Ak Üçgül (Trifolium repens L.) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin Belirlenmesi

Abstract

Sürdürülebilirlik ancak sahip olunan genetik kaynakların kullanımı ve korunması ile mümkün olabilmektedir. Ak üçgül (Trifolium repens L.) ülkemiz meralarında, park ve bahçe alanlarında yaygın olarak bulunan çok yıllık bir baklagil yem bitkisi olmakla birlikte önemli bir genetik hazine kaynağıdır. Bu çalışma ülkemizin yedi ilinden farklı yüksekliklerden toplanan ak üçgül populasyonlarının genetik farklılıklarının belirlenmesi amacıyla yürütülmüştür. Çalışma kapsamında toplanan on beş populasyonun genetik farklılıklarının belirlenmesinde altı adet Basit Dizi Tekrarları (SSR) markörü kullanılmıştır. Çalışma sonucunda 56 allel belirlenmiştir. Genetik akrabalıkların görülmesi amaçlı oluşturulan dendrogramda populasyonlar üç grup altında toplanmışlardır. Elde edilen sonuçlara göre, özellikle yüksek rakımlı duraklardan toplanan populasyonların çoğunlukla aynı grup içerisinde yer aldıkları görülmüştür. Bu durum toplanan örneklerdeki genetik çeşitliliğin coğrafi dağılım ilişkisini ortaya koymuştur. Sonuç olarak, ak üçgül ıslahı çalışmalarında gerekli materyali sağlama açısından ülkemizin zengin bir genetik çeşitliliğe sahip olduğu anlaşılmıştır.

Keywords

• Genetik farklılık,mikrosatelit,polimorfizm

The Determination of Genetic Diversity in White Clover (Trifolium repens L.) Populations

Abstract

Sustainability can only be achieved through the use and protection of genetic resources. White clover (Trifolium repens L.), a perennial legume forage grass, is also an important genetic resource and widely found in grasslands, parks and gardens in many regions of Turkey. This study was conducted to determine the genetic diversity of white clover populations collected from different altitudes on seven provinces of Turkey. Six Simple Sequence Repeats (SSR) molecular markers were used to estimate genetic diversity in fifteen populations collected for the study. In the study, 56 alleles were detected. Populations were gouped as three clusters in the dendogram created to see genetic relationships. According to results, especially population collected from high altitudes were mostly in the same group. This revealed the interaction between geographical distribution and genetic diversity in the collected samples. As a result, it was understood that our country has a rich genetic diversity to provide the necessary material in the white clover breeding.  

Keywords

• Genetic difference,microsatellite,polymorphism

References

1. Acar, Z., Ayan, İ., 2012. Yem Bitkileri Kültürü. Ondokuz Mayıs Üniversitesi Ziraat Fakültesi Ders Kitabı, No: 2, Samsun.
2. Açıkgöz, E., 2001. Yem Bitkileri (Yenilenmiş 3. Baskı). Uludağ Üniversitesi Vakfı Yayın No: 182, Bursa.
3. Açıkgöz, E., Hatipoğlu, R., Altınok, S., Sancak, C., Tan, A., Uraz, D., 2005. Yem bitkileri üretimi ve sorunları. Türkiye Ziraat Mühendisliği VI. Teknik Kongresi, 3-7 Ocak, Ankara, s. 503-518.
4. Finne, M.A., Rognli, O.A., Schjelderup, I., 2000. Genetic variation in a Norwegian germplasm collection of white clover (Trifolium repens L). Euphytica, 112(1): 33-44.
5. George, J., Dobrowolski, M.P., Van Zijll de Jong, E., Cogan, N.O., Smith, K.F., Forster, J.W., 2006. Assessment of genetic diversity in cultivars of white clover (Trifolium repens L.) detected by SSR polymorphisms. Genome, 49(8): 919-930.
6. Gustine, D.L., Voigt, E.C., Brummer, P.W., Papadopoulos, Y.A., 2002. Genetic variation of RAPD markers for North American white clover collections and cultivars. Crop Science, 42(2): 343-347.
7. Gündüz, H., 2013. Kuzeydoğu Anadolu Bölgesi populasyonlarından seçilen yem bezelyesi hatlarının bazı morfolojik ve tarımsal özellikleri. Yüksek Lisans Tezi, Atatürk Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Erzurum.
8. Jones, E.S., Hughes, L.J., Drayton, MC., Abberton, M.T., Michaelson-Yeates T.P.T., Bowen, C., Forster, J.W., 2003. An SSR and AFLP molecular marker-based genetic map of White clover (Trifolium repens L.). Plant Science, 165(3): 531-539.

9. Lefort, F., Lally, M., Thompson, D., Douglas, G.C., 1998. Morfolojical traits microsatellite fingerprinting and genetic relatedness of a stand of elite oaks (Q. Robur L.) at Tuallynally, Ireland. Silvae Genetica, 47(5): 5-6.
10. Mercan, L., 2010. Yerli tavuk genotiplerinin ticari genotipler ile olan genetik farklılığının SSR (Simple Sequence Repeats- Basit Dizi Tekrarları) yöntemi ile analizi. Doktora Tezi, Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Samsun.
11. Poehlman, J.M., 2013. Breeding Field Crops. Springer Science & Business Media, New York.
12. Smýkal, P., Coyne, C.J., Ambrose, M.J., Maxted, N., Schaefer, H., Blair, M.W., Berger, J., Greene, S.L., Nelson, M.N., Besharat, N., Vymyslický, T., Toker, C., Saxena, R.K., Roorkiwal, M., Pandey, M.K., Hu, J., Li, Y.H., Wang, L.X., Guo, Y., Qiu, L.J., Redden, R.J., Varshney, R.K., 2015. Legume crops phylogeny and genetic diversity for science and breeding. Critical Reviews in Plant Sciences, 34 (1-3): 43-104.
13. Toro, M.A., Fernandez, J., Caballero, A., 2009. Molecular characterization of breeds and its use in conservation. Livestock Science, 120(3): 174-195.
14. Treuren, R.V., Bas, N., Goossens, P.J., Jansen, J., Soest, L.J.M.V., 2005. Genetic diversity in perennial ryegrass and white clover among old Dutch grasslands as compared to cultivars and nature reserves. Molecular Ecology, 14(1): 39-52.
15. Zhang, X., Zhang, Y.J., Yan, R., Han, J.G., Fuzeng-Hong, F., Cao, K., 2010. Genetic variation of white clover (Trifolium repens L.) collections from China detected by morphological traits, RAPD and SSR. African Journal of Biotechnology, 9(21): 3032-3041.