs in the unicellular green alga Chlamydomonas reinhardtii. Genes Dev, 2007; 21(94): 1190-203.

Details

Primary Language

Turkish

Subjects

-

Journal Section

-

Authors

Murat Duman This is me

Nilay Çöplü This is me

Dilber Aktaş This is me

Hüsniye Şimşek This is me

Gül Bahar Erdem This is me

İpek Mumcuoğlu This is me

Publication Date

September 1, 2015

Submission Date

-

Acceptance Date

-

Published in Issue

Year 2015 Volume: 72 Number: 3

APA
Duman, M., Çöplü, N., Aktaş, D., Şimşek, H., Erdem, G. B., & Mumcuoğlu, İ. (2015). Türkiye’de mikrobiyoloji laboratuvarlarının kültür ve antibiyotik duyarlılık testi performans değerlendirmesi ve Ulusal Antimikrobiyal Direnç Sürveyans Sistemine veri sağlayacak laboratuvarların seçimi: Anket uygulaması. Türk Hijyen Ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 72(3), 175-272. https://izlik.org/JA44UT23LH
AMA
1.Duman M, Çöplü N, Aktaş D, Şimşek H, Erdem GB, Mumcuoğlu İ. Türkiye’de mikrobiyoloji laboratuvarlarının kültür ve antibiyotik duyarlılık testi performans değerlendirmesi ve Ulusal Antimikrobiyal Direnç Sürveyans Sistemine veri sağlayacak laboratuvarların seçimi: Anket uygulaması. Turk Hij Den Biyol Derg. 2015;72(3):175-272. https://izlik.org/JA44UT23LH
Chicago
Duman, Murat, Nilay Çöplü, Dilber Aktaş, Hüsniye Şimşek, Gül Bahar Erdem, and İpek Mumcuoğlu. 2015. “Türkiye’de Mikrobiyoloji Laboratuvarlarının Kültür Ve Antibiyotik Duyarlılık Testi Performans Değerlendirmesi Ve Ulusal Antimikrobiyal Direnç Sürveyans Sistemine Veri Sağlayacak Laboratuvarların Seçimi: Anket Uygulaması”. Türk Hijyen Ve Deneysel Biyoloji Dergisi 72 (3): 175-272. https://izlik.org/JA44UT23LH.
EndNote
Duman M, Çöplü N, Aktaş D, Şimşek H, Erdem GB, Mumcuoğlu İ (September 1, 2015) Türkiye’de mikrobiyoloji laboratuvarlarının kültür ve antibiyotik duyarlılık testi performans değerlendirmesi ve Ulusal Antimikrobiyal Direnç Sürveyans Sistemine veri sağlayacak laboratuvarların seçimi: Anket uygulaması. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 72 3 175–272.
IEEE
[1]M. Duman, N. Çöplü, D. Aktaş, H. Şimşek, G. B. Erdem, and İ. Mumcuoğlu, “Türkiye’de mikrobiyoloji laboratuvarlarının kültür ve antibiyotik duyarlılık testi performans değerlendirmesi ve Ulusal Antimikrobiyal Direnç Sürveyans Sistemine veri sağlayacak laboratuvarların seçimi: Anket uygulaması”, Turk Hij Den Biyol Derg, vol. 72, no. 3, pp. 175–272, Sept. 2015, [Online]. Available: https://izlik.org/JA44UT23LH
ISNAD
Duman, Murat - Çöplü, Nilay - Aktaş, Dilber - Şimşek, Hüsniye - Erdem, Gül Bahar - Mumcuoğlu, İpek. “Türkiye’de Mikrobiyoloji Laboratuvarlarının Kültür Ve Antibiyotik Duyarlılık Testi Performans Değerlendirmesi Ve Ulusal Antimikrobiyal Direnç Sürveyans Sistemine Veri Sağlayacak Laboratuvarların Seçimi: Anket Uygulaması”. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 72/3 (September 1, 2015): 175-272. https://izlik.org/JA44UT23LH.
JAMA
1.Duman M, Çöplü N, Aktaş D, Şimşek H, Erdem GB, Mumcuoğlu İ. Türkiye’de mikrobiyoloji laboratuvarlarının kültür ve antibiyotik duyarlılık testi performans değerlendirmesi ve Ulusal Antimikrobiyal Direnç Sürveyans Sistemine veri sağlayacak laboratuvarların seçimi: Anket uygulaması. Turk Hij Den Biyol Derg. 2015;72:175–272.
MLA
Duman, Murat, et al. “Türkiye’de Mikrobiyoloji Laboratuvarlarının Kültür Ve Antibiyotik Duyarlılık Testi Performans Değerlendirmesi Ve Ulusal Antimikrobiyal Direnç Sürveyans Sistemine Veri Sağlayacak Laboratuvarların Seçimi: Anket Uygulaması”. Türk Hijyen Ve Deneysel Biyoloji Dergisi, vol. 72, no. 3, Sept. 2015, pp. 175-2, https://izlik.org/JA44UT23LH.
Vancouver
1.Murat Duman, Nilay Çöplü, Dilber Aktaş, Hüsniye Şimşek, Gül Bahar Erdem, İpek Mumcuoğlu. Türkiye’de mikrobiyoloji laboratuvarlarının kültür ve antibiyotik duyarlılık testi performans değerlendirmesi ve Ulusal Antimikrobiyal Direnç Sürveyans Sistemine veri sağlayacak laboratuvarların seçimi: Anket uygulaması. Turk Hij Den Biyol Derg [Internet]. 2015 Sep. 1;72(3):175-22. Available from: https://izlik.org/JA44UT23LH