Determination of disease agents which cause Root and Foot-Rot diseases in some wheat varieties of Sakarya province

Abstract

Root and foot-rot diseases on cereals is one of the major fungal diseases causing economical yield losses in Turkey. With the aim of determining of root and foot-rot diseases, the researches were carried on 18 various cultivars of wheat and in 4 district of Sakarya province in 2007-2008 growing season. Diseased samples were collected from research areas of Sakarya Agricultural Research Institute and in the Hanlı, Esence, Esenler, Kirazca (commercial fields) town of Sakarya province. A total of 44 samples (wheat roots) were collected and these samples were carried through isolation process by using PDA and SNA (Potato Dekstrose Agar and Synthetic Nutrient Agar). Fungi species and genus that developed from the wheat roots were then identified after incubation period. Fusarium graminearum, F. culmorum, F. subglutinans, F. crookwellense, F. oxysporum, F. moniliforme, F. dimerum, F. solani, F. equiseti, F. acuminatum, F. sporotrichoides, Rhizoctonia spp and Alternaria spp are identified from the samples collected. F. graminearum was obtained in 10 wheat cultivars and F. culmorum was obtained in 5 wheat cultivars. Both of them were found to be pathogenic on these cultivars. Moreover, other fungi were found to be pathogen on the front pathogenity tests. Pathogenicity of the isolates were determined by using soil inoculation method.

Keywords

• -

Sakarya ilinde bazı buğday çeşitlerinde kök ve kök boğazı hastalıklarına neden olan etmenlerin belirlenmesi

Öz

Türkiye'de tahıllarda kök ve kök boğazı çürüklüğü hastalıkları, en büyük ekonomik kayıplara neden olan fungal hastalıklardır. Bu çalışma, 2007-2008 yılları arasında Sakarya'da Tarımsal Araştırma Enstitüsünde ve Kirazca İşletmesinde yetiştirilen 18 buğday çeşidinde ve Sakarya merkez ilçeye bağlı 4 bölgede de, kök ve kök boğazı hastalıklarının belirlenmesine yönelik yapılmıştır. Hastalıklı örnekler, Sakarya Tarımsal Araştırma Enstitüsünün deneme parsellerinden ve Hanlı, Esence, Esenler, Kirazca köylerinden alınmıştır. Toplam 44 buğday kök örneği toplanarak, bu örnekler PDA (Patates Dekstroz Agar) ve SNA (Synthetic Nutrient Agar) kullanılarak izolasyonları yapılmıştır. İnkubasyon süresinin sonunda buğday köklerinden gelişen funguslar cins ve tür düzeyinde belirlenmiştir. Toplanan örneklerden Fusarium graminearum, F. culmorum, F. subglutinans, F. crookwellense, F. oxysporum, F. moniliforme, F. dimerum, F. solani, F. equiseti, F. acuminatum, F. sporotrichoides, Rhizoctonia spp. ve Alternaria spp. belirlenmiştir. Fusarium graminearum, 10 buğday çeşidinden, F. culmorum 5 buğday çeşidinden elde edilmiştir. Her iki fungus patojen bulunmuştur. Ayrıca bulunan diğer funguslar ön patojenisite testlerinde patojen bulunmuştur. İzolatların patojenisitelerinin belirlenmesinde toprak inokulasyonu yöntemi kullanılmıştır.

