Derleme
BibTex RIS Kaynak Göster

Pestisidlerin bakteriyel parçalanması

Yıl 2025, Cilt: 4 Sayı: 2, 168 - 179, 30.12.2025
https://doi.org/10.59128/bojans.1805738
https://izlik.org/JA53UM56FX

Öz

Tarımda kimyasal mücadele dünya çapında yaygın bir uygulama olup, bitkisel üretimde çeşitli amaçlara hizmet eder. Pestisitler, zararlılara ve hastalıklara karşı etkili bir kontrol yöntemi olarak işlev görür. Hızlı ve hedefli bir kontrol sağlayarak zararlı popülasyonlarını azaltabilir ve nispeten kısa bir sürede ürün hasarını en aza indirebilirler. Ancak, pestisitlerin yoğun kullanımı çevre ve insan sağlığı üzerinde olumsuz etkilere sahiptir. Çevrede kalıcı olabilir, besin zincirinde birikebilir ve insanlar da dahil olmak üzere hedef dışı organizmalara zarar verebilirler. Toprak ve su kaynakları bu pestisitlerle kirlenir. Pestisit kalıntılarının topraktan uzaklaştırılması karmaşık bir süreçtir çünkü topraktaki kalıntılar uzun süre kalabilir ve toprak profilinin derinliklerine nüfuz edebilir. Topraktaki pestisit kalıntılarını azaltmaya yardımcı olabilecek çeşitli yöntemler mevcuttur. Toprakta doğal olarak bulunan mikroorganizmalar, biyolojik süreçler yoluyla pestisit kalıntılarını parçalayabilir. Bakteriler, mantarlar ve diğer mikroorganizmalar pestisitleri daha basit ve daha az toksik bileşiklere parçalayabilir. Bakteri türleri, pestisitlerle kirlenmiş ortamların doğal olarak azaltılmasında ve biyolojik olarak parçalanmasında önemli rol oynarlar. Birçok bakteri türü pestisitleri parçalama yetenekleriyle bilinmektedir. Bunlardan öne çıkanlar şunlardır: Pseudomonas, Bacillus Sphingomonas, Arthrobacter ve Rhodococcus türleri. Bu derleme, pestisitleri güvenli ve etkili bir şekilde parçalama yeteneğine sahip bakteri türlerini vurgulamaktadır.

Etik Beyan

Sorumlu yazar herhangi bir çıkar çatışması olmadığını beyan eder.

Destekleyen Kurum

Kurumsal bir destekleme sağlanmamıştır

Proje Numarası

No funding was received for conducting this study.

