Yıl 2019, Cilt 29 , Sayı 4, Sayfalar 801 - 808 2019-12-31

Karasal Salyangoz (Helix lucorum L.) Midesinden Elde Edilen Enzim Bileşenleri Kullanılarak Çavdar (Secale spp.) Türlerinde Karyotip Analizi
Karyotype analysis of rye (Secale spp.) species by using the extracted enzyme from the terrestrial snail stomach (Helix lucorum L.)

Eissa ZARİFİ ANAKHATOON [1] , Shakiba SHAHMORADI [2] , Mohsen MIRZAPOUR [3]


Karasal salyangoz (Helix lucorum L.), Helicidae ailesine ait, ormanlarda ve nemli bölgelerde yaşar; yaprak, ağaç kabuğu ve bol miktarda selüloz içeren bitkilerden beslenir. Karasal salyangozun sindirim sistemi, sellülözik materyali sindirebilen özel enzim bileşenlerine sahiptir. Aseto karmin, Aceto orsein, Feulgen ve farklı boyar maddeler kullanılarak yapılan kromozom ve karyotip analizi çalışmalarında, türe ait karakterlere bağlı olarak kromozom boyu, tanen miktarı ve kromozom karşılaştırmalarında sorunlar yaşanmıştır. Kara salyangozu midesinin enzimatik bileşenleri, sitoplazma ve hücre duvarı yumuşaması üzerinde etkili olmuştur. Çalışmada, çavdar (Secale spp.) bitkisine ait iki türde, en iyi ve kolay şekilde kromozomların ayrılması ve dağılması amacıyla bu bileşenler kullanılmıştır. Sitaz ve diğer enzimlerin aktif bir karışımını içeren enzimatik bileşenleri kullanmak amacıyla, karasal salyangozlar İran’ın kuzey batısındaki nemli Arasbaran Ormanları’ndan toplanmış, bileşenler elde edilmiş ve soğuk koşullarda muhafazası sağlanmıştır. İki çavdar türünün (Secale cereale L. ve S. montanum) çimlenmiş tohumlarının kök uçları α-bromonaftalin solüsyonunda ön işleme tabi tutulmuş ve aseto-iron hematoxylin boyar madde ile boyanmıştır. Daha sonra, sitoplazmayı belirginleştirmek, hücre duvarını yumuşatmak ve tatminkar bir kromozom yayılması ve ayrılması elde etmek amacıyla kara salyangozu midesinden elde edilen enzimler kullanılmıştır. Araştırma sonucunda kara salyangozu midesinin enzimatik bileşenleri kullanılarak, her iki türde kromozomlar açık bir şekilde ayırt edilmiş ve, iyi bir metafaz safhası ve dağılımı gözlemlenmiştir. Kromozomlar bozulmadan kalırken, tüm hücrelerin tamamen ayrılması kolay bir şekilde sağlanmıştır. Çavdar türleri (Secale spp.) 2n=2x=14 kromozoma sahiptir ve diploiddir. Her iki türde de satellit (uydu) kromozom vardır ve satellitler, kromozomların kısa kolları üzerinde bulunmaktadır.

The snail (Helix lucorum L.) belongs to Helicidae family, lives in forests and moist regions and feeds from leaves, wood, and vegetable containing a lot of cellulose. The digestive system of this snail has special enzymatic components for digesting cellulosic materials and has some effects on cytoplasmic and cell wall digestion. Chromosomal studies and karyotypes analysis using different methods of staining (Aceto Carmine, Aceto Orcein, Feulgen and etc.) have some problems such as chromosomal size, amount of tannins and difficulty of contrast in chromosome detection depending on species characters. We used these components that included an active mixture of Cytase and other enzymes, for easy squashing and perfect chromosome separation in two species of rye (Secale spp.). The terrestrial snails were collected from Arasbaran humid forests (North West of Iran), and extracted the components and kept in freeze condition. The root tips of germinated seeds of two species of rye were pretreated with α-Bromonaphtalin solution and stained in Aceto-Iron Haematoxylin. Then the enzymes were used for clearing cytoplasm and softening cell walls and to obtain sufficient squashing and chromosomes spread. The using the enzymatic components of snail stomach was very effective in squashing stage, and obtaining good metaphase plates, the chromosomes were counted and distinguished very clearly. The separation of all cells, without damaging the chromosomes, was achieved easily and completely. Species of rye (Secale spp.) were diploid with 2n=2x=14 chromosomes. The satellited chromosomes were seen in both two species on short arms of chromosomes.

