Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi’nde COVID-19 vakalarının sürveyansı, filyasyonu ve temaslılarının belirlenmesi

Abstract

Amaç: Bu çalışmayla Ege Üniversitesi hastanesinin COVID-19 sürveyans, filyasyon ve temaslı işlemlerinde halk sağlığı ekibinin alabileceği rolleri yaşanmış bir örnek üzerinden ortaya koymak, temaslı sağlık çalışanı işlemlerinin organizasyonunu paylaşmak, 18 Mart-31 Mayıs 2020 arasında yapılan çalışmaların temel bulgularını sunmak hedeflenmektedir. Yöntem: Retrospektif tanımlayıcı bir çalışmadır. Pandemi sırasında İl Sağlık Müdürlüğüne hastanenin günlük sürveyans verilerinin gönderilmesi için organize olunmuştur. Hastanede COVID-19 PCR testi pozitif saptanan olguların filyasyon ve temaslı verileri kayıtlardan incelenmiştir. Olguların sosyodemografik özellikleri, risk faktörleri, ilk tanı anında belirtileri gibi özellikleri incelenmiştir. Olguların sağlık çalışanı olan ve olmayan temaslı sayıları, ne kadarının izole edildiği, temaslı sağlık çalışanlarının ne kadarına ilaç başlandığı, PCR testi uygulandığı derlenmiştir ve bu çalışmaların organizasyon deneyimi aktarılmaktadır. Tanımlayıcı istatistikler kullanılmıştır. Sağlık Bakanlığı ve etik kurul onayları alınmıştır. Bulgular: Toplam 595 olgu ile görüşülmüş ve 2618 temaslı bilgisi alınmıştır. Görüşülen olguların %51.3’ü erkek, %67.6’sı 20-59 yaş aralığındadır. Olguların ilk belirti başlangıç tarihi ile ilk PCR pozitifliği arasında geçen süre ortalama 4.4±3.6 gündür, 266’sı (%52.8) ilk 3 gün içinde PCR pozitif saptanmıştır. Olası kaynağı sınıflandırılabilen olguların (n=475) 290’ının (%61.1) ailesi/yakınları/komşuları arasında; 98’inin (%20.6) işyerinde bilinen en az bir COVID-19 olgusu bulunmaktadır. Salgının ilk iki haftasında olguların sırasıyla %62.5 ve %17.1’i tıp fakültesi (TF) çalışanı iken bu oran giderek azalmış ve 11.haftanın sonunda %8.7’dir. TF hastanesinde tanı konan/izlenen olguların fatalite oranı %4.5’tir (27/595). Sonuç: Sağlık Bakanlığı bünyesinde halk sağlığı uzmanlarının da rol aldığı COVID-19 sürveyansı, filyasyonu ve temaslı belirlenmesi işini üniversiteler bünyesinde halk sağlığı öğretim elemanları yapabilmektedir. Yapılan çalışmalar, sürveyans ve salgın kotrolüne katkının yanısıra uzmanlık öğrencilerine deneyim fırsatı oluşturmaktadır.

Keywords

• Pandemi
• epidemiler
• enfeksiyöz hastalık salgınları
• sürveyans
• bulaşıcı hastalık temaslı izlemi

The surveillance, exposure investigation and contact tracing of COVID-19 cases at Ege University Medical School’s Hospital

Abstract

Objective: The aims of this study are to share the experience of COVID-19 surveillance, exposure investigation and contact tracing procedures applied at Ege University Hospital by members of its public health department, to describe how contact tracing and preventive measures were organized for healthcare staff, and to present the main findings of these between March 18-June 1, 2020. Methods: This is a retrospective descriptive study. An organization was established to send the required COVID-19 data to the provincial health directorate. The data of cases found COVID-19 PCR positive and their contacts were evaluated from the records. Their sociodemographic features, risk factors, symptoms at diagnosis were investigated. The numbers of healthcare staff and community contacts, and the numbers of contacts isolated, started to receive prophylactic treatment, PCR-tested and the organizations of all these procedures are reported. Descriptive statistics are presented. Ministerial and ethical approvals were obtained. Results: In total, 595 cases were contacted and information about their 2618 contacts were obtained. Among the cases, 51.3% were male and 67.6% were between 20-59 years. The mean time lag between symptom onset and PCR positivity was 4.4±3.6 days. Additionally, 266 (52.8%) cases were found positive in the first three days. Among cases with potential source classified (n=475), 290 (61.1%) had a relative/acquaintance/neighbour and 98 (20.6%) had a COVID-19 positive contact at the workplace. In the first two weeks of the epidemic, consecutively 62.5% and 17.1% of the cases were hospital staff and this diminished to 8.7% at the end of the 11th week. The case fatality rate was 4.5% (27/595). Conclusions: Public health staff in university hospitals can contribute to COVID-19 surveillance, exposure investigation and contact tracing procedures normally done by the staff of the ministry. Besides a contribution to surveillance and outbreak control, this work also enables an experience to public health specialisation students.

