Yatan Hastaların Kan Örneklerinden İzole Edilen Staphylococcus Spp. Bakterilerin Antibiyotik Dirençliliği

Year 2021, Volume: 14 Issue: 2, 144 - 152, 30.08.2021

Osman Oruç , İbrahim Seyfettin Çelik , Nazan Çömlekcioğlu , Ashabil Aygan

https://doi.org/10.52976/vansaglik.820328

Cited By: 1

Abstract

Amaç: Bakteremi veya septisemi vakalarında kan kültüründe mikroorganizmaların teşhisi ve antibiyotik direnç/duyarlılıklarının tespiti tedavi için çok önemlidir. 2015 Ocak-Aralık ayları arasında laboratuvara gelen kan kültürü örneklerinden izole edilen bakterilerden Staphylococ suşlarının teşhisi ve antibiyotik direnç profillerinin belirlenmesi amaçlanmıştır.
Materyal ve Metot: Mikrobiyoloji Laboratuvarına gelen kan örneklerinden Staphylococcus aureus ve koagülaz negatif Stahylococcus izolasyonları ‘BD Columbia 5% Koyun Kanlı Agar’ (Becton Dickinson, ABD), BD EMB (Eosin Methylene Blue) Agar ve BD Çikolata Agar (Kan Agarı No. 2) besiyerleri ile identifikasyonlar Vitek®2 ID Cards (Biomeriux, France) ve katalaz-koagülaz PYR testleri ile tamamlanmıştır. Antibiyotik duyarlılık testleri manuel olarak Bioanalyse® AST (Bioanalyse, Türkiye) disk difüzyon testlerinin yanı sıra Vitek®2 AST Card (Biomeriux, France) sistemleri kullanılarak yapılmıştır. Antimikrobiyal hassasiyetlerin belirlenmesi ‘Clinical and Laboratory Standards Institute’ (CLSI) kriterlerine göre değerlendirilmiştir.
Bulgular: Farklı kan örneklerinden izole edilen 265 bakteri suşundan 161 gram pozitif bakteri (%60,5) izolatı araştırma kapsamına alınmıştır. Bunlardan 135’i Koagulaz Negatif Staphylococcus (KNS) (%50,4), 13’ü Staphylococcus aureus (%4,9) olarak belirlenmiştir. 122 KNS suşunun metisiline (%90,4) dirençli olduğu (MRKNS), S.aureus’ların ise 8 inin (%61,5) MRSA olduğu gözlenmiştir. KNS suşlarında sadece linezolid ve daptomisine karşı bir direnç gözlenmezken S.aureus suşlarında gentamisin, teikoplanin, vancomisin, tigesilin ve fusidik asite karşı direnç saptanmamıştır.
Sonuç: Antibiyotikler gibi toksik maddelere karşı yüksek adaptasyon gösterebilen bakterilerin tedavi öncesi direnç profillerinin belirlenmesi antibiyotik tedavi stratejilerinin planlanması için faydalı olacaktır.

Keywords

Bakteremi, Kan kültürü, Staphylococcus aureus, Koagülaz negatif Staphylococcus, Antibiyotik direnç

Supporting Institution

KSÜ BAP

Project Number

2016/3-23 YLS

Thanks

Çalışma esnasında yardım ve maddi ve manevi desteklerini sunan K.Maraş Necip Fazıl Hastanesi Mikrobiyoloji çalışanlarına ve KSU BAP birimine teşekkür ederiz. (BAP 2016/3-23 YLS).

Antibiotic Resistance Determination of Staphylococcus Spp. Isolated From Blood Samples of Inpatients