  • Agayev, Y. M., Zarifi, E., & Fernández, J. A. (2010). A study of karyotypes in the crocus sativus L. Aggregate and origin of cultivated saffron. Acta Horticulturae, 850(850), 47–54.
  • Chambers, T. C. (1955). Use of snail stomach cytase in plant cytology [13]. Nature, 175(4448), 215.
  • Dalili, G. H. (2005). Animal classification. Sokhan Gostar, Tehran (In Persian).
  • Dirihan, S., Zarifi, E., Güloğlu, D., & Sevimay, C. S. (2014). Karyotype Features of Berseem Clover (T. alexandrinum L.) and Persian Clover (T. resupinatum L.) Species Which Cultivated in Turkey. Tarım Bilimleri Araştırma Dergisi, 7(1), 49–54.
  • Dorit, R., Walker, W. F. (Warren F., & Barnes, R. D. (1991). Zoology (Internatio). Philadelphia : Saunders College Pub.
  • Fageria, N. K. (1992). Maximizing Crop Yields. Taylor & Francis. Retrieved from https://books.google.com/books?id=NbPMD99XIkEC
  • Habibi, T. (2015). General Zoology Volume II worms and molluscs. Tehran University, Tehran ( In Persian).
  • Huziwara, Y. (1962). Karyotype Analysis in Some Genera of Compositae. VIII. Further Studies on the Chromosomes of Aster. American Journal of Botany, 49(2), 116–119.
  • Karami, M. (2000). Invertebrate Zoology. Shahed University, Tehran ( In persian).
  • Khodabande, N. (2013). Cereals. Tehran University ( In Persian).
  • Khush, G. S. (1962). Cytogenetic and Evolutionary Studies in Secale. II. Interrelationships of the Wild Species. Evolution, 16(4), 484.
  • Khush, G. S. (1963). Cytogenetic and evolutionary studies in Secale III. Cytogenetics of weedy ryes and origin of cultivated rye. Economic Botany, 17(1), 60–71.
  • Kranz, A. R. (1976). Karyotype analysis in meiosis: Giemsa banding in the genus Secale L. Theoretical and Applied Genetics, 47(3), 101–107.
  • Levan, A., Fredga, K., & Sandberg, A. A. (1964). Nomenclature for Centromeric Position on Chromosomes. Hereditas, 52(2), 201–220.
  • Tang, Z. X., Ross, K., Ren, Z. L., Yang, Z. J., Zhang, H. Y., Chikmawati, T., … Gustafson, J. P. (2011). Secale. In Wild Crop Relatives: Genomic and Breeding Resources (pp. 367–396). Berlin, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg.
  • Meier, S., Kunzmann, R., & Zeller, F. J. (1996). Genetic variation in germplasm accessions of Secale vavilovii Grossh. Genetic Resources and Crop Evolution, 43(1), 91–96.
  • Miller, S. A., & Harley, J. P. (1992). Zoology. Wm. C. Brown.
  • Moyes, C. D., & Schulte, P. M. (2008). Principles of Animal Physiology. Pearson Education. Retrieved from http://books.google.com/books?id=f-INSQAACAAJ&pgis=1
  • Myers, F. L., & Northcote, D. (1958). A survey of the enzymes from the gastro-intestinal tract of Helix pomatia. Journal of Experimental Biology, 35(3), 639–648.