Kaynakça

  • Abraham, W. R., Nogales, B., Golyshin, P. N., Pieper, D. H., & Timmis, K. N. (2002). Polychlorinated biphenyl-degrading microbial communities in soils and sediments. Current opinion in microbiology, 5(3), 246-253.
  • Ahirwar, N. K., Singh, R., Chaurasia, S., Chandra, R., & Ramana, S. (2020). Effective role of beneficial microbes in achieving the sustainable agriculture and eco-friendly environment development goals: a review. Front. Microbiol, 5, 111-123.
  • Aislabie J, Lloyd-Jones G (1995). A review of bacterial-degradation of pesticides. Aust. J. Soil Res., 33: 925-942.
  • Arias-Estévez, M., López-Periago, E., Martínez-Carballo, E., Simal-Gándara, J., Mejuto, J. C., & García-Río, L. (2008). The mobility and degradation of pesticides in soils and the pollution of groundwater resources. Agriculture, ecosystems & environment, 123(4), 247-260.
  • Asim, N., Hassan, M., Shafique, F., Ali, M., Nayab, H., Shafi, N., ... & Manzoor, S. (2021). Characterizations of novel pesticide-degrading bacterial strains from industrial wastes found in the industrial cities of Pakistan and their biodegradation potential. PeerJ, 9, e12211.
  • Balthazor, T. M., & Hallas, L. E. (1986). Glyphosate-degrading microorganisms from industrial activated sludge. Applied and environmental microbiology, 51(2), 432-434.
  • Beard, J., & Australian Rural Health Research Collaboration. (2006). DDT and human health. Science of the total environment, 355(1-3), 78-89.
  • Boudh, S., & Singh, J. S. (2018). Pesticide contamination: environmental problems and remediation strategies. In Emerging and eco-friendly approaches for waste management (pp. 245-269). Singapore: Springer Singapore.
  • Cao D., He S., Li X., Shi L., Wang F., Yu S., Xu S., Ju C., Fang H., Yu Y. Characterization, Genome Functional Analysis, and Detoxification of Atrazine by Arthrobacter sp. C2. Chemosphere. 2021;264:128514. doi: 10.1016/j.chemosphere.2020.128514.
  • Cavaliere, M., Feng, S., Soyer, O. S., & Jiménez, J. I. (2017). Cooperation in microbial communities and their biotechnological applications. Environmental microbiology, 19(8), 2949-2963.
  • Chakraborty, S., Behrens, M., Herman, P. L., Arendsen, A. F., Hagen, W. R., Carlson, D. L., ... & Weeks, D. P. A three-component dicamba O-demethylase from Pseudomonas maltophilia, strain DI-6: purification and characterization. Archives of biochemistry and biophysics, 437(1), 20-28.
  • Damalas, C. A. (2009). Understanding benefits and risks of pesticide use. Sci. Res. Essays, 4(10), 945-949.
  • Dubey, S., & Dhanya, M. S. (2023). Chlorpyrifos degradation in semi-arid soil by Pseudomonas fluorescens strain CD5 isolated from manured soil. Soil and Sediment Contamination: An International Journal, 32(4), 460-477.
  • Fang, H., Dong, B., Yan, H., Tang, F., & Yu, Y. (2010). Characterization of a bacterial strain capable of degrading DDT congeners and its use in bioremediation of contaminated soil. Journal of hazardous materials, 184(1-3), 281-289.
  • Fareed, A., Riaz, S., Nawaz, I., Iqbal, M., Ahmed, R., Hussain, J., ... & Naqvi, T. A. (2019). Immobilized cells of a novel bacterium increased the degradation of N-methylated carbamates under low temperature conditions. Heliyon, 5(11).
  • Faust, K., & Raes, J. (2012). Microbial interactions: from networks to models. Nature Reviews Microbiology, 10(8), 538-550.
  • Geiser, K. (2015). Chemicals without harm: Policies for a sustainable world. MIT Press.
  • Gill, H. K., & Garg, H. (2014). Pesticide: environmental impacts and management strategies. Pesticides-toxic aspects, 8(187), 10-5772.
  • Gouma, S. (2009). Biodegradation of mixtures of pesticides by bacteria and white rot fungi.
  • Gullino, M.L., Minuto, A., Gilardi, G., Garibaldi, A., Ajwa, H. ve Duafala, T. 2002. “Efficacy of preplant soil fumigation with chloropicrin for tomato production in Italy”, Crop Protection, 21, 741-749.
  • Hashimi, M. H., Hashimi, R., & Ryan, Q. (2020). Toxic effects of pesticides on humans, plants, animals, pollinators and beneficial organisms. Asian plant research journal, 5(4), 37-47.
  • Hussaini, S. Z., Shaker, M., & Iqbal, M. A. (2013). Isolation of bacterial for degradation of selected pesticides. Adv Biores, 4(3), 82-85.
  • Ibekwe, A. M., Papiernik, S. K., & Yang, C. H. (2004). Enrichment and molecular characterization of chloropicrin-and metam-sodium-degrading microbial communities. Applied microbiology and biotechnology, 66, 325-332.
  • James, J. R., Tweedy, B. G., & Newby, L. C. (1993). Efforts by industry to improve the environmental safety of pesticides. Annual Review of Phytopathology, 31(1), 423-439.
  • Kah, M., Beulke, S., & Brown, C. D. (2007). Factors influencing degradation of pesticides in soil. Journal of agricultural and food chemistry, 55(11), 4487-4492.
  • Kanan, S., Moyet, M. A., Arthur, R. B., & Patterson, H. H. (2020). Recent advances on TiO2-based photocatalysts toward the degradation of pesticides and major organic pollutants from water bodies. Catalysis Reviews, 62(1), 1-65.
  • Katsuyama, C., Nakaoka, S., Takeuchi, Y., Tago, K., Hayatsu, M., & Kato, K. (2009). Complementary cooperation between two syntrophic bacteria in pesticide degradation. Journal of Theoretical Biology, 256(4), 644-654.
  • Keprasertsup, C., Upatham, E. S., Sukhapanth, N., & Prempree, P. (2001). Degradation of methyl parathion in an aqueous medium by soil bacteria. Sci Asia, 27, 261-270.
  • Kim, K. H., Kabir, E., & Jahan, S. A. (2017). Exposure to pesticides and the associated human health effects. Science of the total environment, 575, 525-535.
  • Kumar, P., & Sachan, S. G. (2021). Exploring microbes as bioremediation tools for the degradation of pesticides. In Advanced oxidation processes for effluent treatment plants (pp. 51-67). Elsevier.
  • Laemmli CM, Leveau JHJ, Zehnder AJB, Vandermeer JR (2000). Characterization of a second tfd gene cluster for chlorophenol and chlorocatechol metabolism on plasmid pJP4 in Ralstonia eutropha JMP134 (pJP4). J. Bacteriol., 182: 4165-4172.
  • Li, W., Dai, Y., Xue, B., Li, Y., Peng, X., Zhang, J., & Yan, Y. (2009). Biodegradation and detoxification of endosulfan in aqueous medium and soil by Achromobacter xylosoxidans strain CS5. Journal of hazardous materials, 167(1-3), 209-216.
  • Li, X., Yin, X., & Lian, B. (2017). The degradation of dimethoate and the mineral immobilizing function for Cd2+ by Pseudomonas putida. Geomicrobiology journal, 34(4), 346-354.
