Derleme

Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi

Cilt: 11 Sayı: 1 13 Haziran 2022
PDF İndir

Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi

Öz

Yeni nesil dizileme (YND) araçları, büyük miktarda veri üretme kapasitesine sahiptir ancak dizileme sonrası büyük ölçekli veri analizi için yeterli olmayan hesaplama ve depolama kapasitesi ile donatılmışlardır. Bulut bilişim altyapılarını kullanmak YND verilerinin analizi, depolanması ve aktarılması ile ilgili sorunlara alternatif bir seçenek olmuştur. Bulut bilişim, kullanıcılara dizileme verilerinin analizi için gerekli hesaplama kapasitesi ve bilişim altyapılarına erişim sunmakta ve biyoinformatik altyapıları için gerekli olan ön sermaye harcamalarının çoğunu ortadan kaldırmaktadır. Yapılan bu çalışmada yeni nesil dizileme yöntemi ve dizileme verilerinin analizinde kullanılan bulut bilişim platformaları hakkında bilgi verilmiştir.

Anahtar Kelimeler

Kaynakça

  1. [1]Behjati S., Tarpey P. S., "What is next generation sequencing?," Archives of Disease in Childhood. Education and Practice Edition, 98, 236-238, 2013.
  2. [2] Barba, M., Czosnek, H., & Hadidi, A.” Historical perspective, development and applications of next-generation sequencing in plant virology,” Viruses, 6, 106–136, 2014 . [3] Goodwin, S., McPherson, J. & McCombie, W., “Coming of age: ten years of next-generation sequencing Technologies,” Nat Rev Genet, 17, 333–351, 2016.
  3. [4] Kwon T., Yoo W. G., W.-J. Lee W.J., Kim W., Kim D.W., "Next-generation sequencing data analysis on cloud computing," Genes & Genomics, 37, 489-501, 2015.
  4. [5] Pereira M., Malta F., Freire M., and Couto P., "Application of Next-Generation Sequencing in the Era of Precision Medicine. In Applications of RNA-Seq and Omics Strategies – From Microorganisms to Human Health", Intech Open, 2017.
  5. [6] Celesti F., Celesti A., Carnevale L., Galletta A., Campo S., Romano A., "Big data analytics in genomics: The point on Deep Learning solutions," 22nd IEEE Symposium on Computers and Communications (ISCC), Abstract Book, 306-309, 2017.
  6. [7] Schmidt B. , Hildebrandt A., "Next-generation sequencing: Big data meets high performance computing," Drug Discovery Today, 22, 712-717, 2017.
  7. [8] Zhao S., Watrous K., Zhang C., and Zhang B., "Cloud Computing for Next-Generation Sequencing Data Analysis," InTechOpen, 29–51, 2017 . [9] Thakur R., Bandopadhyay R., Chaudhary B., Chatterjee S., "Now and next-generation sequencing techniques: Future of sequence analysis using cloud computing," Frontiers in Genetics, 3, 280-280, 2012.
  8. [10] Langmead B. and Nellore A., "Cloud computing for genomic data analysis and collaboration," Nature Reviews Genetics, 19, 208-219, 2018.

Ayrıntılar

Birincil Dil

Türkçe

Konular

Mühendislik

Bölüm

Derleme

Yayımlanma Tarihi

13 Haziran 2022

Gönderilme Tarihi

6 Ekim 2021

Kabul Tarihi

25 Ocak 2022

Yayımlandığı Sayı

Yıl 2022 Cilt: 11 Sayı: 1

Kaynak Göster

APA
Karabudak, S., & Akkuş, M. S. (2022). Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi, 11(1), 1-10. https://doi.org/10.17100/nevbiltek.1005534
AMA
1.Karabudak S, Akkuş MS. Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi. 2022;11(1):1-10. doi:10.17100/nevbiltek.1005534
Chicago
Karabudak, Sema, ve Meryem Sena Akkuş. 2022. “Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi”. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi 11 (1): 1-10. https://doi.org/10.17100/nevbiltek.1005534.
EndNote
Karabudak S, Akkuş MS (01 Haziran 2022) Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi 11 1 1–10.
IEEE
[1]S. Karabudak ve M. S. Akkuş, “Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi”, Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi, c. 11, sy 1, ss. 1–10, Haz. 2022, doi: 10.17100/nevbiltek.1005534.
ISNAD
Karabudak, Sema - Akkuş, Meryem Sena. “Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi”. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi 11/1 (01 Haziran 2022): 1-10. https://doi.org/10.17100/nevbiltek.1005534.
JAMA
1.Karabudak S, Akkuş MS. Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi. 2022;11:1–10.
MLA
Karabudak, Sema, ve Meryem Sena Akkuş. “Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi”. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi, c. 11, sy 1, Haziran 2022, ss. 1-10, doi:10.17100/nevbiltek.1005534.
Vancouver
1.Sema Karabudak, Meryem Sena Akkuş. Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi. Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi. 01 Haziran 2022;11(1):1-10. doi:10.17100/nevbiltek.1005534

Cited By

Dergimizin tarandığı indeksler


 

12300          20980     20978