Öz
Etik Beyan
Ethics committee approval was received for this study from the ethics committee of the Muğla Sıtkı Koçman University, Local Ethics Committee for Aquatic Animal Experiments (MSKU-SUHADYEK) (Date: 07.06.2024, No: 2024/05-4).
Teşekkür
We would like to thank the Dean's Office of the Faculty of Fisheries for permitting the use of zebrafish maintained at the Experimental Animals Unit of Muğla Sıtkı Koçman University Faculty of Fisheries. We also express our gratitude to Adnan ONAR, X-ray Technician at Meddem Hospital (Isparta), for his assistance with the X-ray imaging.
Kaynakça
- Akama, K., Ebata, K., Maeno, A., Taminato, T., Otosaka, S., Gengyo-Ando, K., Nakai, J., Yamasu, K., & Kawamura, A. (2020). Role of somite patterning in the formation of Weberian apparatus and pleural rib in zebrafish. Journal of Anatomy, 236(4), 622–629.
- Aluru, N., Deak, K. L., Jenny, M. J., & Hahn, M. E. (2013). Developmental exposure to valproic acid alters the expression of microRNAs involved in neurodevelopment in zebrafish. Neurotoxicology and Teratology, 40, 46–58.
- Arnold, M. C., Forte, J. E., Osterberg, J. S., & Di Giulio, R. T. (2016). Antioxidant rescue of selenomethionine-induced teratogenesis in zebrafish embryos. Archives of Environmental Contamination and Toxicology, 70(2), 311–320.
- Bardon, A., Vandeputte, M., Dupont-Nivet, M., Chavanne, H., Haffray, P., & Chatain, B. (2009). What is the heritable component of spinal deformities in the European sea bass (Dicentrarchus labrax)? Aquaculture, 294(3-4), 194–201.
- Barman, R. P. (1991). A taxonomic revision of the Indo-Burmese species of Danio Hamilton-Buchanan (Pisces: Cyprinidae). Records of the Zoological Survey of India. Occasional Paper, 137, 1–91.
- Bergen, D. J., Tong, Q., Shukla, A., Newham, E., Zethof, J., Lundberg, M., Ryan, R., Youlten, S. E., Frysz, M., Croucher, P. I., & Flik, G. (2022). Regenerating zebrafish scales express a subset of evolutionarily conserved genes involved in human skeletal disease. BMC Biology, 20(1), 21.
- Bird, N. C., & Mabee, P. M. (2003). Developmental morphology of the axial skeleton of the zebrafish, Danio rerio (Ostariophysi: Cyprinidae). Developmental Dynamics, 228(3), 337–357.
- Boglione, C., Mariani, L., Romanelli, M., & Cataudella, S. (1998). Some skeletal anomalies observed in wild larval pilchard (Sardina pilchardus, Walbaum, 1792) in Thyrrenian and Ionian Sea. Fresenius Environmental Bulletin, 7, 518–524.
- Boglione, C., Gisbert, E., Gavaia, P., Witten, P. E., Moren, M., Fontagné, S., & Koumoundouros, G. (2013). Skeletal anomalies in reared European fish larvae and juveniles. Part 2: main typologies, occurrences and causative factors. Reviews in Aquaculture, 5(S1), S121-S167.
- Cavender, T. M., & Coburn, M. (1992). Phylogenetic relationships of North American Cyprinidae. In R. Mayden (Ed.), Systematics, Historical Ecology and North American Freshwater Fishes (pp. 293–327). Stanford: Stanford University Press.
- Cheng, S. H., Wai, A. W. K., So, C. H., & Wu, R. S. S. (2000). Cellular and molecular basis of cadmium-induced deformities in zebrafish embryos. Environmental Toxicology and Chemistry, 19(12), 3024–3031.
- Costa, J. M., Sartori, M. M., Nascimento, N. F. D., Kadri, S. M., Ribolla, P. E., Pinhal, D., & Pezzato, L. E. (2018). Inadequate dietary phosphorus levels cause skeletal anomalies and alter osteocalcin gene expression in zebrafish. International Journal of Molecular Sciences, 19(2), 364.
- Cotti, S., Huysseune, A., Larionova, D., Koppe, W., Forlino, A., & Witten, P. E. (2022). Compression fractures and partial phenotype rescue with a low phosphorus diet in the Chihuahua zebrafish osteogenesis imperfecta model. Frontiers in Endocrinology, 13, 851879.
- Dambroise, E., Ktorza, I., Brombin, A., Abdessalem, G., Edouard, J., Luka, M., Fiedler, I., Binder, O., Pelle, O., Patton, E. E., & Busse, B. (2020). Fgfr3 is a positive regulator of osteoblast expansion and differentiation during zebrafish skull vault development. Journal of Bone and Mineral Research, 35(9), 1782–1797.
- Dauer, M. V., Currie, P. D., & Berger, J. (2018). Skeletal malformations of Meox1-deficient zebrafish resemble human Klippel–Feil syndrome. Journal of Anatomy, 233, 687–695.
- de Azevedo, A. M., Losada, A. P., Barreiro, A., Vázquez, S., & Quiroga, M. I. (2019). Skeletal anomalies in Senegalese sole (Solea senegalensis), an anosteocytic-boned flatfish species. Veterinary Pathology, 56, 307–316.
- Deschamps, M. H., Kacem, A., Ventura, R., Courty, G., Haffray, P., Meunier, F. J., & Sire, J. Y. (2008). Assessment of “discreet” vertebral abnormalities, bone mineralization and bone compactness in farmed rainbow trout. Aquaculture, 279(1–4), 11–17.