  • Negah Media. (2013). Retrieved August 31, 2018, from http://www.negahmedia.ir/media/show_pic/28306
  • Paszko, B. (2006). A critical review and a new proposal of karyotype asymmetry indices. Plant Systematics and Evolution, 258(1–2), 39–48.
  • Pruitt, N. L., Underwood, L. S., & Surver, W. (2000). BioInquiry: Making Connections in Biology. John Wiley. Retrieved from https://books.google.com/books?id=eh5FAQAAIAAJ
  • Quinn, C. J., & Rattenbury, J. A. (1972). Structural hybridity in New Zealand dacrydium. New Zealand Journal of Botany, 10(3), 427–436.
  • Rechinger, K. H. (1973). Gramineae. Flora Iranica, 30–70.
  • Reeves, A. (2001). MicroMeasure: A new computer program for the collection and analysis of cytogenetic data. Genome, 44(3), 439–443.
  • Riley, R. (1955). The cytogenetics of the differences between some Secale species. The Journal of Agricultural Science, 46(3), 377–383.
  • Russel-Hunter, W. D. (1979). A life of invertebrates. Macmillan Publishers Limited.
  • Salahi Moghaddam, A. R. (2009). Medical malacology. Hormozgan University (In persian).
  • Schmidt-Nielsen, K. (1997). Animal physiology: adaptation and environment. Cambridge University Press.
  • Sharma, A. K., & Sharma, A. (1980). Chromosome Techniques: Theory and Practice (3rd ed.). Butterworth & Co (Publishers) Ltd, London.
  • Shekoohinezhad, M., & Amin, A. (1973). Animal Biology. Amir Kabir Publishing institue, Tehran (In Persian).
  • Stebbins, L. G. (1971). Chromosomal Evolution in Higher Plants. Edward Arnold Ltd. London: Edward Arnold Ltd.,.
  • Storer, T. I. (Tracy I., NYBAKKEN, J. W., & Usinger, R. L. (Robert L. (1968). Elements of zoology (3rd ed.). McGraw-Hill.
  • Stutz, H. C. (1957). A cytogenetic analysis of the hybrid Secale cereale L. x Secale montanum Guss. and its progeny. Genetics, 42(3), 199.
  • Watanabe, K., Yahara, T., Denda, T., & Kosuge, K. (1999). Chromosomal Evolution in the Genus Brachyscome (Asteraceae, Astereae): Statistical Tests Regarding Correlation Between Changes in Karyotype and Habit Using Phylogenetic Information. Journal of Plant Research, 112(2), 145–161.
  • Zarco, C. R. (1986). A New Method for Estimating Karyotype Asymmetry. Taxon, 35(3), 526.
  • Zarifi, E., Aghyev, Y., Ghanavati, F., & Aminizadeh, Z. (2006). Cytogenetics and Evolution of Karyotype in Wormwood, Artemisia vulgaris L. Seed and Plant Improvment Journal, 22(1), 1–12.
  • Zarifi, E., & Güloğlu, D. (2016). An improved Aceto-Iron-Haematoxylin staining for mitotic chromosomes in Cornelian cherry (Cornus mas L.). Caryologia, 69(1), 67–72.
Birincil Dil tr
Konular Ziraat
Yayımlanma Tarihi Aralık 2019
Bölüm Makaleler
Yazarlar