  • Lo, C. C. (2010). Effect of pesticides on soil microbial community. Journal of Environmental Science and Health Part B, 45(5), 348-359.
  • Maier, R. M., & Pepper, I. L. (2009). Bacterial communities in natural ecosystems. In Environmental microbiology (pp. 347-356). Academic Press.
  • Maloney, S. E. (2001). Pesticide degradation. In British mycological society symposium series (Vol. 23, pp. 188-223).
  • Megharaj, M., Ramakrishnan, B., Venkateswarlu, K., Sethunathan, N., & Naidu, R. (2011). Bioremediation approaches for organic pollutants: a critical perspective. Environment international, 37(8), 1362-1375.
  • Mónica, P., Darwin, R. O., Manjunatha, B., Zúñiga, J. J., Diego, R., Bryan, R. B., ... & Maddela, N. R. (2016). Evaluation of various pesticides-degrading pure bacterial cultures isolated from pesticide-contaminated soils in Ecuador. African Journal of Biotechnology, 15(40), 2224-2233.
  • Mulchandani A, Kaneva I, Chen W (1999). Detoxification of organophosphate pesticides by immobilized Escherichia coli expressing organophosphorus hydrolase on cell surface. Biotechnol. Bioeng., 63: 216-223.
  • Nadeau LJ, Fu-Min M, Breen A, Sayler GS (1994). Aerobic degradation of (1,1,1 trichloro-2,2-bis (4-chlorophenyl) ethane) DDT by Alcaligenes eutrophus A5. Appl. Environ. Microbiol. 60:51-55.
  • Nguyen, T. P. O., De Mot, R., & Springael, D. (2015). Draft genome sequence of the carbofuran-mineralizing Novosphingobium sp. strain KN65. 2. Genome Announcements, 3(4), 10-1128.
  • Nguyen N.T., Vo V.T., Nguyen T.H.P., Kiefer R. (2022). Isolation and Optimization of a Glyphosate-Degrading Rhodococcus soli G41 for Bioremediation. Arch. Microbiol. 2022;204:252. doi: 10.1007/s00203-022-02875-0.
  • Ortiz-Hernández, M. L., Sánchez-Salinas, E., Dantán-González, E., & Castrejón-Godínez, M. L. (2013). Pesticide biodegradation: mechanisms, genetics and strategies to enhance the process. Biodegradation-life of Science, 10, 251-287.
  • Parekh NR, Hartmann A, Charnay MP, Fournier JC (1995). Diversity of carbofuran-degrading soil bacteria and detection of plasmid-encoded sequences homologous to the mcd gene. FEMS Microbiol. Ecol. 17:149-160.
  • Ramakrishnan B, Megharaj M, Venkateswarlu K, Sethunathan N, Naidu R. (2011). Mixtures of Environmental Pollutants: Effects on Microorganisms and Their Activities in Soils Reviews of Environmental Contamination and Toxicology, 211: 63-120.
  • Rangasamy, K., Athiappan, M., Devarajan, N., & Parray, J. A. (2017). Emergence of multi drug resistance among soil bacteria exposing to insecticides. Microbial Pathogenesis, 105, 153-165.
  • Richins D, Kaneva I, Mulchandani A, Chen W (1997). Biodegradation of organophosphorus pesticides by surface-expressed organophosphorus hydrolase. Nat. Biotechnol., 15: 984-987.
  • Ruomeng, B., Meihao, O., Siru, Z., Shichen, G., Yixian, Z., Junhong, C. & Baishan, F. (2023). Degradation strategies of pesticide residue: From chemicals to synthetic biology. Synthetic and Systems Biotechnology, 8(2), 302-313.
  • Sánchez-Bayo, F. (2012). Insecticides mode of action in relation to their toxicity to non-target organisms. J. Environ. Anal. Toxicol. S, 4, S4-002.
  • Scott, J. P., & Ollis, D. F. (1995). Integration of chemical and biological oxidation processes for water treatment: review and recommendations. Environmental Progress, 14(2), 88-103.
  • Seo, J. S., Keum, Y. S., & Li, Q. X. (2013). Metabolomic and proteomic insights into carbaryl catabolism by Burkholderia sp. C3 and degradation of ten N-methylcarbamates. Biodegradation, 24, 795-811.
  • Sharma, S. K., Ramesh, A., Sharma, M. P., Joshi, O. P., Govaerts, B., Steenwerth, K. L., & Karlen, D. L. (2010). Microbial community structure and diversity as indicators for evaluating soil quality. In Biodiversity, biofuels, agroforestry and conservation agriculture (pp. 317-358). Dordrecht: Springer Netherlands.
  • Singh, B. K., & Walker, A. (2006). Microbial degradation of organophosphorus compounds. FEMS microbiology reviews, 30(3), 428-471.
  • Singh, N. S., Sharma, R., Parween, T., & Patanjali, P. K. (2018). Pesticide contamination and human health risk factor. Modern age environmental problems and their remediation, 49-68.
  • Thanossoulopoulos, C. C., Glannopolitis, C.H., ve Kıtsos, G.T., 1970. “Evolution of senstiveness av development of Resistance of Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici to Benomyl”. Phytopath. Z., 70, 114-120.
  • Torsvik, V., & Øvreas, L. (2002). Microbial diversity and function in soil: from genes to ecosystems. Current opinion in microbiology, 5(3), 240-245.
  • Triky-Dotan, S., Austerweil, M., Steiner, B., Peretez-Alon, Y., Katan, J., ve Gamliel, A. 2007. “Generation and Dissipation of Methyl isothiocyanate in soils following metam sodyum fumigation, impact on Verticillium control and potato yield”, Plant Dis. 91,497-503.
  • Triky-Dotan, S., Ofek, M., Austerweil, M., Steiner, B., Minz, D., Katan, J., & Gamliel, A. (2010). Microbial aspects of accelerated degradation of metam sodium in soil. Phytopathology, 100(4), 367-375.
  • Tudi, M., Daniel Ruan, H., Wang, L., Lyu, J., Sadler, R., Connell, D., ... & Phung, D. T. (2021). Agriculture development, pesticide application and its impact on the environment. International journal of environmental research and public health, 18(3), 1112.
  • Valls, M., & De Lorenzo, V. (2002). Exploiting the genetic and biochemical capacities of bacteria for the remediation of heavy metal pollution. FEMS microbiology Reviews, 26(4), 327-338.
  • Volova, T. G., Prudnikova, S. V., Vinogradova, O. N., Syrvacheva, D. A., & Shishatskaya, E. I. (2017). Microbial degradation of polyhydroxyalkanoates with different chemical compositions and their biodegradability. Microbial ecology, 73(2), 353-367.
  • Ware, G. W. (1980). Effects of pesticides on nontarget organisms. Residue Reviews: Residues of Pesticides and Other Contaminants in the Total Environment, 173-201.
  • Wu,V S., Zhong, J., Lei, Q., Song, H., Chen, S. F., Wahla, A. Q., & Chen, S. (2023). New roles for Bacillus thuringiensis in the removal of environmental pollutants. Environmental Research, 236, 116699.
  • Zhao, H., Tao, K., Zhu, J., Liu, S., Gao, H., & Zhou, X. (2015). Bioremediation potential of glyphosate-degrading Pseudomonas spp. strains isolated from contaminated soil. The Journal of general and applied microbiology, 61(5), 165-170.