- Detrich, W. H., Westerfield, M., & Zon, L. (1999). The Zebrafish: Genetics and Genomics (Vol. 60). San Diego: Academic Press.
- Fazenda, C., Martins, G., Gavaia, P. J., Cancela, M. L., & Conceição, N. (2018). Generation of zebrafish (Danio rerio) transgenic lines overexpressing a heat-shock mediated Gla-rich protein. Journal of Applied Ichthyology, 34(2), 472–480.
- Félix, L., Correia, R., Sequeira, R., Ribeiro, C., Monteiro, S., Antunes, L., Silva, J., Venâncio, C., & Valentim, A. (2021). MS-222 and propofol sedation during and after the simulated transport of Nile tilapia (Oreochromis niloticus). Biology, 10(12), 1309.
- Ferreri, F., Nicolais, C., Boglione, C., & Bertolini, B. (2000). Skeletal characterization of wild and reared zebrafish: anomalies and meristic characters. Journal of Fish Biology, 56, 1115–1128.
- Fisher, S., & Mabee, P. M. (2004). Skeletogenesis in zebrafish Danio rerio: Evolutionary and developmental aspects. In Fish Development and Genetics: The Zebrafish and Medaka Models (pp. 392–423).
- Fjelldal, P. G., Nordgarden, U., & Hansen, T. (2007). The mineral content affects vertebral morphology in under-yearling smolt of Atlantic salmon (Salmo salar L.). Aquaculture, 270, 231–239.
- Fjelldal, P. G., Hansen, T., Breck, O., Sandvik, R., Waagbø, R., Berg, A., & Ørnsrud, R. (2009). Supplementation of dietary minerals during the early seawater phase increases vertebral strength and reduces the prevalence of vertebral deformities in fast-growing under-yearling Atlantic salmon (Salmo salar L.) smolt. Aquaculture Nutrition, 15(4), 366–378.
- Fleming, A., Keynes, R., & Tannahill, D. (2004). A central role for the notochord in vertebral patterning. Development, 131, 873–880.
- Fowler, J. A. (1970). Control of vertebral number in Teleosts: An embryological problem. Quarterly Review of Biology, 45, 148–166.
- Gao, X., Zhang, Y., Hou, L., Zhao, Y., Zhang, H., Jia, Z., Wang, S., Li, H., Pan, X., Liu, X., & Wang, L. (2023). Co-exposure to nanoplastics and acetaminophen causes skeletal dysplasia and behavioral abnormalities in zebrafish. Ecotoxicology and Environmental Safety, 253, 114640.
- Gavaia, P.J., Domingues, S., Engrola, S., Drake, P., Sarasquete, C., Dinis, M.T., & Cancela, M.L. (2009). Comparing skeletal development of wild and hatchery‐reared Senegalese sole (Solea senegalensis, Kaup 1858): evaluation in larval and postlarval stages. Aquaculture Research, 40(14), 1585–1593.
- Gistelinck, C., Witten, P. E., Huysseune, A., Symoens, S., Malfait, F., Larionova, D., Simoens, P., Dierick, M., Van Hoorebeke, L., De Paepe, A., & Kwon, R. Y. (2016). Loss of type I collagen telopeptide lysyl hydroxylation causes musculoskeletal abnormalities in a zebrafish model of Bruck syndrome. Journal of Bone and Mineral Research, 31(11), 1930–1942.
- Gomes, A., Losada García, A. P., Barreiro Lois, A., Barreiro, J. D., Ferreiro, I., Riaza, A., & Vázquez Rodríguez, S. (2017). Skeletal anomalies in reared Senegalese sole (Solea senegalensis) juveniles: A radiographic approach. Diseases of Aquatic Organisms, 124, 117–129.
- Grande, T., & Young, B. (2004). The ontogeny and homology of the Weberian apparatus in the zebrafish Danio rerio (Ostariophysi: Cypriniformes). Zoological Journal of the Linnean Society, 140, 241–254.
- Hamilton, F. (1822). An account of the fishes found in the river Ganges and its branches (Vol. 1). Edinburgh, UK: Archibald Constable. 405 pp.
- Harder, W. (1975). The anatomy of fishes. Stuttgart: E. Schweizerbart'sche Verlagsbuchhandlung.
- Hubbs, C. (1959). High incidence of vertebral deformities in two natural populations of fishes inhabiting warm springs. Ecology, 40, 154–155.
- Inohaya, K., Takano, Y., & Kudo, A. (2007). The teleost intervertebral region acts as a growth center of the centrum: In vivo visualization of osteoblasts and their progenitors in transgenic fish. Developmental Dynamics, 236, 3031–3046.
- Ju, L., Tang, K., Guo, X. R., Yang, Y., Zhu, G. Z., & Lou, Y. (2012). Effects of embryonic exposure to polychlorinated biphenyls on zebrafish skeletal development. Molecular Medicine Reports, 5(5), 1227–1231.
- Kague, E., Turci, F., Newman, E., Yang, Y., Brown, K. R., Aglan, M. S., Otaify, G. A., Temtamy, S.A., Ruiz-Perez, V. L., Cross, S., Royall, C. P., Witten, P. E., & Hammond, C. L. (2021). 3D assessment of intervertebral disc degeneration in zebrafish identifies changes in bone density that prime disc disease. Bone Research, 9(1), 39.
- Khrystoforova, I., Shochat-Carvalho, C., Harari, R., Henke, K., Woronowicz, K., Harris, M. P., & Karasik, D. (2022). Zebrafish mutants reveal unexpected role of Lrp5 in osteoclast regulation. Frontiers in Endocrinology, 13, 985304.
