Sakarya Nehir Sedimentinden İzole Edilen Aktinobakterilerin Antimikrobiyal ve Bitki Gelişim Teşvik Edici Özelliklerinin Belirlenmesi
Öz
Biyoaktif bileşik üretim potansiyeli yüksek olan aktinobakteriler antibiyotik, antitümör ajanı, bitki gelişimini teşvik eden faktörler ve enzimler üretebilmektedirler. Yeni biyoaktif bileşiklerin keşfi için faklı ekstrem ortamlardan izolasyon çalışmaları yapılmaktadır. Bu çalışmada, Sakarya Nehir kaynağının sedimentinden ilk kez aktinobakteri izolasyonu ve bu bakterilerin ürettiği farklı bioaktif metabolitlerin varlığı araştırlmıştır. Antimikrobiyal aktivite deneylerinde Gram pozitif, Gram negatif bakteriler, maya ve funguslar kullanılmıştır. İzolatların azotu (N) fikse edebilme inorganik fosfatı çözebilme yeteneklerine, indol asetik asit (IAA) üretebilme ve kazeinaz aktivitelerine bakılmıştır. 17 aktinobakteri izolatının 16S rDNA analizleri sonucunda, izolatlar Micromonospora sp., (14), Saccharomonospora sp. (2) ve Cellulomonas sp. (1) olarak tanımlanmıştır. Elde edilen sonuçlarda, Micromonospora izolatlarının Gram pozitif bakterilere, maya ve funguslara karşı etkin olduğu belirlenmiştir. 12 izolatın N’u fikse edebildiği, 7 izolatın IAA üretebildiği, 2 izolatın kazeinaz aktivitesine sahip olduğu görülmüştür. Antimikrobiyal özellikleri açısından yüksek aktiviteye sahip olanların iyi birer farmasötik aday olabileceği ve bitki gelişimini teşvik edici potansiyele sahip izolatların da tarım alanında biyogübre olarak kullanım potansiyeline sahip olduğu düşünülmektedir. Ayrıca, 16S rDNA dizi analizleri sonucunda 2 Micromonospora, Saccharomonospora sp. ve Cellulomonas sp. Suşlarının yeni birer tür olması söz konusudur.
Anahtar Kelimeler
Aktinobakteriler , Antimikrobiyal aktivite , Bitki gelişimini teşvik özellikleri , 16S rDNA analizi
References
- Arango, C., Acosta-Gonzalez, A., Parra-Giraldo, C.M., Sánchez-Quitian, Z.A., Kerr, R., and Diaz, L.E., (2018). Characterization of Actinobacterial Communities from Arauca River Sediments (Colombia) Reveals Antimicrobial Potential Presented in Low Abundant Isolates. The Open Microbiology Journal, 12, 181-194.
- Azman, A. S., Othman, I., S Velu, S., Chan, K. G., and Lee, L. H., (2015). Mangrove rare actinobacteria: taxonomy, natural compound, and discovery of bioactivity. Frontiers in Microbiology, 6, 856. Bacteriology", 2nd ed., Vol. 5, Parts A and B.
- Baltz, R., (2007). Antimicrobials from actinomycetes: Back to Future. Microbe. 2, 125-131.
- Barka, E. A., Vatsa, P., Sanchez, L., Gaveau-Vaillant, N., Jacquard, C., Klenk, H.P., Clément, C., Ouhdouch, Y., and van Wezel, G.P., (2016). Taxonomy, Physiology, and Natural Products of Actinobacteria. Microbiology and Molecular Biology Reviews, 80(1), 1–43
- Baskaran, R., Vijayakumar, R., and Mohan, P. M., (2011). Enrichment method for the isolation of bioactive actinomycetes from mangrove sediments of Andaman Islands, India. Malays Journal Microbiology, 7(1), 26-32.
- Berdy, J., (2005). Bioactive microbial metabolites. The Journal of antibiotics, 58(1), 1-26.
- de Souza, R. D., Ambrosini, A., and Passaglia, L. M., (2015). Plant growth-promoting bacteria as inoculants in agricultural soils. Genetics and Molecular Biology, 38(4), 401-419.
- El-Tarabily, K. A., Nassar, A. H., and Sivasithamparam, K., (2008). Promotion of growth of bean (Phaseolus vulgaris L.) in a calcareous soil by a phosphate-solubilizing, rhizosphere-competent isolate of Micromonospora endolithica. Applied soil ecology, 39(2), 161-171.
- Gärtner, A., Wiese, J., and Imhoff, J. F., (2016). Diversity of Micromonospora strains from the deep Mediterranean Sea and their potential to produce bioactive compounds. AIMS Microbiology, 2(2), 205-221.
- Gong, Y., Bai, J. L., Yang, H. T., Zhang, W. D., and Xiong, Y.W. et al., (2018). Phylogenetic diversity and investigation of plant growthpromoting traits of actinobacteria in coastal salt marsh plant rhizospheres from Jiangsu, China. Systematic and Applied Microbiology, 41, 516-527.
