Antalya ili Demre ilçesi biber yetiştiriciliğinde Tomato spotted wilt virus (TSWV) ve Cucumber mosaic virus (CMV) etmenlerinin yaygınlığının belirlenmesi
Abstract
Amaç: Bu çalışmada Antalya ili biber üreticiliğinin yoğun olarak gerçekleştirildiği Kumluca ilçesinde serada yetiştirilen biber bitkilerinde TSWV ve CMV varlığının serolojik olarak belirlenmesi ve DAS-ELISA testi sonucunda pozitif olduğuna karar verilmesinde uygulanan kriterlerin doğruluğunun RT-PCR yöntemi ile karşılaştırılması amaçlanmıştır.
Materyal ve Yöntem: Antalya ili Demre ilçesinde örtü altı biber üretim alanlarında sörveyler yapılarak virüs benzeri belirti gösteren bitkilerden örnekler toplanmıştır. Örnekler CMV ve TSWV etmenlerine spesifik monoklonal ve/veya poliklonal antibody’ler kullanılarak DAS-ELISA testine tabi tutulmuştur. ELISA okuyucuda farklı absorbans değerlerine sahip bazı pozitif örneklere etmenlere spesifik primerler kullanılarak RT-PCR testleri uygulanmıştır.
Araştırma Bulguları: DAS-ELISA yöntemi sonucuna göre toplanan 82 örnekten 65 tanesinde (%79) en az bir virüs etmenine rastlanılmıştır. Sadece CMV olan örnek sayısı 10 adet (%12) olup sadece TSWV olan örnek sayısı 47 adet (%57) olarak tespit edilmiştir. 8 örnekte (%10) hem TSWV hem de CMV’nin karışık infeksiyon yaptığı belirlenmiştir. DAS-ELISA sonucunda pozitif olduğu tespit edilen örneklerin ELISA okuyucuda farklı absorbans değerlerine sahip pozitif sonuç veren örneklerde etmenlerin varlığı RT-PCR yöntemi ile doğrulanmıştır.
Sonuç: Biber örneklerinde TSWV etmeninin daha fazla bulunduğu CMV etmeninin ise fazla yaygınlık göstermediği belirlenmiştir.
Keywords
Cucumber mosaic virus (CMV), DAS-ELISA, RT-PCR, Tomato spotted wilt virus (TSWV)
Supporting Institution
EGE BAP
Project Number
FLP-2019-21477
Thanks
FLP-2019-21477 nolu
Lisans Öğrencisi Katılımlı Araştırma Projesi
References
- Adkins, S. 2000. Tomato spotted wilt virus-positive steps towards negative success, Molecular Plant Pathology, 1(3):151-157 pp.
- Arli-Sokmen, M.A., Mennan, H., Sevik, M.A. and Ecevit, O. 2005. Occurrence of viruses in field-grown pepper crops and some of their reservoir weed hosts in Samsun, Turkey, Phytoparasitica, 33(4):347-358pp.
- Bozokalfa, M ve Eşiyok, D. 2010.Biber (Capsicum annuum L.) aksesyonlarında genetik çeşitliliğin agronomik özellikler ile belirlenmesi, Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, 47(2):123-134 s.
- Burgmans, J.L., Fry, P.R. and Sunde, R. G. 1986. Peppers: survey of virus diseases of Capsicum annuum in Hawke’s Bay and Poverty Bay, New Zealand Journal of Experimental Agriculture, 14:459-463 pp.
- Clark, M.F. and Adams, A.N. 1977. Characteristic of microplate method of Enzyme-Linked Immunosorbent Assay for detection of plant viruses. Journal of General Virology, 34:475-483 pp.
- Deligoz, I., Sokmen, M.A. and Sari, S. 2014. First report of resistance breaking strain of Tomato spotted wilt virus (Tospovirus; Bunyaviridae) on resistant sweet pepper cultivars in Turkey, New Disease Reports, 30:26 p.
- Espín, A., Alcázar, M.D., Egea, C. and Candela, M.E. 1994. Defensive response of two Capsicum annuum cultivars of different sensitivity to an isolate of Cucumber mosaic virus (CMV), Fitopatología, 29(3):178-187 pp.
- Faggioli, F., Ferretti, L., Albanese, G., Sciarroni, R., Pasquini, G., Lumia, V. and Barba, M. 2005. Distribution of olive tree viruses in Italy as revealed by one-step RT-PCR. Journal of Plant Pathology, 49-55 pp.
- Fanigliulo, A., Comes, S., Pacella, R., Crescenzi, A., Momol, M. T., Olson, S. M. and Reitz, S. 2007. Integrated management of viral diseases in field-grown tomatoes in southern Italy. In II International Symposium on Tomato Diseases 808:387-392 pp.
- FAO, 2019. Food and Agriculture Organization of the United Nations, http://faostat3.fao.org/download/Q/QC/E (Erişim Tarihi: 26.Ocak 2019)