- Komada, N. (1982). Vertebral anomalies in the cyprinid fish Tribolodon hakonensis. Japanese Journal of Ichthyology, 29, 185–192.
- Li, X., Chen, C., He, M., Yu, L., Liu, R., Ma, C., Zhang, Y., Jia, J., Li, B., & Li, L. (2022). Lead exposure causes spinal curvature during embryonic development in zebrafish. International Journal of Molecular Sciences, 23(17), 9571.
- Lindsey, C. C., & Ali, M. Y. (1965). The effect of alternating temperature on vertebral count in the medaka (Oryzias latipes). Canadian Journal of Zoology, 43, 99–104.
- Lleras-Forero, L., Narayanan, R., Huitema, L. F. A., VanBergen, M., Apschner, A., Peterson-Maduro, J., Logister, I., Valentin, G., Morelli, L. G., Oates, A. C., & Schulte-Merker, S. (2018). Segmentation of the zebrafish axial skeleton relies on notochord sheath cells and not on the segmentation clock. eLife, 7, e33843.
- Losada, A. P., de Azevedo, A. M., Barreiro, A., Barreiro, J. D., Ferreiro, I., Riaza, A., & Quiroga Vázquez, S. (2014). Skeletal malformations in Senegalese sole (Solea senegalensis Kaup, 1858): Gross morphology and radiographic correlation. Journal of Applied Ichthyology, 30(4), 804–808.
- Marino, G., Boglione, C., Bertolini, B., Rossi, A., Ferreri, F., & Cataudella, S. (1993). Observations on development and anomalies in the appendicular skeleton of sea bass (Dicentrarchus labrax L. 1758) larvae and juveniles. Aquaculture and Fisheries Management, 24, 445–456.
- Martini, A., Huysseune, A., Witten, P. E., & Boglione, C. (2021). Plasticity of the skeleton and skeletal deformations in zebrafish (Danio rerio) linked to rearing density. Journal of Fish Biology, 98, 971–986.
- Martini, A., Sahd, L., Rücklin, M., Huysseune, A., Hall, B. K., Boglione, C., & Witten, P. E. (2023). Deformity or variation? Phenotypic diversity in the zebrafish vertebral column. Journal of Anatomy, 243(6), 960–981.
- McClure, M. (1998). Development and evolution of melanophore patterns in fishes of the genus Danio (Teleostei: Cyprinidae) (PhD dissertation). Cornell University, Ithaca.
- Mhalhel, K., Levanti, M., Abbate, F., Laurà, R., Guerrera, M. C., Aragona, M., Porcino, C., Pansera, L., Sicari, M., Cometa, M., & Briglia, M. (2023). Skeletal morphogenesis and anomalies in Gilthead seabream: A comprehensive review. International Journal of Molecular Sciences, 24(22), 16030.
- Pang, L., Zhang, Z., Shen, Y., Cheng, Z., Gao, X., Zhang, B., Wang, X., & Tian, H. (2020). Mutant dlx3b disturbs normal tooth mineralization and bone formation in zebrafish. PeerJ, 8, e8515.
- Papathanasiou, S., Walton, L. A., & Thompson, J. D. (2020). A systematic review of viewing conditions and monitor specifications in mammography. Radiography, 26(4), 325–331.
- Prakash, D., & Kotian, R. P. (2025). Mammography: Physics, principle of operation, quality control, and safety. In Fundamentals of X-ray Imaging: Basic Principles, Quality Control, Clinical Applications, and Safety (pp. 239–277). Singapore: Springer Nature.
- Preziosi, R., Gridelli, S., Borghetti, P., Diana, A., Parmeggiani, A., Fioravanti, M. L., Marcer, F., Bianchi, I., Walsh, M., & Berzins, I. (2006). Spinal deformity in a sandtiger shark (Carcharias taurus Rafinesque): A clinical–pathological study. Journal of Fish Diseases, 29(1), 49–60.
- Printzi, A., Fragkoulis, S., Dimitriadi, A., Keklikoglou, K., Arvanitidis, C., Witten, P. E., & Koumoundouros, G. (2021). Exercise-induced lordosis in zebrafish (Danio rerio). Journal of Fish Biology, 98, 987–994.
- Pu, S. Y., Hamid, N., Ren, Y. W., & Pei, D. S. (2020). Effects of phthalate acid esters on zebrafish larvae: Development and skeletal morphogenesis. Chemosphere, 246, 125808.
- Riera-Heredia, N., Vélez, E. J., Gutiérrez, J., Navarro, I., & Capilla, E. (2019). Gene expression analyses in malformed skeletal structures of gilthead seabream (Sparus aurata). Journal of Fish Diseases, 42(8), 1169–1180.
- Rosenthal, H., & Alderdice, D. F. (1976). Sublethal effects of environmental stressors, natural and pollutional, on marine fish eggs and larvae. Journal of the Fisheries Research Board of Canada, 33, 2047–2065.
- Sfakianakis, D. G., Leris, I., Laggis, A., & Kentouri, M. (2011). The effect of rearing temperature on body shape and meristic characters in zebrafish (Danio rerio) juveniles. Environmental Biology of Fishes, 92, 197–205.
- Shkil, F., Siomava, N., Voronezhskaya, E., & Diogo, R. (2019). Effects of hyperthyroidism on the development of the appendicular skeleton and muscles of zebrafish, with notes on evolutionary developmental pathology (Evo-Devo-Path). Scientific Reports, 9, 5413.
