Distribution and Antifungal Sensitivity of Candida Isolates Detected in Blood Cultures

Yıl 2020, Cilt: 34 Sayı: 3, 77 - 85, 31.12.2020

Duygu Beder , Fatma Esenkaya Taşbent , Metin Doğan

https://doi.org/10.5222/ankem.2020.077

Öz

Candidemia is a serious clinical condition that can result in mortality. This condition is particularly common in intensive care patients. This retrospective study aimed to identify Candida strains isolated from blood cultures and to determine antifungal susceptibility patterns. For this purpose, isolated Candida species were identified and, their susceptibility to amphotericin B, caspofungin, flucytosine, fluconazole, micafungin and voriconazole were investigated. VITEK 2 automated system was used to identify and detect antifungal susceptibility of Candida species that were subjected to Gram staining and germ tube tests on Candida species detected from blood cultures sent to our laboratory between January 2014 and December 2018. Candida spp. isolation rate was found most frequently (n=157; 64.9 %) in intensive care units; followed by internal clinics (n=64; 26.5 %) and surgical clinics (n=21; 8.6 %). The most frequently isolated species among these Candida isolates are Candida albicans (100/242; 41.3 %) and Candida parapsilosis (92/242; 38 %). Especially in intensive care patients, rapid identification of Candida species and determination of their antifungal susceptibilities are important for planning treatment. It is thought that collecting data reflecting regional resistance status at certain intervals will be guiding in terms of treatment approaches.

Anahtar Kelimeler

antifungal susceptibility, blood culture, Candida, candidemia

Etik Beyan

This study was carried out with the approval of Necmettin Erbakan University Meram Medical Faculty Medicine and Non-Medical Device Research Ethics Committee (22.11.2019/2170).

Kan Kültürlerinde Tespit Edilen Candida İzolatlarının Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları

Öz

Kandidemi mortalite ile sonuçlanabilen ciddi bir klinik tablodur. Bu tablo özellikle yoğun bakım hastalarında sık görülmektedir. Bu retrospektif çalışmada, kan kültürlerinden izole edilmiş Candida suşlarının tanımlanması ve antifungal duyarlılık paternlerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla izole edilen Candida türleri identifiyemedilmiş; amfoterisin B, kaspofungin, flusitozin, flukonazol, mikafungin ve vorikonazolen duyarlılıkları araştırılmıştır. Ocak 2014-Aralık 2018 tarihlerinde kan kültürlerinden izole edilen Candida suşlarına Gram boyama ve germ tüp testi uygulanmış, Candida türlerinin tanımlanması ve antifungal duyarlılığının tespitinde VITEK 2 otomatize sistem kullanılmıştır. Candida spp. en sık yoğun bakım ünitelerinde (n=157, % 64,9) saptanmış, bunu dahili servisler (n=64, % 26,5) ve cerrahi servisler (n=21, % 8,6) izlemiştir. En sık izole edilen türler Candida albicans (100/242, % 41,3) ve Candida parapsilosis’tir (92/242, % 38). Özellikle yoğun bakım hastalarında, Candida türlerinin hızla tanımlanması ve antifungal duyarlılıklarının tespit edilmesi, tedavi planlaması için önemlidir. Bölgesel direnç durumunu yansıtan verilerin belli aralarla toplanmasının tedavi yaklaşımları açısından yol gösterici olacağı düşünülmektedir.

Anahtar Kelimeler

antifungal duyarlılık, Candida, kan kültürü, kandidemi

Etik Beyan

Necmettin Erbakan Üniversitesi Meram Tıp Fakültesi İlaç ve Tıbbi Cihaz Dışı Araştırmalar Etik Kurulu’nun onayı alınmıştır (22.11.2019/2170).

