BibTex RIS Kaynak Göster

Screening of Transformed Bacteriial Colonies By Using Polymerase Chain Reaction (Pcr-screening)

Yıl 2003, Cilt: 8 Sayı: 2, 79 - 82, 01.04.2003

Aykut Özdarendeli Zülal Aşçı Toraman Salih Kuk Şükrü Tonbak Yasemin Bulut Ahmet Kalkan

Öz

Aim: In this study, it was investigated that bacterial colonies obtained after transformation were tested whether they contained positive recombinant colonies by using PCR screening method. Material and method: For this aim, Fasciola hepatica cathepsin L1 gene and Rinderpest virus matrix gene were cloned into three different vector systems and transformed into E. coli. It was determined some bacterial colonies which had the right size band after PCR screening. Plasmid DNA of those bacterial colonies was extracted by classical miniprep method. The colonies positive with PCR screening were assayed by enzyme digestion assays to verify the PCR screening results. Results: There was 100% correlation between PCR screening and enzyme digestion assays. Conclusion: Using PCR screening method reduce the time requirement for detection the positive colonies and saving the materials used for plasmid DNA extraction.

Anahtar Kelimeler

-

Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Transforme Bakteriyel Kolonilerın Belirlenmesi (Pzr-tarama)

Yıl 2003, Cilt: 8 Sayı: 2, 79 - 82, 01.04.2003

Aykut Özdarendeli Zülal Aşçı Toraman Salih Kuk Şükrü Tonbak Yasemin Bulut Ahmet Kalkan

Öz

Amaç: Bu çalışmada Polimeraz Zincir Reaksiyonu Tarama (PZR-T) yöntemiyle klonlama sonucu elde edilen bakteriyel kolonilerin pozitifliği araştırılmıştır. Gereç ve yöntem: Fasciola hepatica katepsin L1 geni ve sığır vebası virüs matriks genleri üç farklı vektör sistemine klonlandıktan sonra E.coli kompetan hücrelerine transformasyon yapıldı. Transformasyon sonucu elde edilen kolonilerin bir kısmı PZR-T yöntemi kullanılarak değerlendirmeye tabi tutuldu. PZR-T sonucu istenilen büyüklükte elde edilen bantları içeren koloniler belirlenerek klasik miniprep yöntemiyle plasmid DNA'lar elde edildi. Kesim deneyleri yapılarak istenilen gen bölgelerinin varlığı doğrulandı. Bulgular: PZR-T ile pozitif olduğu saptanan 61 örneğin tamamının miniprep sonrası yapılan kesim deneylerinde de pozitif olduğu belirlendi. Sonuç: PZR-T yöntemiyle hem çok daha kısa zamanda pozitif koloniler belirlenecek hem de materyal açısından büyük ölçüde tasarruf edilmiş olacaktır.

Anahtar Kelimeler

-

Toplam 0 adet kaynakça vardır.

Ayrıntılar

Birincil Dil Türkçe
Bölüm Makaleler
Yazarlar

Aykut Özdarendeli Bu kişi benim

Zülal Aşçı Toraman Bu kişi benim

Salih Kuk Bu kişi benim

Şükrü Tonbak Bu kişi benim

Yasemin Bulut Bu kişi benim

Ahmet Kalkan Bu kişi benim

Yayımlanma Tarihi 1 Nisan 2003
Yayımlandığı Sayı Yıl 2003 Cilt: 8 Sayı: 2

Kaynak Göster

APA Özdarendeli, A., Toraman, Z. A., Kuk, S., Tonbak, Ş., vd. (2003). Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Transforme Bakteriyel Kolonilerın Belirlenmesi (Pzr-tarama). Fırat Tıp Dergisi, 8(2), 79-82.
AMA Özdarendeli A, Toraman ZA, Kuk S, Tonbak Ş, Bulut Y, Kalkan A. Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Transforme Bakteriyel Kolonilerın Belirlenmesi (Pzr-tarama). Fırat Tıp Dergisi. Nisan 2003;8(2):79-82.
Chicago Özdarendeli, Aykut, Zülal Aşçı Toraman, Salih Kuk, Şükrü Tonbak, Yasemin Bulut, ve Ahmet Kalkan. “Polimeraz Zincir Reaksiyonu Ile Transforme Bakteriyel Kolonilerın Belirlenmesi (Pzr-Tarama)”. Fırat Tıp Dergisi 8, sy. 2 (Nisan 2003): 79-82.
EndNote Özdarendeli A, Toraman ZA, Kuk S, Tonbak Ş, Bulut Y, Kalkan A (01 Nisan 2003) Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Transforme Bakteriyel Kolonilerın Belirlenmesi (Pzr-tarama). Fırat Tıp Dergisi 8 2 79–82.
IEEE A. Özdarendeli, Z. A. Toraman, S. Kuk, Ş. Tonbak, Y. Bulut, ve A. Kalkan, “Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Transforme Bakteriyel Kolonilerın Belirlenmesi (Pzr-tarama)”, Fırat Tıp Dergisi, c. 8, sy. 2, ss. 79–82, 2003.
ISNAD Özdarendeli, Aykut vd. “Polimeraz Zincir Reaksiyonu Ile Transforme Bakteriyel Kolonilerın Belirlenmesi (Pzr-Tarama)”. Fırat Tıp Dergisi 8/2 (Nisan 2003), 79-82.
JAMA Özdarendeli A, Toraman ZA, Kuk S, Tonbak Ş, Bulut Y, Kalkan A. Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Transforme Bakteriyel Kolonilerın Belirlenmesi (Pzr-tarama). Fırat Tıp Dergisi. 2003;8:79–82.
MLA Özdarendeli, Aykut vd. “Polimeraz Zincir Reaksiyonu Ile Transforme Bakteriyel Kolonilerın Belirlenmesi (Pzr-Tarama)”. Fırat Tıp Dergisi, c. 8, sy. 2, 2003, ss. 79-82.
Vancouver Özdarendeli A, Toraman ZA, Kuk S, Tonbak Ş, Bulut Y, Kalkan A. Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Transforme Bakteriyel Kolonilerın Belirlenmesi (Pzr-tarama). Fırat Tıp Dergisi. 2003;8(2):79-82.