MEME KANSERİ SINIFLANDIRMASI İÇİN VERİ FÜZYONU VE GENETİK ALGORİTMA TABANLI GEN SEÇİMİ

Cilt: 27 Sayı: 3 19 Şubat 2013
  • Oktay Yıldız
  • Mesut Tez
  • H. Şakir Bilge
  • M. Ali Akcayol
  • İnan Güler
PDF İndir
TR

MEME KANSERİ SINIFLANDIRMASI İÇİN VERİ FÜZYONU VE GENETİK ALGORİTMA TABANLI GEN SEÇİMİ

Öz

Ciddi rahatsızlıklardan biri olan meme kanserinin erken teşhis edilmesi hastalığın tedavisinde önemli rol oynar. Bu çalışmada meme kanseri hastalığında etkin rol oynayan genlerin belirlenmesi için veri füzyonu ve genetik algoritma tabanlı yeni bir nitelik seçme metodu önerilmektedir. Yapılan çalışma iki aşamadan oluşmaktadır: İlk aşamada filtreleme yöntemi ile gen ifade verisi indirgenmiş, ikinci aşamada genetik algoritma ile meme kanserinde etkin rol alan genlerin tespiti gerçekleştirilmiştir. Destek vektör makinesi, genetik algoritma için uygunluk fonksiyonu olarak kullanılmıştır. Yapılan çalışmada belirlenen 10 gen ile sınıflandırma doğruluk oranı %94,65 elde edilmiştir.

Anahtar Kelimeler

Kaynakça

  1. Segal, E.,Wang, H. ve Koller, D., “Discovering Molecular Pathways From Protein Interaction And Gene Expression Data”, Bioinformatics, Cilt 19, 264-272, 2003.
  2. Hedenfalk, I., Duggan, D., Chen, Y., Radmacher, M., Bittner, M., Simon, R., Meltzer, P., Gusterson, B., Esteller, M., Kallioniemi, O.P., Wilfond, B., Borg, A., Trent, J., “Gene-Expression Profiles in Hereditary Breast Cancer”, The New England Journal of Medicine, Cilt 344, 539-548, 2001.
  3. van de Vijver, M.J, He, Y.D., van't Veer, L.J., Dai, H., Hart, A.A., Voskuil, D.W., Schreiber, G.J., Peterse, J.L., Roberts, C., Marton, M.J., Parrish, M., Atsma, D., Witteveen, A., Glas, A., Delahaye, L., van der Velde, T., Bartelink, H., Rodenhuis, S., Rutgers, E.T., Friend, S.H., Bernards, R., “A Gene-Expression Signature As A Predictor Of Survival In Breast Cancer”, The
  4. New England Journal of Medicine, Cilt 347, 1999-2009, 2002.
  5. Peng, Y., Wu, Z., Jiang, J., “A Novel Feature Selection Approach For Biomedical Data Classification”, Journal of Biomedical Informatics, Cilt 43, 15-23, 2010.
  6. Alon, U., Barkai, N., Notterman, D. A., Gish, K., Ybarra, S., Mack, D. ve Levine, A. J., “Broad Patterns Of Gene Expression Revealed By Clustering Analysis Of Tumor And Normal Colon Tissues Probed By Oligonucleotide Arrays”, Cell Biology, Cilt 96, 6745-6750, 1999.
  7. Dudoit, S., Fridlyand, J ve Speed, T., P., “Comparison of Discrimination Methods for the Classification of Tumors Using Gene Expression Data”, American Statistical Association, Cilt 97, 77-87, 2002.
  8. Horng, J.T., Wub, L.C., Liu, B.J., Kuo, J.L., Kuo, W.H., Zhang, J.J., "An Expert System To Classify Microarray Gene Expression Data Using Gene Selection By Decision Tree", Expert Systems with Applications, Cilt 36, 9072-9081, 2009.

