IL7R GEN MUTASYON VE POLİMORFİZMLARİNİN AĞIR KOMBİNE İMMUN YETMEZLİKLİ HASTALARDAKİ SIKLIĞI

Atıl Bişgin; İbrahim Boğa; Mustafa Yılmaz; Derya Ufuk Altıntaş

doi:10.25279/sak.350281

IL7R GEN MUTASYON VE POLİMORFİZMLARİNİN AĞIR KOMBİNE İMMUN YETMEZLİKLİ HASTALARDAKİ SIKLIĞI

Abstract

Öz

Ağır kombine immün yetmezlik immün sistem hücrelerinin defektleri ile ilgili olan nadir görülen genetik bir hastalıktır. Bu hastalık T lenfosit, B lenfosit ve Doğal Öldürücü (NK) lenfosit gruplarının birinde veya birkaçında görülebilir. Çalışmamızda Türkiye’nin güneyinde yer alan ağır kombine immün yetmezlikli hastalarda IL7R gen polimorfizmlerinin tanımlanması ve hastaların immünfenotip sonuçları ile birlikte değerlendirilmesi amaçlandı. Çalışmamızda ağır kombine immün yetmezlik tanısı alan 30 hastanın sanger DNA dizi analizi yöntemi ile analizi yapıldı. Hastalardan taze kan örnekleri alınarak akım sitometri yöntemi ile hastalardaki IL7R gen polimorfizmlerinin fenotiplendirilmesi yapıldı. Çalışmanın sonunda ağır kombine immün yetmezlikli hastalardan birinde (%3,3; 1/30) heterozigot p.R140Q (c.419G>A) mutasyonu tespit edilirken, hastaların 26’sında (%86,7; 26/30) de heterozigot ve/veya homozigot IL7R polimorfizmleri (T166I, I138V, T244I ve I356V) saptandı. Ağır immün yetmezlikli hastalarda IL7R gen polimorfizmlerinin sık görülmesi, bu polimorfizm ile hastalık arasında ilişki olduğu görüşünü güçlendirmiştir.

Abstract

Severe combined immunodeficiencies are a group of rare inherited disorders with profound defects in immune cells. This genetic disorder might have effect on T lymphocytes, B lymphocytes and/or Natural Killer cells (NK). This study aimed at the identifying the polymorphisms in IL7R gene present in severe combined immunodeficies patients who located in southern part of Turkey. A total of 30 patients with severe combined immunodeficiencies were investigated for IL7R polymorphisms using Sanger sequencing and immune phenotyping by flow cytometric analysis. One heterozygote p.R140Q (c.419G>A) mutation was identified in 1 patient (n=1, %3,3) and 86.7% (n=26) of all patients had IL7R polymorphisms (T166I, I138V, T244I and I356V) whether heterozygote and/or homozygote. The frequent occurence of IL7R gene polymorphisms in patients with severe immunodeficiency has strengthened the view that there is a relationship between this polymorphism and disease.

Keywords

Ağır kombine immün yetmezlik,IL7R polimorfizmleri

References

Butte, M.J., Haines, C., Bonilla, F.A., Puck, J., (2007) IL-7 reseptor deficient SCID with a unique intronic mutation and post-transplant autoimmunity due to chronic GVHD. Clin Immunol, 125(2), 159-164.
Chou, J., Ohsumi, T.K., & Geha, R.S., (2012) Use of whole exome and genome sequencing in the identification of genetic causes of primary immunodeficiencies. Curr Opin Allergy Clin Immunol, 12(6), 623-628.
Derelli, E., Bozdoğan, G., & İkincioğulları, A., (2004) Ağır kombine immün yetmezlik. Sted, 13(9):349-350.
Dincer, D., Erdem, C., (2015) Primer İmmün Yetmezlik Sendromları ve Kutanöz Bulguları. Dermatoz, 15062d1.
Felgentreff, K., Perez-Becker, R., Speckmann, C., (2011) Clinical and immunological manifestations of patients with atypical severe combined immunodeficiency. Clin Immunol, 141(1), 73-82.
Hanımeli, Ö.A., Yılmaz, Ö., & Yüksel, H. (2010) Primer immün yetmezlikli çocuğa Yaklaşım. Dicle Tıp Dergisi, 37(3), 307-313.
Kalman, L., Lindegren, M.L., Kobrynski, L., Vogt, R., Hannon, H., & Howard, J.T., (2004) Mutations in genes required for T-cell development: IL7R, CD45, IL2RG, JAK3, RAG1, ARTEMIS and ADA and severe combined immunodeficiency: HuGE review. Genet Med 2004; 6:16-26.
Özkan A., (2014) Primer immün yetmezlik hastalıkları ve hematopoetik kök hücre nakli. Arşiv Kaynak Tarama Dergisi, 23(1), 108-117.