- Sun, X., Zhou, Y., Zhang, R., Wang, Z., Xu, M., Zhang, D., Huang, J., Luo, F., Li, F., Ni, Z., & Zhou, S. (2020). Dstyk mutation leads to congenital scoliosis-like vertebral malformations in zebrafish via dysregulated mTORC1/TFEB pathway. Nature Communications, 11, 479.
- Tåning, A. V. (1952). Experimental study of meristic characters in fishes. Biological Reviews of the Cambridge Philosophical Society, 27, 169–193.
- Tubbs, R. S., Shoja, M. M., & Loukas, M. (2016). Bergman's comprehensive encyclopedia of human anatomic variation. Hoboken, NJ: John Wiley & Sons.
- Valcarce, D. G., Vuelta, E., Robles, V., & Herráez, M. P. (2017). Paternal exposure to environmental 17α-ethinylestradiol concentrations modifies testicular transcription, affecting the sperm transcript content and the offspring performance in zebrafish. Aquatic Toxicology, 193, 18–29.
- Vasamsetti, B. M. K., Kim, N. S., Chon, K., & Park, H. H. (2020). Teratogenic and developmental toxic effects of etridiazole on zebrafish (Danio rerio) embryos. Applied Biological Chemistry, 63(1), 80.
- Verraes, W. (1981). Theoretical discussion on some functional-morphological terms and some general reflections on explanations in biology. Acta Biotheoretica, 30, 255–273.
- Witten, P. E., & Hall, B. K. (2003). Seasonal changes in the lower jaw skeleton in male Atlantic salmon (Salmo salar L.): Remodelling and regression of the kype after spawning. Journal of Anatomy, 203, 435–450.
- Witten, P. E., & Huysseune, A. (2009). A comparative view on mechanisms and functions of skeletal remodelling in teleost fish, with special emphasis on osteoclasts and their function. Biological Reviews, 84(2), 315–346.
- Witten, P. E., Obach, A., Huysseune, A., & Baeverfjord, G. (2006). Vertebrae fusion in Atlantic salmon (Salmo salar): Development, aggravation and pathways of containment. Aquaculture, 258(1–4), 164–172.
- Witten, P. E., Gil-Martens, L., Huysseune, A., Takle, H., & Hjelde, K. (2009). Towards a classification and an understanding of developmental relationships of vertebral body malformations in Atlantic salmon (Salmo salar L.). Aquaculture, 295(1–2), 6–14.
- Witten, P. E., Fjelldal, P. G., Huysseune, A., McGurk, C., Obach, A., & Owen, M. A. G. (2019). Bone without minerals and its secondary mineralization in Atlantic salmon (Salmo salar): The recovery from phosphorus deficiency. Journal of Experimental Biology, 222, jeb188763.
- Xiong, S., Wu, J., Jing, J., Huang, P., Li, Z., Mei, J., & Gui, J. F. (2017). Loss of stat3 function leads to spine malformation and immune disorder in zebrafish. Science Bulletin, 62(3), 185–196.
- Yossa, R., Sarker, P. K., Mock, D. M., & Vandenberg, G. W. (2014). Dietary biotin requirement for growth of juvenile zebrafish (Danio rerio). Aquaculture Research, 45(11), 1787–1797.
- Zhang, X., Zhang, P., Perez-Rodriguez, V., Souders, C. L. II, & Martyniuk, C. J. (2020). Assessing the toxicity of the benzamide fungicide zoxamide in zebrafish (Danio rerio): Towards an adverse outcome pathway for beta-tubulin inhibitors. Environmental Toxicology and Pharmacology, 78, 103405.
- Zoupa, M., & Machera, K. (2017). Zebrafish as an alternative vertebrate model for investigating developmental toxicity: The triadimefon example. International Journal of Molecular Sciences, 18(4), 817.
Morphological Analysis of Axial Skeleton Deformities in Zebrafish Using Mammography Conducted in Türkiye
Öz
The zebrafish (Danio rerio) is a key model organism for vertebrate development, yet a detailed radiographic classification of its common skeletal deformities is lacking. High-resolution radiographs of 100 zebrafish from a controlled population were acquired using a clinical digital mammography unit to characterize vertebral and costal abnormalities. Deformities were detected in 23 specimens. Analysis identified three predominant types: (1) kyphosis-lordosis (3 specimens; 31.1–32.2 mm), presenting with spinal curve angles of 120°–160°; (2) vertebral fusion (8 specimens; 22.5–32.0 mm), characterized by centra coalescence in caudal and abdominal regions; and (3) abdominal rib anomalies (12 specimens; 22.5–39.3 mm), including misalignment, twisting, and shortening. This study provides a detailed morphological classification of common skeletal aberrations in zebrafish, establishing a radiographic reference for future research in developmental biology.
Anahtar Kelimeler
Danio rerio Vertebral fusion Developmental biology Mammography Axial skeletal deformities
Etik Beyan
Ethics committee approval was received for this study from the ethics committee of the Muğla Sıtkı Koçman University, Local Ethics Committee for Aquatic Animal Experiments (MSKU-SUHADYEK) (Date: 07.06.2024, No: 2024/05-4).
Teşekkür
We would like to thank the Dean's Office of the Faculty of Fisheries for permitting the use of zebrafish maintained at the Experimental Animals Unit of Muğla Sıtkı Koçman University Faculty of Fisheries. We also express our gratitude to Adnan ONAR, X-ray Technician at Meddem Hospital (Isparta), for his assistance with the X-ray imaging.
