Meme Kanseri Proteom Profilinin Yüzey Geliştirilmiş Lazer Desorpsiyon / İyonizasyon Uçuş Kütle Spektrometrisi (SELDI-TOF MS) ile Belirlenmesi

Cilt: 2 Sayı: 4 11 Aralık 2015
  • Yasemin Baskın
  • Türkan Yiğitbaşı
  • Murat Kemal Atahan
  • Hasan Küpeli
  • Seyran Yiğit
  • Ercüment Tarcan
PDF İndir
EN TR

Öz

Objective: Surface-enhanced laser desorption/ionization time-of flight mass spectrometry (SELDI-TOF MS) was used to screen serum proteomic profiling to identify protein markers for early breast cancer patients. Methods: We used metal ion affinity chromatography (IMAC30-Cu) for serum proteome fractionation technique and identify differentially expressed peptides (m/z; P < 0.0001) from benign disease and healthy controls as potential biomarkers of early breast cancer. The mass spectra, analyzed using ProteinChip Data Manager Software, distinguished between patients and healthy individuals based on k-nearest neighbor genetic algorithm. We collected 70 serum samples from patients with breast cancer (62 invasive breast carcinoma; 8 ductal carcinoma in situ), 31 bening disease and 37 healthy individuals. Results: Forty two peaks showed statistically significantly different intensities between cases and controls (P<0.05); 10 protein peaks were differentially expressed between the patients and benign disease. These results indicate that there are differences in serum protein expression among the three different groups of patients. Conclusion: SELDI-TOF MS could be used to screen blood samples for the early detection of breast cancer patients. Serum proteomic profiling by SELDI-TOF MS is a novel potential tool for the clinical diagnosis of patients with breast carcinoma.

Anahtar Kelimeler

Kaynakça

  1. Jemal A, Siegel R, Ward E, et al. Cancer statistics. CA Cancer J Clin, 2007; 57 (1): 43-669.
  2. Petterson SD, Aebersold RH. Proteomics: First decade and beyond. Nature Genetics Supplement 2003; 33: 311-32.
  3. Baskın Y. Tıpta teknolojik gelişimin neden olduğu kavram değişimleri: kişiselleştirilmiş tıp. Türk Hijyen ve Deneysel Tıp Dergisi, 2007; 64(2): 54-59. 4. Baskın Y. Yigitbası T. Clinical Proteomics of Breast Cancer. Current Genomics, 2010; 11 (7): 528-536.
  4. Celis JE, Gromov P. Proteomics in tranlational cancer research: Toward an integrated approach. Cancer Cell 2003; 3: 9-15.
  5. Li J, Zhang Z, Rosenzweig J, et al. Proteomics and bioinformatics approaches for identification of serum biomarkers to detect breast cancer. Clin. Chem. 2002; 48: 1296–1304.
  6. Hanash SM, Pitteri SJ, Faca VM. Mining the plasma proteome for cancer biomarkers. Nature, 2008; 452:571– 579.
  7. Becker S, Cazares LH, Watson P et al. Surfaced-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight (SELDI-TOF) differentiation of serum protein profiles of BRCA-1 and sporadic breast cancer. Ann Surg Oncol, 2004; 11: 907– 914.
  8. Laronga C, Becker S, Watson P et al. SELDI-TOF serum profiling for prognostic and diagnostic classification of breast cancers. Dis Markers, 2003; 19: 229–238

Ayrıntılar

Birincil Dil

Türkçe

Konular

-

Bölüm

-

Yazarlar

Yasemin Baskın Bu kişi benim

Türkan Yiğitbaşı Bu kişi benim
Medipol Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Biyokimya A.D

Murat Kemal Atahan Bu kişi benim
Atatürk Eğitim ve Araştırma Hastanesi, 1. Cerrahi Kliniği, İzmir, Türkiye

Hasan Küpeli Bu kişi benim
Atatürk Eğitim ve Araştırma Hastanesi, 1. Cerrahi Kliniği, İzmir, Türkiye

Seyran Yiğit Bu kişi benim

Ercüment Tarcan Bu kişi benim
Atatürk Eğitim ve Araştırma Hastanesi, 1. Cerrahi Kliniği, İzmir, Türkiye

