Kan Kültürlerinde Üreyen Gram Negatif Bakteriler ve Antibiyotik Duyarlılık Profilleri

Yıl 2022, Cilt: 3 Sayı: 2, 11 - 19, 20.09.2022

Osman Oruç , Ashabil Aygan , Nazan Çömlekcioğlu , İbrahim Seyfettin Çelik

Öz

Amaç: Kan dolaşımı enfeksiyonları mortalite ve morbiditenin en önemli sebeplerinden biridir. Kan kültürleri tanı için standart referanstır. Bakteriler antimikrobiyal ajanlara karşı geliştirdikleri direnç sayesinde, antibiyotik tedavisinde kısıtlamalarla beraber birçok sorunu da beraberinde getirmektedir. Bu çalışmada, 2015 Ocak-Aralık ayları arasında, mikrobiyoloji laboratuvarına gelen yatan hastaların kan kültürü örneklerinden izole edilen Gram negatif mikroorganizmaların görülme sıklığı ve antibiyotik direnç profillerinin belirlenmesi ile bir durum değerlendirmesi amaçlanmıştır.
Gereç ve Yöntemler: İzolatlar yatan hastalardan alınan örneklerden BACTEC/9050 sisteminde inkübe edildikten sonra Columbia, Kanlı Agar, EMB Agar ve Çikolata Agar besi yerlerinde aerobik olarak paralel inokülasyon yapılarak elde edilmiştir. İzolatların tanımlanması ileVitek-2 ID sistem ile gerçekleştirilmiş olup antibiyotik duyarlılık testleri de Vitek-2 AST Card sistemleri ile yapılmıştır.
Bulgular: Çalışma dahilinde laboratuvara gönderilen 1069 kan kültürü örneğinden total 265 bakteriyel izolasyon gerçekleştirildi. .Bunlardan 104’ü (%39,2) Gram negatif organizma olarak tespit edilmiştir. Bu Gram negatif izolatlardan 25’i Acinetobacter spp. (%24,0), 20’si Escherichia coli (%19,2), 18’i Klebsiella spp. (%17,3), 16’sı Stenotrophomonas malthophilia (%15,3), 15’i Pseudomonas spp.(%14,2), ve diğerleri olarak belirlenmiştir. Test edilen antibiyotikler arasında E.coli, Klebsiella spp. ve Enterobacter spp.de tigesiline karşı Acinetobacter spp., Pseudomonas spp. ve Enterobacter spp.de ise kolistine karşı bir direnç gözlenmemiştir.İzolatlardan 16 E.coli(%80) ve 15Klebsiella spp.’nın (%83,3) GSBL üreten suş olduğu tespit edilmiştir.
Sonuç: Bu çalışma kan kültürlerinden izole edilen Gram negatif mikroorganizma veantibiyotik direnç oranlarını göstermektedir. Çoklu antibiyotik direnç gösteren suş oranları hastanelerde sürveyans çalışmalarının sürekli yapılmasını ve akılcı antibiyotik kullanım politikalarının uygulanması gerekliliğini göstermektedir.

Anahtar Kelimeler

Bakteriyemi, Kan kültürü, Gram negatif, Beta laktamaz, Antibiyotik direnç

Destekleyen Kurum

KSÜ BAP

Proje Numarası

2016/3-23 YLS

Teşekkür

Çalışma süresince yardım ve maddi ve manevi desteklerini esirgemeyen K.Maraş Necip Fazıl Hastanesi Mikrobiyoloji çalışanlarına ve KSU BAP birimine teşekkür ederiz. (BAP 2016/3-23 YLS).