Orcid: 0000-0003-0851-9619
Yazar: Eissa ZARİFİ ANAKHATOON (Sorumlu Yazar)
Kurum: Genetics and Genetic Resources Research Department, Seed and Plant Improvement Institute (SPII), Agricultural Research & Education Organization(AREO), Karaj, Iran
Ülke: Iran


Orcid: 0000-0000-0000-0000
Yazar: Shakiba SHAHMORADI
Kurum: Genetics and Genetic Resources Research Department, Seed and Plant Improvement Institute (SPII), Agricultural Research & Education Organization(AREO), Karaj, Iran
Ülke: Iran


Orcid: 0000-0000-0000-0000
Yazar: Mohsen MIRZAPOUR
Kurum: Department of Agricultural Biotechnology, Faculty of Agriculture, Siirt University, 56100, Siirt, Turkey
Ülke: Turkey


Destekleyen Kurum Seed and Plant Improvement Institute (SPII), Agricultural Research & Education Organization(AREO)
Proje Numarası 7-03-03-92318
Teşekkür Bu çalışma, Genetik Araştırma ve İran Ulusal Bitki Gen Bankası (SPII) tarafından desteklenen projenin (7-03-03-92318) parçasıydı
Tarihler

Yayımlanma Tarihi : 31 Aralık 2019

Bibtex @araştırma makalesi { yyutbd570576, journal = {Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi}, issn = {1308-7576}, eissn = {1308-7584}, address = {}, publisher = {Yüzüncü Yıl Üniversitesi}, year = {2019}, volume = {29}, pages = {801 - 808}, doi = {10.29133/yyutbd.570576}, title = {Karasal Salyangoz (Helix lucorum L.) Midesinden Elde Edilen Enzim Bileşenleri Kullanılarak Çavdar (Secale spp.) Türlerinde Karyotip Analizi}, key = {cite}, author = {ZARİFİ ANAKHATOON, Eissa and SHAHMORADI, Shakiba and MIRZAPOUR, Mohsen} }
APA ZARİFİ ANAKHATOON, E , SHAHMORADI, S , MIRZAPOUR, M . (2019). Karasal Salyangoz (Helix lucorum L.) Midesinden Elde Edilen Enzim Bileşenleri Kullanılarak Çavdar (Secale spp.) Türlerinde Karyotip Analizi. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi , 29 (4) , 801-808 . DOI: 10.29133/yyutbd.570576
MLA ZARİFİ ANAKHATOON, E , SHAHMORADI, S , MIRZAPOUR, M . "Karasal Salyangoz (Helix lucorum L.) Midesinden Elde Edilen Enzim Bileşenleri Kullanılarak Çavdar (Secale spp.) Türlerinde Karyotip Analizi". Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi 29 (2019 ): 801-808 <https://dergipark.org.tr/tr/pub/yyutbd/issue/50355/570576>
Chicago ZARİFİ ANAKHATOON, E , SHAHMORADI, S , MIRZAPOUR, M . "Karasal Salyangoz (Helix lucorum L.) Midesinden Elde Edilen Enzim Bileşenleri Kullanılarak Çavdar (Secale spp.) Türlerinde Karyotip Analizi". Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi 29 (2019 ): 801-808
RIS TY - JOUR T1 - Karasal Salyangoz (Helix lucorum L.) Midesinden Elde Edilen Enzim Bileşenleri Kullanılarak Çavdar (Secale spp.) Türlerinde Karyotip Analizi AU - Eissa ZARİFİ ANAKHATOON , Shakiba SHAHMORADI , Mohsen MIRZAPOUR Y1 - 2019 PY - 2019 N1 - doi: 10.29133/yyutbd.570576 DO - 10.29133/yyutbd.570576 T2 - Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi JF - Journal JO - JOR SP - 801 EP - 808 VL - 29 IS - 4 SN - 1308-7576-1308-7584 M3 - doi: 10.29133/yyutbd.570576 UR - https://doi.org/10.29133/yyutbd.570576 Y2 - 2019 ER -
EndNote %0 Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi Karasal Salyangoz (Helix lucorum L.) Midesinden Elde Edilen Enzim Bileşenleri Kullanılarak Çavdar (Secale spp.) Türlerinde Karyotip Analizi %A Eissa ZARİFİ ANAKHATOON , Shakiba SHAHMORADI , Mohsen MIRZAPOUR %T Karasal Salyangoz (Helix lucorum L.) Midesinden Elde Edilen Enzim Bileşenleri Kullanılarak Çavdar (Secale spp.) Türlerinde Karyotip Analizi %D 2019 %J Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi %P 1308-7576-1308-7584 %V 29 %N 4 %R doi: 10.29133/yyutbd.570576 %U 10.29133/yyutbd.570576
ISNAD ZARİFİ ANAKHATOON, Eissa , SHAHMORADI, Shakiba , MIRZAPOUR, Mohsen . "Karasal Salyangoz (Helix lucorum L.) Midesinden Elde Edilen Enzim Bileşenleri Kullanılarak Çavdar (Secale spp.) Türlerinde Karyotip Analizi". Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi 29 / 4 (Aralık 2020): 801-808 . https://doi.org/10.29133/yyutbd.570576
AMA ZARİFİ ANAKHATOON E , SHAHMORADI S , MIRZAPOUR M . Karasal Salyangoz (Helix lucorum L.) Midesinden Elde Edilen Enzim Bileşenleri Kullanılarak Çavdar (Secale spp.) Türlerinde Karyotip Analizi. YYÜ TAR BİL DERG. 2019; 29(4): 801-808.
Vancouver ZARİFİ ANAKHATOON E , SHAHMORADI S , MIRZAPOUR M . Karasal Salyangoz (Helix lucorum L.) Midesinden Elde Edilen Enzim Bileşenleri Kullanılarak Çavdar (Secale spp.) Türlerinde Karyotip Analizi. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi. 2019; 29(4): 808-801.