Kocaeli’de Yayılış Gösteren Bazı Böcek Türlerinin Mitokondrial Sitokrom Oksidaz Alt Ünite 1 Geni ile Filogenetik Analizi

Fikriye Polat; Serkan Dede; Günsel Bingöl; Aysel Kekillioğlu

Kocaeli’de Yayılış Gösteren Bazı Böcek Türlerinin Mitokondrial Sitokrom Oksidaz Alt Ünite 1 Geni ile Filogenetik Analizi

Öz

Böcek türleri bakımından zengin bir coğrafyada yaşamaktayız. Ancak coğrafyamızda tespit edilen böcek türleri sayısı tahmin edilen sayıdan çok daha azdır. Buradan yola çıkarak yapılan bu çalışmada, Kocaeli ilinden rastgele toplanılan çeşitli böcek türlerinin moleküler düzeyde tespit edilmesi amaçlandı. Bunun için böceklerden önce DNA izolasyonu ardından mitokondrial COI bölgelerine ait evrensel primerler kullanılarak Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ve DNA sekans analizi yapıldı. Her bir DNA dizisi NCBI Nucleotide BLAST’a yüklenerek erişim numaraları elde edildi. Böcek türlerine ait COI gen dizileri MEGA 7.0 programına yüklenerek modelleme yöntemleri ve mesafeleri belirlendi. DNA barkod geni olarak yaygın bir şekilde kullanılan COI geni ile yapılan bu çalışmada, böcek türlerinin Exechia seriata, Phlebotomus neglectus, Chironomus riparius, Drosophila tsukubaensis, ve Rhamphomyia sp. oldukları tespit edildi.

Anahtar Kelimeler

Böcek,COI geni,Filogenetik Analiz,Kocaeli

Kaynakça

Hancı H., 2003. Adli Entomoloji, TBB Dergisi, 2003(49).
Aydın G., 2016. Böceklerin Sınıflandırılması (Takım) Düzeyinde,http://atabeymyo.isparta.edu.tr/assets/uploads/sites/76/files/boceklerin-siniflandirilmasi-1810201 6.pdf.
Gullan P. J., Cranston P. S., 2005. The Insects: An Outline of Entomology, 4. ed., Blackwell Publishig, California, USA.
Hancı İ., Tüzün A., Açıkgöz N., Balseven A., Candar, S., 2002. Adli Entomoloji, Asayiş Daire Başkanlığı, Yayın no: 9, Ankara.
Eric J., Biyoloji Öz., 2015. 1. Baskı, Pearson, Nobel, Ankara.
Yılmaz C., 2017. Terme’nin Biyoçeşitlilik ve Doğal Ortam Özellikleri, O.M.Ü. Eğitim Fak. Serander Yayınları, Samsun.
Yıldırım E., 2012. The distribution and biogeography of Vespidae (Hymenoptera: Aculeata) in Turkey, Türk Entomol. Dergisi., 36(1), 23-42.
Yıldırım E., Gusenleitner J., 2012. Contribution to the knowledge of the Vespidae (Hymenoptera, Aculeata) of Turkey, with a checklist of the Turkish species, Türk J. Zool., 36(3), 361-374.

https://en.wikipedia.org/wiki/Rhamphomyia (Erişim tarihi: 29.08.2018).
Ivović V., Chaniotis V., Vujanić M., B. Bobić B., Nikolić A., Klun A., Živković T, Djurković-Djaković O., 2010., Life Tables And Reproductive Parameters Of Phlebotomus Neglectus Tonnoır, 1921 (Diptera, Psychodidae) Under Laboratory Conditions. Arch. Biol. Sci., Belgrade, 62(1), 153-157.
Chaniotis B., Spyridaki I., Scoulika E., Antoniou M., 2000. Colonization of Phlebotomus neglectus (Diptera: Psychodidae), the major vector of visceral leishmaniasis in Greece. J Med Entomol., 37(3): 346-348.
https://en.wikipedia.org/wiki/Chironomus_riparius, Erişim tarihi 29.08.2018.
Barták M., Danielson R., 2007. Revision of Rhamphomyia species (Diptera, Empididae) described by J. W. Zetterstedt. Acta Zoologica Universitatis Comenianae 47(2): 105–114.
https://en.wikipedia.org/wiki/Drosophila, (Erişim Tarihi 29.08.2018).
Hebert P. D. N., Cywinska A., Ball S. L., deWaard J. R., 2003a. Biological identifications through DNA barcodes. Proceedings Of The Royal Society B: Biological Sciences. 270, 313-321.
Avise J. C., 2000. Phylogeography: the history and formation of species. Harvard university pres, Harvard.
Hebert P. D. N., Ratnasingham S., deWaard J. R., 2003b. Barcoding animal life: cytochrome c oxidase subunit 1 divergences among closely related species. Proceedings in Biological Sciences, 270(1): 96–99.
Arnot D. E., Roper C., Bayoumi R. A., 1993. Digital codes from hypervariable tandemly repeated DNA sequences in the Plasmodium falciparum circumsporozoite gene can genetically barcode isolates. Molecular and Biochemical Parasitology, 61, 15-24.
Ball S. L., Armstrong K. F., 2006. DNA barcodes for insect pest identification: a test case with tussock moths (Lepidoptera: Lymantriidae). Canadian Journal of Forest Research, 36(2), 337-350.
Martijn J. T. N., Timmermans C. V., Geoff M., Kevin H. A., Vogler P., 2016. Rapid assembly of taxonomically validated mitochondrial genomes from historical insect collections. Biological Journal of the Linnean Society, 117, 83-95.

