Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi
Abstract
Yeni nesil dizileme (YND) araçları, büyük miktarda veri üretme kapasitesine sahiptir ancak dizileme sonrası büyük ölçekli veri analizi için yeterli olmayan hesaplama ve depolama kapasitesi ile donatılmışlardır. Bulut bilişim altyapılarını kullanmak YND verilerinin analizi, depolanması ve aktarılması ile ilgili sorunlara alternatif bir seçenek olmuştur. Bulut bilişim, kullanıcılara dizileme verilerinin analizi için gerekli hesaplama kapasitesi ve bilişim altyapılarına erişim sunmakta ve biyoinformatik altyapıları için gerekli olan ön sermaye harcamalarının çoğunu ortadan kaldırmaktadır. Yapılan bu çalışmada yeni nesil dizileme yöntemi ve dizileme verilerinin analizinde kullanılan bulut bilişim platformaları hakkında bilgi verilmiştir.
Keywords
References
- [1]Behjati S., Tarpey P. S., "What is next generation sequencing?," Archives of Disease in Childhood. Education and Practice Edition, 98, 236-238, 2013.
- [2] Barba, M., Czosnek, H., & Hadidi, A.” Historical perspective, development and applications of next-generation sequencing in plant virology,” Viruses, 6, 106–136, 2014 . [3] Goodwin, S., McPherson, J. & McCombie, W., “Coming of age: ten years of next-generation sequencing Technologies,” Nat Rev Genet, 17, 333–351, 2016.
- [4] Kwon T., Yoo W. G., W.-J. Lee W.J., Kim W., Kim D.W., "Next-generation sequencing data analysis on cloud computing," Genes & Genomics, 37, 489-501, 2015.
- [5] Pereira M., Malta F., Freire M., and Couto P., "Application of Next-Generation Sequencing in the Era of Precision Medicine. In Applications of RNA-Seq and Omics Strategies – From Microorganisms to Human Health", Intech Open, 2017.
- [6] Celesti F., Celesti A., Carnevale L., Galletta A., Campo S., Romano A., "Big data analytics in genomics: The point on Deep Learning solutions," 22nd IEEE Symposium on Computers and Communications (ISCC), Abstract Book, 306-309, 2017.
- [7] Schmidt B. , Hildebrandt A., "Next-generation sequencing: Big data meets high performance computing," Drug Discovery Today, 22, 712-717, 2017.
- [8] Zhao S., Watrous K., Zhang C., and Zhang B., "Cloud Computing for Next-Generation Sequencing Data Analysis," InTechOpen, 29–51, 2017 . [9] Thakur R., Bandopadhyay R., Chaudhary B., Chatterjee S., "Now and next-generation sequencing techniques: Future of sequence analysis using cloud computing," Frontiers in Genetics, 3, 280-280, 2012.
- [10] Langmead B. and Nellore A., "Cloud computing for genomic data analysis and collaboration," Nature Reviews Genetics, 19, 208-219, 2018.
Details
Primary Language
Turkish
Subjects
Engineering
Journal Section
Review
Publication Date
June 13, 2022
Submission Date
October 6, 2021
Acceptance Date
January 25, 2022
Published in Issue
Year 2022 Volume: 11 Number: 1
APA
Karabudak, S., & Akkuş, M. S. (2022). Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi. Nevşehir Bilim Ve Teknoloji Dergisi, 11(1), 1-10. https://doi.org/10.17100/nevbiltek.1005534
AMA
1.Karabudak S, Akkuş MS. Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi. 2022;11(1):1-10. doi:10.17100/nevbiltek.1005534
Chicago
Karabudak, Sema, and Meryem Sena Akkuş. 2022. “Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi”. Nevşehir Bilim Ve Teknoloji Dergisi 11 (1): 1-10. https://doi.org/10.17100/nevbiltek.1005534.
EndNote
Karabudak S, Akkuş MS (June 1, 2022) Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi 11 1 1–10.
IEEE
[1]S. Karabudak and M. S. Akkuş, “Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi”, Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi, vol. 11, no. 1, pp. 1–10, June 2022, doi: 10.17100/nevbiltek.1005534.
ISNAD
Karabudak, Sema - Akkuş, Meryem Sena. “Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi”. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi 11/1 (June 1, 2022): 1-10. https://doi.org/10.17100/nevbiltek.1005534.
JAMA
1.Karabudak S, Akkuş MS. Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi. 2022;11:1–10.
MLA
Karabudak, Sema, and Meryem Sena Akkuş. “Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi”. Nevşehir Bilim Ve Teknoloji Dergisi, vol. 11, no. 1, June 2022, pp. 1-10, doi:10.17100/nevbiltek.1005534.
Vancouver
1.Sema Karabudak, Meryem Sena Akkuş. Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi. 2022 Jun. 1;11(1):1-10. doi:10.17100/nevbiltek.1005534
Cited By
GIDA MİKROBİYOLOJİSİNDE METAGENOMİK YAKLAŞIMLAR
GIDA / THE JOURNAL OF FOOD
https://doi.org/10.15237/gida.GD23101TÜRKİYE’NİN ENDÜSTRİ 4.0’A GEÇİŞ SÜRECİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ
Yönetim Bilimleri Dergisi
https://doi.org/10.35408/comuybd.1344608