Kaynakça

• Ağca H, Cilo BD, Özmerdiven GE, Sağlam S, Ener B. Candida türlerini tanımlayan bir gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu yönteminin geliştirilmesi. Mikrobiyol Bul. 2015;49(1):56-65. https://doi.org/10.5578/mb.8889
• Altuncu E, Bilgen H, Çerikçioğlu N, et al. Neonatal kandida enfeksiyonları ve etkenlerinin antifungal duyarlılıkları. Mikrobiyol Bul. 2010;44(4):593-603.
• Atalay MA, Sav H, Demir G, Koç AN. Kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin dağılımı ve amfoterisin B ve flukonazole in vitro duyarlılıkları. Selçuk Tıp Derg. 2012;28(3):149-51.
• Ayhancı T, Altındiş M. Hızla yayılan çoklu ilaca dirençli maya mantarı: Candida auris. Turk Hij Den Biyol Derg. 2020;77(1):123-36. https://doi.org/10.5505/TurkHijyen.2019.26879
• Bourgeois N, Dehandschoewercker L, Bertout S, Bousquet PJ, Rispail P, Lachaud L. Antifungal susceptibility of 205 Candida spp. isolated primarily during invasive candidiasis and comparison of the Vitek 2 system with the CLSI broth microdilution and Etest methods. J Clin Microbiol. 2010;48(1):154-61. https://doi.org/10.1128/JCM.01096-09
• Bozkurt-Güzel Ç, Tüysüz M, İnan N, Savage PB. Katyonik steroid antibiyotiklerden olan Csa-8, Csa-13, Csa-44, Csa-131 ve Csa-138’in, kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans suşlarına karşı antifungal etkilerinin araştırılması. ANKEM Derg. 2014;28(1): 8-13. https://doi.org/10.5222/ankem.2014.008
• Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Reference method for broth dilution antifungal susceptibility testing of yeasts; fourth informational supplement. Wayne: Clinical and Laboratory Standards Institute; 2012 (Document M27-S4).
• Çalışkan E, Dede A, Biten Güven G. Kan kültürlerinde saptanan Candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıkları. ANKEM Derg. 2013;27(1):25-30. https://doi.org/10.5222/ankem.2013.025
• Çiçek B, Yılmaz H, Mutlu Yılmaz E, Esen Ş, Birinci A. Candida epidemiyolojisindeki değişikliklerin araştırılması. Mikrobiyol Bul. 2015;49(3):423-31. https://doi.org/10.5578/mb.9647
• Çiçek-Kolak Ç, Erman-Daloğlu A, Özhak B, Öğünç D, Günseren F. Akdeniz Üniversitesi Hastanesi’nde izlenen yetişkin hastalarda kandidemi epidemiyolojisi, Candida türlerinin antifungal duyarlılıkları ve mortalite üzerine etkileri. Klimik Derg. 2019;32(3):250-8. https://doi.org/10.5152/kd.2019.71
• Dalyan Cilo B, Topaç T, Agca H, Saglam S, Efe K, Ener B. Candida izolatlarinin antifungal duyarlılığının belirlenmesinde Klinik Laboratuvar Standartlari Enstitüsü (CLSI) ve Avrupa Antimikrobiyal Duyarlılık Testleri Komitesi (EUCAST) sıvı mikrodilüsyon yöntemlerinin karşılaştırılması. Mikrobiyol Bul. 2018;52(1):35-48. https://doi.org/10.5578/mb.63991
• Erdem F, Tuncer Erdem G, Oral B, Karakoç E, Demiröz AP, Tülek N. Candida türlerine bağlı nozokomiyal enfeksiyonların epidemiyolojik ve mikrobiyolojik açıdan değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul. 2012;46(4):637-48.
• Etiz P, Kibar F, Ekenoğlu Y, Yaman A. Kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin dağılımının ve antifungal duyarlılıklarının retrospektif olarak değerlendirilmesi. ANKEM Derg. 2015;29(3):105-13.
• Falagas ME, Roussos N, Vardakas KZ. Relative frequency of albicans and the various non-albicans Candida spp among candidemia isolates from inpatients in various parts of the world: a systematic review. Int J Infect Dis. 2010;14(11):e954-e66. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2010.04.006
• Grandesso S, Sapino B, Mazzuccato S, et al. Study on in vitro susceptibility of Candida spp. isolated from blood culture. Le infezioni in medicina: rivista periodica dieziologia, epidemiologia, diagnostica, clinica e terapia delle patologie infettive. SJR. 2012;20(1):25-30.