Abstract

Aim: Isolation and antibiotic resistance/ sensitivity determination of bacterial agents from blood samples is very important in the case of bacteremia or septicemia. In this study, it was aimed to isolate and determine anti-biotic resistance profiles of Staphylococcus strains sent to microbiology laboratory between January-December 2015.
Materials and Methods: Isolation of Staphylococcus aureus and Coagulase Negative Stahylococcus (CoNS) isola-tions were carried out on Columbia Agar (5% sheep blood), Eosin Methylene Blue (EMB) Agar and Chocolate Agar (Blood Agar No 2 media and identifications were completed with conventional bacteriological methods and Vitek®2 ID Cards (Biomeriux, France). Antibiotic susceptibility tests were practiced with Vitek®2 AST Card (Biomeriux, France) system. Evaluation of antibiotic susceptibilities were performed using the criteria of Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI).
Results: A total of 161 (60,5 %) strains out of 265 bacterial isolates from different blood cultures were determined as Gram positive. Among these bacteria, 135 and 13 strains were identified as CoNS (50,4%), S. aureus (4,9%), respectively. In terms of methicillin resistance, 122 of CoNS (90,4%) strains and 8 of S. aureus (61,5 %) were re-sistant. Although there was no resistance to linezolide and daptomycine among CoNS, gentamicine, teicopla-nin, vancomicin, tigecycline and fusidic asid resistance were not detected among S. aureus.
Conclusion: In this study, antibiotic resistance of CoNS were observed higher than that of S. aureus. It was tho-ught that determining the resistance profiles of bacterial agents causing infection in hospitalized patients would be useful for planning for antibiotic treatment strategies.

Keywords

Bacteremia, Blood culture, Staphylococcus aureus, Coagulase negative Staphylococcus, Antibiotic resistance