Kaynakça

• 1. Hart CA. Antibiotic resistance: an increasing problem? It always has been, but there are things we can do. BMJ. 1998; 316 (7140):1255-6.
• 2. Saga T, Yamaguchi K. History of Antimicrobial Agents and Resistant Bacteria. JMAJ. 2009; 52(2): 103-8.
• 3. Yüce A. Antimikrobik İlaçlara Direnç Kazanma Mekanizmaları. Klinik Dergisi. 2001; 14(2):41-6.
• 4. Bockstael K, Aerschot A. Antimicrobial resistance in bacteria. Open Medicine.2009; 4(2):141-55.
• 5. Davies J, Davies D. Origins and evolution of antibiotic resistance. Microbiol Mol Biol Rev. 2010; 74(3): 417-33.
• 6. Mazel D. Integrons: agents of bacterial evolution. Nature reviews. Microbiology. 2006; 4(8):608-20.
• 7. Archibald L, Phillips L, Monnet D, McGowan JE Jr, Tenover F, Gaynes, R. Antimicrobial resistance in isolates from inpatients and outpatients in the United States: increasing importance of the intensive care unit. Clin Infect Dis.1997; 24(2): 211-5.
• 8. Harbart S, Pittet D. Multiresistance of gramnegative bacteria in intensive care units: bad news from without. Crit Care Med.1999;27(6):1037-8.
• 9. Siegel RE. Emerging gram-negative antibiotic resistance: daunting challenges, declining sensitivities, and dire consequences. Respir Care. 2008; 53(4):471-9.
• 10. Gaynes R, Edwards JR; National Nosocomial Infections Surveillance System. Overview of nosocomial infections caused by Gram-negative bacilli. Clin Infect Dis. 2005:41(6):848-54.
• 11. Rice LB. Challenges in identifying new antimicrobial agents effective for treating infections with Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa. Clin Infect Dis. 2006; 1:43 Suppl 2: 100-5.
• 12. Şahin İ, Çalışkan E, Öztürk E, Yavuz MT, Albayrak HT, Karadağ G, et al. Distribution of microorganisms in blood culture and antimicrobial susceptibility. Düzce Tıp Derg. 2013;15(2):11-4.
• 13. Trung NT, Tong HV, Lien TT, Son TV, Huyen TTT, Quyen DT, et al. Clinical utility of an optimised multiplex real-time PCR assay for the identification of pathogens causing sepsis in Vietnamese patients. Int J Infect Dis. 2018; 67:122-8.
• 14. Singh SP. Nucleic acid-based methods for early detection of sepsis. Ann Card Anaesth. 2017; 20(1):112-3.
• 15. Wu JN, Gan TE, Zhu YX, Cao JM, Ji CH, Wu YH, et al. Epidemiology and microbiology of nosocomial bloodstream infections: analysis of 482 cases from a retrospective surveillance study. J Zhejiang Univ Sci B. 2015;16(1):70-7.
• 16. Orucu M, Geyik MF. Yoğun Bakım Ünitesinde Sık Görülen Enfeksiyonlar.Düzce Tıp Derg.200;1: 40-3.
• 17. Yılmaz S, Gümral R, Güney M, Bedir O, Güçlü AÜ, Duyan S, et al. İki yıllık dönemde kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkların değerlendirilmesi. Gülhane Tıp Derg.2013; 55:247-52.
• 18. Queenan AM, Foleno B, Gownley C, Wira E, Bush K. Effects of inoculum and beta-lactamase activity in AmpC- and extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae clinical isolates tested by using NCCLS ESBL methodology. J Clin Microbiol. 2004; 42(1): 269-75.
• 19. Hernandez J, Johansson A, Stedt J, Bengtsson S, Porczak A, Granholm S, et al. Characterization and comparison of extended-spectrum β-lactamase (ESBL) resistance genotypes and population structure of Escherichia coli isolated from Franklin's gulls (Leucophaeus pipixcan) and humans in Chile. PLoS One. 2013; 30:8(9):76150.
• 20. Garg A, Anupurba S, Garg J, Goyal R, Sen M. Bacteriological Profile and Antimicrobial Resistance of Blood Culture Isolates from a University Hospital JIACM. 2007; 8(2):139-43.
