SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜRBAĞIMLI KARAKTERİZASYONU

Mehmet Burçin Mutlu; Seval Çınar

doi:10.18036/aubtdc.305855

TR EN

SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜRBAĞIMLI KARAKTERİZASYONU

Öz

Bu çalışmada Sivas’ta bulunan farklı solar tuzlalardan halofilik mikroorganizmaların izolasyonu yapılmıştır ve elde edilen izolatların 16S rRNA gen analizine dayalı karakterizasyonu gerçekleştirilmiştir. İzolasyon işlemi farklı tuz konsantrasyonları ile hazırlanmış 5 farklı besiyeri ile gerçekleştirilmiştir. Morfolojik olarak farklılık gösteren kolonilerin 16S rRNA genleri ARDRA ile analiz edilmiştir ve kesim profilleri karşılaştırılmıştır. 47 adet suş tanımlama amacıyla seçilmiştir. Bacteria domaini içerisinde yer alan izolatların Idiomarina, Salinivibrio, Halomonas, Salinibacter, Gracilibacillus, Thalassobacillus, Aliifodinibius, Chromohalobacter, Planococcus, Marinobacter, Bacillus, Aquisalimonas, Marinococcus, Alkalibacillus, Kangiella ve Microbulbifer cinsleri ile filogenetik olarak ilişkili olduğu saptanmıştır. Halofilik arke izolatları ise Haloferax, Natrinema, Haloterrigena, Halopelagius, Halorhabdus ve Haloarcula cinsleri içerisinde dağılım göstermiştir.

Anahtar Kelimeler

Halofilik Mikroorganizmalar,Solar Tuzlalar,Sivas

Kaynakça

[1] Oren A. Diversity of halophilic microorganisms: environments, phylogeny, physiology, and applications. Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology 2002; 28:56-63.
[2] Oren A. Industrial and environmental applications of halophilic microorganisms. Environmental Technology 2010; 31:825-834.
[3] Antón J., Rosselló-Mora R., Rodríguez-Valera F., Amann R. Extremely halophilic bacteria in crystallizer ponds from solar salterns. Applied and Environmental Microbiology 2000; 66:3052-3057.
[4] Burns D.G., Camakaris H.M., Janssen P.H., Dyall-Smith M.L. Combined use of cultivation-dependent and cultivation-independent methods indicates that members of most haloarchaeal groups in an Australian crystallizer pond are cultivable. Applied and Environmental Microbiology 2004; 70:5258-5265
[5] Baati H., Guermazi S., Amdouni R., Gharsallah N., Sghir A., Ammar E. Prokaryotic diversity of a Tunisian multipond solar saltern. Extremophiles 2008; 12:505-518.
[6] Taşman C.E. Tuzlarımız. MTA Dergisi 1945; 33:105-108.
[7] Ergin Z. Tuzun üretim teknolojisi ve insan sağlığındaki yeri. Madencilik Dergisi 1988; 27:21-30.
[8] Stchepinsky V. Sivas Vilâyeti İdrokarbürleri, Liğnitleri ve Tuzlu Menbaları, MTA Dergisi 1939; 4:88-94
[9] Yazıcı H., Başıbüyük A., Altınbilek S. Kemah (Erzincan) Tuzlaları. Türk Coğrafya Dergisi 1998; 33:53-78
[10] Rodrı́guez-Valera F., Ventosa A., Juez G., Imhoff J.F. Variation of environmental features and microbial populations with salt concentrations in a multi-pond saltern. Microbial Ecology 1985; 11:107-115.