• Gültekin B, Eyigör M, Tiryaki Y, Kırdar S, Aydın N. Kan kültürlerinden izole edilen Candida suşlarında antifungal duyarlılığın ve bazı virülans faktörlerinin araştırılması ve RAPD-PCR ile genotiplendirilmesi. Mikrobiyol Bul. 2011;45(2):306-17.
• Hazirolan G, Saribas Z, Arikan Akdagli S. Comparison of microdilution and disk diffusion methods for the detection of fluconazole and voriconazole susceptibility against clinical Candida glabrata isolates and determination of changing susceptibility with new CLSI breakpoints. Mikrobiyol Bul. 2016;50(3): 628-37. https://doi.org/10.5578/mb.26544
• Jeffery-Smith A, Taori SK, Schelenz S, et al. Candida auris: a review of the literature. Clin Microbiol Rev. 2018;31(1):e00029-17. https://doi.org/10.1128/CMR.00029-17
• Jung SI, Shin JH, Song JH, et al and Korean Study Group for Candidemia. Multicenter surveillance of species distribution and antifungal susceptibilities of Candida bloodstream isolates in South Korea. Med Mycol. 2010;48(4):669-74. https://doi.org/10.3109/13693780903410386
• Karabıçak N, Altun HU, Karatuna O, ve ark. Mikrobiyoloji laboratuvarlarında maya türlerinin tanımlanmasında sık kullanılan ticari sistemlerin değerlendirilmesi: çok merkezli bir çalışma. Mikrobiyol Bul. 2015;49(2):210-20. https://doi.org/10.5578/mb.9370
• Keçeli Özcan S, Mutlu B, Dündar D, Willke A. Kan kültürleinden izole edilen Candida spp. suşlarının antifungal ilaçlara karşı duyarlılıklarının belirlenmesinde buyyon mikrodilüsyon ile E test yöntemlerinin karşılaştırılması. Mikrobiyol Bul. 2010;44(2):263-71.
• Koçak BY, Kuloğlu F, Çelik AD, Akata F. Bir üçüncü basamak hastanesinde erişkin kandidemi olgularının epidemiyolojik özellikleri ve risk faktörlerinin değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul. 2011;45(3):489-503.
• Kooshki P, Rezaei-Matehkolaei A, Mahmoudabadi AZ. The patterns of colonization and antifungal susceptibility of Candida, isolated from preterm neonates in Khorramabad, South West of Iran. J de Mycol Med. 2018;28(2):340-4. https://doi.org/10.1016/j.mycmed.2018.02.010
• Maede Y, Ibara S, Nagasaki H, et al. Micafungin versus fluconazole for prophylaxis against fungal infections in premature infants. Pediatr Int. 2013;55(6):727-30. https://doi.org/10.1111/ped.12157
• Manzoni P, Wu C, Tweddle L, Roilides E. Micafungin in premature and non-premature infants: a systematic review of 9 clinical trials. The Pediatr Infect Dis J. 2014;33(11):e291. https://doi.org/10.1097/INF.0000000000000434
• Medrano DJA, Brilhante RSN, Cordeiro RdA, Rocha MFG, Rabenhorst SHB, Sidrim JJC. Candidemia in a Brazilian hospital: the importance of Candida parapsilosis. Rev İnst Med Trop S Paulo. 2006;48(1):17-20. https://doi.org/10.1590/S0036-46652006000100004
• Munoz JF, Gade L, Chow NA, et al. Genomic basis of multidrugresistance, mating, and virulence in Candida auris and related emerging species. bioRxiv. 2018;299917. https://doi.org/10.1101/299917
• Oktay E, Gülbudak H, Özgür D, Otağ F. Yoğun bakım ünitesi hastaları kan kültürlerinden izole edilen Candida parapsilosis suşlarının mini epidemiler bakımından araştırılması. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2015;45(1):41-7. https://doi.org/10.5222/TMCD.2015.041
• Özbek E, Tekay F, Pirinççioğlu HÇ. Yoğun bakım hastalarına ait çeşitli örneklerden izole edilen Candida izolatlarında antifungal direnç. Dicle Tıp Derg. 2012;39(2):207-12. https://doi.org/10.5798/diclemedj.0921.2012.02.0128
• Öztürk T, Özseven AG, Çetin ES, Selçuk K. Kan kültürlerinden izole edilen Candida suşlarının tiplendirilmesi ve antifungal duyarlılıklarının araştırılması. Kocatepe Tıp Derg. 2013;14(1):17-22.