Anahtar Kelimeler

• Patojenisite, kök ve kök boğazı çürüklüğü, Sakarya, buğday

Kaynakça

1. Anonim, 2001. Tarımsal Yapı-Üretim, Fiat, Değer. T.C. Başbakanlık Devlet İstatistik Enstitüsü Matbaası Ankara, Yayın no: 2758, 8+13.s.
2. Ahmad, Q and Sharma, R. N. 1990. Sources of Resistance to Fusarium Wilt of Chickpea in Bihar. International Chickpea Newsletter. 23: 20-21.
3. Aktaş, A., Bolat, N., Keser, M. ve İnce, T. 2000. Eskişehir İli Hububat Ekim Alanlarında Hububat Kök Boğazı Çürüklüğü Hastalık Etmenlerinin Saptanması, Buğday ve Arpada Dreschlera sorokiniana (Sacc.) Subram. and Jain’ya Karşı Genitör Çeşit ve Hatların Belirlenmesi. Bitki Koruma Bülteni, 40 (1-2): 71-83.
4. Aktaş, H., 2001. Önemli Hububat Hastalıkları ve Survey Yöntemleri. Tarımsal Araştırmalar Genel Müdürlüğü yayını, Tarım ve Köyişleri Bakanlığı Tarımsal Araştırmalar Genel Müdürlüğü Bitki Sağlığı Araştırmaları Daire Başkanlığı.
5. Aktaş, H., Bostancıoğlu, H., Tunalı, B. ve Bayram, E. 1996. Sakarya yöresinde buğday kök ve kök boğazı çürüklüğüne neden olan hastalık etmenlerinin belirlenmesi ve bu etmenlerin buğday yetiştirme teknikleri ile ilişkileri üzerinde araştırmalar. Bitki Koruma Bülteni, 36 (3-4): 151-167.
6. Aktaş, H., Kınacı, E., Yıldırım, A.F., Sayın, L. ve Kural, A. 1999. Konya yöresinde hububatta sorun olan kök ve kökboğazı çürüklüğü etmenlerinin hububatta verim komponentlerine etkileri ve mücadelesi üzerinde araştırmalar. Orta Anadolu Hub. Tarımının Sorunları ve Çözüm Yolları Semp., 8-11 Haziran 1999, Konya, 392-403.
7. Bacon, C.W., Porter, J.K., Norred, W.P. and Leslie, J.F. 1996. Production of Fusaric Acid by Fusarium Species. Applied and Environmental Microbiology. Pp: 4039-4043.
8. Bateman, G.L. and Murray, G. 2001. Seasonal Variations in Populations of Fusarium Species in wheat field Soil. Applied Soil Ecology, 18. 117-128.