Bacterial Biodegredation of Pesticides

Yıl 2025, Cilt: 4 Sayı: 2, 168 - 179, 30.12.2025
https://doi.org/10.59128/bojans.1805738
https://izlik.org/JA53UM56FX

Öz

Chemical control in agriculture is a common practice worldwide and serves several purposes in crop production. Pesticides act as an effective control way of pests and diseases. They can provide rapid and targeted control, reducing pest populations and minimizing crop damage in a relatively short period. However, the intensive use of pesticides has a negative impact on the environment and human health. They may persist in the environment, accumulate in the food chain, and potentially harm non-target organisms, including humans. Soil and water sources are contaminated with these pesticides. Eliminating pesticide residues from soil is a complex process because residues in soil can persist for long periods and may penetrate deeper into the soil profile. Several methods can help mitigate pesticide residues in the soil. Microorganisms naturally present in the soil can degrade pesticide residues through biological processes. Bacteria, fungi, and other microorganisms can break down pesticides into simpler, less toxic compounds. Bacterial species play vital role in the natural attenuation and bioremediation of pesticide-contaminated environments. Several bacterial species are known for their ability to degrade pesticides. Some of the notable ones include: Pseudomonas, Bacillus Sphingomonas, Arthrobacter and Rhodococcus species. This review highlights bacterial strains having pesticide biodegradation capability in a the safety and effective way.

Etik Beyan

The corresponding author affirms that there is no conflict of interest.

Destekleyen Kurum

No support was received for the article

Proje Numarası

No funding was received for conducting this study.