Project Number

2016/3-23 YLS

References

• Arıdoğan A. Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarının Antibiyotiklere Dirençleri. Turk mikrobiyol Cem Derg. 2004; 34: 20-23.
• Aydın N, Gültekin B, Eyigör M, Gürel M. Klinik Örneklerden İzole Edilen Stafilokokların Antibiyotik Direnci. ADÜ Tıp Fak Derg. 2001; 2(3): 21-26. Barros EM, Ceotto H, Bastos MCF, Dos Santos KRN, Giambiagi-Demarval M. Staphylococcus haemolyticus as an important hospital pathogen and carrier of methicillin resistance genes. J clin microbiol. 2012; 50(1): 166-168. doi:10.1128/JCM.05563-11
• Berkiten R. Antibiyotik Direncinin Bölgelere Göre farklılığı. ANKEM derg. 1988; 2(3): 193-202.
• Bockstael K, Aerschot A. Antimicrobial resistance in bacteria. Open Medicine. 2009; 4(2): 141-155. doi:10.2478/s11536-008-0088-9
• Büyükbaba Ö, Nakipoğlu Y, Katrancı H, Derbentli Ş, Gürler N. S.aureus Suşlarında Çeşitli Antibiyotiklere ve Klorheksidine Direnç. ANKEM Derg. 1998; 12(1): 70-76.
• Cengiz M. Bakterilerde Kinolon Direncinin Genetiği. Uludag Univ J Fac Vet Med. 2010; 29 (1): 55-60.
• Çopur-Çiçek A, Şentürk-Köksal Z, Ertürk A, Köksal E. Rize 82. Yıl Devlet Hastanesi’nde bir yıllık sürede kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotiklere duyarlılıkları Türk HijDen Biyol Derg. 2011; 68(4): 175-184 doi:10.5505/TurkHijyen.2011.66588
• Davies J, Davies D. Origins and evolution of antibiotic resistance. Microbiol Mol Biol Rev. 2010; 74(3): 417-433. doi:10.1128/MMBR.00016-10 Davis B, Ginsberg H, Dulbecco R, Eisen H. Microbiology.4th Ed. Philadelphia: J.B.Lippincott Company; 1990.
• De Vecchi EGD, Romanò CL, Pregliasco FE, Mattina R, Drago L. Antibiotic sensitivities of coagulase-negative staphylococci and Staphylococcus aureus in hip and knee periprosthetic joint infections: does this differ if patients meet the International Consensus Meeting. Criteria Infect Drug Resist. 2018; 11: 539–546 doi:10.2147/IDR.S151271
• Doğan Ö, Yalınay-Çırak M, Engin D,Türet S. Klinik Örneklerden İzole Edilen Stafilokoklarda Metisilin Direnci ve Çeşitli Antibiyotiklere İnvitro Duyarlılıkları. ANKEM Derg. 2005; 19(1):39-42.
• Ekşi F, Balcı İ, Gayyurhan ED, Çekem G. Klinik Örneklerden Soyutlanan Staphylococcus aureus suşlarının Metisilin Direncinin Belirlenmesi. İnf Derg. 2007; 21(1): 27-31.
• Garg A, Anupurba S, Garg J, Goyal R, Sen M. Bacteriological Profile and Antimicrobial Resistance of Blood Culture Isolates from a University Hospital Journal Indian Academy Clin Med. 2007; 8(2): 139-143.
• Güler İ, Kılıç H, Atalay MA, Perçin D, Erçal BD. Metisilin dirençli Staphylococcus aureus suşlarının antibiyotiklere in-vitro duyarlılıkları. Dicle Med J. 2011; 38(4):466-470.
• Gürler N, Kaygusuz A, Karayay S, Töreci K. Methicillin Resistant Staphylococci Isolated From Pus Since 1992 and Aminoglycoside and Quinolone Resistance in These Strain. ANKEM Derg. 1997; 11(1):9-13.
• Karchmer AW. Nosocomial Bloodstream Infections: Organisms, Risk Factors, and Implications. Clin Inf Dis. 2000; 31(4): 139-143. doi:10.1086/314078
• Köksal-Çakırlar F, Uyar Y, Özdemir S, Barış A, Gözün-Şaylan E, Habip Z ve ark. 2011-2014 yılları arasında kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antimikrobiyal direnç durumları. Turk Hij Den Biyol Derg. 2017; 74(1):55-70. doi:10.5505/TurkHijyen.2016.04809
• Madhavan HN, Murali S. Mechanism of development of antibiotic resistance in bacteria among clinical specimens. J Clin Biomed Sci. 2011; 1(2):42-48.
• Özkaya E, Tümer S, Kirişçi Ö, Çalışkan A,Erdoğmuş P. Son iki yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesi’nde kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi. Turk Hij Den Biyol Derg. 2015; 72(2):115-122. doi: 10.5505/TurkHijyen.2015.49260
• Şahin İ, Çalışkan E, Öztürk E, Yavuz MT, Albayrak HT, Karadağ G ve ark. Distribution Of Microorganisms In Blood Culture And Antimicrobial Susceptibility. Düzce Tıp Derg. 2013; 15(2): 11-15.
• Şanlı K. Hastane Kökenli ve Toplum Kaynaklı Staphylococcus aureus Suşlarının Çeşitli Antimikrobiyallere Duyarlılıkları. İKSSTD. 2020; 12(2):188-193.
• Sörberg M, Farra A, Ransjö U, Gardlund B, Rylander M, Settergren B et al. Different trends in antibiotic resistance rates at a university teaching hospital. Clin Microbiol Infection. 2003; 9(5): 388-396. doi:https://doi.org/10.1046/j.1469-0691.2003.00545.x
• Venezia RA, Domaracki BE, Evans AM, PrestonKE, Graffunder EM. Selection of high level oxacillin resistance in heteroresistant Staphylococcus aureus by fluoroquinolone exposure. J Antimic Chemotherapy. 2001; 48:375-381.
• Verhoef J, Schmitz FJ. Staphylococci and the micrococaceae. In J. C. D Armstrong (Ed.), Infectious Diseases (1 ed., Vol. 8-13). London: Mosby-Harcourt Publishers Ltd, 1999.
• WHO. Antimicrobial resistance: global report on surveillance 2014 (ISBN 978 92 4 156474 8). https://www.who.int/antimicrobial-resistance/publications/surveillancereport/en/ 03.09.2020.
• Wisplinghoff H, Bischoff T, Tallent SM, Seifert H, Wenzel RP,Edmond MB. Nosocomial Bloodstream Infections in US Hospitals: Analysis of 24,179 Cases from a Prospective Nationwide Surveillance Stud. Clin Inf Dis. 2004; 39(3):309-317.
• Yiğit N, Aktaş AE, Doğruman-Al F, Ayyıldız A. Kan kültürlerinden izole edilen koagülaz negatif stafilokokların tiplendirilmesi ve metisilin direnci. Turk Hij Den Biyol Derg. 2008; 65(2): 61-66.
• Yılmaz S, Gümral R, Güney M, Bedir O, Duyan S, Üsküdar Güçlü A ve ark. İki yıllık dönemde kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkların değerlendirilmesi. Gülhane Tıp Derg. 2013; 55(4):247-252. doi:10.5455/gulhane.2424