Keywords

• Pandemics
• epidemics
• infectious disease outbreaks
• surveillance
• communicable disease contact tracing

References

1. WHO. Advice on the use of masks in the context of COVID-19: Interim guidance, 5 June 2020. COVID-19: Infection prevention and control / WASH [online]. Erişim:https://www.who.int/publications/i/item/advice-on-the-use-of-masks-in-the-community-during-home-care-and-in-healthcare-settings-in-the-context-of-the-novel-coronavirus-(2019-ncov)-outbreak. Erişim tarihi: 11 Haziran 2020.
2. Demirtaş T, Tekiner H. Filiation: A historical term the COVID-19 outbreak recalled in Turkey. Erciyes Med J 2020; 42(0) [online]. Erişim: https://avesis.erciyes.edu.tr/yayin/b8b1187e-f11b-4e88-9252-28ce963230b6/filiation-a-historical-term-the-covid-19-outbreak-recalled-in-turkey. Erişim tarihi: 4 Haziran 2020.
3. Durusoy R, Kantar M. Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi’nde bulaşıcı hastalık bildirimlerini geliştirmek için laboratuvar tanılarının kullanımı ve bulaşıcı hastalıklar bildirim komitesinin rolü. Ege Tıp Dergisi. 2009;48(2): 109-118.
4. Wang J, Zhou M, Liu F. Reasons for healthcare workers becoming infected with novel coronavirus disease 2019 (COVID-19) in China. J Hosp Infect. 2020;105(1):100-101.
5. Zhan M, Qin Y, Xue X, Zhu S. Death from Covid-19 of 23 Health care workers in China. N Engl J Med 2020;382(23):2267-2268.
6. Akın L. Bulaşıcı Hastalıkların Kontrolü In: Güler Ç., Akın L. Halk Sağlığı Temel Bilgiler, Hacettepe Üniversitesi Yayınları, 2006.
7. Sağlık Bakanlığı Halk Sağlığı Genel Müdürlüğü. COVID-19 genel bilgiler, epidemiyoloji ve tanı [online]. https://covid19bilgi.saglik.gov.tr/depo/rehberler/covid-19-rehberi/COVID-19_REHBERI_GENEL_BILGILER_EPIDEMIYOLOJI_VE_TANI.pdf (Güncellenme Tarihi 1 Haziran 2020).
8. European Centre for Disease Prevention and Control. Contact tracing: public health management of persons, including healthcare workers, having had contact with COVID-19 cases in the European Union – second update. 8 April 2020 [online]. Erişim:https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/Contact-tracing-Public-health-management-persons-including-healthcare-workers-having-had-contact-with-COVID-19-cases-in-the-European-Union%E2%80%93second-update_0.pdf. Erişim tarihi 17 Temmuz 2020.

9. Sağlık Bakanlığı. 2019 Yeni Koronavirus enfeksiyonu (COVID-19) vaka bilgi formu [online]. Erişim: https://covid19bilgi.saglik.gov.tr/depo/formlar/COVID-19_VAKA_BILGI_FORMU_v2.2_1.pdf Erişim tarihi 17 Temmuz 2020.
10. Sağlık Bakanlığı. COVID-19 (Yeni Coronavirus Hastalığı) - Temaslı inceleme formu [online]. https://covid19bilgi.saglik.gov.tr/depo/formlar/COVID-19_temasli_izlem_formu.xlsx Erişim tarihi 17 Temmuz 2020.
11. TC Sağlık Bakanlığı. COVID-19 teması olan sağlık çalışanlarının değerlendirilmesi. (Güncellenme Tarihi: 09.04.2020) [online]. Erişim:https://covid19bilgi.saglik.gov.tr/depo/tedavi/COVID19-TemasiOlanSaglikCalisanlarininDegerlendirilmesi.pdf. Erişim tarihi 17 Temmuz 2020.
12. TC Sağlık Bakanlığı Halk Sağlığı Genel Müdürlüğü. Temaslı takibi, salgın yönetimi, evde hasta izlemi ve filiasyon. (Güncellenme Tarihi 1 Haziran 2020), Ankara [online]. https://covid19bilgi.saglik.gov.tr/depo/rehberler/covid-19-rehberi/COVID-19_REHBERI_TEMASLI_TAKIBI_EVDE_HASTA_IZLEMI_VE_FILYASYON.pdf. Erişim tarihi 17 Temmuz 2020.
13. Worldometers. COVID-19 Coronavirus pandemic updates [online]. Erişim:https://www.worldometers.info/coronavirus Erişim tarihi: 11 Haziran 2020.
14. Li Y, Yao L, Li J, et al. Stability issues of RT-PCR testing of SARS-CoV-2 for hospitalized patients clinically diagnosed with COVID-19. J Med Virol. 2020;92:903–908. https://doi.org/10.1002/jmv.25786.
15. Pollán M, Pérez-Gómez B, Pastor-Barriuso R ve ark. Prevalence of SARS-CoV-2 in Spain (ENE-COVID): a nationwide, population-based seroepidemiological study. Lancet 2020;S0140-6736(20)31483-5.
16. Bulut C, Kato Y. Epidemiology of COVID-19. Turk J Med Sci 2020;50:563-570.
17. Wiersinga WJ, Rhodes A, Cheng AC, Peacock SJ, Prescott HC. Pathophysiology, transmission, diagnosis, and treatment of Coronavirus Disease 2019 (COVID-19): A review. JAMA 2020. Online ahead of print doi: 10.1001/jama.2020.12839. Erişim tarihi 17 Temmuz 2020.
18. Jones NK, Rivett L, Sparkes D ve ark. Effective control of SARS-CoV-2 transmission between healthcare workers during a period of diminished community prevalence of COVID-19. Elife 2020;9:e59391. 19. Rivett L, Sridhar S, Sparkes D ve ark. Screening of healthcare workers for SARS-CoV-2 highlights the role of asymptomatic carriage in COVID-19 transmission. Elife 2020;11;9:e58728.
19. Jeon YW, Park ES, Jung SJ, Kim Y, Choi JY, Kim HC. Protection of healthcare workers against COVID-19 at a large teaching hospital in Seoul, Korea. Yonsei Med J 2020 Jul;61(7):631-634.
20. Jin Y, Yang H, Ji W ve ark. Virology, epidemiology, pathogenesis, and control of COVID-19. Viruses 2020;12, 372.