Yayımlanma Tarihi

11 Aralık 2015

Gönderilme Tarihi

11 Temmuz 2016

Kabul Tarihi

-

Yayımlandığı Sayı

Yıl 2015 Cilt: 2 Sayı: 4

Kaynak Göster

APA
Baskın, Y., Yiğitbaşı, T., Atahan, M. K., Küpeli, H., Yiğit, S., & Tarcan, E. (2015). Meme Kanseri Proteom Profilinin Yüzey Geliştirilmiş Lazer Desorpsiyon / İyonizasyon Uçuş Kütle Spektrometrisi (SELDI-TOF MS) ile Belirlenmesi. Celal Bayar Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 2(4), 101-105. https://izlik.org/JA93HM76XW
AMA
1.Baskın Y, Yiğitbaşı T, Atahan MK, Küpeli H, Yiğit S, Tarcan E. Meme Kanseri Proteom Profilinin Yüzey Geliştirilmiş Lazer Desorpsiyon / İyonizasyon Uçuş Kütle Spektrometrisi (SELDI-TOF MS) ile Belirlenmesi. CBU-SBED. 2015;2(4):101-105. https://izlik.org/JA93HM76XW
Chicago
Baskın, Yasemin, Türkan Yiğitbaşı, Murat Kemal Atahan, Hasan Küpeli, Seyran Yiğit, ve Ercüment Tarcan. 2015. “Meme Kanseri Proteom Profilinin Yüzey Geliştirilmiş Lazer Desorpsiyon / İyonizasyon Uçuş Kütle Spektrometrisi (SELDI-TOF MS) ile Belirlenmesi”. Celal Bayar Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Dergisi 2 (4): 101-5. https://izlik.org/JA93HM76XW.
EndNote
Baskın Y, Yiğitbaşı T, Atahan MK, Küpeli H, Yiğit S, Tarcan E (01 Aralık 2015) Meme Kanseri Proteom Profilinin Yüzey Geliştirilmiş Lazer Desorpsiyon / İyonizasyon Uçuş Kütle Spektrometrisi (SELDI-TOF MS) ile Belirlenmesi. Celal Bayar Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Dergisi 2 4 101–105.
IEEE
[1]Y. Baskın, T. Yiğitbaşı, M. K. Atahan, H. Küpeli, S. Yiğit, ve E. Tarcan, “Meme Kanseri Proteom Profilinin Yüzey Geliştirilmiş Lazer Desorpsiyon / İyonizasyon Uçuş Kütle Spektrometrisi (SELDI-TOF MS) ile Belirlenmesi”, CBU-SBED, c. 2, sy 4, ss. 101–105, Ara. 2015, [çevrimiçi]. Erişim adresi: https://izlik.org/JA93HM76XW
ISNAD
Baskın, Yasemin - Yiğitbaşı, Türkan - Atahan, Murat Kemal - Küpeli, Hasan - Yiğit, Seyran - Tarcan, Ercüment. “Meme Kanseri Proteom Profilinin Yüzey Geliştirilmiş Lazer Desorpsiyon / İyonizasyon Uçuş Kütle Spektrometrisi (SELDI-TOF MS) ile Belirlenmesi”. Celal Bayar Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Dergisi 2/4 (01 Aralık 2015): 101-105. https://izlik.org/JA93HM76XW.
JAMA
1.Baskın Y, Yiğitbaşı T, Atahan MK, Küpeli H, Yiğit S, Tarcan E. Meme Kanseri Proteom Profilinin Yüzey Geliştirilmiş Lazer Desorpsiyon / İyonizasyon Uçuş Kütle Spektrometrisi (SELDI-TOF MS) ile Belirlenmesi. CBU-SBED. 2015;2:101–105.
MLA
Baskın, Yasemin, vd. “Meme Kanseri Proteom Profilinin Yüzey Geliştirilmiş Lazer Desorpsiyon / İyonizasyon Uçuş Kütle Spektrometrisi (SELDI-TOF MS) ile Belirlenmesi”. Celal Bayar Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Dergisi, c. 2, sy 4, Aralık 2015, ss. 101-5, https://izlik.org/JA93HM76XW.
Vancouver
1.Yasemin Baskın, Türkan Yiğitbaşı, Murat Kemal Atahan, Hasan Küpeli, Seyran Yiğit, Ercüment Tarcan. Meme Kanseri Proteom Profilinin Yüzey Geliştirilmiş Lazer Desorpsiyon / İyonizasyon Uçuş Kütle Spektrometrisi (SELDI-TOF MS) ile Belirlenmesi. CBU-SBED [Internet]. 01 Aralık 2015;2(4):101-5. Erişim adresi: https://izlik.org/JA93HM76XW