Microorganisms Isolated from Respiratory Intensive Care Unit and the Change of Antibiotic Resistance Status By Years And Its Effect On Mortality

Year 2023, Volume: 20 Issue: 3, 485 - 493, 31.12.2023

Hamdiye Turan , Cengizhan Sezgi , Abdurrahman Abakay Cetin Tanrikulu

https://doi.org/10.35440/hutfd.1281480

Abstract

BACKGROUND: Intensive care units (ICU) are multidisciplinary departments where patients with life-threatening diseases, major surgical interventions, respiratory failure, coma condition, hemodynamic insufficiency, and ≥1 organ failure are admitted for relevant diagnoses and treatment.
AIM: The present study sought to investigate pathogens causing infections in patients admitted to our respiratory ICU and their antibiotic resistance patterns.
MATERİALS and METHOD: The antibiogram results and clinical data of all patient samples submitted between January 1, 2008, and December 31, 2010, were retrospectively reviewed.
RESULT: In total, 248 patients with 561 culture results were included in the study. Microbial growth was detected in the following samples: blood, 336 (59.9%); deep tracheal aspirate, 104 (18.6%); urine, 89 (15.9%); wound drain, 12 (2.1%); central venous catheter liquid, 7 (1.3%); phlegm, 10 (1.8%); Foley tip liquid, 1 (0.2%); and pleural effusion, and 1 (0.2%). Rapid growth was most frequently noted in the cultures of coagulase-negative staphylococci (25.3%), Acinetobacter spp. (23.1%), and Escherichia coli (12.6%).
STATISTICAL ANALYSIS
Descriptive statistics for continuous variables were expressed as means and standard deviations. The intermittent variables were converted into cross-tables and analyzed using Fisher’s exact and Pearson’s chi-square tests. The normal distribution of the study data was assessed using Kolmogorov–Smirnov test. The mean values of the variables were analyzed using Student’s t-test. Bidirectional hypotheses were used, and a p-value of <0.05 was considered statistically significant. The IBM Statistical Package for the Social Sciences Ver. 18.0 for Windows (SPSS Inc., Chicago, IL, USA) software was used for statistical analyses.

IN CONCLUSION, the present study revealed microorganisms’ resistance profiles similar to those of other relevant studies. The study provides important insights into the selection of empiric antibiotic therapy for patients admitted in intensive care unit.

Keywords: respiratory intensive care unit, intensive care infections, antibiotic resistance, antibiotic susceptibility

Keywords

respiratory intensive care unit,, intensive care infections,, antibiotic resistance, antibiotic susceptibility

Solunumsal Yoğun Bakım Ünitesinde İzole Edilen Mikroorganizmalar ve Antibiyotik Direnç Durumlarının Yıllara Göre Değişimi ve Mortaliteye Etkisi

Abstract

ÖZET:
GİRİŞ :Yoğun bakım üniteleri (YBÜ), yaşamı tehdit eden hastalıkları, büyük cerrahi girişimleri, solunum yetmezliği, koma durumu, hemodinamik yetmezliği ve ≥1 organ yetmezliği olan hastaların ilgili tanı ve tedavi için kabul edildiği multidisipliner bölümlerdir.
AMAÇ: Bu çalışma, solunum yoğun bakım ünitemize kabul edilen hastalarda enfeksiyonlara neden olan patojenleri ve antibiyotik direnç modellerini araştırmayı amaçladı.
MATERYAL VE METOD: 1 Ocak 2008 ile 31 Aralık 2010 tarihleri arasında sunulan tüm hasta örneklerinin antibiyogram sonuçları ve klinik verileri retrospektif olarak incelendi.
İSTATİSTİK: Sürekli değişkenler için tanımlayıcı istatistikler, ortalama ve standart sapma olarak ifade edildi. Kesintili değişkenler çapraz tablolara dönüştürüldü ve Fisher'in kesinliği ve Pearson'un ki-kare testleri kullanılarak analiz edildi. Çalışma verilerinin normal dağılımı Kolmogorov-Smirnov testi ile değerlendirildi. Değişkenlerin ortalama değerleri Student t-testi kullanılarak analiz edildi. Çift yönlü hipotezler kullanıldı ve p <0,05 değeri istatistiksel olarak anlamlı kabul edildi. Sosyal Bilimler için IBM İstatistik Paketi Ver. İstatistiksel analizler için Windows için 18.0 (SPSS Inc., Chicago, IL, ABD) yazılımı kullanıldı.
SONUÇ: Toplamda 561 kültür sonucu olan 248 hasta çalışmaya dahil edildi. Aşağıdaki örneklerde mikrobiyal üreme tespit edildi: kan, 336 (%59,9); derin trakeal aspirasyon, 104 (%18.6); idrar, 89 (%15.9); yara drenajı, 12 (%2,1); santral venöz kateter sıvısı, 7 (%1,3); balgam, 10 (%1.8); Foley uçlu sıvı, 1 (%0,2); ve plevral efüzyon ve 1 (%0.2).
Hızlı üreme en sık olarak koagülaz negatif stafilokok (%25,3), Acinetobacter spp. (%23,1) ve Escherichia coli (%12,6).
Sonuç olarak, bu çalışma mikroorganizmaların direnç profillerini ilgili diğer çalışmalara benzer şekilde ortaya koymuştur. Çalışma, yoğun bakım ünitesine kabul edilen hastalar için ampirik antibiyotik tedavisinin seçimine ilişkin önemli bilgiler sunmaktadır.
Anahtar Kelimeler: Solunum yoğun bakım ünitesi, yoğun bakım enfeksiyonları, antibiyotik direnci, antibiyotik duyarlılığı

