Derleme
BibTex RIS Kaynak Göster

Ancient DNA

Yıl 2015, Sayı: 30, 53 - 60, 30.12.2015
https://doi.org/10.1501/antro_0000000320

Öz

DNA studies from highly degraded biological samples that are not preserved in suitable conditions for DNA analyses are called “ancient DNA analyses” Ancient DNA studies may shed light on many scientific issues in parallel with the improvements of the field of molecular biology, however it requires a higher level of sensitivity during applications when compared to standard molecular genetic studies. These researches raises the need for a collaborative work of scientists from different disciplines to carry out several explorative stages; initiating from sample collection to laboratory analyses which finally provides solutions on the evolutionary and anthropological hypothesis. The aim of this article is to focus on the importance of ancient DNA studies, discuss the problems encountered during these studies and provide solution proposals to overcome these problems

Kaynakça

  • Alakoc YD., Aka PS. (2009) “Orthograde Entrance Technique To Recover DNA From Ancient Teeth Preserving The Physical Structure.” Forensic Sci Int. 2009 Jul 1;188(1-3):96-8.
  • Alakoc, Y. D., Aka P. S., , Eğin Y, Akar N. (2010). "V Leiden in an Urartian, dating Back to 1000 BC”. Journal of the International Academy of Clinical and Applied Thrombosis/ Hemostasis (Clin Appl. Tromb Hemost) 16 (6):679-83.
  • Bouwman, A. S., Chilvers E. R., Brown K. A., Brown T. A. (2006). "Brief communication: identification of the authentic ancient DNA sequence in a human bone contaminated with modern DNA." Am J Phys Anthropol 131(3): 428-31.
  • Germonpore M., Sablin M.V. et al. (2009).” Fossil dogs wolvesfrom Palaolithic sites in Belgium, the Ukraine and Russia: osteometry, ancient DNA and stable isotopes” Journal od Archaelogical Science 36:473-490.
  • Halle J., Froese GG, et al (2009). “Ancient DNA reveals late survival of mammoth and horse in interior Alaska” PNAS 106 (52): 22352-57.
  • Higgins D., Austin J. (2013). “ Teeth as a source of DNA for forensic identification of human remains”.Science and Justice. 53:413-441.
  • Higuchi, R., B. Bowman, et al. (1984). "DNA Squences from quagga, an extinct member of the horse family." Nature 312: 282-284.
  • Hummel S. (2007). “Ancient DNA” . Handbook of Paleoantropology. Springer: 643-671.
  • Kirsanow K. ve Burger J. (2012). “Ancient human DNA” Annals of Anatomy 194: 121-132.
  • Meyer, E., M. Wiese, et al. (2000). "Extraction and amplification of authentic DNA from ancient human remains." Forensic Sci Int 113(1-3): 87-90.
  • Pääbo S. (1985). “Molecular Colning of ancient Egyptian mummy DNA” Nature. 314: 644-645.
  • Pruvost, M., R. Schwarz, et al. (2007). "Freshly excavated fossil bones are best for amplification of ancient DNA." Proc Natl Acad Sci U S A 104(3): 739-44.
  • Rohland, N. and M. Hofreiter (2007). "Ancient DNA extraction from bones and teeth." Nat Protoc 2(7): 1756-62.
  • Schubert, M., Ginolhac A., Thompson J., Al- Rashid K., Willerslev E., Krogh A. and Orlando L. (2012) “Improving ancient DNA read mapping aganist modern genomes”. BMC Genomics: 13:178.
  • Von Wurmb-Schwark, N., M. Harbeck, et al. (2003). "Extraction and amplification of nuclear and mitochondrial DNA from ancient and artificially aged bones." Leg Med (Tokyo) 5 Suppl 1: S169-72.
  • Yang, DY. ve Watt, K. (2005). "Contamination controls when preparing archaeological remains for ancient DNA analysis." Journal of Archaeological Sceince 32: 331-336.

Antik DNA Çalışmaları ve Karşılaşılan Sorunlar

Yıl 2015, Sayı: 30, 53 - 60, 30.12.2015
https://doi.org/10.1501/antro_0000000320

Öz

İleri derecede zarar görmüş ve DNA eldesi için özel koşullarda saklanmamış biyolojik örneklerden DNA elde edilerek gerçekleştirilen moleküler genetik çalışmaları “antik DNA çalışmaları” olarak adlandırılır. Moleküler biyoloji alanında ortaya konulan gelişmeler paralelinde pek çok bilimsel soruna ışık tutacak olan antik DNA çalışmaları, uygulamada standart moleküler genetik çalışmalarına kıyasla farklı hassasiyetler gerektirmektedir. Örneklerin elde edilmesinden laboratuvarda gerçekleştirilen birçok aşamaya kadar pek çok farklı bilim dalından insanın ortak çalışmasını gerektiren bu araştırmalar, sonunda evrimsel ve antropolojik sorulara çözüm sunacak güçtedir. Bu makalede antik DNA çalışmalarının önemi ve çalışma süresince karşılaşılan sorunlar ve çözüm önerileri üzerinde durulacaktır

