Muğla ve Kütahya’dan Toplanan Gymnopus ocior (Pers.) Antonin & Noordel ve Gymnopus dryophilus (Bull.) Murrill Türlerine Ait Örneklerin Klasik Sistematik ve ITS Gen Dizileri ile Analizi

Year 2017, Volume: 17 Issue: 2, 366 - 371, 31.08.2017

Bekir Çöl , Ezgin Tırpan Ebru Balcı Hakan Allı Dilek Akkanat İsmail Şen

Abstract

Morfolojik ve mikroskobik karakterlerinin benzerliği nedeniyle, Gymnopus (Pers.) Gray (Basidiomycota, Omphalotaceae) cinsine ait Gymnopus dryophilus (Bull.) Murrill ve Gymnopus ocior (Pers.) Antonín & Noordel türlerinin klasik yöntemlerle ayrımı oldukça zordur. Bu yüzden bu çalışmada, Muğla ve Kütahya’dan toplanan bu iki türe ait örneklerin teşhisinde yardımcı olmak üzere, moleküler sistematik yaklaşımdan yararlanılmıştır. Bunun için, makrofunguslarda evrensel barkod geni olan ITS (Internal Transcribed Spacer) bölgesi tercih edilmiştir. Ülkemizden toplanan söz konusu mantar örneklerinin ITS gen dizileri veri tabanlarına kazandırılmış ve biyoinformatik analizler sonucu filogenetik ağaç oluşturulmuştur. Sonuç olarak, G. ocior ve G. dryophilus örneklerinin ayrımında ITS gen dizi analizinin, tür teşhisinde destekleyici olabileceği gösterilmiştir.

Keywords

Gymnopus ocior, Gymnopus dryophilus, ITS, Barkod Gen.

References

• Akata, I. and Uzun, Y., 2017. Macrofungi determined in Uzungöl Nature Park (Trabzon). Trakya Unıversity Journal of Natural Sciences 18(1): xx-xx, DOI: 10.23902/trkjnat.295542. Akata, I. 2017. Macrofungal Diversity of Belgrad Forest (İstanbul). Kastamonu Üniversitesi Orman Fakültesi Dergisi 17 (1): 150-164.
• Afyon, A. and Konuk, M., 2002. A study on macrofungi of Zonguldak District. The Herb Journal of Systematic Botany 9(1): 121-128.
• Antonin, V. and Noordeloos, M.E., 2010. A monograph of marasmioid and collybioid fungi in Europe. IHW-Verlag.
• Antonín, V., Sedlák, P. and Tomšovský, M., 2013. Taxonomy and phylogeny of European Gymnopus subsection Levipedes (Basidiomycota, Omphalotaceae). Persoonia 31: 179–187.
• Baba H., Alkan S., Kaşık G., 2012. Hatay Kent Merkezi (Antakya) ve Habib-i Neccar Dağında Yayılış Gösteren Makromantar Çeşitliliği, 21. Ulusal Biyoloji Kong., 3-7 Eylül 2012, p. 1180, Bornova-İZMİR.
• Balcı E., 2016. Bazı Stereum hirsutum ve Schizophyllum commune Makrofungus Türlerine ait Örneklerden Misel Üretimi ve RAPD-PCR Analizi ile Genetik Akrabalıklarının Araştırılması. Yüksek lisans tezi, Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Muğla, 65.
• Gücin, F., Işıloğlu, M., Solak, M.H. 1995. Macrofungi of Kozak plateau (West Anatolia). XIIth Congress of European Mycologists, Wageningen, 3-7 September. P. 22. Wageningen, The Netherlands. pp: 27.
• Işıloğlu, M., Solak, M.H., Gücin, F. 1998. The edible macrofungi of northwest Anatolia. 5th International Symposium Plant Life in South-West and Central Asia, Tashkent, 18-22 May 1998. Pp. 88-90. Tashkent.
• Kaya, A. 2000. New records of Tricholomataceae for the mycoflora of Turkey. Bulletin of Pure and Applied Sciences 19B(2): 77-81.
• Kaşık, G., Doğan, H.H., Öztürk, C., Aktaş, S., Sabahlar, Ş. 2005. New records of the macrofungi from Turkey. Pakistan Journal of Botany 37 (3): 769-777.
• Knudsen, H. and Vesterhold, J., 2012. Funga Nordica. Copanhagen: Nordsvamp.
• Öztürk, C., Kaşık, G. 1996. Macrofungi in Ürgüp District. Selçuk Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Fen Dergisi 13: 50-54.
• Öztürk Ö., Doğan, H.H., Yıldırımlı, Ş. 2010. Macrofungi of Eldivan dağ. (Çankırı), Ot sistematik Botanik Dergisi, 17 (2): 141-154.
• Pilát, A.A. 1933. Additamenta ad floram Asiae Minoris hymenomycetum pars secunda: Agaricineae. Bulletin Trimestriel Society Mycologie France 49: 283-302.
• Schoch, C.A., Seifert, K.A., Huhndorf, S., Robert, V., Spouge, J.L., Levesque, C.A., Chen, W. and Fungal Barcoding Consortium, 2012. Nuclear ribosomal internel transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for fungi, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 109 (16): 6241-6246.
• Sesli, E., Denchev, C.M. 2014. Checklists of the myxomycetes, larger ascomycetes, and larger basidiomycetes in Turkey. 6th edn. Mycotaxon Checklists Online (http://www.mycotaxon.com/resources/checklists/sesli-v106-checklist.pdf): 1–136.
• Solak, M.H., Işıloğlu, M., Kalmış, E. and Allı, H., 2015. Macrofungi of Turkey, Checklist Vol. 2. İzmir Üniversiteliler Ofset.
• Taşkın, H. 2011. Türkiye florasında yetişen kuzugöbeği mantarlarının moleküler karakterizasyonu. Yüksek Lisans Tezi, Çukurova Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Adana, 167.
• Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski A.,3 and Kumar S., 2013. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0, Oxford University, Molecular Biology and Evolution, 30(12):2725–2729.
• Vizzini, A., Antonin, V., Sesli, E. and Contu, M., 2015. Gymnopus trabzonensis sp. nov. (Omphalotaceae) and Tricholoma virgatum var. fulvoumbonatum var. nov. (Tricholomataceae), two new white-spored agarics from Turkey. Phytotaxa. 226(2):119-130.
• Watling, R. and Gregory, N.M. 1977. Larger fungi from Turkey, Iran and neighbouring countries. Karstenia 17: 59-72.
• Webster, J. and Weber, R.W.S., 2007. Introduction to Fungi, 3, Cambridge University Press, Newyork.
• 1-http://www.mbio.ncsu.edu/bioedit/bioedit.html, (05.01.2017)