Asmada (Vitis vinifera L.) Klasik Melezleme Sonucu Elde Edilmiş F1 Genotiplerinin SSR Metodu ile Ebeveyn Tayini

Year 2018, Volume: 5 Issue: 3, 348 - 354, 26.07.2018

Atilla Çakır , Gökhan Söylemezoğlu

https://doi.org/10.30910/turkjans.448391

Cited By: 1

Abstract

Araştırmada
Karadimrit ve Boğazkere üzüm çeşitleri ana ebeveyn, 1103 P ve 140 Ru Amerikan
asma anaçları da baba ebeveyn olarak kullanılmıştır. Melezleme sonucu elde
edilmiş olan F1genotipleri bitkiye dönüşümü sağlandıktan sonra amaca yönelik
olarak seçilmiş genotiplerde ebeveyn tayini yapılmıştır. Ebeveyn tayininde,
Avrupa Birliği Araştırma Projesince (GENRES 081), Avrupa’daki asma çeşit
koleksiyonları için kullanılan ve artık tüm dünya tarafından minimum standart
set (core set) olarak kabul gören VVMD27, VrZAG79, VrZAG62. VVMD5, VVS2 ve VVMD7
mikrosatelik lokusları olmak üzere toplam 6 SSR primeri kullanılmıştır. Seçilen F1 genotiplerin (M1, M2, M3, M4) SSR lokuslarında ebeveynlere
ait alleller olup olmadığı karşılaştırılmıştır. Karşılaştırma sonucunda F1
genotiplerinden yapılan karışımlardaki (M1, M2, M3, M4) SSR lokuslarında
ebeveynlere ait alleller bulunmuştur. Elde edilen sonuçlar doğrultusunda
yapılan melezleme çalışmasında doğru programın uygulanmış olduğunun ispatlanmış
olması çok büyük önem arz etmektedir. Ayrıca bu alanda yapılmış ilk
çalışmalardan biri olması da söz konusu çalışmanın önemini biraz daha ileriye
götürmektedir. Klasik melezleme ile mokeküler biyoteknolojinin birlikte
kullanılmış olması, bundan sonra yapılacak benzer çalışmalara ışık tutabilmesi
umut edilmektedir.

Keywords

Vitis vinifera L., melezleme, F1, SSR.

Parental Reassortment of F1 Genotypes Obtained in Asma (Vitis vinifera L.) Classical Hybridization Outcome by SSR Method

Abstract

In the study,
Karadimrit and Boğazkere grape cultivars were used as the maternal lines and
1103 P, 140 Ru American rootstocks as the paternal lines. After hybridization,
the F1 genotypes obtained from the plant transformation were subjected to
parental designation in selected genotypes for the purpose. In the Parental
Assignment, European Union Research Project (GENRES 081), a total of 6,
including VVMD27, VrZAG79, VrZAG62, VVMD5, VVS2 and VVMD7 microsatellite loci,
which are now used as the minimum standard set by the whole world for the collection
of grape varieties in Europe, SSR (simple
sequence repeats)primer was used. The
selected F1 genotypes (M1, M2, M3, M4)
were compared in SSR loci whether they were parental alleles. As a
result, parental alleles were found in SSR loci (M1, M2, M3, M4) in mixtures
made from F1 genotypes. It is very important that the correct program has been
proven to be applied in the cross-breeding study in the direction of the
obtained results. Besides being one of the first
studies made in this area, it takes the importance of studying a bit further.
It is hoped that classical hybridization and molecular biotechnology can be
used together to illuminate similar work to be done thereafter.

Keywords

Vitis vinifera L., hybridization, F1, SSR.