Keywords

Solunumsal yoğun bakım ünitesi, yoğun bakım enfeksiyonları, antibiyotik direnci, antibiyotik duyarlılığı.

Thanks

tezim olup yayınlanması gerekmektedir.

References

• 1. Erbay H, Yalçın AN, Serin S, Turgut H, Tomatir E, Çetin B, Zencir M. Bir Türk üniversite hastanesinde yoğun bakım üni-tesinde hastane enfeksiyonları: 2 yıllık bir anket. Yoğun ba-kım tıbbı. 2003: 29, 1482-1488.
• 2. VINCENT, Jean-Louis. Yearbook of Intensive Care and Emer-gency Medicine 2002. Springer Science & Business Media 2013.217:271.
• 3. Hsueh PR, Chen WH, Luh KT. Relationships Between Anti- microbial use and Antimicrobial Resistance in Gram Negative Bacteria Causing Nosocomial Infections from 1991- 2003 at a University Hospital in Taiwan. Int J Antimicrob Agents 2005: 26(6):463-72.
• 4. Peterson LR. Squeezing The Antibiotic Balloon: The Impact of Antibiotic Classes On Emerging Resistance. Review. Clin Microbiol Infect 2005;11(Suppl 5):S4-16.
• 5. Aygen B., Kayabaş Ü., Güven M., Doğanay M., Sümerkan B., Yıldız O. Intensive Care Units Surveillance for Nosoco- mial Infections: Epidemiology, Risk Factors and Factors Af- fect-ing Prognosis: Erciyes University Faculty of Medicine: Inten-sive Care Journal 2001 ;1(2):122-130.
• 6. Cakar N, Tutuncu A. Reasons for Hospitalization in Inten- sive Care Unit, Invasive Interventions and Infection Prob- lem. Clinical Journal 1996; 9: 3-5.
• 7. Vincent JL, Bihari DJ, Suter PM, et al. The Prevalence of Nosocomial Infection in Intensive Care Units in The Eu- rope. Results of The European Prevalence of Infection in In-tensive Care (EPIC) Study. EPIC International Advisory Committee. JAMA 1995; 274:639-44.
• 8. RICHARDS, Michael J., et al. Nosocomial infections in medi-cal intensive care units in the United States. Critical care medicine, 1999: 27.5: 887-892.
• 9. Atatürk Üniversitesi Tıp Fakültesi Araştırma Hastanesinin Yoğun Bakım Ünitelerinde Yatmakta Olan Hastalarda Geli- şen Hastane Enfeksiyonları, Etkenleri, Antimikrobiyal Du- yarlılıkları Ve Mortalite Üzerine Etkileri Bilgen Borulu Uz-manlık Tezi, Danışman Prof.Dr.Mehmet Parlak Erzurum- 2020.
• 10. Uzun K, Teke T, Yavuz Z. Göğüs Hastalıkları Yoğun Bakım Ünitesinde izole edilen patojen mikroorganizmalar arasında antibiyotik direnç ve duyarlılık oranları. Tıp Araşt Derg 2006: 4(3), 8-13.
• 11. Akkuş N, Biberoğlu K, Tarhan O. Infection Risk Factors in Intensive Care Unit: Dokuz Eylul University Faculty of Me- dicine Experience. Journal of Hospital Infections 1997; 1:101-5.
• 12. Dündar D, Meriç M, Baykara N, Willke A. Kocaeli Üniversitesi Tıp Fakültesi Yoğun Bakım Ünitesi’nde yatan hastalardan izole edilen infeksiyon etkenleri ve antimikrobiyal duy-arlılıkları. Klimik Derg, 2008, 21.3: 122-5.
• 13. Brawley RL, Weber DJ, Samsa GP, Rutala WA. Multiple No- socomial İnfections: An İncidence Study. Am J Epidemiol 1989;130:769-80.
• 14. Miller PJ, Wenzel RP. Etiologic Organisms As Independent Predictors of Death and Morbidity Associated With Blo- od-stream Infections. J Infect Dis 1987;156:471-7.
• 15. Aube H, Milan C, Blettery B. Risk Factors For Septic Shock in The Early Management of Bacteremia. Am J Med 1992;93:283-8
• 16. Uzun O, Akalın HE, Hayran M. Factors Influencing Progno- sis in Bacteremia Due to Gram-Negative Organisms: Eva- lua-tion of 448 Episodes in a Turkish University Hospital. Clin In-fect Dis 1992;15:866-73.
• 17. Çetin CB, Yalcın AN, Turgut H, Kaleli İ, Orhan N.: Hospital Infections in Pamukkale University Medical Faculty Hospi- tal. Journal of Hospital Infections 1999;3:161-4.