Kaynakça
- Akama, K., Ebata, K., Maeno, A., Taminato, T., Otosaka, S., Gengyo-Ando, K., Nakai, J., Yamasu, K., & Kawamura, A. (2020). Role of somite patterning in the formation of Weberian apparatus and pleural rib in zebrafish. Journal of Anatomy, 236(4), 622–629.
- Aluru, N., Deak, K. L., Jenny, M. J., & Hahn, M. E. (2013). Developmental exposure to valproic acid alters the expression of microRNAs involved in neurodevelopment in zebrafish. Neurotoxicology and Teratology, 40, 46–58.
- Arnold, M. C., Forte, J. E., Osterberg, J. S., & Di Giulio, R. T. (2016). Antioxidant rescue of selenomethionine-induced teratogenesis in zebrafish embryos. Archives of Environmental Contamination and Toxicology, 70(2), 311–320.
- Bardon, A., Vandeputte, M., Dupont-Nivet, M., Chavanne, H., Haffray, P., & Chatain, B. (2009). What is the heritable component of spinal deformities in the European sea bass (Dicentrarchus labrax)? Aquaculture, 294(3-4), 194–201.
- Barman, R. P. (1991). A taxonomic revision of the Indo-Burmese species of Danio Hamilton-Buchanan (Pisces: Cyprinidae). Records of the Zoological Survey of India. Occasional Paper, 137, 1–91.
- Bergen, D. J., Tong, Q., Shukla, A., Newham, E., Zethof, J., Lundberg, M., Ryan, R., Youlten, S. E., Frysz, M., Croucher, P. I., & Flik, G. (2022). Regenerating zebrafish scales express a subset of evolutionarily conserved genes involved in human skeletal disease. BMC Biology, 20(1), 21.
- Bird, N. C., & Mabee, P. M. (2003). Developmental morphology of the axial skeleton of the zebrafish, Danio rerio (Ostariophysi: Cyprinidae). Developmental Dynamics, 228(3), 337–357.
- Boglione, C., Mariani, L., Romanelli, M., & Cataudella, S. (1998). Some skeletal anomalies observed in wild larval pilchard (Sardina pilchardus, Walbaum, 1792) in Thyrrenian and Ionian Sea. Fresenius Environmental Bulletin, 7, 518–524.
- Boglione, C., Gisbert, E., Gavaia, P., Witten, P. E., Moren, M., Fontagné, S., & Koumoundouros, G. (2013). Skeletal anomalies in reared European fish larvae and juveniles. Part 2: main typologies, occurrences and causative factors. Reviews in Aquaculture, 5(S1), S121-S167.
- Cavender, T. M., & Coburn, M. (1992). Phylogenetic relationships of North American Cyprinidae. In R. Mayden (Ed.), Systematics, Historical Ecology and North American Freshwater Fishes (pp. 293–327). Stanford: Stanford University Press.
- Cheng, S. H., Wai, A. W. K., So, C. H., & Wu, R. S. S. (2000). Cellular and molecular basis of cadmium-induced deformities in zebrafish embryos. Environmental Toxicology and Chemistry, 19(12), 3024–3031.
- Costa, J. M., Sartori, M. M., Nascimento, N. F. D., Kadri, S. M., Ribolla, P. E., Pinhal, D., & Pezzato, L. E. (2018). Inadequate dietary phosphorus levels cause skeletal anomalies and alter osteocalcin gene expression in zebrafish. International Journal of Molecular Sciences, 19(2), 364.
- Cotti, S., Huysseune, A., Larionova, D., Koppe, W., Forlino, A., & Witten, P. E. (2022). Compression fractures and partial phenotype rescue with a low phosphorus diet in the Chihuahua zebrafish osteogenesis imperfecta model. Frontiers in Endocrinology, 13, 851879.
- Dambroise, E., Ktorza, I., Brombin, A., Abdessalem, G., Edouard, J., Luka, M., Fiedler, I., Binder, O., Pelle, O., Patton, E. E., & Busse, B. (2020). Fgfr3 is a positive regulator of osteoblast expansion and differentiation during zebrafish skull vault development. Journal of Bone and Mineral Research, 35(9), 1782–1797.
- Dauer, M. V., Currie, P. D., & Berger, J. (2018). Skeletal malformations of Meox1-deficient zebrafish resemble human Klippel–Feil syndrome. Journal of Anatomy, 233, 687–695.
- de Azevedo, A. M., Losada, A. P., Barreiro, A., Vázquez, S., & Quiroga, M. I. (2019). Skeletal anomalies in Senegalese sole (Solea senegalensis), an anosteocytic-boned flatfish species. Veterinary Pathology, 56, 307–316.
- Deschamps, M. H., Kacem, A., Ventura, R., Courty, G., Haffray, P., Meunier, F. J., & Sire, J. Y. (2008). Assessment of “discreet” vertebral abnormalities, bone mineralization and bone compactness in farmed rainbow trout. Aquaculture, 279(1–4), 11–17.
- Detrich, W. H., Westerfield, M., & Zon, L. (1999). The Zebrafish: Genetics and Genomics (Vol. 60). San Diego: Academic Press.
- Fazenda, C., Martins, G., Gavaia, P. J., Cancela, M. L., & Conceição, N. (2018). Generation of zebrafish (Danio rerio) transgenic lines overexpressing a heat-shock mediated Gla-rich protein. Journal of Applied Ichthyology, 34(2), 472–480.
- Félix, L., Correia, R., Sequeira, R., Ribeiro, C., Monteiro, S., Antunes, L., Silva, J., Venâncio, C., & Valentim, A. (2021). MS-222 and propofol sedation during and after the simulated transport of Nile tilapia (Oreochromis niloticus). Biology, 10(12), 1309.