• 21. Özkaya E, Tümer S, Kirişçi Ö, Çalışkan A, Erdoğmuş P. Son iki yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesi’nde kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi. Turk Hij Den Biyol Derg, 2015; 72(2): 115-22.
• 22. Çopur-Çiçek A, Şentürk-Köksal Z, Ertürk A, Köksal E. Rize 82. Yıl Devlet Hastanesi’nde bir yıllık sürede kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotiklere duyarlılıkları.Turk Hij Den Biyol Derg.2011;68(4):175-84.
• 23. Köksal-Çakırlar F, Uyar Y, Özdemir S, BARIŞ A, Şaylan EG, Habip Z, et al. 2011-2014 yılları arasında kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antimikrobiyal direnç durumları. Turk Hij Den Biyol Derg.2017;74(1): 55-70.
• 24. Kuzucu Ç, Durmaz B, Ayan M, Abut L, Bayraktar M. Yatan Hastalardan İzole Edilen Gram Negatif Basillerde Antibiyotik Direnci. İst Tıp Fak Derg. 2001; 8(4):193-6.
• 25. Sörberg M, Farra A, Ransjö U, Gardlund B, Rylander M, Settergren B, et al. Different trends in antibiotic resistance rates at a university teaching hospital. Clin Microbiol Infection. 2003; 9(5): 388-96.
• 26. Şirin MC, Aguş N, Yılmaz N, Bayram A, Yılmaz-Hancı S, Şamlıoğlu P, et al. Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları. Türk HijDen BiyolDerg. 2017; 74(3):269-78 10.
• 27. Ye JJ, Huang CT, Shie SS, Huang PY, Su LH, Chiu CH, et al. Multidrug resistant Acinetobacter baumannii: risk factors for appearance of imipenem resistant strains on patients formerly with susceptible strains. PLoS One.2010; 5(4):9947.
• 28. Cesur S, Irmak H, Yalçın A N, Berktaş M, Baysan BÖ, Kınıklı S, et al. Yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların çeşitli kültür örneklerinden izole edilen Acinetobacter baumannii suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. Ortadoğu Tıp Derg.2017;9(2): 51-5.
• 29. Davis BD. Chemotherapy. in Davis BD, DulbeccoR, Eisen HN, Ginsberg HS eds. Microbiology J.B lippincot Company, 1990.p. 201-28.
• 30. Nordmann P, Poirel L. Emerging carbapenemases in Gram-negative aerobes. Clin Microbiol Infect. 2002; 8(6): 321-31.
• 31. Gültekin E, Uyanık MH, Hancı H, Erdil Z, Gelen FN, Çelebi S. Kan Kültürlerinden izole Edilen Non fermentatif Gram Negatif Bakterilerin Çeşitli Antibiyotiklere Duyarlılıkları. ANKEM derg. 2014; 28(3): 79-85.
• 32. Yaman G, Çıkman A, Parlak M, Güdücüoğlu H, Berktaş M. Nozokomiyal Kökenli Pseudomonas aeruginosa İzolatlarında Metallo-Beta-Laktamaz Sıklığı. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2014; 44(4): 139-43.
• 33. Henrichfreise B, Wiegand I, Pfister W, Wiedemann B. Resistance Mechanisms of Multiresistant Pseudomonas aeruginosa Strains from Germany and Correlation with Hypermutation.Antimicrob Agents Chemother. 2007; 51(11): 4062-70.
• 34. Dülger D, Berktaş M. Stenotrophomonas Maltophilia Suşlarının Klinik Önemi. Van Tıp Derg. 2007; 14 (3): 90-5.
• 35. Aydin K, Koksal I, Kaygusuz S, Kaklikkaya I, Caylan R, Ozdemir R. Endocarditis caused by Stenotrophomonas maltophilia. Scand J Infect Dis.2000; 32(4): 427-30.
• 36. Hejnar P, Kolář M, Hájek V, Koukalová D, Hamal P. Occurrence of variants with temperature-dependent susceptibility (TDS) to antibiotics amongStenotrophomonas maltophilia clinical strains. Folia Microbiologica. 2001; 46(2): 151-5.
• 37. Şahin AR, Doğruer D, Nazik S, Aktemur A, Öksüz H, Aral M, et al. Hastane Kökenli Patojenlerde Artan Antimikrobiyal Direnç Sorunu: Acinetobacter baumannii. Online Türk Sağlık Bil Derg. 2019; 4(2):156-69.