Sistem Biyolojisi
Öz
Sistem biyolojisi, klasik biyolojideki indirgemeci yaklaşımın aksine, canlıların genler, proteinler ve biyokimyasal tepkimelerin etkileşen ve bütünleşmiş ağ yapısı olarak algılanarak girift şekilde incelenmesini amaçlayan çok yeni ve çok disiplinli bir bilim dalıdır. Bu bilim dalı moleküler biyoloji, genetik, biyokimya vb. bilim dallarında olduğu gibi tek tek proteinlerin, genlerin ya da belirli bir metabolizmaya ait yolağının incelenmesi yerine tüm parçaların bir bütünün parçaları olduğunu ve etkileşerek çalıştığını kabul eden bütünleştirici yeni bir yaklaşımı benimsemektedir. Bu bilim dalı genomik, transkriptomik, proteomik, metabolomik, glikomik, interaktomik, fluksomik ve biyoinformatiğin birleşiminden oluşur. Bu disiplinlerden elde ettiği verileri matematiksel modellere dökerek gözlemsel kabul edilen biyolojiyi sayısallaştırır ve bu sayede bilgisayarlar yardımıyla canlı sistem modelleri yaratarak tüm sistem hakkında bilgi edinir.
Anahtar Kelimeler
Kaynakça
- Kitano H. Systems biology: a brief overview. Science, 2002; 295 (5560):1662-4.
- Http://www.systemsbiology.org/Intro_to_ISB_and_Systems_Biology/Systems_Biology_--_the_21st_Century_Science. Erişim Tarihi:29.03.2009
- Http://epa.gov/osa/spc/pdfs/genomics.pdf. Erişim Tarihi:29.03.2009
- Subramanian A, Tamayo P, Mootha VK et al. Gene set enrichment analysis: a knowledgebased approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proc Natl Acad Sci USA, 2005; 102(43): 15545-50.
- Wilkins MR, Pasquali C, Appel RD et al. From Proteins to Proteomes: Large Scale Protein Identification by Two-Dimensional Electrophoresis and Amino Acid Analysis. Nature Biotechnology, 1996; 14(1): 61–65.
- Bertalanffy VL. Der Organismus als physikalisches System betrachtet. Die Naturwissenschaften, 1940; 28: 521–531.
- Hodgkin AL, Huxley AF. A quantitative description of membrane current and its application to conduction and excitation in nerve. J Physiol, 1952; 117: 500–544.
- Noble D. Cardiac action and pacemaker potentials based on the Hodgkin-Huxley equations. Nature, 1960; 188: 495–497.
- Cairney CJ, Sanguinetti G, Ranghini E et al. A systems biology approach to Down syndrome: Identification of Notch/Wnt dysregulation in a model of stem cells aging, Biochim. Biophys. Acta, 2009, doi:10.1016/j.bbadis.2009.01.015