Safaei, S., Pourpak, Z., Moin, M., & Houshmand, M., (2011) IL7R and RAG1/2 genes mutations/polymorphisms in patients SCID. Iran J Allergy Asthma Immunol, 10(2), 129-132.
Lee, P.P., Chan, T.X., & Jiang, L.P., (2011) Molecular diagnosis of severe combined immunodeficiency identification of IL2RG, JAK3, DCLRE1C, RAG1 and RGA2 mutations in a cohort of Chinese and Southeast sian children. J Clin Immunol, 31(2), 281-296.
Metzker, M.L., (2010) Sequencing Technologies-the next generation. Nature Reviews Genetics, 11(1): 31-46.
Rivers, L., Gaspar, B., (2014) Severe combined immunodeficiency: recent developments and guidance on clinical management. Archdischild, 6.
Tan, W., Yu, S., & Lei, J., (2015) A novel common gamma chain mutation in a Chinese family with X-linked severe combined immunodeficiency X-SCID; T(-) NK(-) B(+). Immunogenetics, 67(11-12), 629-639.
Uygun, Kocacık, D.F., & Hafızoglu, D., (2015) Primer immün yetmezlik hastalarımızın retrospektif değerlendirilmesi; Erzurum deneyimi. Asthma Allergy Immunol, 13, 90-93.
Wang, X.S., Wen, P.F., & Zhang, M., (2014) Interleukin-7 receptor single nucleotide polymorphism rs6897932 (C/T) and the susceptibility to systemic lupus erythematosus. Inflammation, 37(2), 615-620.
Yu, G.P., Nadeau, K.C., Berk, D.R., (2011) Genotype, phenotype and outcomes of nine patients with T-B+NK+SCID. Pediatr Transplant, 15(7), 733-741.
Yorulmaz, A., Artaç, H., Kara, R., Keleş, S., & Reiskli, İ. (2008) Primer immün yetmezlikli 1054 olgunun retrospektif değerlendirilmesi. Astım Allerji İmmünoloji, 6(3), 127-134.

Details

Primary Language

English

Subjects

-

Journal Section

Research Article

Authors

Atıl Bişgin
Çukurova Üniversitesi, Adana Genetik Hastalıklar Tanı ve Tedavi Merkezi, Adana, Türkiye
Türkiye

İbrahim Boğa This is me
Çukurova Üniversitesi, Adana Genetik Hastalıklar Tanı ve Tedavi Merkezi, Adana, Türkiye
Türkiye

Mustafa Yılmaz This is me
Çukurova Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Çocuk immünoloji ve Alerji Hastalıkları Bilim Dalı, Adana, Türkiye
Türkiye

Derya Ufuk Altıntaş
Çukurova Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Çocuk immünoloji ve Alerji Hastalıkları Bilim Dalı, Adana, Türkiye
Türkiye

Publication Date

August 31, 2018

Submission Date

November 9, 2017

Acceptance Date

December 10, 2017

Published in Issue

Year 2018 Volume: 3 Number: 2

DOI

https://doi.org/10.25279/sak.350281

IZ

https://izlik.org/JA62MX98FS

Cite

RIS / Bibtex

APA

Bişgin, A., Boğa, İ., Yılmaz, M., & Altıntaş, D. U. (2018). IL7R GEN MUTASYON VE POLİMORFİZMLARİNİN AĞIR KOMBİNE İMMUN YETMEZLİKLİ HASTALARDAKİ SIKLIĞI. Health Academy Kastamonu, 3(2), 102-114. https://doi.org/10.25279/sak.350281

AMA

1.Bişgin A, Boğa İ, Yılmaz M, Altıntaş DU. IL7R GEN MUTASYON VE POLİMORFİZMLARİNİN AĞIR KOMBİNE İMMUN YETMEZLİKLİ HASTALARDAKİ SIKLIĞI. HAK. 2018;3(2):102-114. doi:10.25279/sak.350281

Chicago

Bişgin, Atıl, İbrahim Boğa, Mustafa Yılmaz, and Derya Ufuk Altıntaş. 2018. “IL7R GEN MUTASYON VE POLİMORFİZMLARİNİN AĞIR KOMBİNE İMMUN YETMEZLİKLİ HASTALARDAKİ SIKLIĞI”. Health Academy Kastamonu 3 (2): 102-14. https://doi.org/10.25279/sak.350281.

EndNote

Bişgin A, Boğa İ, Yılmaz M, Altıntaş DU (August 1, 2018) IL7R GEN MUTASYON VE POLİMORFİZMLARİNİN AĞIR KOMBİNE İMMUN YETMEZLİKLİ HASTALARDAKİ SIKLIĞI. Health Academy Kastamonu 3 2 102–114.

IEEE

[1]A. Bişgin, İ. Boğa, M. Yılmaz, and D. U. Altıntaş, “IL7R GEN MUTASYON VE POLİMORFİZMLARİNİN AĞIR KOMBİNE İMMUN YETMEZLİKLİ HASTALARDAKİ SIKLIĞI”, HAK, vol. 3, no. 2, pp. 102–114, Aug. 2018, doi: 10.25279/sak.350281.

ISNAD

Bişgin, Atıl - Boğa, İbrahim - Yılmaz, Mustafa - Altıntaş, Derya Ufuk. “IL7R GEN MUTASYON VE POLİMORFİZMLARİNİN AĞIR KOMBİNE İMMUN YETMEZLİKLİ HASTALARDAKİ SIKLIĞI”. Health Academy Kastamonu 3/2 (August 1, 2018): 102-114. https://doi.org/10.25279/sak.350281.

JAMA

1.Bişgin A, Boğa İ, Yılmaz M, Altıntaş DU. IL7R GEN MUTASYON VE POLİMORFİZMLARİNİN AĞIR KOMBİNE İMMUN YETMEZLİKLİ HASTALARDAKİ SIKLIĞI. HAK. 2018;3:102–114.

MLA

Bişgin, Atıl, et al. “IL7R GEN MUTASYON VE POLİMORFİZMLARİNİN AĞIR KOMBİNE İMMUN YETMEZLİKLİ HASTALARDAKİ SIKLIĞI”. Health Academy Kastamonu, vol. 3, no. 2, Aug. 2018, pp. 102-14, doi:10.25279/sak.350281.

Vancouver

1.Atıl Bişgin, İbrahim Boğa, Mustafa Yılmaz, Derya Ufuk Altıntaş. IL7R GEN MUTASYON VE POLİMORFİZMLARİNİN AĞIR KOMBİNE İMMUN YETMEZLİKLİ HASTALARDAKİ SIKLIĞI. HAK. 2018 Aug. 1;3(2):102-14. doi:10.25279/sak.350281