Kaynakça

  • Abraham, W. R., Nogales, B., Golyshin, P. N., Pieper, D. H., & Timmis, K. N. (2002). Polychlorinated biphenyl-degrading microbial communities in soils and sediments. Current opinion in microbiology, 5(3), 246-253.
  • Ahirwar, N. K., Singh, R., Chaurasia, S., Chandra, R., & Ramana, S. (2020). Effective role of beneficial microbes in achieving the sustainable agriculture and eco-friendly environment development goals: a review. Front. Microbiol, 5, 111-123.
  • Aislabie J, Lloyd-Jones G (1995). A review of bacterial-degradation of pesticides. Aust. J. Soil Res., 33: 925-942.
  • Arias-Estévez, M., López-Periago, E., Martínez-Carballo, E., Simal-Gándara, J., Mejuto, J. C., & García-Río, L. (2008). The mobility and degradation of pesticides in soils and the pollution of groundwater resources. Agriculture, ecosystems & environment, 123(4), 247-260.
  • Asim, N., Hassan, M., Shafique, F., Ali, M., Nayab, H., Shafi, N., ... & Manzoor, S. (2021). Characterizations of novel pesticide-degrading bacterial strains from industrial wastes found in the industrial cities of Pakistan and their biodegradation potential. PeerJ, 9, e12211.
  • Balthazor, T. M., & Hallas, L. E. (1986). Glyphosate-degrading microorganisms from industrial activated sludge. Applied and environmental microbiology, 51(2), 432-434.
  • Beard, J., & Australian Rural Health Research Collaboration. (2006). DDT and human health. Science of the total environment, 355(1-3), 78-89.
  • Boudh, S., & Singh, J. S. (2018). Pesticide contamination: environmental problems and remediation strategies. In Emerging and eco-friendly approaches for waste management (pp. 245-269). Singapore: Springer Singapore.
  • Cao D., He S., Li X., Shi L., Wang F., Yu S., Xu S., Ju C., Fang H., Yu Y. Characterization, Genome Functional Analysis, and Detoxification of Atrazine by Arthrobacter sp. C2. Chemosphere. 2021;264:128514. doi: 10.1016/j.chemosphere.2020.128514.
  • Cavaliere, M., Feng, S., Soyer, O. S., & Jiménez, J. I. (2017). Cooperation in microbial communities and their biotechnological applications. Environmental microbiology, 19(8), 2949-2963.
  • Chakraborty, S., Behrens, M., Herman, P. L., Arendsen, A. F., Hagen, W. R., Carlson, D. L., ... & Weeks, D. P. A three-component dicamba O-demethylase from Pseudomonas maltophilia, strain DI-6: purification and characterization. Archives of biochemistry and biophysics, 437(1), 20-28.
  • Damalas, C. A. (2009). Understanding benefits and risks of pesticide use. Sci. Res. Essays, 4(10), 945-949.
  • Dubey, S., & Dhanya, M. S. (2023). Chlorpyrifos degradation in semi-arid soil by Pseudomonas fluorescens strain CD5 isolated from manured soil. Soil and Sediment Contamination: An International Journal, 32(4), 460-477.
  • Fang, H., Dong, B., Yan, H., Tang, F., & Yu, Y. (2010). Characterization of a bacterial strain capable of degrading DDT congeners and its use in bioremediation of contaminated soil. Journal of hazardous materials, 184(1-3), 281-289.
  • Fareed, A., Riaz, S., Nawaz, I., Iqbal, M., Ahmed, R., Hussain, J., ... & Naqvi, T. A. (2019). Immobilized cells of a novel bacterium increased the degradation of N-methylated carbamates under low temperature conditions. Heliyon, 5(11).
  • Faust, K., & Raes, J. (2012). Microbial interactions: from networks to models. Nature Reviews Microbiology, 10(8), 538-550.
  • Geiser, K. (2015). Chemicals without harm: Policies for a sustainable world. MIT Press.
  • Gill, H. K., & Garg, H. (2014). Pesticide: environmental impacts and management strategies. Pesticides-toxic aspects, 8(187), 10-5772.
  • Gouma, S. (2009). Biodegradation of mixtures of pesticides by bacteria and white rot fungi.
  • Gullino, M.L., Minuto, A., Gilardi, G., Garibaldi, A., Ajwa, H. ve Duafala, T. 2002. “Efficacy of preplant soil fumigation with chloropicrin for tomato production in Italy”, Crop Protection, 21, 741-749.
  • Hashimi, M. H., Hashimi, R., & Ryan, Q. (2020). Toxic effects of pesticides on humans, plants, animals, pollinators and beneficial organisms. Asian plant research journal, 5(4), 37-47.
  • Hussaini, S. Z., Shaker, M., & Iqbal, M. A. (2013). Isolation of bacterial for degradation of selected pesticides. Adv Biores, 4(3), 82-85.
  • Ibekwe, A. M., Papiernik, S. K., & Yang, C. H. (2004). Enrichment and molecular characterization of chloropicrin-and metam-sodium-degrading microbial communities. Applied microbiology and biotechnology, 66, 325-332.
  • James, J. R., Tweedy, B. G., & Newby, L. C. (1993). Efforts by industry to improve the environmental safety of pesticides. Annual Review of Phytopathology, 31(1), 423-439.
  • Kah, M., Beulke, S., & Brown, C. D. (2007). Factors influencing degradation of pesticides in soil. Journal of agricultural and food chemistry, 55(11), 4487-4492.
  • Kanan, S., Moyet, M. A., Arthur, R. B., & Patterson, H. H. (2020). Recent advances on TiO2-based photocatalysts toward the degradation of pesticides and major organic pollutants from water bodies. Catalysis Reviews, 62(1), 1-65.
  • Katsuyama, C., Nakaoka, S., Takeuchi, Y., Tago, K., Hayatsu, M., & Kato, K. (2009). Complementary cooperation between two syntrophic bacteria in pesticide degradation. Journal of Theoretical Biology, 256(4), 644-654.
  • Keprasertsup, C., Upatham, E. S., Sukhapanth, N., & Prempree, P. (2001). Degradation of methyl parathion in an aqueous medium by soil bacteria. Sci Asia, 27, 261-270.
  • Kim, K. H., Kabir, E., & Jahan, S. A. (2017). Exposure to pesticides and the associated human health effects. Science of the total environment, 575, 525-535.
  • Kumar, P., & Sachan, S. G. (2021). Exploring microbes as bioremediation tools for the degradation of pesticides. In Advanced oxidation processes for effluent treatment plants (pp. 51-67). Elsevier.
  • Laemmli CM, Leveau JHJ, Zehnder AJB, Vandermeer JR (2000). Characterization of a second tfd gene cluster for chlorophenol and chlorocatechol metabolism on plasmid pJP4 in Ralstonia eutropha JMP134 (pJP4). J. Bacteriol., 182: 4165-4172.
  • Li, W., Dai, Y., Xue, B., Li, Y., Peng, X., Zhang, J., & Yan, Y. (2009). Biodegradation and detoxification of endosulfan in aqueous medium and soil by Achromobacter xylosoxidans strain CS5. Journal of hazardous materials, 167(1-3), 209-216.
  • Li, X., Yin, X., & Lian, B. (2017). The degradation of dimethoate and the mineral immobilizing function for Cd2+ by Pseudomonas putida. Geomicrobiology journal, 34(4), 346-354.
