Öz
Sicyos spp. which is invasive weed species in crops, roadside and uncultivated
area in the Eastern Black Sea Region. The plant is an invasive weed species
that is easily adapted to its environment with its clinging and climber
structure and which compete with other plants and suppress on them. In this
study, population samples of thirty Sicyos
spp. collected from different locations of Ordu and Giresun provinces were
determined to be genetic diversity by using ribosomal DNA (rDNA) Internal
Transcribed Spacer (ITS) gene regions. Analyzes were performed by using
Neighbour-Joining (NJ), Maximum-Parsimony (MP) and Maximum-Likelihood (ML)
algorithm. According to the results, two haplotypes were found. Haplotype-1 and
Haplotype-2 were similar 100% S. davilae
Rodr.-Arév. & Lira and S. angulatus
L., respectively. A genetic relationship was found 68% and 74% (NJ / MP)
between the nine samples and Haplotype-1, respectively. Haplotype-2 was similar
to six samples at the rate 69%, 80%, 70%
(NJ / MP / ML), respectively for phylogenetic relationship. S. davilae Rodr.-Arév. & Lira is a
new species for our country flora.
Anahtar Kelimeler
Sicyos spp. ITS (Internal Transcribed Spacer) Molecular characterization
Kaynakça
- Prof. Dr. Husrev MENNAN
- Prof. Dr. Saban KORDALI
Öz
Sicyos spp. Doğu Karadeniz Bölgesi’nde kültür
bitkilerinde, yol kenarlarında ve tarım yapılmayan alanlarda rastlanılan
istilacı yabancı otlardandır. Bitki sarılıcı ve tırmanıcı yapısı ile bulunduğu
ortama kolayca adapte olan ve diğer bitkilerle rekabete girerek onları baskı
altına alan istilacı bir yabancı ot türüdür. Bu çalışmada Ordu ve Giresun
illerinin farklı noktalarından alınan otuz Sicyos
spp.’nin populasyon örneklerinin genetik karakterizasyonunun
belirlenmesinde ribozomal DNA (rDNA) İnternal Transcribed Spacer (ITS) gen
bölgeleri kullanılmıştır. Analizler Neighbour-Joining (NJ), Maximum-Parsimony
(MP) ve Maximum-Likelihood (ML) algoritması kullanılarak yapılmıştır. Elde
edilen sonuçlara göre, iki haplotip bulunmuştur. Haplotip-1 ve Haplotip-2’nin
sırasıyla S. davilae Rodr.-Arév.
& Lira ve S. angulatus L. ile %100
oranında benzerlik gösterdiği belirlenmiştir. Dokuz örnek ile Haplotip-1
arasında sırasıyla %68 ve %74 (NJ/MP) oranında genetik akrabalık saptanmıştır.
Altı örnek ile Haplotip-2 arasında ise sırasıyla %69, %80 ve %70 (NJ/MP/ML) oranında benzerlik bulunmuştur. S. davilae Rodr.-Arév. & Lira
ülkemiz florası için yeni bir türdür.
Anahtar Kelimeler
Sicyos spp. ITS (İnternal Transcribed Spacer) Moleküler karakterizasyon
Kaynakça
- Prof. Dr. Husrev MENNAN
- Prof. Dr. Saban KORDALI
Ayrıntılar
| Birincil Dil | Türkçe |
|---|---|
| Konular | Yapısal Biyoloji |
| Bölüm | Araştırma Makalesi |
| Yazarlar | |
| Yayımlanma Tarihi | 4 Temmuz 2019 |
| Kabul Tarihi | 30 Haziran 2019 |
| Yayımlandığı Sayı | Yıl 2019 Cilt: 22 Sayı: 1 |