- Ferreri, F., Nicolais, C., Boglione, C., & Bertolini, B. (2000). Skeletal characterization of wild and reared zebrafish: anomalies and meristic characters. Journal of Fish Biology, 56, 1115–1128.
- Fisher, S., & Mabee, P. M. (2004). Skeletogenesis in zebrafish Danio rerio: Evolutionary and developmental aspects. In Fish Development and Genetics: The Zebrafish and Medaka Models (pp. 392–423).
- Fjelldal, P. G., Nordgarden, U., & Hansen, T. (2007). The mineral content affects vertebral morphology in under-yearling smolt of Atlantic salmon (Salmo salar L.). Aquaculture, 270, 231–239.
- Fjelldal, P. G., Hansen, T., Breck, O., Sandvik, R., Waagbø, R., Berg, A., & Ørnsrud, R. (2009). Supplementation of dietary minerals during the early seawater phase increases vertebral strength and reduces the prevalence of vertebral deformities in fast-growing under-yearling Atlantic salmon (Salmo salar L.) smolt. Aquaculture Nutrition, 15(4), 366–378.
- Fleming, A., Keynes, R., & Tannahill, D. (2004). A central role for the notochord in vertebral patterning. Development, 131, 873–880.
- Fowler, J. A. (1970). Control of vertebral number in Teleosts: An embryological problem. Quarterly Review of Biology, 45, 148–166.
- Gao, X., Zhang, Y., Hou, L., Zhao, Y., Zhang, H., Jia, Z., Wang, S., Li, H., Pan, X., Liu, X., & Wang, L. (2023). Co-exposure to nanoplastics and acetaminophen causes skeletal dysplasia and behavioral abnormalities in zebrafish. Ecotoxicology and Environmental Safety, 253, 114640.
- Gavaia, P.J., Domingues, S., Engrola, S., Drake, P., Sarasquete, C., Dinis, M.T., & Cancela, M.L. (2009). Comparing skeletal development of wild and hatchery‐reared Senegalese sole (Solea senegalensis, Kaup 1858): evaluation in larval and postlarval stages. Aquaculture Research, 40(14), 1585–1593.
- Gistelinck, C., Witten, P. E., Huysseune, A., Symoens, S., Malfait, F., Larionova, D., Simoens, P., Dierick, M., Van Hoorebeke, L., De Paepe, A., & Kwon, R. Y. (2016). Loss of type I collagen telopeptide lysyl hydroxylation causes musculoskeletal abnormalities in a zebrafish model of Bruck syndrome. Journal of Bone and Mineral Research, 31(11), 1930–1942.
- Gomes, A., Losada García, A. P., Barreiro Lois, A., Barreiro, J. D., Ferreiro, I., Riaza, A., & Vázquez Rodríguez, S. (2017). Skeletal anomalies in reared Senegalese sole (Solea senegalensis) juveniles: A radiographic approach. Diseases of Aquatic Organisms, 124, 117–129.
- Grande, T., & Young, B. (2004). The ontogeny and homology of the Weberian apparatus in the zebrafish Danio rerio (Ostariophysi: Cypriniformes). Zoological Journal of the Linnean Society, 140, 241–254.
- Hamilton, F. (1822). An account of the fishes found in the river Ganges and its branches (Vol. 1). Edinburgh, UK: Archibald Constable. 405 pp.
- Harder, W. (1975). The anatomy of fishes. Stuttgart: E. Schweizerbart'sche Verlagsbuchhandlung.
- Hubbs, C. (1959). High incidence of vertebral deformities in two natural populations of fishes inhabiting warm springs. Ecology, 40, 154–155.
- Inohaya, K., Takano, Y., & Kudo, A. (2007). The teleost intervertebral region acts as a growth center of the centrum: In vivo visualization of osteoblasts and their progenitors in transgenic fish. Developmental Dynamics, 236, 3031–3046.
- Ju, L., Tang, K., Guo, X. R., Yang, Y., Zhu, G. Z., & Lou, Y. (2012). Effects of embryonic exposure to polychlorinated biphenyls on zebrafish skeletal development. Molecular Medicine Reports, 5(5), 1227–1231.
- Kague, E., Turci, F., Newman, E., Yang, Y., Brown, K. R., Aglan, M. S., Otaify, G. A., Temtamy, S.A., Ruiz-Perez, V. L., Cross, S., Royall, C. P., Witten, P. E., & Hammond, C. L. (2021). 3D assessment of intervertebral disc degeneration in zebrafish identifies changes in bone density that prime disc disease. Bone Research, 9(1), 39.
- Khrystoforova, I., Shochat-Carvalho, C., Harari, R., Henke, K., Woronowicz, K., Harris, M. P., & Karasik, D. (2022). Zebrafish mutants reveal unexpected role of Lrp5 in osteoclast regulation. Frontiers in Endocrinology, 13, 985304.
- Komada, N. (1982). Vertebral anomalies in the cyprinid fish Tribolodon hakonensis. Japanese Journal of Ichthyology, 29, 185–192.
- Li, X., Chen, C., He, M., Yu, L., Liu, R., Ma, C., Zhang, Y., Jia, J., Li, B., & Li, L. (2022). Lead exposure causes spinal curvature during embryonic development in zebrafish. International Journal of Molecular Sciences, 23(17), 9571.
- Lindsey, C. C., & Ali, M. Y. (1965). The effect of alternating temperature on vertebral count in the medaka (Oryzias latipes). Canadian Journal of Zoology, 43, 99–104.
