Kromozom İmmunopresipitasyon Metodu (ChIP Dizileme) ile Transkripsiyon Faktörü Bağlanma Bölgelerinin Saptanması

Sema Sırma-ekmekçi; Neslihan Abacı; Çağrı Güleç; Duran Üstek

TR

Kromozom İmmunopresipitasyon Metodu (ChIP Dizileme) ile Transkripsiyon Faktörü Bağlanma Bölgelerinin Saptanması

Öz

Kromozom İmmunopresipitasyon (ChIP) dizileme translripsiyon faktörlerinin genom boyunca bağlanma bölgelerinin saptanması, histon modifikasyonları ve kromotin modifiye edici proteinlerin araştırılmasında kullanılabilir. Bu makalede bu uygulamalardan sadece transkripsiyon faktörü bağlanma bölgelerinin tespitinde ChIP dizileme yönteminin uygulanması tartışılacaktır. Transkripsiyon faktörlerinin genom boyunca bağlanma bölgelerinin saptanması, evrimin , embriyonik gelişimin ve hastalıkların gelişimine neden olan biyolojik süreçlerin altında yatan transkripsiypon düzenleyici ağların anlaşılması için son derece önemlidir. ChIP dizileme metodunda bir transkripsiyon faktörünün bağlandığı DNA parçacıkları ChIP ile elde edilir ve yüksek verimli dizileme uygulanarak dizilenir. Son yıllarda geliştirilmiş olan ChIP dizileme yönteminin önceki yöntemlere göre birçok avantajı bulunmasına rağmen hala çözülmesi gereken bazı zorluklar vardır. Bu makalede bu zorluklardan ve uygulanması gereken stratejilerden bahsedilecektir.

Anahtar Kelimeler

-

Ayrıntılar

Birincil Dil

Türkçe

Konular

-

Bölüm

-

Yazarlar

Sema Sırma-ekmekçi Bu kişi benim

Neslihan Abacı Bu kişi benim

Çağrı Güleç Bu kişi benim

Duran Üstek Bu kişi benim

Yayımlanma Tarihi

21 Mart 2014

Gönderilme Tarihi

21 Mart 2014

Kabul Tarihi

-

Yayımlandığı Sayı

Yıl 2013 Cilt: 3 Sayı: 6

IZ

https://izlik.org/JA79UJ95CC

Kaynak Göster

RIS / Bibtex

APA

Sırma-ekmekçi, S., Abacı, N., Güleç, Ç., & Üstek, D. (2014). Kromozom İmmunopresipitasyon Metodu (ChIP Dizileme) ile Transkripsiyon Faktörü Bağlanma Bölgelerinin Saptanması. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi, 3(6), 1-6. https://izlik.org/JA79UJ95CC

AMA

1.Sırma-ekmekçi S, Abacı N, Güleç Ç, Üstek D. Kromozom İmmunopresipitasyon Metodu (ChIP Dizileme) ile Transkripsiyon Faktörü Bağlanma Bölgelerinin Saptanması. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi. 2014;3(6):1-6. https://izlik.org/JA79UJ95CC

Chicago

Sırma-ekmekçi, Sema, Neslihan Abacı, Çağrı Güleç, ve Duran Üstek. 2014. “Kromozom İmmunopresipitasyon Metodu (ChIP Dizileme) ile Transkripsiyon Faktörü Bağlanma Bölgelerinin Saptanması”. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi 3 (6): 1-6. https://izlik.org/JA79UJ95CC.

EndNote

Sırma-ekmekçi S, Abacı N, Güleç Ç, Üstek D (01 Mart 2014) Kromozom İmmunopresipitasyon Metodu (ChIP Dizileme) ile Transkripsiyon Faktörü Bağlanma Bölgelerinin Saptanması. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi 3 6 1–6.

IEEE

[1]S. Sırma-ekmekçi, N. Abacı, Ç. Güleç, ve D. Üstek, “Kromozom İmmunopresipitasyon Metodu (ChIP Dizileme) ile Transkripsiyon Faktörü Bağlanma Bölgelerinin Saptanması”, Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi, c. 3, sy 6, ss. 1–6, Mar. 2014, [çevrimiçi]. Erişim adresi: https://izlik.org/JA79UJ95CC

ISNAD

Sırma-ekmekçi, Sema - Abacı, Neslihan - Güleç, Çağrı - Üstek, Duran. “Kromozom İmmunopresipitasyon Metodu (ChIP Dizileme) ile Transkripsiyon Faktörü Bağlanma Bölgelerinin Saptanması”. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi 3/6 (01 Mart 2014): 1-6. https://izlik.org/JA79UJ95CC.

JAMA

1.Sırma-ekmekçi S, Abacı N, Güleç Ç, Üstek D. Kromozom İmmunopresipitasyon Metodu (ChIP Dizileme) ile Transkripsiyon Faktörü Bağlanma Bölgelerinin Saptanması. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi. 2014;3:1–6.

MLA

Sırma-ekmekçi, Sema, vd. “Kromozom İmmunopresipitasyon Metodu (ChIP Dizileme) ile Transkripsiyon Faktörü Bağlanma Bölgelerinin Saptanması”. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi, c. 3, sy 6, Mart 2014, ss. 1-6, https://izlik.org/JA79UJ95CC.

Vancouver

1.Sema Sırma-ekmekçi, Neslihan Abacı, Çağrı Güleç, Duran Üstek. Kromozom İmmunopresipitasyon Metodu (ChIP Dizileme) ile Transkripsiyon Faktörü Bağlanma Bölgelerinin Saptanması. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi [Internet]. 01 Mart 2014;3(6):1-6. Erişim adresi: https://izlik.org/JA79UJ95CC