References

• Adams, L.T. 1979. A Practical Ampelography Grapevine Identification. ISBN: 0-8014-1240-4, Cornell Univ. USA, 245 p.
• Ağaoğlu, Y.S. 1999. Bilimsel ve Uygulamalı Bağcılık (Asma Biyolojisi). Kavaklıdere Eğitim Yayınları, No: 1, Ankara. 205 s.
• Ağaoğlu, Y. S., Marasalı, B., Ergül, A. 1998. Asma ıslahında son gelişmeler. IV. Bağcılık Sempozyumu, 20-23 Ekim, Yalova, s. 9-16.
• Ağaoğlu, Y. S., Söylemezoğlu, G., Ergül, A., Çalışkan, M. 1995. Ülkemizde yetiştirilen bazı sofralık üzüm çeşitlerinin izoenzim bantlarından yararlanılarak elektroforez tekniği ile tanımlanmaları. Türkiye II. Bahçe Bitkileri Ulusal Kongresi. Cilt II, 3-6 Ekim, Adana, s. 567-571.
• Anonim 1990b. Standart Üzüm Çeşitleri Kataloğu. T.C. Tarım ve Köyişleri Bakanlığı, Mesleki Yayınlar Serisi, 15. Ankara. 91 s. Anonim, 2007. Tekirdağ Bağcılık Araştırma Enstitüsü (Yazılı Görüşme).
• Aras, Ö. 2006. Üzüm ve Üzüm Ürünlerinin Toplam Karbonhidrat, Protein, Mineral Madde ve Fenolojik Bileşik İçeriklerinin Belirlenmesi (Yüksek Lisans Tezi). Süleyman Demirel Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bahçe Bitkileri A.B.D., 58 s.
• Arroyo-Garcia, R., Ruiz-Garcia, L., Boulling, L., Ocete, R., López, M.A., Arnold, C., Ergul, A., Söylemezoğlu, G., Uzun, H. İ., Cabello, F, Ibáñez, J., Aradhya, M.K., Atanassov, A., Atanassov, I., Balint, S., Cenis, J.L., Costantini, L., Gorislavets, S., Grando, M.S., Klein, B. Y., McGovern, P., Merdinoglu, D., Pejic, I., Pelsy, F., Primikirios, N., Risovannaya, V., Roubelakis-Angelakis, K.A., Snouss, H., Sotiri, P., Tamhankar, S., This, P., Troshin, L., Malpica, J.M., Lefort, F., Martinez-Zapater, J.M. 2006. Genetic evidence for the existence of independent domestication events in grapevine. Molecular Ecology, 15(12): 3707-3714.
• Brookfield, J.F.Y. 1996. A simple new method for estimating null allele frequency from heterozygote deficiency. Mos. Ecol., 5: 453-455. Bowers, J.E., Dangl, G. ., Vignani, R., Meredith, C.P. 1996. Isolation and characterization of new polymorphic simple sequence repeat loci in grape (Vitis vinifera L.). Genome, 39: 628-633.
• Çelik, H., Ağaoğlu, Y.S., Fidan, Y., Marasalı, B., Söylemezoğlu, G. 1998. Genel Bağcılık. Sun Fidan A. Ş. Mesleki Kitaplar Serisi: 1, Ankara.
• Çelik, S. 1998. Bağcılık (Ampeloji) Cilt I., Anadolu Matbaa Ambalaj San. ve Tic. Ltd. Şti., ISBN. 975-94530-0-2, Tekirdağ. 426 s. Çelik, S. 2006. Üzüm Çeşit Kataloğu. Sunfidan A.Ş. Mesleki Kitaplar Serisi: 3. 165 s.
• Ergül, A. 1992. Bağcılıkta Melezleme Islahı. Yüksek Lisans Semineri. Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Bahçe Bitkileri A.B.D., Ankara, 92 s.
• Ergül, A. 2000. Asmalarda (Vitis vinifera L. cv) Genomik DNA Parmak İzi Analizi ile Moleküler Karakterizasyon. Doktora Tezi. Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Bahçe Bitkileri A.B.D., 86 s.
• Ergül, A., Ağaoğlu, Y.S. 2001. Molecular similarity analysis of some grapevine rootstocks from different nursery in Turkey. J. Agric. Sci., 7: 141-143.
• Ergül, A., Kazan, K., Aras, S., Çevik, V., Çelik, H., Söylemezoğlu, G. 2006. AFLP analysis of genetic variation within the two economically important grapevine (Vitis vinifera L.) varietal groups. Genome, 49(5): 467-475.
• Fidan, Y. 1985. Özel Bağcılık. Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Yayınları 930, Ders Kitabı No: 265. 401 s.
• Lefort, F., Lally, M., Thompson, D., Douglas, G.C. 1998. Morphological traits microsatellite fingerprinting and genetic relatedness of a stand of elite oaks (Q. robur L.) at Tuallynally, Ireland. Silvae Genetica 47: 5-6.
• Lodhi, MA., Guang-Ning Ye, Norman, F., Weeden B., Reisch, I. 1994. A simple and efficient method for DNA extraction from grapevine cultivars, Vitis species and Ampelopsis. Plant Molecular Biology Reporter, 12(1): 6-13.
• McGovern, P.E. 2003. Ancient Wine: The Search for the Origins of Viticulture. Princeton University Press, Princeto, New Jersey.
• Minch, E., Ruiz-Linares, A., Goldstein, D.B., Feldman, M., Cavalli-Sforza, L.L. 1995. Microsat (Version 1.4d): A Computer Program for Calculating Various Statistics on Microsatellite Allele Data. Stanford. California, University of Stanford.
• Nei, M. 1987. Molecular Evolutionary Genetics. Columbia University Pres, Newyork. 106-107 p.
• Paetkau, D., Calvert, W., Stirling., I., Strobeck, C. 1995. Microsatellite analysis of population structure in Canadian polar bears. Mol. Ecol., 4: 347-354 p.
• Sefc, K.M., Regner, F., Turetschek, E., Glössl, J., Steinkellner, H. 1999. Identification of microsatellite sequences in Vitis riparia and their applicability for genotyping of different Vitis species. Genome, 42: 367-373.
• Thomas, M.R., Scott, N.S. 1993. Microsatellite repeats in grapevine reveal DNA polymorphisms when analysed as sequence-tagged sites (STSs). Theor. Appl. Genet., 86: 985-990.
• Wegner, H.W., Sefc., K.M. 1999. IDENTITY 1.0. Centre for Applied Genetics. University of Agricultural Science, Vienna.