9. Beddis, A. and Burgess, L.W. 1992. The Influence of Plant Water Stres on Infection and Colonization of Wheat Seedlings by Fusarium graminearum Group 1. Phytopathology, 82: 78-83.
10. Bremer, H. 1948. Türkiye Fitopatolojisi. Özel Bölüm. Tarım Bakanlığı. Neşriyat Müdürlüğü. Sayı: 657.
11. Booth, C. 1971. The Genus Fusarium. Com. Myc. Inst. Kew, Surrey, England, 237.
12. Booth, C. 1977. Fusarium. Laboratory Guide to the Identification of the Major Species. Commonwealth Mycological Inst. Kew, Surrey, England. pp:58.
13. Bottalico, A., Logrieco, A. and Visconti, A. 1989. Fusarium species and their mycotoxins in infected corn in Italy. Mycopathologica 107: 85-92.
14. Burgess, L., Summerell, B.A., Bullock, S., Gott, P.G. and Backhouse, D. 1994. Laboratory Manual for Fusarium research. 3rd Ed. Fusarium Research Lab. University of Sydney, pp: 133.
15. Domsch, K.H., Gams, W. and Anderson, T.H. 1980. Compendium of Soil Fungi. Academic Pres, London, Newyork, Toronto, Sydney, San Fransisco, I:859.
16. Ellis, M.B. 1971. Dematiaceus Hyphomycetes. Comm. Mycol. Inst., Kew, Surrey, England, C.A.B.,608.
17. Ellis, M.B. 1976. More Dematious Hypomycetes. Commenwealth Mycol. Inst. England. Pp. 507.
18. El-Meleigi, M.A. and Hassan, Z.M. 2000. Biological control of common root rot of spring wheat by coating seeds with Bacillus or Trichoderma spp. In Central Saudi Arabia, Plant Protection Department, College of Agriculture and Veterinary Medicine, King Saud University, Gassim Branch, Saudi Arabia.
19. Haberle, J., Schmolke, M., Schweizer, G., Korzun, V., Ebmeyer, E., Zimmermenn, G. and Hartl, L. 2007. Effects of two major Fusarium head blight resistance OTL verified in a winter wheat backcross population. Crop. Sci., 47, 1823-1831.
20. Hatat, G. and Maden, S. 1988. Fungal Disease of Corn and Their Incidence in Samsun. J. Turk. Phytopath., 17(3), 117.
21. Inglis, D.A. and Cook, R.J. 1986. Persistence of Clamydospores of Fusarium culmorum in wheat field soils of Eastern Washington. Phytopathology, 76:1205-1208.
22. Karaca, İ. 1974. Sistematik Bitki Hastalıkları, Deuteromycetes (Fungi Imperfecti) Cilt IV. Ege Üniv. Zir. Fak. Yayınları, No: 217.
23. Karman, M. 1971. Bitki Koruma Araştırmalarında Genel Bilgiler, Denemelerin Kuruluşu ve Değerlendirme Esasları. T.C.Tarım Bak. Zir.Müc. Zir. Karantina Gn. Müd. Yayınları, Mesleki Kitaplar serisi 279.
24. Kunwar, I.K., Satyaprasad, K.and Ramarao. P. 1989. Histopathology of Chickpea Plants Infected with F. oxysporum f. sp. ciceri. Int. Chickpea Newsletter. 20: 17-18.
25. Lopez, T.A, Escande, A., Chayer, R., Dosanto, M., Gerpe, O. and Salomon, M.L. 1997. Fusarium crookwellense-produced zearalenone in maize stubble in the field. New Zealand Veterinary Journal, Volume 45, Number 6, 1 December pp. 251-253 (3).
26. Mathieson, J.T., Rush, G.M., Bordovsky, D., Clark, L.E. and Jones, O.R. 1990. Effects of Tillage on common Root rot of wheat in Texas. Plant Dis. 74. 1006-1008.
27. Mıshra, C.B.P. 1973. Untersuchungen über Fusarium-Arten an weizen-karyopen und Nachweis ihrer Pathogenitet Fusskrankheitserreger. Arch Phytopath. PflSchutz., 9(2): 123-132.
28. Muratçavuşoğlu, N. ve Hancıoğlu, Ö. 1995. Ankara ili Buğday ekim alanlarında kök ve kök boğazı hastalıklarına neden olan Fusarium türlerinin tesbiti üzerine araştırmalar. VII. Türkiye Fitopatoloji Kongresi Bildirileri 20-29 Eylül, sayfa: 174-177.
29. Ocamb, C.M. and Kommedahl, T. 1994. Rhizosphere Competence of Fusarium Species Colonizing Corn Roots. Phytopathology, 84: 166-172.
30. Samson, A.R., Hoekstra, E.S., Frisvard, J.C. and Filtenborg, O. 1996. Introduction to food-borne Fungi, Fifth Edition, Centraalbureau voor Schimmelcultures, P.O.Box 273, 3740 AG BAARN The Netherlands pp:119.
31. Singh, K., Frisvard, J.C., Thrane, U., and Mathur, S.B. 1991. An Illustrated Manual on Identification of some seed-borne Aspergilli, Fusaria, Penicillia and their Mycotoxins. Danish Gow. Inst. of Seed Path. For Developing Countries Denmark, pp:233.
32. Smiley, R.W. and Patterson, L.M. 1996. Pathogenic Fungi Associated with Fusarium Foot Rot of Winter Wheat in the Semiarid Pacific Northwest. Plant Disease, 80: 944-949.
33. Sneh, B. and Ichievlevich-Auster, M. 1998. Induced Resistance of Cucumber Seddlings Caused by Some Non-pathogenic Rhizoctonia (np-R) Isolates. Phytoparasitica 26 (1): 27-38.
34. Stubbs, R.W., Prescott, J.M., Saari, E.E. and Dubin, H.J. 1992. Tahıl Hastalıkları Metodları Kılavuzu. S.120.
35. Toussoun, T.A and Nelson, P.E. 1995. A Pictorial Guide to the Identification of Fusarium Species. FUSARIUM. The Pennsylvania State University Pres. University Park and London. Pp.43.
36. Tunalı, B., Nıcol, J., Hodson, D., Uckun, Z., Büyük O., Erdurmuş, D., Hekimhan, H., Aktaş. H., Akbudak, M.A. and Bağcı, S.A. 2008. Root and Crown Rot Fungi Associated with Spring, Facultative, and Winter Wheat in Turkey. Plant Disease, 92(9): 1299-1306.
37. Wiese, M.V. 1987. Compendium of Wheat Disease 2nd ed. American Phytopathological Society, St. Paul MN. 53-55.
38. Wildermuth, G.B., Thomas, G.A., Radford, B.J., McNamara, R.B. and Kelly, A. 1997. Crown Rot and Common Root Rot in Winter Wheat Grown Under Different Tillage and Stubble Treatments in Southern Queensland, Australia. Soil & Tillage Research 44: 211-224.
39. Zadoks, J.C., Chang, T.T. and Konzak, C.F. 1974. A decimal code for the growth stages of cereals. Weed Research 14: 415-421.