Evaluation of Antibiotic Resistence and Rectal Screening Findings in Enterococci

Yıl 2026, Cilt: 40 Sayı: 1 , 16 - 24 , 30.04.2026

Burcu Yağci , Metin Doğan

https://doi.org/10.54962/ankemderg.1861421

https://izlik.org/JA49JZ99DS

Öz

Enterococci are clinically significant opportunistic pathogens due to their increasing frequency of isolation in hospital-acquired infections and their multidrug resistance characteristics. In this retrospective study, the distribution and antimicrobial resistance profiles of Enterococcus species isolated from various clinical samples, as well as vancomycin-resistant enterococcus (VRE) colonization detected in rectal swab screenings, were evaluated at the Necmettin Erbakan University Faculty of Medicine Hospital Medical Microbiology Laboratory between January 2023 and July 2025. A total of 4,295 Enterococcus spp. isolates were analyzed, with Enterococcus faecalis (54.1%) and Enterococcus faecium (44.7%) identified as the most frequently isolated species. The majority of isolates were recovered from urine (68.4%) and blood (17.7%) cultures. Regarding antimicrobial resistance, the lowest resistance rates were observed against linezolid (0.3%) and tigecycline (2.1%), whereas the highest resistance rates were detected against high-level gentamicin (61.4%) and ciprofloxacin (58.0%). E. faecium isolates exhibited significantly higher resistance rates to all tested antibiotics compared to E. faecalis(p<0.05). During the same period, VRE positivity was detected in 18.6% of the 5,713 rectal swab samples analyzed. Furthermore, VRE growth in clinical samples was observed in 17.3% of the patients who tested positive for VRE in rectal screening. The fact that clinical VRE positivity was most frequently detected in blood cultures (44.0%) indicates that rectal colonization is a significant risk factor for invasive infections. These findings indicate that the increasing antibiotic resistance in enterococcal infections must be closely monitored and that rectal VRE screening programs play a critical role in infection control and in guiding the selection of appropriate empirical treatment strategies

Anahtar Kelimeler

Antibiotic resistance , Enterococcus , Rectal screening , Surveillance , Vancomycin-resistant enterococci

Etik Beyan

This study was conducted with the approval of the Necmettin Erbakan University Ethics Committee for Non-Pharmaceutical and Non-Medical Device Research (Document date and number: 24.10.2025-2025/6083).

Destekleyen Kurum

No financial support was received for the study.

ENTEROKOKLARDA ANTİBİYOTİK DİRENCİ VE REKTAL TARAMA BULGULARININ DEĞERLENDİRİLMESİ

https://izlik.org/JA49JZ99DS

Öz

Enterokoklar, hastane kaynaklı enfeksiyonlarda giderek artan sıklıkta izole edilmeleri ve çoklu antibiyotik direnç özellikleri nedeniyle klinik açıdan önemli fırsatçı patojenlerdir. Bu retrospektif çalışmada, Ocak 2023–Temmuz 2025 tarihleri arasında Necmettin Erbakan Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’nda çeşitli klinik örneklerden izole edilen Enterococcus türlerinin dağılımı ve antimikrobiyal direnç profilleri ile aynı döneme ait rektal sürüntü taramalarında saptanan vankomisine dirençli enterokok (VRE) kolonizasyonu retrospektif olarak değerlendirilmiştir. Toplam 4.295 Enterococcus spp. izolatı incelenmiş olup, en sık izole edilen türler Enterococcus faecalis (%54.1) ve Enterococcus faecium (%44.7) olarak belirlenmiştir. İzolatların çoğu idrar (%68.4) ve kan (%17.7) kültürlerinden elde edilmiştir. Antimikrobiyal direnç açısından en düşük direnç linezolid (%0.3) ve tigesikline (%2.1), en yüksek direnç ise yüksek düzey gentamisin (%61.4) ve siprofloksasine (%58.0) karşı saptanmıştır. E. faecium izolatlarının tüm antibiyotiklere karşı E. faecalis’e kıyasla anlamlı derecede daha yüksek direnç gösterdiği belirlenmiştir (p<0.05). Aynı dönemde incelenen 5.713 rektal sürüntü örneğinin %18.6’sında VRE pozitifliği saptanmış, rektal taramada VRE pozitif bulunan hastaların %17.3’ünde klinik örneklerde de VRE üremesi gösterilmiştir. Klinik VRE pozitifliğinin en sık kan kültürlerinde saptanması (%44.0), rektal kolonizasyonun invaziv enfeksiyonlar açısından önemli bir risk faktörü olduğunu göstermektedir. Bu bulgular, enterokok enfeksiyonlarında artan antibiyotik direncinin yakından izlenmesi gerektiğini ve rektal VRE tarama programlarının enfeksiyon kontrolü ile uygun ampirik tedavi stratejilerinin belirlenmesinde kritik bir rol oynadığını ortaya koymaktadır.

