Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi
Öz
Yeni nesil dizileme (YND) araçları, büyük miktarda veri üretme kapasitesine sahiptir ancak dizileme sonrası büyük ölçekli veri analizi için yeterli olmayan hesaplama ve depolama kapasitesi ile donatılmışlardır. Bulut bilişim altyapılarını kullanmak YND verilerinin analizi, depolanması ve aktarılması ile ilgili sorunlara alternatif bir seçenek olmuştur. Bulut bilişim, kullanıcılara dizileme verilerinin analizi için gerekli hesaplama kapasitesi ve bilişim altyapılarına erişim sunmakta ve biyoinformatik altyapıları için gerekli olan ön sermaye harcamalarının çoğunu ortadan kaldırmaktadır. Yapılan bu çalışmada yeni nesil dizileme yöntemi ve dizileme verilerinin analizinde kullanılan bulut bilişim platformaları hakkında bilgi verilmiştir.
Anahtar Kelimeler
Kaynakça
- [1]Behjati S., Tarpey P. S., "What is next generation sequencing?," Archives of Disease in Childhood. Education and Practice Edition, 98, 236-238, 2013.
- [2] Barba, M., Czosnek, H., & Hadidi, A.” Historical perspective, development and applications of next-generation sequencing in plant virology,” Viruses, 6, 106–136, 2014 . [3] Goodwin, S., McPherson, J. & McCombie, W., “Coming of age: ten years of next-generation sequencing Technologies,” Nat Rev Genet, 17, 333–351, 2016.
- [4] Kwon T., Yoo W. G., W.-J. Lee W.J., Kim W., Kim D.W., "Next-generation sequencing data analysis on cloud computing," Genes & Genomics, 37, 489-501, 2015.
- [5] Pereira M., Malta F., Freire M., and Couto P., "Application of Next-Generation Sequencing in the Era of Precision Medicine. In Applications of RNA-Seq and Omics Strategies – From Microorganisms to Human Health", Intech Open, 2017.
- [6] Celesti F., Celesti A., Carnevale L., Galletta A., Campo S., Romano A., "Big data analytics in genomics: The point on Deep Learning solutions," 22nd IEEE Symposium on Computers and Communications (ISCC), Abstract Book, 306-309, 2017.
- [7] Schmidt B. , Hildebrandt A., "Next-generation sequencing: Big data meets high performance computing," Drug Discovery Today, 22, 712-717, 2017.
- [8] Zhao S., Watrous K., Zhang C., and Zhang B., "Cloud Computing for Next-Generation Sequencing Data Analysis," InTechOpen, 29–51, 2017 . [9] Thakur R., Bandopadhyay R., Chaudhary B., Chatterjee S., "Now and next-generation sequencing techniques: Future of sequence analysis using cloud computing," Frontiers in Genetics, 3, 280-280, 2012.
- [10] Langmead B. and Nellore A., "Cloud computing for genomic data analysis and collaboration," Nature Reviews Genetics, 19, 208-219, 2018.
Ayrıntılar
Birincil Dil
Türkçe
Konular
Mühendislik
Bölüm
Derleme
Yayımlanma Tarihi
13 Haziran 2022
Gönderilme Tarihi
6 Ekim 2021
Kabul Tarihi
25 Ocak 2022
Yayımlandığı Sayı
Yıl 2022 Cilt: 11 Sayı: 1
APA
Karabudak, S., & Akkuş, M. S. (2022). Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi, 11(1), 1-10. https://doi.org/10.17100/nevbiltek.1005534
AMA
1.Karabudak S, Akkuş MS. Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi. 2022;11(1):1-10. doi:10.17100/nevbiltek.1005534
Chicago
Karabudak, Sema, ve Meryem Sena Akkuş. 2022. “Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi”. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi 11 (1): 1-10. https://doi.org/10.17100/nevbiltek.1005534.
EndNote
Karabudak S, Akkuş MS (01 Haziran 2022) Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi 11 1 1–10.
IEEE
[1]S. Karabudak ve M. S. Akkuş, “Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi”, Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi, c. 11, sy 1, ss. 1–10, Haz. 2022, doi: 10.17100/nevbiltek.1005534.
ISNAD
Karabudak, Sema - Akkuş, Meryem Sena. “Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi”. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi 11/1 (01 Haziran 2022): 1-10. https://doi.org/10.17100/nevbiltek.1005534.
JAMA
1.Karabudak S, Akkuş MS. Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi. 2022;11:1–10.
MLA
Karabudak, Sema, ve Meryem Sena Akkuş. “Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi”. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi, c. 11, sy 1, Haziran 2022, ss. 1-10, doi:10.17100/nevbiltek.1005534.
Vancouver
1.Sema Karabudak, Meryem Sena Akkuş. Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi. 01 Haziran 2022;11(1):1-10. doi:10.17100/nevbiltek.1005534
Cited By
GIDA MİKROBİYOLOJİSİNDE METAGENOMİK YAKLAŞIMLAR
GIDA / THE JOURNAL OF FOOD
https://doi.org/10.15237/gida.GD23101TÜRKİYE’NİN ENDÜSTRİ 4.0’A GEÇİŞ SÜRECİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ
Yönetim Bilimleri Dergisi
https://doi.org/10.35408/comuybd.1344608