  • Lo, C. C. (2010). Effect of pesticides on soil microbial community. Journal of Environmental Science and Health Part B, 45(5), 348-359.
  • Maier, R. M., & Pepper, I. L. (2009). Bacterial communities in natural ecosystems. In Environmental microbiology (pp. 347-356). Academic Press.
  • Maloney, S. E. (2001). Pesticide degradation. In British mycological society symposium series (Vol. 23, pp. 188-223).
  • Megharaj, M., Ramakrishnan, B., Venkateswarlu, K., Sethunathan, N., & Naidu, R. (2011). Bioremediation approaches for organic pollutants: a critical perspective. Environment international, 37(8), 1362-1375.
  • Mónica, P., Darwin, R. O., Manjunatha, B., Zúñiga, J. J., Diego, R., Bryan, R. B., ... & Maddela, N. R. (2016). Evaluation of various pesticides-degrading pure bacterial cultures isolated from pesticide-contaminated soils in Ecuador. African Journal of Biotechnology, 15(40), 2224-2233.
  • Mulchandani A, Kaneva I, Chen W (1999). Detoxification of organophosphate pesticides by immobilized Escherichia coli expressing organophosphorus hydrolase on cell surface. Biotechnol. Bioeng., 63: 216-223.
  • Nadeau LJ, Fu-Min M, Breen A, Sayler GS (1994). Aerobic degradation of (1,1,1 trichloro-2,2-bis (4-chlorophenyl) ethane) DDT by Alcaligenes eutrophus A5. Appl. Environ. Microbiol. 60:51-55.
  • Nguyen, T. P. O., De Mot, R., & Springael, D. (2015). Draft genome sequence of the carbofuran-mineralizing Novosphingobium sp. strain KN65. 2. Genome Announcements, 3(4), 10-1128.
  • Nguyen N.T., Vo V.T., Nguyen T.H.P., Kiefer R. (2022). Isolation and Optimization of a Glyphosate-Degrading Rhodococcus soli G41 for Bioremediation. Arch. Microbiol. 2022;204:252. doi: 10.1007/s00203-022-02875-0.
  • Ortiz-Hernández, M. L., Sánchez-Salinas, E., Dantán-González, E., & Castrejón-Godínez, M. L. (2013). Pesticide biodegradation: mechanisms, genetics and strategies to enhance the process. Biodegradation-life of Science, 10, 251-287.
  • Parekh NR, Hartmann A, Charnay MP, Fournier JC (1995). Diversity of carbofuran-degrading soil bacteria and detection of plasmid-encoded sequences homologous to the mcd gene. FEMS Microbiol. Ecol. 17:149-160.
  • Ramakrishnan B, Megharaj M, Venkateswarlu K, Sethunathan N, Naidu R. (2011). Mixtures of Environmental Pollutants: Effects on Microorganisms and Their Activities in Soils Reviews of Environmental Contamination and Toxicology, 211: 63-120.
  • Rangasamy, K., Athiappan, M., Devarajan, N., & Parray, J. A. (2017). Emergence of multi drug resistance among soil bacteria exposing to insecticides. Microbial Pathogenesis, 105, 153-165.
  • Richins D, Kaneva I, Mulchandani A, Chen W (1997). Biodegradation of organophosphorus pesticides by surface-expressed organophosphorus hydrolase. Nat. Biotechnol., 15: 984-987.
  • Ruomeng, B., Meihao, O., Siru, Z., Shichen, G., Yixian, Z., Junhong, C. & Baishan, F. (2023). Degradation strategies of pesticide residue: From chemicals to synthetic biology. Synthetic and Systems Biotechnology, 8(2), 302-313.
  • Sánchez-Bayo, F. (2012). Insecticides mode of action in relation to their toxicity to non-target organisms. J. Environ. Anal. Toxicol. S, 4, S4-002.
  • Scott, J. P., & Ollis, D. F. (1995). Integration of chemical and biological oxidation processes for water treatment: review and recommendations. Environmental Progress, 14(2), 88-103.
  • Seo, J. S., Keum, Y. S., & Li, Q. X. (2013). Metabolomic and proteomic insights into carbaryl catabolism by Burkholderia sp. C3 and degradation of ten N-methylcarbamates. Biodegradation, 24, 795-811.
  • Sharma, S. K., Ramesh, A., Sharma, M. P., Joshi, O. P., Govaerts, B., Steenwerth, K. L., & Karlen, D. L. (2010). Microbial community structure and diversity as indicators for evaluating soil quality. In Biodiversity, biofuels, agroforestry and conservation agriculture (pp. 317-358). Dordrecht: Springer Netherlands.
  • Singh, B. K., & Walker, A. (2006). Microbial degradation of organophosphorus compounds. FEMS microbiology reviews, 30(3), 428-471.
  • Singh, N. S., Sharma, R., Parween, T., & Patanjali, P. K. (2018). Pesticide contamination and human health risk factor. Modern age environmental problems and their remediation, 49-68.
  • Thanossoulopoulos, C. C., Glannopolitis, C.H., ve Kıtsos, G.T., 1970. “Evolution of senstiveness av development of Resistance of Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici to Benomyl”. Phytopath. Z., 70, 114-120.
  • Torsvik, V., & Øvreas, L. (2002). Microbial diversity and function in soil: from genes to ecosystems. Current opinion in microbiology, 5(3), 240-245.
  • Triky-Dotan, S., Austerweil, M., Steiner, B., Peretez-Alon, Y., Katan, J., ve Gamliel, A. 2007. “Generation and Dissipation of Methyl isothiocyanate in soils following metam sodyum fumigation, impact on Verticillium control and potato yield”, Plant Dis. 91,497-503.
  • Triky-Dotan, S., Ofek, M., Austerweil, M., Steiner, B., Minz, D., Katan, J., & Gamliel, A. (2010). Microbial aspects of accelerated degradation of metam sodium in soil. Phytopathology, 100(4), 367-375.
  • Tudi, M., Daniel Ruan, H., Wang, L., Lyu, J., Sadler, R., Connell, D., ... & Phung, D. T. (2021). Agriculture development, pesticide application and its impact on the environment. International journal of environmental research and public health, 18(3), 1112.
  • Valls, M., & De Lorenzo, V. (2002). Exploiting the genetic and biochemical capacities of bacteria for the remediation of heavy metal pollution. FEMS microbiology Reviews, 26(4), 327-338.
  • Volova, T. G., Prudnikova, S. V., Vinogradova, O. N., Syrvacheva, D. A., & Shishatskaya, E. I. (2017). Microbial degradation of polyhydroxyalkanoates with different chemical compositions and their biodegradability. Microbial ecology, 73(2), 353-367.
  • Ware, G. W. (1980). Effects of pesticides on nontarget organisms. Residue Reviews: Residues of Pesticides and Other Contaminants in the Total Environment, 173-201.
  • Wu,V S., Zhong, J., Lei, Q., Song, H., Chen, S. F., Wahla, A. Q., & Chen, S. (2023). New roles for Bacillus thuringiensis in the removal of environmental pollutants. Environmental Research, 236, 116699.
  • Zhao, H., Tao, K., Zhu, J., Liu, S., Gao, H., & Zhou, X. (2015). Bioremediation potential of glyphosate-degrading Pseudomonas spp. strains isolated from contaminated soil. The Journal of general and applied microbiology, 61(5), 165-170.
Toplam 64 adet kaynakça vardır.