Ayrıntılar

Birincil Dil

Türkçe

Konular

-

Bölüm

-

Yazarlar

Oktay Yıldız Bu kişi benim

H. Şakir Bilge Bu kişi benim

M. Ali Akcayol Bu kişi benim

İnan Güler Bu kişi benim

Yayımlanma Tarihi

19 Şubat 2013

Gönderilme Tarihi

19 Şubat 2013

Kabul Tarihi

-

Yayımlandığı Sayı

Yıl 2012 Cilt: 27 Sayı: 3

Kaynak Göster

APA
Yıldız, O., Tez, M., Bilge, H. Ş., Akcayol, M. A., & Güler, İ. (2013). MEME KANSERİ SINIFLANDIRMASI İÇİN VERİ FÜZYONU VE GENETİK ALGORİTMA TABANLI GEN SEÇİMİ. Gazi Üniversitesi Mühendislik Mimarlık Fakültesi Dergisi, 27(3). https://izlik.org/JA27AJ23SF
AMA
1.Yıldız O, Tez M, Bilge HŞ, Akcayol MA, Güler İ. MEME KANSERİ SINIFLANDIRMASI İÇİN VERİ FÜZYONU VE GENETİK ALGORİTMA TABANLI GEN SEÇİMİ. GUMMFD. 2013;27(3). https://izlik.org/JA27AJ23SF
Chicago
Yıldız, Oktay, Mesut Tez, H. Şakir Bilge, M. Ali Akcayol, ve İnan Güler. 2013. “MEME KANSERİ SINIFLANDIRMASI İÇİN VERİ FÜZYONU VE GENETİK ALGORİTMA TABANLI GEN SEÇİMİ”. Gazi Üniversitesi Mühendislik Mimarlık Fakültesi Dergisi 27 (3). https://izlik.org/JA27AJ23SF.
EndNote
Yıldız O, Tez M, Bilge HŞ, Akcayol MA, Güler İ (01 Mart 2013) MEME KANSERİ SINIFLANDIRMASI İÇİN VERİ FÜZYONU VE GENETİK ALGORİTMA TABANLI GEN SEÇİMİ. Gazi Üniversitesi Mühendislik Mimarlık Fakültesi Dergisi 27 3
IEEE
[1]O. Yıldız, M. Tez, H. Ş. Bilge, M. A. Akcayol, ve İ. Güler, “MEME KANSERİ SINIFLANDIRMASI İÇİN VERİ FÜZYONU VE GENETİK ALGORİTMA TABANLI GEN SEÇİMİ”, GUMMFD, c. 27, sy 3, Mar. 2013, [çevrimiçi]. Erişim adresi: https://izlik.org/JA27AJ23SF
ISNAD
Yıldız, Oktay - Tez, Mesut - Bilge, H. Şakir - Akcayol, M. Ali - Güler, İnan. “MEME KANSERİ SINIFLANDIRMASI İÇİN VERİ FÜZYONU VE GENETİK ALGORİTMA TABANLI GEN SEÇİMİ”. Gazi Üniversitesi Mühendislik Mimarlık Fakültesi Dergisi 27/3 (01 Mart 2013). https://izlik.org/JA27AJ23SF.
JAMA
1.Yıldız O, Tez M, Bilge HŞ, Akcayol MA, Güler İ. MEME KANSERİ SINIFLANDIRMASI İÇİN VERİ FÜZYONU VE GENETİK ALGORİTMA TABANLI GEN SEÇİMİ. GUMMFD. 2013;27. Available at https://izlik.org/JA27AJ23SF.
MLA
Yıldız, Oktay, vd. “MEME KANSERİ SINIFLANDIRMASI İÇİN VERİ FÜZYONU VE GENETİK ALGORİTMA TABANLI GEN SEÇİMİ”. Gazi Üniversitesi Mühendislik Mimarlık Fakültesi Dergisi, c. 27, sy 3, Mart 2013, https://izlik.org/JA27AJ23SF.
Vancouver
1.Oktay Yıldız, Mesut Tez, H. Şakir Bilge, M. Ali Akcayol, İnan Güler. MEME KANSERİ SINIFLANDIRMASI İÇİN VERİ FÜZYONU VE GENETİK ALGORİTMA TABANLI GEN SEÇİMİ. GUMMFD [Internet]. 01 Mart 2013;27(3). Erişim adresi: https://izlik.org/JA27AJ23SF