Derleme
BibTex RIS Kaynak Göster

Moleküler Araştırmalara Uygun Popülasyon Geliştirme

Yıl 2001, Cilt: 14 Sayı: 2, 85 - 90, 02.12.2001

Öz

Bu çalışmada moleküler genetik araştırmalarda kullanılan çeşitli populasyon tipleri tanıtılarak değerlendirilmiştir. Bu amaçla kullanılan dört farklı populasyondan söz edilebilir. Bunlar; yakın izogenik hatlar, F2 populasyonu, double-haploidler ve rekombinant inbred populasyonlardır. Moleküler genetik araştırmalarda kullanılan yakın izogenik hatlar, rekombinant inbredler ve F2 populasyonları homozigot ebeveynlerin melezlenmesiyle elde edilmektedir. Ancak kendilemenin mümkün olmadığı bazı bitki türlerinde çok nadir olmakla birlikte bu populasyonlar heterozigot bireylerin melezlenmesiyle de elde edilebilir. Double-haploid populasyonlar ise, çoğunlukla anter kültürü kullanılarak tek bir polen tanesinden genomun ikiye katlanması sonucunda elde edilmektedir. Her bir populasyon tipinin zayıf veya güçlü tarafları, bunların moleküler genetik çalışmalarda seçilmelerinde önemli rol oynamaktadır. Bu nedenle, araştırıcı bitki cinsine ve araştırdığı özelliğe ve hatta elindeki mevcut şartlara bağlı olarak uygun bir populasyon belirlemeli, gerekirse birden fazla populasyon kullanarak sonuca gitmelidir.

Kaynakça

  • Cloutier, S., Cappadocia, M. and Landry, B.S. 1995. Study of microspore-culture responsiveness in oilseed rape (Brassica napus L.) by comparative mapping of a F2 population and two microspore-derived populations. Theor Appl Genet, 91: 841-847.
  • Emiroğlu, Ü. 1982. Haploidi ve bitki ıslahında önemi. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Yayınları, No 450, Bornova, İzmir.
  • Ercan, N. Ve Boyacı F. 1997. Haploidi ve bitki ıslahında önemi. Akd. Univ. Zir. Fak. Derg., 10: 381-390.
  • Hormoza, J.I., Dollo, L. and Polito, V.S. 1994. Identification of a RAPD marker linked to sex determination in Pistacia vera using bulked segregant analysis. Theor Appl Genet, 89: 9-13.
  • Kochert, G. 1994. RFLP technology. In: DNA-Based Markers in Plants. Eds: Ronald L. Philips and Andra K. Vasil, pp. 9-37, Netherlands.
  • Koester, R.P., Sisco, P.H. and Stuber, C.W. 1993. Identification of quantitative trait loci controlling days to flowering and plant height in two near isogenic lines of maize. Crop Sci., 33: 1209-1216.
  • Kornberg, A. 1960. Biologic synthesis of deoxyribonucleic acid. Science, 138: 1503-1508.
  • Mahe, A., Bannerot, H. and Grisvard, J. 1995. Construction of near-isogenic lines to investigate the efficiency of different resistance genes to anthracnose. Theor Appl Genet, 90: 859-864.
  • Michelmore, R.W., Paran, I. and Kesseli, R.V. 1991. Identification of markers linked to disease-resistance genes by bulked segregant analysis: A rapid method to detect markers in specific genomic regions by using segregating populations. Proc Natl Acad Sci, 88: 9828-9832.
  • Miklas, P.N., Stavely, J.R. and Kelly, J.D. 1993. Identification and potential use of a molecular marker for rust resistance in common bean. Theor Appl Genet, 85: 745-749.
  • Onus, A.N. 1996. Bitki ıslahında DNA markerlerinin kullanımı. Akd. Univ. Zir. Fak. Derg., 9: 322-333.
  • Page, D., Delclos, B., Aubert, G., Bonavent, J.F. and Mousset-Declas, C. 1997. Sclerotinia rot resistance in red clover: Identification of RAPD markers using bulked segregant analysis. Plant Breeding, 116: 73-78.
  • Paterson, A.H. 1996. Making genetic maps. In: Genome Mapping in Plants. Ed: Andrew H. Paterson, pp. 23-39, Texas, USA.
  • Poulsen, D.M.E., Henry, R.J., Johnston, R.P., Irwin, J.A.G. and Rees, R.G. 1995. The use of bulk segregant analysis to identify a RAPD marker linked to leaf rust resistance in barley. Theor Appl Genet, 91: 270-273.
  • Wang, G.L. and Paterson, A.H. 1994. Assesment of DNA pooling strategies for mapping of QTLs. Theor Appl Genet, 88: 355-361.
  • Watson, J.D. and Crick, F.H.C. 1953. Molecular structure of nucleic acids. Nature, 171: 737-738.
  • Welsh, J. and McClelland, M. 1990. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers. Nucleic Acids Research, 18: 7213-7218.
  • Williams, J.G.K., Kubelik, A.R., Livak, K.J., Rafalski, J.A. and Tingey, S.V. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Research, 18: 6531-6535.
  • Vos, P., Hogers, R., Bleeker, M., Reijans, M., Lee, T.V.D., Hornes, M., Frijters, A., Pot, J., Peleman, J., Kuiper, M. and Zabeau, M. AFLP: a new technique for DNA fingerprinting. Nucleic Acids Research, 23: 4407-4414.
  • Zabeau, M. and Vos, P. 1993. Selective restriction fragment amplification: a general method for DNA fingerprinting. European Patent Application, Application number, 92402629.7, publication number 0 534 858 A1.