[11] Oren A. Estimation of the contribution of halobacterial to the bacterial biomass and activity in solar salterns by the use of bile salts. FEMS Microbiology Ecology 1990; 6:41-47.
[12] Dyall-Smith M.L. The Halohandbook- Protocols for Haloarchaeal Genetics, Version 7.2, 2009; (http://www.haloarchaea.com/resources/halohandbook /index.html).
[13] DeLong E.F. Archaea in coastal marine environments. Proceedings of the National Academy of Sciences 1992; 89:5685-5689.
[14] Lane D. J., Pace B., Olsen G.J., Stahl D.A., Sogin M.L., Pace N.R. Rapid determination of 16S ribosomal RNA sequences for phylogenetic analyses. Proceedings of the National Academy of Sciences 1985; 82:6955-6959.
[15] Dereeper A., Audic S., Claverie J.M., Blanc G. BLAST-EXPLORER helps you building datasets for phylogenetic analysis. BMC Evolutionary Biology 2010; 10:8.
[16] Dereeper A., Guignon V., Blanc G., Audic S., Buffet S., Chevenet F., Dufayard J.F., Guindon S., Lefort V., Lescot M. et al. Phylogeny.fr: robust phylogenetic analysis for the non-specialist. Nucleic Acids Research 2008; 36:W465-W469
[17] Edgar R.C. MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Nucleic Acids Research 2004; 32:1792-1797.
[18] Yaşa İ., Kahraman Ö., Tekin E., Koçyiğit A. Çamaltı Tuzlasından Ekstrem Halofilik Archaea İzolasyonu ve Moleküler Karakterizasyonu. E.Ü. Su Ürünleri Dergisi 2008; 2:117-121.
[19] Mutlu M.B., Güven K. Bacterial Diversity in Çamaltı Saltern, Turkey. Polish Journal of Microbiology 2015; 64:37-45.
[20] Elevi R., Assa P., Birbir M., Ogan A., Oren A. Characterization of extremely halophilic Archaea isolated from the Ayvalik Saltern, Turkey. World Journal of Microbiology and Biotechnology 2004; 20:719-725.
[21] Birbir M., Calli B., Mertoglu B., Bardavid R.E., Oren A., Ogmen M.N., Ogan A. Extremely halophilic Archaea from Tuz Lake, Turkey, and the adjacent Kaldırım and Kayacık salterns. World Journal of Microbiology and Biotechnology 2007; 23:309-316.
[22] Viver T., Cifuentes A., Díaz S., Rodríguez-Valdecantos G., González B., Antón J., Rosselló-Móra R. Diversity of extremely halophilic cultivable prokaryotes in Mediterranean, Atlantic and Pacific solar salterns: evidence that unexplored sites constitute sources of cultivable novelty. Systematic and Applied Microbiology 2015; 38:266-275.
[23] Sabet S., Diallo L., Hays L., Jung W., Dillon J.G. Characterization of halophiles isolated from solar salterns in Baja California, Mexico. Extremophiles 2009; 13:643-656.
[24] Maturrano L., Santos F., Rosselló-Mora R., Antón J. Microbial diversity in Maras salterns, a hypersaline environment in the Peruvian Andes. Applied and Environmental Microbiology 2006; 72:3887-3895.
[25] Çınar S., Mutlu M.B. Comparative analysis of prokaryotic diversity in solar salterns in eastern Anatolia (Turkey). Extremophiles 2016; 20:589-601.
[26] Burns D.G., Janssen P.H., Itoh T., Kamekura M., Li Z., Jensen G., Rodrı́guez-Valera F., Bolhuis H., Dyall-Smith, M.L. Haloquadratum walsbyi gen. nov., sp. nov., the square haloarchaeon of Walsby, isolated from saltern crystallizers in Australia and Spain. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 2007; 57:387-392.
[27] Enache M., Itoh T., Kamekura M., Teodosiu G., Dumitru L. Haloferax prahovense sp. nov., an extremely halophilic archaeon isolated from a Romanian salt lake. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 2007; 57:393-397.
[28] Caton T.M., Witte L.R., Ngyuen H.D., Buchheim J.A., Buchheim M.A., Schneegurt M.A. Halotolerant aerobic heterotrophic bacteria from the Great Salt Plains of Oklahoma. Microbial Ecology 2004; 48:449-462.

