Evaluation of SARS-CoV-2 PCR Test Results During Hospital Admission and Positivity Rates in Pre-Operative Screenings

Yıl 2022, Cilt: 2 Sayı: 3, 8 - 14, 30.12.2022

Fulya Bayındır Bılman Selcuk Kaya Bilal Olcay Peker Tuba Muderrıs Sureyya Gul Yurtsever Egemen Usta Erkan Ozmen Rahim Ozdemır Ilhan Afsar Asli Gamze Karatas Sener Hakan Er Nuray Gundogdu Bayram Pektas Ozlem Ulusan Bagcı

Öz

Objective: Following the emergence of the first cases in Wuhan, China, in late December 2019, the World Health Organization declared the Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) a pandemic which affected the entire world and continues to have an impact. This research aimed to contribute to the epidemiological and present guideline data of the pan-demic by evaluating the COVID-19 RT-PCR test results.
Material and Methods: The results of the SARS-CoV-2 RT-qPCR test, which were studied in the Microbiology Laboratory of the Izmir Ka-tip Celebi University Ataturk Training and Research Hospital between 14.09.2020-30.06.2021, were retrospectively analyzed according to the months and reasons for admission(probable case, pre-operative screening).
Results: The total of probable cases and pre-operative tests was 140.249. The ratio of females to males in test requests was 48.4%/51.6%. The test request rates by age groups were 2.1%, 64.2%, and 33.7% for 0-18 years, 19-50 years, and 51-99 years, respectively. November 2020, December 2020, and April 2021 were the months with the highest number of test requests. The rates of positive results from probable cases and pre-operative tests examined in these months were 26.8%, 25.7%, and 16.5%, respectively. The test positivity rate for probable case testing was 19.3% (21.300/110.381), and the positivity rate for female and male cases was 49.5/50.5% (10.546/10.754). The test positivity rate in asymptomatic cases, tested pre-operatively per screening rules in the pre-operative period, was 4% (1.200/29.868), and the test positivity rate of pre-operative positivity for females and males was 51.6/48.4% (619/584) respectively. As a result of analyzing the ten-month period in our region, COVID-19 infection is more common in males and the age range of 19-50 years, and it also spreads faster in November and April.
Conclusion: An important point to be considered to prevent the spread of infection during the pandemic process is the follow-up of asymptomatic cases.

Anahtar Kelimeler

COVID-19, pandemic, pre-operative COVID-19 testing

Hastaneye Başvurularda SARS-CoV-2 PCR Test Sonuçlarının ve Preoperatif Dönem Taramalarda Pozitiflik Oranlarının Değerlendirilmesi

Öz

Amaç: Aralık 2019 sonlarında Çin’in Wuhan kentinde ilk vakaların ortaya çıkmasının ardından Dünya Sağlık Örgütü tarafından Coronavirüs Hastalığı 2019 (COVID-19) olarak adlandırılan ve tüm dünyayı etkisi altına alan pandemi, etkisini sürdürmeye devam ediyor. İzmir Kâtip Çelebi Üniversitesi Atatürk Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarına gönderilen nazofaringeal sürüntülerde çalışılan COVID-19 RT-PCR test sonuçları değerlendirilerek pandemi çalışmasına katkı sağlayacak epidemiyolojik ve güncel kılavuz verilerine katkı sağlanması amaçlanmıştır.
Gereç ve Yöntemler: İzmir Kâtip Çelebi Üniversitesi Atatürk Eğitim ve Araştırma Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında 14.09.2020-30.06.2021 tarihleri arasında çalışı-lan SARS-CoV-2 RT-qPCR testi sonuçları aylara ve başvuru nedenlerine (olası vaka, ameliyat öncesi tarama) göre retrospektif olarak analiz edildi.
Bulgular: Olası vaka+preoperatif test sayısı 140.249 idi. Test çalışılan kadın/erkek oranı %48,4/%51,6 olarak tespit edildi. Yaş gruplarına göre başvuru oranları 0-18 yaş, 19-50 yaş, 51-99 yaş için sırasıyla %2,1, %64,2 ve %33,7 oldu. En fazla test istemi olan aylar ise Kasım 2020, Aralık 2020 ve Nisan 2021 oldu. Bu aylarda incelenen olası vaka+preoperatif test/pozitif sonuç oranları sırasıyla %26,8, %25,7 ve %16,5 oldu. Olası vaka testlerinde pozitiflik oranı %19,3 (21.300/110.381) ve kadın ve erkek vakalar için pozitiflik oranı %49.5/50.5 (10.546/10.754) idi. Ameliyat öncesi dönemde tarama kuralları gereğince test istenen asemptomatik olgularda pozitiflik oranları ameliyat öncesi dönemde %4 (1.200/29.868), kadın ve erkeklerde ameliyat öncesi pozitiflik oranı %51.6/48.4 (619/584) idi. Bölgemizde 10 aylık dönem incelendiğinde COVID-19 enfeksiyonunun erkeklerde ve 19-50 yaş aralığında daha sık görüldüğü, ayrıca Kasım ve Nisan aylarında daha hızlı yayıldığı görülmektedir.
Sonuç: Pandemi sürecinde enfeksiyonun yayılmasını önlemek için dikkat edilmesi gereken önemli bir nokta da asemptomatik vakaların takibidir.

Anahtar Kelimeler

COVID-19, pandemi, preoperatif COVID-19 testi