Anahtar Kelimeler

Enterococcus , Rektal tarama , Sürveyans , Vankomisin dirençli enterokok , Antibiyotik direnci

Etik Beyan

Bu çalışma, Necmettin Erbakan Üniversitesi İlaç ve Tıbbi Cihaz Dışı Araştırmalar Etik Kurulu onayı ile gerçekleştirilmiştir (Evrak Tarih ve Sayısı: 24.10.2025-2025/6083).

Destekleyen Kurum

Çalışma için herhangi bir finansal destek alınmamıştır.

Kaynakça

• Alçi G, Güneşer D, Güner A, Karahasan A. Hastanede yatan hastalardan alınan rektal sürüntü örneklerinde vankomisine dirençli enterokok taranması: stratejik değerlendirme. ANKEM Derg. 2021;35(3):70-6. https://doi.org/10.54962/ankemderg.1048456
• Alevizakos M, Gaitanidis A, Nasioudis D, Tori K, Flokas ME, Mylonakis E. Colonization with vancomycin-resistant enterococci and risk for bloodstream infection among patients with malignancy: a systematic review and meta-analysis. Open Forum Infect Dis. 2017;4(1):ofw246. https://doi.org/10.1093/ofid/ofw246
• Altun B, Hazırolan G, Gur D. Antibiotic resistance of Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis (2010–2023). Klimik Derg. 2025;38(1):13–8. https://doi.org/10.36519/kd.2025.5110
• Atalay S, Ece G, Şamlioğlu P, et al. İzmir’de üçüncü basamak bir hastanede görülen vankomisine dirençli enterokok olgularının değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul. 2012;46(4):553-9.
• Bahçeci İ, Yıldız S, Şahin K. Enterococcus species isolated from urine cultures and antibiotic resistance rates. Life Med Sci. 2023;2(1):48-52. https://doi.org/10.54584/lms.2023.29
• Bilen S, Parlak M, Yakupoğulları Y, et al. Phenotypic and genotypic evaluation of vancomycin-resistant Enterococcus strains isolated from various clinical specimens. Turk Mikrobiyol Cem Derg. 2021;51(2):143-9. https://doi.org/10.5222/TMCD.2021.143
• Bilgin M, Görgün S, İşler H, Başbulut E. Evaluation of the distribution and antibiotic resistance profiles of Enterococcus species isolated from urine cultures. Turk Hij Den Biyol Dergisi. 2021;78(3):265-72. https://doi.org/10.5505/TurkHijyen.2021.86412
• Bilici D, Aktaş O, Özbek A, Bilici S. The investigation of the in vitro resistance to the antibiotics used in therapy of enterococci isolated from clinical specimens. Klimik Derg. 2015;26(3):102-7. https://doi.org/10.5152/kd.2015.09
• Binici İ, Karahocagil MK, Sünnetçioğlu M, Parlak M. The surveillance of colonisation of vancomycin resistant enterococci and investigation antibiotic susceptibility and risk factors. Van Med J. 2022;29(2):177-83.
• Boccella M, Santella B, Pagliano P, et al. Prevalence and antimicrobial resistance of Enterococcus species: a retrospective cohort study in Italy. Antibiotics (Basel). 2021;10(12):1552. https://doi.org/10.3390/antibiotics10121552
• Deshpande LM, Fritsche TR, Moet GJ, Biedenbach DJ, Jones RN. Antimicrobial resistance and molecular epidemiology of vancomycin-resistant enterococci from North America and Europe. Diagn Microbiol Infect Dis.2007;58(2):163-70. https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2006.12.022
• European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC). Antimicrobial resistance in the EU/EEA (EARS-Net). 2025. Available from: https://atlas.ecdc.europa.eu/
• Etiz P, Kibar F, Ekenoğlu Y, Yaman A. Evaluation of antibiotic resistance profiles of Enterococcus species isolated from urine cultures. Turk Mikrobiyol Cem Derg. 2014;44(3):107-13. https://doi.org/10.5222/TMCD.2014.107
• Fisher K, Phillips C. The ecology, epidemiology and virulence of Enterococcus. Microbiology. 2009;155(6):1749-57. https://doi.org/10.1099/mic.0.026385-0
• García-Solache M, Rice LB. The Enterococcus: a model of adaptability to its environment. Clin Microbiol Rev.2019;32(2):e00058-18. https://doi.org/10.1128/CMR.00058-18
• Giraffa G. Enterococci from foods. FEMS Microbiol Rev. 2002;26(2):163-71. https://doi.org/10.1111/j.1574-6976.2002.tb00608.x
