Determination of Olive Knot Disease (Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi) in Olive Production Areas of Hatay Province

Year 2020, Volume: 7 Issue: 1, 96 - 103, 25.01.2020

Senem Filiz Doksöz İ. Adem Bozkurt

https://doi.org/10.30910/turkjans.680020

Cited By: 2

Abstract

Olive knot disease caused by Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi (Psv) is one of the most important problems in olive production areas of Hatay province. The disease causes full drying of young seedlings in intensive infections. The aim of this study was to determine the prevalence and incidence of olive knot disease in Hatay province. The highest prevalence rate of the disease was determined in Samandağ, İskenderun and Arsuz districts with 90% and no disease was detected in Hassa, Kırıkhan, Reyhanlı and Kumlu districts. In other districts, the prevalence of the disease was found to be between 15% and 50%. The incidence of the disease in infected gardens varied between 4.5-75%. The pathogenic bacteria isolated from fresh knots was identified by Gram stain, LOPAT (Levan, Oxidase, Potato pectolytic activity, Arginine dehydrolase, Tobacco hypersensitive reaction), MALDI-TOF and molecular techniques. All strains were determined as gram negative, levan negative, oxidase negative, pectolytic activity negative, arginine dehydrolase negative, but tobacco hypersensitivity reaction was positive. According to the test results, a total of 14 isolates were identified as Pseudomonas savastanoi pv savastanoi. Pathogenicity tests were performed with 14 strains and a reference strain (Ayvalık1). All isolates caused knot formation on one-year-old olive seedling (cv. Gemlik).

Keywords

Olive knot, Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi

Hatay İli Zeytin Üretim Alanlarında Zeytin Dal Kanseri (Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi) Hastalığının Belirlenmesi

Abstract

Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi (Psv)’nin neden olduğu zeytin dal kanseri hastalığı Hatay ili zeytin üretim alanlarındaki en önemli problemlerden birisidir. Hastalık yoğun enfeksiyonlarda özellikle genç fidanların tamamen kurumasına neden olmaktadır. Bu çalışma ile Hatay bölgesi zeytin üretim alanlarında zeytin dal kanseri hastalığının yaygınlık ve bulunma oranları belirlenmiştir. Hastalığın en yüksek yaygınlık oranı %90 ile Samandağ, İskenderun ve Arsuz ilçelerinde belirlenmiş olup, Hassa, Kırıkhan, Reyhanlı ve Kumlu ilçelilerinde ise hastalık saptanmamıştır. Diğer ilçelerde ise hastalığın %15 ile %50 arasında yaygınlık gösterdiği tespit edilmiştir. Hastalığın enfekteli bahçelerdeki bulunma oranları ise %4.5-75 arasında değişiklik göstermiştir. Taze urlardan izole edilen hastalık etmeninin tanısı Gram boyama, LOPAT (Levan oluşumu, Oksidaz, Patates yumuşak çürüklük testi, Arginin dehidrolaz, Tütün aşırı duyarlılık) testleri, MALDI-TOF ve moleküler yöntemler ile yapılmıştır. Yapılan testler sonucu toplam 14 izolat Pseudomonas savastanoi pv savastanoi olarak tanılanmıştır. Patojenisite testlerinde tüm izolatlar ve Ayvalık1 referans izolatı 1 yıllık Gemlik zeytin fidanlarında hastalığın tipik belirtisi olan urlara neden olmuştur.