• Pfaller MA, Castanheira M, Messer SA, Moet GJ, Jones RN. Echinocandin and triazole antifungal susceptibility profiles for Candida spp., Cryptococcus neoformans, and Aspergillus fumigatus: application of new CLSI clinical breakpoints and epidemiologic cutoff values to characterize resistance in the Sentry Antimicrobial Surveillance Program (2009). Diagn Microbiol and Infect Dis. 2011;69(1):45-50. https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2010.08.013
• Rex JH. Clinical and Laboratory Standards Institute. Reference method for broth dilution antifungal susceptibility testing of yeasts: Approved standard M27-A3- 3rd Ed. Wayne, PA: Clinical and Laboratory Standards Institute; (2008).
• Sardi J, Scorzoni L, Bernardi T, Fusco-Almeida A, Giannini MM. Candida species: current epidemiology, pathogenicity, biofilm formation, natural antifungal products and new therapeutic options. J Med Microbiol. 2013;62(1):10-24. https://doi.org/10.1099/jmm.0.045054-0
• Savcı Ü, Yılmaz N. Çeşitli örneklerden izole edilen Candidaların tür dağılımı ve antifungal direnç oranları. Turk J Clin Lab. 2017;8(3):85-90. https://doi.org/10.18663/tjcl.340562
• Sütçü M, Acar M, Genç GE, ve ark. Pediyatrik invaziv kandidiyazis olgularında Candida türleri’nin ve antifungal duyarlılıklarının değerlendirilmesi. Turk Pediatri Ars. 2017;52(3):145-53.
• Şahiner F, Ergünay K, Özyurt M, Ardıç N, Hoşbul T, Haznedaroğlu T. Hastane enfeksiyonu etkeni olarak izole edilen Candida suşlarının genotipik ve fenotipik olarak tanımlanması. Mikrobiyol Bul. 2011;45(3):478-88.
• Temiz H, Temiz S, Kaya Ş. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Kandida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıkları. Okmeydanı Tıp Derg. 2015;31(1):13-7. https://doi.org/10.5222/otd.2015.013
• Tsekoura M, Ioannidou M, Pana ZD, et al. Efficacy and safety of echinocandins for the treatment of invasive candidiasis in children: a meta-analysis. Pediatr Infect Dis J. 2019;38(1):42-9. https://doi.org/10.1097/INF.0000000000002032
• Wagener J, Loiko V. Recent insights into the paradoxical effect of echinocandins. Journal of Fungi. 2018;4(1):5. https://doi.org/10.3390/jof4010005
• Wang H, Xiao M, Chen SC-A, et al. In vitro susceptibilities of yeast species to fluconazole and voriconazole as determined by the 2010 National China Hospital Invasive Fungal Surveillance Net study. JCM. 2012;50(12):3952-9. https://doi.org/10.1128/JCM.01130-12
• Warnock DW. Trends in the epidemiology of invasive fungal infections. Jpn J Med Mycol. 2007;48(1): 1-12. https://doi.org/10.3314/jjmm.48.1
• Yapar N, Pullukcu H, Avkan-Oguz V, et al. Evaluation of species distribution and risk factors of candidemia: a multicenter case-control study. Med Mycol. 2011;49(1):26-31. https://doi.org/10.3109/13693786.2010.501344
• Yesil E, Çelebi S, Sezgin Evim M, ve ark. Çocuklarda Mikafungin kullanımının degerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul. 2020;54(1):120-34.
• Yüksekkaya Ş, Fındık D, Arslan U. Yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların idrarlarından izole edilen Candida türlerinin moleküler epidemiyolojisi ve antifungal duyarlılıkları. Mikrobiyol Bul. 2011;45(1):137-49.
• Zhang XB, Yu SJ, Yu JX, Gong YL, Feng W, Sun FJ. Retrospective analysis of epidemiology and prognostic factors for candidemia at a hospital in China, 2000-2009. Jpn J Infect Dis. 2012;65(6):510-5. https://doi.org/10.7883/yoken.65.510
• Ziyade N, Elgörmüş N, Arslan MN. Çeşitli Postmortem örneklerden izole edilen maya türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıkları. Türk Mikrobiyoloji Cem Derg. 2019;49(3):147-53.