Ayrıntılar

Birincil Dil İngilizce
Konular Tarımda Bitki Bakteriolojisi
Bölüm Derleme
Yazarlar

H. Nilüfer Yıldız 0000-0002-1945-2272

Proje Numarası No funding was received for conducting this study.
Gönderilme Tarihi 17 Ekim 2025
Kabul Tarihi 26 Aralık 2025
Erken Görünüm Tarihi 30 Aralık 2025
Yayımlanma Tarihi 30 Aralık 2025
DOI https://doi.org/10.59128/bojans.1805738
IZ https://izlik.org/JA53UM56FX
Yayımlandığı Sayı Yıl 2025 Cilt: 4 Sayı: 2

Kaynak Göster

APA Yıldız, H. N. (2025). Bacterial Biodegredation of Pesticides. Bozok Tarım ve Doğa Bilimleri Dergisi, 4(2), 168-179. https://doi.org/10.59128/bojans.1805738

Amaç ve Kapsam

Tarım ve doğal hayat ile ilgili özgün ve ileri teknoloji araştırma sonuç ve yorumlarını yayınlamayı hedeflemektedir. Hayvansal üretim, bitkisel üretim, su ürünleri, toprak bilimi, sürdürülebilir tarım sistemleri, tarım ekonomisi, genetik, tarımsal istatistik, bitki koruma, tarım makineleri, gıda mühendisliği, biyoloji, biyoteknoloji, peyzaj mimarlığı, orman mühensdisliği, endüstriyel kenevir  konularında araştırma ve derleme makalelerini yayınlamaktadır.

Dergi yeni bulgular ortaya koyan ulaşılabilir ve uygulanabilir temel ve uygulamalı yöntem ve tekniklerin sunulduğu bir platformdur. Güncel konularda hazırlanan derleme çalışmalarda basım için kabul edilebilir. Basım dili Türkçe ve İngilizcedir.

Dergiye gönderilecek makale, A4 boyutunda olmalıdır. Makalenin her sayfası ve satırları numaralandırılmalıdır. Makale toplam 20 sayfayı geçmemelidir.

Dergimizin ŞABLONUNU kullanmanızı öneririz. ŞABLON için tıklayınız:

TELİF HAKKI DEVİR FORMU için tıklayınız:

KAPAK DOSYASI için tıklayınız:


Yazar ad(lar)ı açık olarak ve 11 punto Calibri yazı tipi ile yazılmalı (akademik unvan belirtilmemeli), tüm yazarların adres bilgileri ile yazışma yapılacak yazarın iletişim bilgileri (e-mail, telefon, ORCID ID vb.) belirtilmeli ve 10 punto Calibri yazı tipi kullanılmalıdır. Adresler kelimelerin ilk harfi büyük olacak şekilde, yazar adlarının hemen altında açıkça yazılmalıdır.
(YAZAR ADLARı ve ADRESLERİ, Tam Metinde yazılmamalı, Kapak Yazısı içinde belirtilmelidir). Sayfa Numarası sağ alt köşede verilmelidir.
Dergiye sunulan makale: Özet, Abstract, Giriş, Materyal ve Yöntem, Bulgular ve Tartışma, Sonuç, Teşekkür (gerekirse) ve Kaynaklar bölümlerinden oluşmalıdır.

Başlık: Makale başlığı kısa ve açıklayıcı ve 20 kelimeyi geçmemelidir ve kısaltma içermemelidir.

Özet: Hem Türkçe ve hem de İngilizce özet 250 kelimeyi geçmeyecek şekilde yazılmalı, makalenin amacını, çalışmanın önemli veri ve sonuçlarını içermelidir. İngilizce hazırlanan makalelerde Türkçe özete gerek yoktur.

Anahtar kelimeler: Alfabetik sıraya göre 5 kelimeyi geçmeyecek ve en az 3 kelime olacak şekilde verilmelidir.

Giriş: Bu bölüm çalışmadaki problemi açıkça ifade etmeli, önceki ve özellikle son yıllardaki yapılan ve yayınlanan çalışmaları açıklamalı, çalışmanın amaçlarını açıkça vermelidir.

Materyal ve Yöntem: Bu bölüm, çalışmada kullanılan tüm materyalleri içermeli, yöntemler detaylı açıklanmalı, istatistiksel metotlar açıklanmalıdır.

Sonuçlar ve Tartışma: Çalışmadaki elde edilen veriler ve bulgular tablo ve bilgi olarak verilmeli, önceki yapılan çalışma sonuçlarına göre yorumlanarak tartışılmalıdır.

Teşekkür: Bu bölümde çalışmanın yapılmasına katkı veren kişi, kuruluş ve projelere yer verilebilir.

Şekiller ve çizelgeler: Tüm şekil ve tablolar numaralandırılıp makale içerisinde olması gereken yerde  verilmelidir. Şekil ve tablo genişlikleri 8 veya 15 cm olabilir. Resimler renkli ve her çözünürlükte olabilir. Makalenin sonunda (Kaynaklardan sonra) Şekiller ve tablolar konumlandırılmalıdır. Resim çözünürlükleri iyi (anlaşılabilir) olmalıdır.