Ayrıntılar

Birincil Dil

Türkçe

Konular

Yapısal Biyoloji

Bölüm

Araştırma Makalesi

Yazarlar

Fikriye Polat ^*
0000-0002-5414-2501
Türkiye

Serkan Dede Bu kişi benim
0000-0002-9228-2812
Türkiye

Günsel Bingöl
0000-0001-9834-0019
Türkiye

Aysel Kekillioğlu
0000-0001-5369-6265
Türkiye

Yayımlanma Tarihi

29 Aralık 2018

Gönderilme Tarihi

27 Eylül 2018

Kabul Tarihi

22 Ekim 2018

Yayımlandığı Sayı

Yıl 2018 Cilt: 1 Sayı: 2

IZ

https://izlik.org/JA49RJ57UF

Kaynak Göster

RIS / Bibtex

APA

Polat, F., Dede, S., Bingöl, G., & Kekillioğlu, A. (2018). Kocaeli’de Yayılış Gösteren Bazı Böcek Türlerinin Mitokondrial Sitokrom Oksidaz Alt Ünite 1 Geni ile Filogenetik Analizi. Kocaeli Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi, 1(2), 62-66. https://izlik.org/JA49RJ57UF

AMA

1.Polat F, Dede S, Bingöl G, Kekillioğlu A. Kocaeli’de Yayılış Gösteren Bazı Böcek Türlerinin Mitokondrial Sitokrom Oksidaz Alt Ünite 1 Geni ile Filogenetik Analizi. KOUFBD. 2018;1(2):62-66. https://izlik.org/JA49RJ57UF

Chicago

Polat, Fikriye, Serkan Dede, Günsel Bingöl, ve Aysel Kekillioğlu. 2018. “Kocaeli’de Yayılış Gösteren Bazı Böcek Türlerinin Mitokondrial Sitokrom Oksidaz Alt Ünite 1 Geni ile Filogenetik Analizi”. Kocaeli Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi 1 (2): 62-66. https://izlik.org/JA49RJ57UF.

EndNote

Polat F, Dede S, Bingöl G, Kekillioğlu A (01 Aralık 2018) Kocaeli’de Yayılış Gösteren Bazı Böcek Türlerinin Mitokondrial Sitokrom Oksidaz Alt Ünite 1 Geni ile Filogenetik Analizi. Kocaeli Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi 1 2 62–66.

IEEE

[1]F. Polat, S. Dede, G. Bingöl, ve A. Kekillioğlu, “Kocaeli’de Yayılış Gösteren Bazı Böcek Türlerinin Mitokondrial Sitokrom Oksidaz Alt Ünite 1 Geni ile Filogenetik Analizi”, KOUFBD, c. 1, sy 2, ss. 62–66, Ara. 2018, [çevrimiçi]. Erişim adresi: https://izlik.org/JA49RJ57UF

ISNAD

Polat, Fikriye - Dede, Serkan - Bingöl, Günsel - Kekillioğlu, Aysel. “Kocaeli’de Yayılış Gösteren Bazı Böcek Türlerinin Mitokondrial Sitokrom Oksidaz Alt Ünite 1 Geni ile Filogenetik Analizi”. Kocaeli Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi 1/2 (01 Aralık 2018): 62-66. https://izlik.org/JA49RJ57UF.

JAMA

1.Polat F, Dede S, Bingöl G, Kekillioğlu A. Kocaeli’de Yayılış Gösteren Bazı Böcek Türlerinin Mitokondrial Sitokrom Oksidaz Alt Ünite 1 Geni ile Filogenetik Analizi. KOUFBD. 2018;1:62–66.

MLA

Polat, Fikriye, vd. “Kocaeli’de Yayılış Gösteren Bazı Böcek Türlerinin Mitokondrial Sitokrom Oksidaz Alt Ünite 1 Geni ile Filogenetik Analizi”. Kocaeli Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi, c. 1, sy 2, Aralık 2018, ss. 62-66, https://izlik.org/JA49RJ57UF.

Vancouver

1.Fikriye Polat, Serkan Dede, Günsel Bingöl, Aysel Kekillioğlu. Kocaeli’de Yayılış Gösteren Bazı Böcek Türlerinin Mitokondrial Sitokrom Oksidaz Alt Ünite 1 Geni ile Filogenetik Analizi. KOUFBD [Internet]. 01 Aralık 2018;1(2):62-6. Erişim adresi: https://izlik.org/JA49RJ57UF