Keywords

Zeytin dal kanseri, Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi

References

• Anonim, 2017. (https://www.tarimorman.gov.tr) (Erişim Tarihi: 20.05.2019).
• Azad, H.R., Cooksey, D.A. 1995. A semiselective medium for detecting epiphytic and systemic populations of Pseudomonas savastanoi from oleander. Phytopathology 85, 740–5.
• Azeri, T. 1993. Research on olive leaf spot, olive knot and Verticillium wilt of olive in Turkey. EPPO Bulletin 23: 437-440.
• Basim, H., Ersoy, A. 2000. Batı Akdeniz Bölgesinde zeytin ağaçlarında Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi tarafından oluşturulan bakteriyel dal kanseri hastalığının yayılışı ve hastalık etmeninin tanısı. Türkiye 1. Zeytincilik Sempozyumu 310-315. 6-9 Haziran 2000, Bursa.
• Bozkurt, A., Soylu, S., Mirik, M., Ulubas Serce, C., Baysal, Ö. 2014. Characterization of bacterial knot disease caused by Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi on pomegranate (Punica granatum L.) trees: A new host of the pathogen. Letters in Applied Microbiology 59 (5):520–27.
• Caballo-Ponce, E., Murillo, J., Martínez-Gil, M., Moreno-Pérez, A., Pintado, A., Ramos, C,. Knots untie: molecular determinants involved in knot formation induced by Pseudomonas savastanoi in woody hosts. Front Plant Sci. 2017;8:1089.
• Bradbury, J.F. 1986. Guide to the Plant Pathogenic Bacteria. CAB International Mycological Institute, Kew, UK.
• Dara, R. 2010. Sofralara Geldi Bahar Baharatlar- Kokulu Otlar Yerel ve Evrensel Tatlar. İstanbul: Yapı Kredi Yayınları.
• Eltlbany. N, Prokscha. Z-Z, Castaneda-Ojeda. MP, Krögerrecklenfort, E., Heuer, H., Wohanka, W., Ramos, C., Smalla, K. 2012. A new bacterial disease on Mandevilla sanderi, caused by Pseudomonas savastanoi: Lessons learned for bacterial diversity studies. Appl Environ Microbiol 78:8492–8497.
• FAOSTAT, 2018. http://www.fao.org/faostat/en/#data/QC (Erişim tarihi:25.09.2019).
• Fernandes, A., Marcelo, M. 2002. A possible synergistic effect of Erwinia sp. on the development of olive knot symptoms caused by Pseudomonas syringae pv. savastanoi in Olea europaea. Acta Horticulture 586, 729–31.
• Hehn, V. 2000. Zeytin Üzüm ve İncir- Kültür Tarihi ve Eskizleri. çev. Necati Aça Ankara: Dost Kitabevi Yayınları.
• Iacobellis, N S., Caponero, A., Evidente, A. 1998. Characterization of Pseudomonas syringae subsp. savastanoi strains isolated from ash. Plant Pathology, 47: 73-78. Janse, JD. 1981. The bacterial disease of ash (Fraxinus excelsior) caused by Pseudomonas syringae subsp. savastanoi pv. fraxini. II. Etiplogy and taxanomic considerations. Eur. J. For. Pathol., 11: 425-438.
• Kaplan, M., Arıhan, K. Seda. (2012). “Antik Çağdan Günümüze Bir Şifa Kaynağı: Zeytin ve Zeytinyağının Halk Tıbbında Kullanımı”, Ankara Üniversitesi Dil ve Tarih-Coğrafya Fakültesi Dergisi 52:2, 41-56.
• Koch, R. 1884. Die Aetiologie der Tuberkulose. Mitt Kaiser Gesundh. 2, 1–88. (Google Scholar).
• Leliott, R. A., Stead, D. E. 1987. Diagnostic procedures for bacterial plant diseases In: Methods for the diagnosis of bacterial diseases of plants. p:58-59. Blackwell Scientific Publications.
• Marchi, G., Sisto, A., Cimmino, A., Andolfi, A., Cipriani, M.G., Evidente, A., Surico, G. 2006. Interaction between Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi and Pantoea agglomerans in olive knots. Plant Pathology 55: 61.
• Mirik, M., Aysan, Y., Cinar, O., Sahin, F. 2004. Türkiye’de çeşitli bitkilerden izole edilen Pseudomonas savastanoi izolatlarınınn fenotipik karakterizasyonu. Türkiye 1. Bitki Koruma Kongresi 139. 8-10 Eylül 2004, Samsun.
• Mirik, M., Aysan, Y., Sahin, F. 2011. Characterization of Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi strains isolated from several host plants in Turkey and report of fontanesia as a new host. Journal of Plant Pathology Vol. 93, No. 2, 263-270.
• Mirik, M., Aysan, Y. 2011. Marmara Bölgesinde Zeytin Dal Kanseri Hastalığının Yaygınlığı ve Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi İzolatlarının Fenotipik ve Genotipik Karakterizasyonu. Tarım Bilimleri Dergisi, 17: 279-290.
• Mirik, M., Aysan, Y., Soylu, S. 2019. Zeytin Dal Kanseri, Nar Dal Kanseri, Bacterial Knot Diseases, Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi. Alınmıştır: Bitki Bakteri Hastalıkları, (ed) Saygılı, H., Aysan, Y., Şahin, F., Soylu, S., Mirik, M., 113-115.
• Pavlovic, M., Konrad, R., Iwobi, A.N., Sing, A., Busch, U., and Huber, I., 2012. A dual approach employing MALDI-TOF MS and real-time PCR for fast species identification within the Enterobacter cloacae complex. FEMS Microbiology Letters 328: 46-53.
• Penyalver, R., Garcia, A., Ferrer, A., Bertolini, E., Lopez, M. M. 2000. Detection of Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi in olive plants by enrichment and PCR. Applied and Environmental Microbiology 66:2673-2677.
• Quesada, J.M., García, A., Bertolini, E., López, M.M., and Penyalver, R. 2007. Recovery of Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi from symptomless shoots of naturally infected olive trees. Int Microbiol 10: 77– 84.
• Schaad, N. W., Jones, J. B., Lacy, G. H. 2001. Gram negative bacteria, Pseudomonas. p: 84-117. In:Laboratory Guide for Identification of Plant Pathogenic Bacteria (Third Edition). APS Press. St. Paul, Minnesota.
• Servi, D. 2009. Aydın İlinde Zeytin Dal Kanseri (Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi)’nin Yaygınlığının Belirlenmesi ve PCR ile Tanısı. Selçuk Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Yüksek Lisans Tezi, 105 s.
• Sivri, N. 2012. Kahramanmaraş, Gaziantep ve Kilis İllerindeki Zeytin Üretim alanlarında Görülen Zeytin Dal Kanseri Hastalığı Etmeni Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi Tanılanması. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Yüksek Lisans Tezi, 89s.
• Surico, G., Lavermicocca, P, 1989. A semiselective medium for the isolation of Pseudomonas syringae pv. savastanoi.Phytopathology 79,185–90.
• Tatli, B., Benlioglu, K. 2004. Aydın ve Muğla illeri zeytin alanlarında zeytin ağacı uru hastalığı (Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi) üzerine çalışmalar. Türkiye 1. Bitki Koruma Kongresi. 147. 8-10 Eylül 2004, Samsun.
• Tegli, S., Cerboneschi, M., Marsili, I., Libelli, I.M., Santilli, E. 2010. Development of a versatile tool for the simultaneous differential detection of Pseudomonas savastanoi pathovars by End Point and Real-Time PCR. BMC Microbiology 10:156-169.
• TUİK, 2018. https://biruni.tuik.gov.tr/medas/?kn=92&locale=tr (Erişim tarihi:12.02.2018).