Population Development For Molecular Studies

Yıl 2001, Cilt: 14 Sayı: 2, 85 - 90, 02.12.2001

Öz

In this study, several types of plant populations used in molecular genetic research were described and evaluated. There are four different types of populations suited for this objective i.e., near isogenic lines, F2 populations, double-haploid populations and recombinant inbred lines. Near isogenic lines, F2 populations and recombinant inbreds have been derived from crosses between homozygous parents. However, several plant species which are intolerant to inbreeding must rely on crosses between heterozygous individuals. Double-haploids are basically obtained by regenarating plants from single pollen grains, and inducing chromosome doubling. Unique strenghts and/or weaknesses of the each population type play an important role for performing molecular genetic research. Therefore, researcher should select a suitable population based on plant species, trait interested, and facilities available. It is also regarded that more than one population may be used to get targetted result when necessary.

Kaynakça

  • Cloutier, S., Cappadocia, M. and Landry, B.S. 1995. Study of microspore-culture responsiveness in oilseed rape (Brassica napus L.) by comparative mapping of a F2 population and two microspore-derived populations. Theor Appl Genet, 91: 841-847.
  • Emiroğlu, Ü. 1982. Haploidi ve bitki ıslahında önemi. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Yayınları, No 450, Bornova, İzmir.
  • Ercan, N. Ve Boyacı F. 1997. Haploidi ve bitki ıslahında önemi. Akd. Univ. Zir. Fak. Derg., 10: 381-390.
  • Hormoza, J.I., Dollo, L. and Polito, V.S. 1994. Identification of a RAPD marker linked to sex determination in Pistacia vera using bulked segregant analysis. Theor Appl Genet, 89: 9-13.
  • Kochert, G. 1994. RFLP technology. In: DNA-Based Markers in Plants. Eds: Ronald L. Philips and Andra K. Vasil, pp. 9-37, Netherlands.
  • Koester, R.P., Sisco, P.H. and Stuber, C.W. 1993. Identification of quantitative trait loci controlling days to flowering and plant height in two near isogenic lines of maize. Crop Sci., 33: 1209-1216.
  • Kornberg, A. 1960. Biologic synthesis of deoxyribonucleic acid. Science, 138: 1503-1508.
  • Mahe, A., Bannerot, H. and Grisvard, J. 1995. Construction of near-isogenic lines to investigate the efficiency of different resistance genes to anthracnose. Theor Appl Genet, 90: 859-864.
  • Michelmore, R.W., Paran, I. and Kesseli, R.V. 1991. Identification of markers linked to disease-resistance genes by bulked segregant analysis: A rapid method to detect markers in specific genomic regions by using segregating populations. Proc Natl Acad Sci, 88: 9828-9832.
  • Miklas, P.N., Stavely, J.R. and Kelly, J.D. 1993. Identification and potential use of a molecular marker for rust resistance in common bean. Theor Appl Genet, 85: 745-749.
  • Onus, A.N. 1996. Bitki ıslahında DNA markerlerinin kullanımı. Akd. Univ. Zir. Fak. Derg., 9: 322-333.
  • Page, D., Delclos, B., Aubert, G., Bonavent, J.F. and Mousset-Declas, C. 1997. Sclerotinia rot resistance in red clover: Identification of RAPD markers using bulked segregant analysis. Plant Breeding, 116: 73-78.
  • Paterson, A.H. 1996. Making genetic maps. In: Genome Mapping in Plants. Ed: Andrew H. Paterson, pp. 23-39, Texas, USA.
  • Poulsen, D.M.E., Henry, R.J., Johnston, R.P., Irwin, J.A.G. and Rees, R.G. 1995. The use of bulk segregant analysis to identify a RAPD marker linked to leaf rust resistance in barley. Theor Appl Genet, 91: 270-273.
  • Wang, G.L. and Paterson, A.H. 1994. Assesment of DNA pooling strategies for mapping of QTLs. Theor Appl Genet, 88: 355-361.
  • Watson, J.D. and Crick, F.H.C. 1953. Molecular structure of nucleic acids. Nature, 171: 737-738.
  • Welsh, J. and McClelland, M. 1990. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers. Nucleic Acids Research, 18: 7213-7218.
  • Williams, J.G.K., Kubelik, A.R., Livak, K.J., Rafalski, J.A. and Tingey, S.V. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Research, 18: 6531-6535.
  • Vos, P., Hogers, R., Bleeker, M., Reijans, M., Lee, T.V.D., Hornes, M., Frijters, A., Pot, J., Peleman, J., Kuiper, M. and Zabeau, M. AFLP: a new technique for DNA fingerprinting. Nucleic Acids Research, 23: 4407-4414.
  • Zabeau, M. and Vos, P. 1993. Selective restriction fragment amplification: a general method for DNA fingerprinting. European Patent Application, Application number, 92402629.7, publication number 0 534 858 A1.
Toplam 20 adet kaynakça vardır.

