BibTex RIS Kaynak Göster

Investigation of PrP locus polymorphisms in some native Turkish sheep breeds

Yıl 2014, Cilt: 30 Sayı: 3, 145 - 151, 01.09.2014

Öz

Aim: The objective of this study was to investigate polymorphisms in codons 136, 154 and 171 of the PrP gene in native sheep breeds of Turkey.Materials and Methods: Sampling (n=175) was conducted from Akkaraman, Guney Karaman, Kangal Akkaraman, Daglic and Awassi breeds. Genomic DNA was isolated using a standard phenol/chloroform method. PrP region was amplified by polymerase chain reaction (PCR) and allele genotypes were determined by using restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. General population parameters including allel numbers (Na), observed (Ho) and expected (He) heterozygosities and deviation from Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE) were calculated.Results: High level of A136R154Q171 genotype was observed in all populations. A136R154Q171, which is known as the most resistant genotype to scrapie, was observed at lower (0.175-0.313) frequencies. However, V136R154Q171, the most susceptible genotype to the disease, was not determined in all investigated breeds. All sheep population investigated in this study were found to be generally in R2 (resistant) and R3 (little resistant) risc categories described in National Scrapie Plan (NSP). Conclusions: It is critically important to consider PrP polymorphisms and increase frequencies of scrapie resistant genotypes in breeding of these breeds.

Türkiye’de bulunan bazı koyun ırklarının PrP lokus polimorfizmleri yönünden incelenmesi

Yıl 2014, Cilt: 30 Sayı: 3, 145 - 151, 01.09.2014

Öz

Amaç: Bu çalışmanın amacı, Türkiye'de bulunan bazı yerli koyun ırklarında PrP lokusu 136., 154. ve 171. kodon polimorfizmlerinin belirlenmesidir.Gereç ve Yöntem: Akkaraman, Güney Karaman, Kangal Akkaraman, Dağlıç ve İvesi koyunlarından (n=175) örnekleme çalışması yapılmıştır. Kan örneklerinden standart fenol/kloroform yöntemi kullanılarak genomik DNA izolasyonu gerçekleştirilmiştir. PrP bölgesi polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile yükseltgenmiş, restriksiyon parça uzunluk polimorfizm (RFLP) analizi ile allel genotipleri tespit edilmiştir. Genel populasyon parametrelerinden allel sayısı (Na), gözlenen (Ho) ve beklenen (He) heterozigotluk değerleri ile HardyWeinberg Dengesinden (HWE) sapma değerleri hesaplanmıştır. Bulgular: Bütün populasyonlarda yüksek oranda A136R154Q171 genotipi tespit edilmiştir. Scrapie’ye en dirençli genotip olarak kabul edilen Aşük (0.175-0.313) oranda gözlenmiştir. Ancak, hastalığa en duyarlı olan V136R154Q171 genotipine çalışmaya konu olan koyun ırklarında rastlanmamıştır. Bu çalışmada kullanılan koyun populasyonlarının Ulusal Scrapie Plan (NSP)’ına göre genel olarak R2 (dirençli) ve R3 (az dirençli) risk kategorilerinde yer aldığı tespit edilmiştir. Öneri: Bu ırkların ıslah programlarında PrP polimorfizmlerinin
dikkate alınmasının ve scrapie dirençli genotiplerin frekanslarının artırılmasının uygun olacağı kanaatine varılmıştır.

Toplam 0 adet kaynakça vardır.

Ayrıntılar

Diğer ID JA62EY65GT
Bölüm Araştırma
Yazarlar

Ercan Kurar Bu kişi benim

Zafer Bulut Bu kişi benim

Mehmet Nizamlıoğlu Bu kişi benim

Yayımlanma Tarihi 1 Eylül 2014
Yayımlandığı Sayı Yıl 2014 Cilt: 30 Sayı: 3

Kaynak Göster

APA Kurar, E., Bulut, Z., & Nizamlıoğlu, M. (2014). Investigation of PrP locus polymorphisms in some native Turkish sheep breeds. Eurasian Journal of Veterinary Sciences, 30(3), 145-151.
AMA Kurar E, Bulut Z, Nizamlıoğlu M. Investigation of PrP locus polymorphisms in some native Turkish sheep breeds. Eurasian J Vet Sci. Eylül 2014;30(3):145-151.
Chicago Kurar, Ercan, Zafer Bulut, ve Mehmet Nizamlıoğlu. “Investigation of PrP Locus Polymorphisms in Some Native Turkish Sheep Breeds”. Eurasian Journal of Veterinary Sciences 30, sy. 3 (Eylül 2014): 145-51.
EndNote Kurar E, Bulut Z, Nizamlıoğlu M (01 Eylül 2014) Investigation of PrP locus polymorphisms in some native Turkish sheep breeds. Eurasian Journal of Veterinary Sciences 30 3 145–151.
IEEE E. Kurar, Z. Bulut, ve M. Nizamlıoğlu, “Investigation of PrP locus polymorphisms in some native Turkish sheep breeds”, Eurasian J Vet Sci, c. 30, sy. 3, ss. 145–151, 2014.
ISNAD Kurar, Ercan vd. “Investigation of PrP Locus Polymorphisms in Some Native Turkish Sheep Breeds”. Eurasian Journal of Veterinary Sciences 30/3 (Eylül 2014), 145-151.
JAMA Kurar E, Bulut Z, Nizamlıoğlu M. Investigation of PrP locus polymorphisms in some native Turkish sheep breeds. Eurasian J Vet Sci. 2014;30:145–151.
MLA Kurar, Ercan vd. “Investigation of PrP Locus Polymorphisms in Some Native Turkish Sheep Breeds”. Eurasian Journal of Veterinary Sciences, c. 30, sy. 3, 2014, ss. 145-51.
Vancouver Kurar E, Bulut Z, Nizamlıoğlu M. Investigation of PrP locus polymorphisms in some native Turkish sheep breeds. Eurasian J Vet Sci. 2014;30(3):145-51.