• Güçkan UR, Elmas A, Tilgel S, et al. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik direnç oranları. Int J Basic Clin Med. 2013;1(2):74-7.
• Güzel G, Cebeci B, Ateş MG, Tuna A. Kırıkkale Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi’nde son bir yılda tespit edilen enterokok türleri ve antibiyotik dirençleri. Mediterr J Infect Microbes Antimicrob. 2025;14:356. https://doi.org/10.4274/mjima.galenos.2025.356
• Hendrix CW, Hammond JMJ, Swoboda SM, et al. Surveillance strategies and impact of vancomycin-resistant enterococcal colonization and infection in critically ill patients. Ann Surg.2001;233(2):259-65. https://doi.org/10.1097/00000658-200102000-00011
• İraz M, Ceylan A, Akkoyunlu Y. Antibiotic susceptibility of Enterococcus strains isolated from various clinical samples. ANKEM Derg. 2012;26(4):176-80. https://doi.org/10.5222/ankem.2012.176
• Karakosta P, Meletis G, Kousouli E, et al. Rectal colonization with multidrug-resistant organisms and risk for bloodstream infection among high-risk Greek patients. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2025;44(2):437-42. https://doi.org/10.1007/s10096-024-04756-6
• Kılbaş İ, Ciftci IH. Antimicrobial resistance of Enterococcus isolates in Turkey: a meta-analysis of current studies. J Glob Antimicrob Resist. 2018;12:26-30. https://doi.org/10.1016/j.jgar.2017.08.016
• Kutlu O, Arabacı Ç. Antibiotic susceptibility pattern of Enterococcus isolates in a five-year period at a tertiary care hospital. J Surg Med. 2019;3(9):644-7. https://doi.org/10.28982/josam.556973
• Mahajan M, Shinde R, Karande GS, Patil S. Prevalence of Enterococcus species in various clinical samples and their antimicrobial susceptibility pattern. Cureus. 2024;16(11):e72836. https://doi.org/10.7759/cureus.72836
• Mansur A, Gündüz A. Klinik örneklerden izole edilen Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium suşlarında antibiyotik dirençlerinin değerlendirilmesi: 8 yıllık analiz. J Med Top Updates. 2025;4(1):9-15.
• Meena S, Yadav M, Chouhan S, Sharma P, Goyal R. Revisiting nitrofurantoin for vancomycin resistant enterococci. J Clin Diagn Res. 2017;11(8):DC34-7. https://doi.org/10.7860/JCDR/2017/29334.10335
• Mullally CA, Fahriani M, Mowlaboccus S, Coombs GW. Non-faecium non-faecalis enterococci: a review of clinical manifestations, virulence factors, and antimicrobial resistance. Clin Microbiol Rev. 2024;37(2):e00041-22. https://doi.org/10.1128/cmr.00041-22
• Navidinia M. The clinical importance of emerging ESKAPE pathogens in nosocomial infections. J Paramed Sci.2016;7(3):e69236. https://doi.org/10.22037/jps.v7i3.69236
• Özseven AG, Sesli Çetin E, Cicioğlu Arıdoğan B, Çiftçi E, Özseven L. Antimicrobial susceptibility of enterococci isolated from various clinical specimens. ANKEM Derg. 2012;26(4):256-62.
• Özkan F, Coşkun MY. Evaluation of patients colonized with vancomycin-resistant enterococci retrospectively hospitalized in pediatric clinics in 2013–2014. Ümraniye Pediatri Derg. 2024;1(1):24-31.
• Sarı N, Kurt NT, Arslan AH, Azap Ö. Enterokok bakteriyemileri: Son 5 yılda E. faecium ve E. faecalis’in direnç profili ve prognoza etkisi. Turk J Clin Lab. 2025;16(1):131-9.
• Savcı Ü, Şahin M, Eser B, et al. The evaluation of antimicrobial resistances of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium strains isolated from clinical specimens. J Health Sci Med. 2018;1(1):4-8. https://doi.org/10.32322/jhsm.405716
• Şanlı K, Mart Kömürcü SZ, Şahin AS. Yoğun bakım ünitesindeki erişkin hastaların kan kültüründe üretilen Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium’un prevalansı ve antimikrobiyal duyarlılıkları. Istanbul Kanuni Sultan Suleyman Med J. 2022;14(3):268-73. https://doi.org/10.14744/iksstd.2022.55823
• Ulusal Antimikrobiyal Direnç Sürveyans Sistemi (UAMDSS). 2022–2023 Yıllık Raporu. T.C. Sağlık Bakanlığı, Halk Sağlığı Genel Müdürlüğü; (2024).