Kaynak Gösterme biçimi APA 6'dır
Kaynaklar: Makale içinde tek yazar için yazarın soyadı ve yayım tarihi (Akın, 2022), ikili yazarlarda yazar soyadları arasında ‘ve’ (Karadağ ve Yılmaz 2019) şeklinde verilmelidir. 3 ve daha fazla yazarların atıf ve kaynak gösteriminde ilk yazarın soyadından sonra ‘ve ark.’ (Gürbüz ve ark., 2021) şeklinde yazılmalıdır. Aynı yazarın aynı tarihli birden fazla eserine atıfta bulunulacaksa, yıla bitişik biçimde ‘a, b’ şeklinde harflendirilmesi yapılmalıdır (Gülümser, 2015a,b). Kaynaklar bölümü alfabetik ve kronolojik sıralamaya göre 12 punto -1,25 cm Asılı girinti verilmelidir. Kaynaklar; yararlanılan makale, kitap, kongre bildirisi, kitap bölümü vb. aşağıda verilenler gibi listelenmelidir:

Yazici, K. ve Gülgün B. (2021). The Alternatives Use of Aquatic Plants in Geopark within Approach Landscape Ecology. Environment, Development and Sustainability, 23, 4086–4102.

Gürbüz, Y. (2019). Determination of The Effect of Technological Procedures Applied in Feed Factories on Mixed Feed Nutrition and Forming Quality Critical Points. Turkish Journal of Agriculture - Food Science and Technology, 7(12), 2245–2251.

Gülgün B., Köse, M., Yazici, K., Dursun, Ş., Ankaya, F., ve Köse, H. (2015). Soil polutions in The Environment Created by Developing Technology and Biological Measures in Soil Pollution. Presented at the 5th Internatonal Conference of Ecosystems, Tirana. (Bildiri alıntı örneği)

FAO, (2019). World chestnut production list. http://www.fao.org/faostat/en/#data/QC. Access date: 03.06.2020 (Yazarı olmayan web site alıntı)

Yazici, K. (2021).Peyzajın Temel Yapı Taşları. Gece Kitabevi,  Basım sayısı:1, Sayfa sayısı:255, ISBN:978-625-7793-41-4, Ankara. (Kitap alıntı örneği)

Yazici, K. (2018). The Most Recent Studıes in Scıence and Art, Evaluatıon of The Vısual Qualıty of Hıstorıcal Surroundıngs in Urban Landscape wıth Q-Sort Analysıs,  ISBN:978-605-288-356-3, Bölüm Sayfaları:537 -551. (Kitap Böl. Alıntı Örneği).

Yılmaz, G. (1993).Bazı patates (Solanum tuberosum L.) çeşit ve hatlarında genotip x çevre etkileşimleri üzerinde araştırmalar, Gaziosmanpaşa Üniversitesi , Fen Bilimleri Enstitüsü, Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı Anabilim dalı, Doktora Tezi. (Tez alıntı Örneği)

BOZOK TARIM VE DOĞA BİLİMLERİ DERGİSİ'nin yayın etiği ve açık erişim politikası, yayın sürecinin tüm paydaşlarının kılavuz ve politikalar doğrultusunda etik ilkelere uymasını şart koşmaktadır (Örneğin, "Yayın Etiği Kurulu (COPE) Davranış Kuralları ve En İyi Uygulama İlkeleri" Dergi Editörleri için; Yayın Etiği Komitesi (Committee on Publication Ethics, COPE) tarafından açık erişimle yayınlanan "Dergi Editörleri için Davranış Kuralları ve En İyi Uygulama Yönergeleri" ve" Dergi Editörleri için COPE En İyi Uygulama Yönergeleri").

Makalelerde kullanılan verilerin manipüle edilmesi, tahrif edilmesi, makyaj verilerinin kullanılması gibi durumların tespiti halinde, bu durum yazar(lar)ın kurumlarına resmi olarak bildirilecek ve makale reddedilecektir. Dergi, editörler ve/veya hakemler tarafından verilen geri bildirimlere göre yazarların analiz sonuçlarının çıktı dosyalarını talep etme hakkına sahiptir.


Yayıncının Etik Sorumlulukları

BOZOK TARIM VE DOĞA BİLİMLERİ DERGİSİ' kamu yararınadır ve kar amacı gütmez. Derginin yayın kurulu bir baş editör, bir editör yardımcısı ve alan editörlerinden oluşur. Ayrılan üyenin yerine yeni üye atanır. Editör, makalenin konusuna göre, gerektiğinde yayın kurulu üyesi olmayan ve en az doktora derecesine sahip öğretim üyelerine alan editörü olarak değerlendirilmek üzere makale gönderebilir.

Dergi Yayın Kurulunun Sorumlulukları

Dergiye gönderilen her yazıdan yayın kurulu sorumludur ve yayın kurulu bu sorumluluğun bilincindedir.
Yayın kurulu, dergiyi geliştirmek ve yayın kalitesini sürekli artırmak için çalışmaktadır.
Yayın kurulu, yayın, kör hakemlik, değerlendirme süreci, etik ilkeler gibi dergi politikalarının belirlenmesini ve uygulanmasını sağlar.
Yayın kurulu, makale ve dergilerde fikri mülkiyet hakları, bilim dışı, etik dışı davranışlar ve intihal ile ilgili önlemlerin alınmasından sorumludur.
Dergiye gönderilen yazılar için uzman hakem atama sorumluluğu yayın kuruluna aittir.

BOZOK TARIM VE DOĞA BİLİMLERİ DERGİSİ'nde yayınlanan makale, derleme vb. yazılardan ücret alınmaz, ayrıca dergi yazarlara herhangi bir ücret ödemez.