Kaynakça

  • Alakoc YD., Aka PS. (2009) “Orthograde Entrance Technique To Recover DNA From Ancient Teeth Preserving The Physical Structure.” Forensic Sci Int. 2009 Jul 1;188(1-3):96-8.
  • Alakoc, Y. D., Aka P. S., , Eğin Y, Akar N. (2010). "V Leiden in an Urartian, dating Back to 1000 BC”. Journal of the International Academy of Clinical and Applied Thrombosis/ Hemostasis (Clin Appl. Tromb Hemost) 16 (6):679-83.
  • Bouwman, A. S., Chilvers E. R., Brown K. A., Brown T. A. (2006). "Brief communication: identification of the authentic ancient DNA sequence in a human bone contaminated with modern DNA." Am J Phys Anthropol 131(3): 428-31.
  • Germonpore M., Sablin M.V. et al. (2009).” Fossil dogs wolvesfrom Palaolithic sites in Belgium, the Ukraine and Russia: osteometry, ancient DNA and stable isotopes” Journal od Archaelogical Science 36:473-490.
  • Halle J., Froese GG, et al (2009). “Ancient DNA reveals late survival of mammoth and horse in interior Alaska” PNAS 106 (52): 22352-57.
  • Higgins D., Austin J. (2013). “ Teeth as a source of DNA for forensic identification of human remains”.Science and Justice. 53:413-441.
  • Higuchi, R., B. Bowman, et al. (1984). "DNA Squences from quagga, an extinct member of the horse family." Nature 312: 282-284.
  • Hummel S. (2007). “Ancient DNA” . Handbook of Paleoantropology. Springer: 643-671.
  • Kirsanow K. ve Burger J. (2012). “Ancient human DNA” Annals of Anatomy 194: 121-132.
  • Meyer, E., M. Wiese, et al. (2000). "Extraction and amplification of authentic DNA from ancient human remains." Forensic Sci Int 113(1-3): 87-90.
  • Pääbo S. (1985). “Molecular Colning of ancient Egyptian mummy DNA” Nature. 314: 644-645.
  • Pruvost, M., R. Schwarz, et al. (2007). "Freshly excavated fossil bones are best for amplification of ancient DNA." Proc Natl Acad Sci U S A 104(3): 739-44.
  • Rohland, N. and M. Hofreiter (2007). "Ancient DNA extraction from bones and teeth." Nat Protoc 2(7): 1756-62.
  • Schubert, M., Ginolhac A., Thompson J., Al- Rashid K., Willerslev E., Krogh A. and Orlando L. (2012) “Improving ancient DNA read mapping aganist modern genomes”. BMC Genomics: 13:178.
  • Von Wurmb-Schwark, N., M. Harbeck, et al. (2003). "Extraction and amplification of nuclear and mitochondrial DNA from ancient and artificially aged bones." Leg Med (Tokyo) 5 Suppl 1: S169-72.
  • Yang, DY. ve Watt, K. (2005). "Contamination controls when preparing archaeological remains for ancient DNA analysis." Journal of Archaeological Sceince 32: 331-336.
Toplam 16 adet kaynakça vardır.

Ayrıntılar

Birincil Dil Türkçe
Konular Antropoloji, Arkeoloji
Diğer ID JA87NS27TZ
Bölüm Değerlendirme (Derleme) Makaleleri
Yazarlar

H. Merve İyras Bu kişi benim

Yeşim Doğan Bu kişi benim

Yayımlanma Tarihi 30 Aralık 2015
Gönderilme Tarihi 1 Ağustos 2015
Kabul Tarihi 1 Aralık 2015
Yayımlandığı Sayı Yıl 2015 Sayı: 30

Kaynak Göster

APA İyras, H. M., & Doğan, Y. (2015). Antik DNA Çalışmaları ve Karşılaşılan Sorunlar. Antropoloji(30), 53-60. https://doi.org/10.1501/antro_0000000320

17919

Antropoloji’de yayımlanan makaleler ve diğer yazıların tümünün yayın hakkı Creative Commons Atıf-Gayri Ticari 4.0 Uluslararası Lisansı (CC BY-NC 4.0) altında lisanslanmıştır. Yani yayımlanan makale ve diğer muhtelif yazılar, başka yayınlarda ancak uygun referans gösterilerek, lisansa bağlantı sağlanarak, değişiklik yapıldıysa belirtilerek ve ticarî amaç gütmeyerek kullanılabilirler. Kısaca yazar(lar) veya okuyucu(lar) herhangi bir maddî çıkar gözetmeksizin, Antropoloji’deki yayınları basılı ve/veya elektronik olarak çoğaltmakta ve/veya yaymakta özgürdürler. Bu durum yine de lisans sahibi olarak Antropoloji’nin sizi ve çalışmanızı onaylayacağı anlamına gelmek zorunda değildir.
Budapeşte Açık Erişim Girişimi