- Lleras-Forero, L., Narayanan, R., Huitema, L. F. A., VanBergen, M., Apschner, A., Peterson-Maduro, J., Logister, I., Valentin, G., Morelli, L. G., Oates, A. C., & Schulte-Merker, S. (2018). Segmentation of the zebrafish axial skeleton relies on notochord sheath cells and not on the segmentation clock. eLife, 7, e33843.
- Losada, A. P., de Azevedo, A. M., Barreiro, A., Barreiro, J. D., Ferreiro, I., Riaza, A., & Quiroga Vázquez, S. (2014). Skeletal malformations in Senegalese sole (Solea senegalensis Kaup, 1858): Gross morphology and radiographic correlation. Journal of Applied Ichthyology, 30(4), 804–808.
- Marino, G., Boglione, C., Bertolini, B., Rossi, A., Ferreri, F., & Cataudella, S. (1993). Observations on development and anomalies in the appendicular skeleton of sea bass (Dicentrarchus labrax L. 1758) larvae and juveniles. Aquaculture and Fisheries Management, 24, 445–456.
- Martini, A., Huysseune, A., Witten, P. E., & Boglione, C. (2021). Plasticity of the skeleton and skeletal deformations in zebrafish (Danio rerio) linked to rearing density. Journal of Fish Biology, 98, 971–986.
- Martini, A., Sahd, L., Rücklin, M., Huysseune, A., Hall, B. K., Boglione, C., & Witten, P. E. (2023). Deformity or variation? Phenotypic diversity in the zebrafish vertebral column. Journal of Anatomy, 243(6), 960–981.
- McClure, M. (1998). Development and evolution of melanophore patterns in fishes of the genus Danio (Teleostei: Cyprinidae) (PhD dissertation). Cornell University, Ithaca.
- Mhalhel, K., Levanti, M., Abbate, F., Laurà, R., Guerrera, M. C., Aragona, M., Porcino, C., Pansera, L., Sicari, M., Cometa, M., & Briglia, M. (2023). Skeletal morphogenesis and anomalies in Gilthead seabream: A comprehensive review. International Journal of Molecular Sciences, 24(22), 16030.
- Pang, L., Zhang, Z., Shen, Y., Cheng, Z., Gao, X., Zhang, B., Wang, X., & Tian, H. (2020). Mutant dlx3b disturbs normal tooth mineralization and bone formation in zebrafish. PeerJ, 8, e8515.
- Papathanasiou, S., Walton, L. A., & Thompson, J. D. (2020). A systematic review of viewing conditions and monitor specifications in mammography. Radiography, 26(4), 325–331.
- Prakash, D., & Kotian, R. P. (2025). Mammography: Physics, principle of operation, quality control, and safety. In Fundamentals of X-ray Imaging: Basic Principles, Quality Control, Clinical Applications, and Safety (pp. 239–277). Singapore: Springer Nature.
- Preziosi, R., Gridelli, S., Borghetti, P., Diana, A., Parmeggiani, A., Fioravanti, M. L., Marcer, F., Bianchi, I., Walsh, M., & Berzins, I. (2006). Spinal deformity in a sandtiger shark (Carcharias taurus Rafinesque): A clinical–pathological study. Journal of Fish Diseases, 29(1), 49–60.
- Printzi, A., Fragkoulis, S., Dimitriadi, A., Keklikoglou, K., Arvanitidis, C., Witten, P. E., & Koumoundouros, G. (2021). Exercise-induced lordosis in zebrafish (Danio rerio). Journal of Fish Biology, 98, 987–994.
- Pu, S. Y., Hamid, N., Ren, Y. W., & Pei, D. S. (2020). Effects of phthalate acid esters on zebrafish larvae: Development and skeletal morphogenesis. Chemosphere, 246, 125808.
- Riera-Heredia, N., Vélez, E. J., Gutiérrez, J., Navarro, I., & Capilla, E. (2019). Gene expression analyses in malformed skeletal structures of gilthead seabream (Sparus aurata). Journal of Fish Diseases, 42(8), 1169–1180.
- Rosenthal, H., & Alderdice, D. F. (1976). Sublethal effects of environmental stressors, natural and pollutional, on marine fish eggs and larvae. Journal of the Fisheries Research Board of Canada, 33, 2047–2065.
- Sfakianakis, D. G., Leris, I., Laggis, A., & Kentouri, M. (2011). The effect of rearing temperature on body shape and meristic characters in zebrafish (Danio rerio) juveniles. Environmental Biology of Fishes, 92, 197–205.
- Shkil, F., Siomava, N., Voronezhskaya, E., & Diogo, R. (2019). Effects of hyperthyroidism on the development of the appendicular skeleton and muscles of zebrafish, with notes on evolutionary developmental pathology (Evo-Devo-Path). Scientific Reports, 9, 5413.
- Sun, X., Zhou, Y., Zhang, R., Wang, Z., Xu, M., Zhang, D., Huang, J., Luo, F., Li, F., Ni, Z., & Zhou, S. (2020). Dstyk mutation leads to congenital scoliosis-like vertebral malformations in zebrafish via dysregulated mTORC1/TFEB pathway. Nature Communications, 11, 479.
- Tåning, A. V. (1952). Experimental study of meristic characters in fishes. Biological Reviews of the Cambridge Philosophical Society, 27, 169–193.
- Tubbs, R. S., Shoja, M. M., & Loukas, M. (2016). Bergman's comprehensive encyclopedia of human anatomic variation. Hoboken, NJ: John Wiley & Sons.