Ayrıntılar

Birincil Dil Türkçe
Bölüm Makaleler
Yazarlar

Bülent Uzun Bu kişi benim

M. İlhan Çağırgan Bu kişi benim

Yayımlanma Tarihi 2 Aralık 2001
Yayımlandığı Sayı Yıl 2001 Cilt: 14 Sayı: 2

Kaynak Göster

APA Uzun, B., & Çağırgan, M. İ. (2001). Moleküler Araştırmalara Uygun Popülasyon Geliştirme. Akdeniz University Journal of the Faculty of Agriculture, 14(2), 85-90.
AMA Uzun B, Çağırgan Mİ. Moleküler Araştırmalara Uygun Popülasyon Geliştirme. Akdeniz University Journal of the Faculty of Agriculture. Aralık 2001;14(2):85-90.
Chicago Uzun, Bülent, ve M. İlhan Çağırgan. “Moleküler Araştırmalara Uygun Popülasyon Geliştirme”. Akdeniz University Journal of the Faculty of Agriculture 14, sy. 2 (Aralık 2001): 85-90.
EndNote Uzun B, Çağırgan Mİ (01 Aralık 2001) Moleküler Araştırmalara Uygun Popülasyon Geliştirme. Akdeniz University Journal of the Faculty of Agriculture 14 2 85–90.
IEEE B. Uzun ve M. İ. Çağırgan, “Moleküler Araştırmalara Uygun Popülasyon Geliştirme”, Akdeniz University Journal of the Faculty of Agriculture, c. 14, sy. 2, ss. 85–90, 2001.
ISNAD Uzun, Bülent - Çağırgan, M. İlhan. “Moleküler Araştırmalara Uygun Popülasyon Geliştirme”. Akdeniz University Journal of the Faculty of Agriculture 14/2 (Aralık 2001), 85-90.
JAMA Uzun B, Çağırgan Mİ. Moleküler Araştırmalara Uygun Popülasyon Geliştirme. Akdeniz University Journal of the Faculty of Agriculture. 2001;14:85–90.
MLA Uzun, Bülent ve M. İlhan Çağırgan. “Moleküler Araştırmalara Uygun Popülasyon Geliştirme”. Akdeniz University Journal of the Faculty of Agriculture, c. 14, sy. 2, 2001, ss. 85-90.
Vancouver Uzun B, Çağırgan Mİ. Moleküler Araştırmalara Uygun Popülasyon Geliştirme. Akdeniz University Journal of the Faculty of Agriculture. 2001;14(2):85-90.