• 18. TROUILLET, Jean-Louis, vd. Potansiyel olarak ilaca dirençli bakterilerin neden olduğu ventilatör ilişkili pnömoni. Amerikan solunum ve yoğun bakım tıbbı dergisi, 1998; 157.2: 531-539.
• 19. Namiduru M, Gungor G, Karaoglan I, et al. Antibiotic Re-sistance of Bacterial Ventilator Associated Pneumonia In Surgical Intensive Care Units. Journal of International Me- dical Research 2004; 32:78-83.
• 20. Sevinç C, Uysal Ü, Kılınç O et al. Clinical and Bacteriolo- gical Features of Hospital Acquired Pneumonias. ERS An- nual Congress Abstract Book 2001
• 21. Cetin S, Celik I, Artan C. Evaluation of microorganisms and antibiotic resistance profile isolated in intensive care unit patients. Türk Yogun Bakim Dergisi. 2021: 19.1: 9.
• 22. Köseoğlu, Ö., Kocagöz, S., Gür, D., & Akova, M. Nosocomial bloodstream infections in a Turkish university hospital: study of Gram-negative bacilli and their sensitivity pat-terns. International journal of antimicrobial agents. 2001: 17(6), 477-481.477–481
• 23. Taşbakan MS, Pullukçu H, Ekren PK, Oz AT, Midilli M, Ay-demir S, Gürgün A, Başoğlu OK, Bacakoğlu F. Colistin use in ventilator-associated pneumonia due to panresistant Pseu-domonas aeruginosa and Acinetobacter bau-mannii. Mikrobiyoloji Bulteni. 2009: 43(1), 61-70.
• 24. Över U, Gür D, Ünal S, Miller GH and Aminoglycoside Re- sistance Study Group. Mechanisms of Resistance to Ami- noglycoside Antibiotics in Gram Negative Bacteria: Recent Developments and Results for Türkiye. Flora 2000; 3:168- 78.
• 25. Kollef MH, Fraser VJ. Antibiotic resistance in the intensive care unit. Annals of internal medicine.2001;134(4), 298-314.
• 26. Elmanama AA. Antimicrobial Resistance of Acinetobacter spp. Isolated from Pus Specimens from AL-Shifa Hospital, Gaza, Palestine. Al-Aqsa University Journal (Natural Scienc-es Series), 2006: 10(SE), 59-68.
• 27. Aksaray S, DokuzoGuz B, Güvener E, Yücesoy M, Yuluğ N, Kocagöz S, et al. Surveilance of Antimicrobial Resistance Among Gram Negative Isolates from Intensive Care Units in Eight Hospitals in Turkey. J Antimicrob Chemother 2000; 45:695-9.
• 28. Kim JM, Park ES, Jeong JS, Kim KM, Kim JM, Oh HS, et al. Muticenter Surveillance Study For Nosocomial Infections in Major Hospitals in Ko- rea. Nosocomial Infection Surveil-lance Committee of Control. Am J Infect Control 2000; 28:458-8.
• 29. Engin A, Gürelik B, Elaldi N, Bakır M, Dökmetaş İ, bakici MZ, ve ark. Cumhuriyet Üniversitesi Tıp Fakültesi Reanimasyon Yoğun Bakım Ünitesinde Nozokomiyal İnfeksiyonlar: Dört Yıllık Takip Çalışması. Yoğun Bakım Dergisi 2006;6(4):227-232
• 30. Hiramatsu K, Hanaki H, Inot, Yabuta K, Ogurit, Tenover FC: Methicillinresistant Staphylococcus Aureus Clinical Strain With Reduced Vancomycin Susceptibility, J Antimicrob Chemother 1997;40(1):135-6.
• 31. Dawn M. Sievert, James T. Rudrik, Jean B. Patel L. Clifford McDonald, Melinda J. Wilkins, and Jeffrey C. Hageman. Van-comycin Resistant Staphylococcus Aureus in The Uni- ted States, 2002–2006. Clinical Infectious Diseases 2008; 46:668–74.
• 32. Koçak AA, Yayla B, Güçlü AÜ, Mirza HC, İştar EH, Alışkan H. ve ark. Adana’da Bir Üniversite Hastanesinde İzole Edilen Solunum Yolu Patojenleri ve Antibiyotik Direnç Profillerinin Değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyoloji Cem Derg. 2019: 49(4), 226-232.
• 33. Çiragil P. Ülkemizde Yoğun Bakım Ünitelerinde Anti-mikrobiyal Direnç Sorunu. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2016: 46(3):97-104