Derleme

Tanısal Mikrobiyolojide Altın Standart Testin Yokluğunda Gizli Sınıf Analizinin Kullanımı

Cilt: 25 Sayı: 4 31 Aralık 2016
Gül Bayram Abiha Abiha , E. Arzu Kanık
PDF İndir
EN TR

Usage of Latent Class Analysis in Diagnostic Microbiology in the Absence of Gold Standard Test

Öz

The evaluation of performance of various tests diagnostic tests in the absence of gold standard is an important problem. Latent class analysis (LCA) is a statistical analysis method known for many years, especially in the absence of a gold standard for evaluation of diagnostic tests so that LCA has found its wide application area. During the last decade, LCA method has widely used in for determining sensivity and specifity of different microbiological tests. It has investigated in the diagnosis of mycobacterium tuberculosis, mycobacterium bovis, human papilloma virus, bordetella pertussis, influenza viruses, hepatitis E virus (HEV), hepatitis C virus (HCV) and other various viral infections. Researchers have compared several diagnostic tests for the diagnosis of different pathogens with LCA. We aimed to evaluate performance of latent class analysis method used microbiological diagnosis in various diseases in several researches. When we took into account all of these tests’ results, we suppose that LCA is a good statistical analysis method to assess different test performances in the absence of gold standard.


Anahtar Kelimeler

Diagnostic tests,infection,nucleic acid amplification techniques

Kaynakça

  1. Guatto R, Seegers H, Taurel AF, Joly A, Beaudeau F. Prevelance of Coxiella burnetii infection in domestic ruminants: a critical review. Vet Microbiol. 2011;149:1-16.
  2. Rabenau HF, Kessler HH, Kortenbusch M, Steinhorst A, Raggam RB, Berger A: Verification and validation of diagnostic laboratory tests in clinical virology. J Clin Virol. 2007;40:93-8.
  3. Qu YS, Tan M, Kutner MH: Random effects models in latent class analysis for evaluating accuracy of diagnostic tests. Biometrics. 1996; 52:797-810.
  4. Pepe MS, Janes H. Insights into latent class analysis of diagnostic test performance. Biostatistics. 2007;8:474-84.
  5. Strizich G, Gammon MD, Jacobson JS, Wall M, Abrahamson P, Bradshaw PT et al. Latent class analysis suggests four distinct classes of complementary medicine users among women with breast cancer. BMC Complement Altern Med. 2015;15:1-10.
  6. Broonsvoort BMC, Wissmann B, Fevre EM, Handel IG, Picozzi K, Welburn SC. No gold standard estimation of the sensitivity and specificity of two molecular diagnostic protocols for Trypanosoma brucei spp. in Western Kenya. Plos one. 2010;5:1-8.
  7. Carter RL, Kang L, Darcy KM, Kauderer J, Liao SY, Rodgers WH et al. A modified Latent Class Model assessment of human papillomavirus-based screening tests for cervical lesions in women with atypical glandular cells: a Gynecologic Oncology Group study. Cancer Causes Control.
  8. Erdoğan S, Temel GO. Altın standart testin olmadığı durumda tanı testlerinin performanslarının değerlendirilmesi. Düzce Tıp Fakültesi Dergisi. 2014;16:58-62.
  9. Bloomfield MG, Balm MND, Blackmore TK. Molecular testing for viral and bacterial enteric pathogens:gold standard for viruses, don’t let culture go just yet? Pathology. 2015;47:227-33.
  10. Hadgu A, Dendukuri N, Hilden J. Evaluation of nucleic acid amplification tests in the absence of a perfect gold-standard test. Epidemiology. 2005;16:604-12.

Kaynak Göster

APA
Abiha, G. B. A., & Kanık, E. A. (2016). Tanısal Mikrobiyolojide Altın Standart Testin Yokluğunda Gizli Sınıf Analizinin Kullanımı. Arşiv Kaynak Tarama Dergisi, 25(4), 467-488. https://doi.org/10.17827/aktd.253560
AMA
1.Abiha GBA, Kanık EA. Tanısal Mikrobiyolojide Altın Standart Testin Yokluğunda Gizli Sınıf Analizinin Kullanımı. aktd. 2016;25(4):467-488. doi:10.17827/aktd.253560
Chicago
Abiha, Gül Bayram Abiha, ve E. Arzu Kanık. 2016. “Tanısal Mikrobiyolojide Altın Standart Testin Yokluğunda Gizli Sınıf Analizinin Kullanımı”. Arşiv Kaynak Tarama Dergisi 25 (4): 467-88. https://doi.org/10.17827/aktd.253560.
EndNote
Abiha GBA, Kanık EA (01 Aralık 2016) Tanısal Mikrobiyolojide Altın Standart Testin Yokluğunda Gizli Sınıf Analizinin Kullanımı. Arşiv Kaynak Tarama Dergisi 25 4 467–488.
IEEE
[1]G. B. A. Abiha ve E. A. Kanık, “Tanısal Mikrobiyolojide Altın Standart Testin Yokluğunda Gizli Sınıf Analizinin Kullanımı”, aktd, c. 25, sy 4, ss. 467–488, Ara. 2016, doi: 10.17827/aktd.253560.
ISNAD
Abiha, Gül Bayram Abiha - Kanık, E. Arzu. “Tanısal Mikrobiyolojide Altın Standart Testin Yokluğunda Gizli Sınıf Analizinin Kullanımı”. Arşiv Kaynak Tarama Dergisi 25/4 (01 Aralık 2016): 467-488. https://doi.org/10.17827/aktd.253560.
JAMA
1.Abiha GBA, Kanık EA. Tanısal Mikrobiyolojide Altın Standart Testin Yokluğunda Gizli Sınıf Analizinin Kullanımı. aktd. 2016;25:467–488.
MLA
Abiha, Gül Bayram Abiha, ve E. Arzu Kanık. “Tanısal Mikrobiyolojide Altın Standart Testin Yokluğunda Gizli Sınıf Analizinin Kullanımı”. Arşiv Kaynak Tarama Dergisi, c. 25, sy 4, Aralık 2016, ss. 467-88, doi:10.17827/aktd.253560.
Vancouver
1.Gül Bayram Abiha Abiha, E. Arzu Kanık. Tanısal Mikrobiyolojide Altın Standart Testin Yokluğunda Gizli Sınıf Analizinin Kullanımı. aktd. 01 Aralık 2016;25(4):467-88. doi:10.17827/aktd.253560