Assessment of genetic diversity in Aegilops species in North-West of Iran using ISSR marker

Volume: 23 Number: 2 June 1, 2013
  • A. JAM Baranduzı
  • O. Sofalıan
  • R. ASGHARI Zakarıa
  • A. Asgharı
  • M. Shokrpour
EN TR

Assessment of genetic diversity in Aegilops species in North-West of Iran using ISSR marker

Öz

Basit tekrarlı diziler arası polimorfizm (ISSR) ve ASİT-PAGE analizleri İran'ın Kuzey-Batı Aegilops türlerinin akrabalık ilişkileri ve genetik çeşitliliğini değerlendirmek için kullanılmıştır. Altı adet Aegilops türüne [Ae. taucshii (D), Ae. cylindrica (CD), Ae. umbellulata (U), Ae. triuncialis (UC), Ae. biuncialis (UM) ve Ae. crassa (DM)] ait otuz üç aksesyon ISSR çalışmasında kullanılmıştır. Aksesyonlardan on iki tanesi ASİT-PAGE çalışmalarına dahil edilmiştir. On bir adet ISSR primerinden elde edilen 171 adet polimorfik ISSR bandı dendrogramlar oluşturmak için kullanılmıştır. ISSR yönteminde, üzerinde çalışılan Aegilops türleri alt gruplara ayrılmıştır ve ortak genoma sahip türlerin aynı gruplar içerisinde yer aldığı belirlenmiştir. ASİT-PAGE analizi Aegilops aksesyonları içerisinde yüksek oranda polimorfizmi ortaya çıkarmıştır. Bu nedenle, sonuçlar İran'ın Kuzey-Batı Aegilops türleri içerisinde potansiyel bir genetik çeşitlilik olduğunu ve herhangi bir ıslah yaklaşımında bunların yararlı genetik stok olabileceklerini göstermiştir Özellikle, tür içi özel genetik çeşitlilik herhangi bir seleksiyon faaliyetleri için uygun genetik tabanı olabilecektir.

Anahtar Kelimeler

References

  1. Boyko E, Kalendar R, Korzun V, Fellers J, Korol A, Schulman AH, Gill BS (2002). A high-density cytogenetic map of the Aegilops tauschii genome incorporating retrotransposons and defenserelated genes: insights into cereal chromosome structure and function. Plant Molecular Biology. 48: 767–790.
  2. Chhuneja P, Kaur S, Goel RK, Aghaee-Sarbarzeh M, Dhaliwal HS (2007). Introgression of leaf rust and stripe rust resistance genes from Aegilops umbellulata to hexaploid wheat through induced homoeologous pairing. In: Buck HT, Nisi JE, Salomon N (eds) Wheat production in stressed environments. Springer, Doerdrecht, Netherlands. pp. 83–90.
  3. Ciaffi M, Lanfiandra D, Porceddu E, Benedettelli S (1993). Storage protein variation in wild emmer (triticum turgidum ssp. dicoccoides) from Jordan and Turkey. 1. Electrophoretic characterization of genotypes. Theoretical and Applied Genetics. 86: 474-480.
  4. Ciaffi M, Lanfiandra D, Porceddu E, Benedettelli S (1993). Storage protein variation in wild emmer (triticum turgidum ssp. dicoccoides) from Jordan and Turkey. 2. Patterns of allele distribution. Theoretical and Applied Genetics. 86: 518-525.
  5. Gong, HY, Liu AH, Wang JB (2006). Genomic evolutionary changes in Aegilops allopolyploids revealed by ISSR markers. Acta Phytotaxonomica Sinica. 44: 286–295.
  6. Hajjar R, Hodgkin T (2007). The use of wild relatives in crop improvement: A survey of developments over the last 20 years. Euphytica. 156:1-13.
  7. Ki-Hyun K, Abuhena MK, Kwang-Hyun S, Jong-Soon C, Hwa-Young H, Sun-Hee W (2010). Largescale proteome investigation in wild relatives (A, B and genomes) of wheat. Acta Phytotaxonomica Sinica. 10 (1093):1-8
  8. Konstantinos G, Penelope J (2010). Genetic diversity of Greek Aegilops species using different types of nuclear genome markers. Molcular Phylogenetics and Evolution. Elsevier. 56: 951-961.

Details

Primary Language

Turkish

Subjects

-

Journal Section

-

Authors

A. JAM Baranduzı This is me

O. Sofalıan This is me

R. ASGHARI Zakarıa This is me

A. Asgharı This is me

M. Shokrpour This is me

Publication Date

June 1, 2013

Submission Date

July 10, 2014

Acceptance Date

-

Published in Issue

Year 2013 Volume: 23 Number: 2

APA
Baranduzı, A. J., Sofalıan, O., Zakarıa, R. A., Asgharı, A., & Shokrpour, M. (2013). Assessment of genetic diversity in Aegilops species in North-West of Iran using ISSR marker. Yuzuncu Yıl University Journal of Agricultural Sciences, 23(2), 66-75. https://izlik.org/JA48CA67XH
Creative Commons License
Yuzuncu Yil University Journal of Agricultural Sciences by Van Yuzuncu Yil University Faculty of Agriculture is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.