Ayrıntılar

Birincil Dil

Türkçe

Konular

-

Bölüm

Araştırma Makalesi

Yazarlar

Mehmet Burçin Mutlu
ANADOLU ÜNİVERSİTESİ
Türkiye

Seval Çınar
ANADOLU ÜNİVERSİTESİ
Türkiye

Yayımlanma Tarihi

28 Şubat 2018

Gönderilme Tarihi

12 Nisan 2017

Kabul Tarihi

17 Eylül 2017

Yayımlandığı Sayı

Yıl 2018 Cilt: 7 Sayı: 1

DOI

https://doi.org/10.18036/aubtdc.305855

IZ

https://izlik.org/JA32ME55JS

APA

Mutlu, M. B., & Çınar, S. (2018). SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜRBAĞIMLI KARAKTERİZASYONU. Anadolu University Journal of Science and Technology C - Life Sciences and Biotechnology, 7(1), 1-11. https://doi.org/10.18036/aubtdc.305855

AMA

1.Mutlu MB, Çınar S. SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜRBAĞIMLI KARAKTERİZASYONU. Anadolu University Journal of Science and Technology C - Life Sciences and Biotechnology. 2018;7(1):1-11. doi:10.18036/aubtdc.305855

Chicago

Mutlu, Mehmet Burçin, ve Seval Çınar. 2018. “SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜRBAĞIMLI KARAKTERİZASYONU”. Anadolu University Journal of Science and Technology C - Life Sciences and Biotechnology 7 (1): 1-11. https://doi.org/10.18036/aubtdc.305855.

EndNote

Mutlu MB, Çınar S (01 Şubat 2018) SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜRBAĞIMLI KARAKTERİZASYONU. Anadolu University Journal of Science and Technology C - Life Sciences and Biotechnology 7 1 1–11.

IEEE

[1]M. B. Mutlu ve S. Çınar, “SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜRBAĞIMLI KARAKTERİZASYONU”, Anadolu University Journal of Science and Technology C - Life Sciences and Biotechnology, c. 7, sy 1, ss. 1–11, Şub. 2018, doi: 10.18036/aubtdc.305855.

ISNAD

Mutlu, Mehmet Burçin - Çınar, Seval. “SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜRBAĞIMLI KARAKTERİZASYONU”. Anadolu University Journal of Science and Technology C - Life Sciences and Biotechnology 7/1 (01 Şubat 2018): 1-11. https://doi.org/10.18036/aubtdc.305855.

JAMA

1.Mutlu MB, Çınar S. SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜRBAĞIMLI KARAKTERİZASYONU. Anadolu University Journal of Science and Technology C - Life Sciences and Biotechnology. 2018;7:1–11.

MLA

Mutlu, Mehmet Burçin, ve Seval Çınar. “SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜRBAĞIMLI KARAKTERİZASYONU”. Anadolu University Journal of Science and Technology C - Life Sciences and Biotechnology, c. 7, sy 1, Şubat 2018, ss. 1-11, doi:10.18036/aubtdc.305855.

Vancouver

1.Mehmet Burçin Mutlu, Seval Çınar. SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜRBAĞIMLI KARAKTERİZASYONU. Anadolu University Journal of Science and Technology C - Life Sciences and Biotechnology. 01 Şubat 2018;7(1):1-11. doi:10.18036/aubtdc.305855

SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜRBAĞIMLI KARAKTERİZASYONU

SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜRBAĞIMLI KARAKTERİZASYONU

Öz

Anahtar Kelimeler

CULTIVATION-BASED CHARACTERIZATION of MICROBIAL ASSEMBLAGES in SOLAR SALTERNS, SİVAS

Öz

Anahtar Kelimeler

Kaynakça

Ayrıntılar

Birincil Dil

Konular

Bölüm

Yazarlar

Yayımlanma Tarihi

Gönderilme Tarihi

Kabul Tarihi

Yayımlandığı Sayı

DOI

IZ

Kaynak Göster