- Valcarce, D. G., Vuelta, E., Robles, V., & Herráez, M. P. (2017). Paternal exposure to environmental 17α-ethinylestradiol concentrations modifies testicular transcription, affecting the sperm transcript content and the offspring performance in zebrafish. Aquatic Toxicology, 193, 18–29.
- Vasamsetti, B. M. K., Kim, N. S., Chon, K., & Park, H. H. (2020). Teratogenic and developmental toxic effects of etridiazole on zebrafish (Danio rerio) embryos. Applied Biological Chemistry, 63(1), 80.
- Verraes, W. (1981). Theoretical discussion on some functional-morphological terms and some general reflections on explanations in biology. Acta Biotheoretica, 30, 255–273.
- Witten, P. E., & Hall, B. K. (2003). Seasonal changes in the lower jaw skeleton in male Atlantic salmon (Salmo salar L.): Remodelling and regression of the kype after spawning. Journal of Anatomy, 203, 435–450.
- Witten, P. E., & Huysseune, A. (2009). A comparative view on mechanisms and functions of skeletal remodelling in teleost fish, with special emphasis on osteoclasts and their function. Biological Reviews, 84(2), 315–346.
- Witten, P. E., Obach, A., Huysseune, A., & Baeverfjord, G. (2006). Vertebrae fusion in Atlantic salmon (Salmo salar): Development, aggravation and pathways of containment. Aquaculture, 258(1–4), 164–172.
- Witten, P. E., Gil-Martens, L., Huysseune, A., Takle, H., & Hjelde, K. (2009). Towards a classification and an understanding of developmental relationships of vertebral body malformations in Atlantic salmon (Salmo salar L.). Aquaculture, 295(1–2), 6–14.
- Witten, P. E., Fjelldal, P. G., Huysseune, A., McGurk, C., Obach, A., & Owen, M. A. G. (2019). Bone without minerals and its secondary mineralization in Atlantic salmon (Salmo salar): The recovery from phosphorus deficiency. Journal of Experimental Biology, 222, jeb188763.
- Xiong, S., Wu, J., Jing, J., Huang, P., Li, Z., Mei, J., & Gui, J. F. (2017). Loss of stat3 function leads to spine malformation and immune disorder in zebrafish. Science Bulletin, 62(3), 185–196.
- Yossa, R., Sarker, P. K., Mock, D. M., & Vandenberg, G. W. (2014). Dietary biotin requirement for growth of juvenile zebrafish (Danio rerio). Aquaculture Research, 45(11), 1787–1797.
- Zhang, X., Zhang, P., Perez-Rodriguez, V., Souders, C. L. II, & Martyniuk, C. J. (2020). Assessing the toxicity of the benzamide fungicide zoxamide in zebrafish (Danio rerio): Towards an adverse outcome pathway for beta-tubulin inhibitors. Environmental Toxicology and Pharmacology, 78, 103405.
- Zoupa, M., & Machera, K. (2017). Zebrafish as an alternative vertebrate model for investigating developmental toxicity: The triadimefon example. International Journal of Molecular Sciences, 18(4), 817.
Ayrıntılar
| Birincil Dil | İngilizce |
|---|---|
| Konular | Hidrobiyoloji |
| Bölüm | Araştırma Makalesi |
| Yazarlar | |
| Gönderilme Tarihi | 12 Kasım 2025 |
| Kabul Tarihi | 12 Aralık 2025 |
| Yayımlanma Tarihi | 3 Mart 2026 |
| DOI | https://doi.org/10.22392/actaquatr.1822166 |
| IZ | https://izlik.org/JA22YJ59BL |
| Yayımlandığı Sayı | Yıl 2026 Sayı: 2 |
Amaç ve Kapsam
AMAÇ:
Acta Aquatica Turcica, limnoloji, balıkçılık yönetimi, ekoloji, genetik, biyoloji, su ürünleri yetiştiriciliği, hastalık, sosyo-ekonomi ve su ürünleri işleme teknolojileri konularında yazılmış makalelere yayınlamayı amaçlamaktadır.
Dergide İngilizce olarak hazırlanmış araştırma makalesi, olgu sunumu, kısa makale ve derleme formatlarında makaleler yayımlamaktadır.
DUYURU: 1 Ocak 2025 tarihinden itibaren sadece İngilizce dilinde gönderilen çalışmalar kabul edilecektir.
KAPSAM:
Acta Aquatica Turcica, aşağıdaki konu başlıklarını
kapsamaktadır.
- Su Ürünleri Yetiştiriciliği/Sağlığı/Beslenme/Genetiği
- Limnoloji
- Balıkçılık
Biyolojisi/Balıkçılık Yönetimi
- Balık-Omurgasız Biyolojisi/Taksonomisi
- Nehirağzı ve Denizel Çevre/Biyolojisi
- Su Kirliliği/Koruma/Sürdürülebilirlik
- Su Ürünleri İşleme Teknolojileri/Mikrobiyoloji/Biyokimyası
- Su Ürünleri Sosyo-Ekonomisi
- Su Ürünleri Avcılığı ve Teknolojisihttps://apastyle.apa.org/instructional-aids/reference-examples.pdf
Yazım Kuralları
Makale Yükleme Aşamasında Gerekli Belgeler
1. Başlık sayfası
2. Makalenin yazar isimsiz tam metni
3. Benzerlik raporu (Maks. %25) (İmkan dahilinde) (PDF formatında, raporun tamamı)
4. Telif Hakkı Devir Formu
5. Etik Kurul İzin Belgesi (Etik Kurul İzni gerekmiyorsa gerekçesini bildiren açıklama dosyası)
Örnek başlık sayfası: English
Örnek makale: English
SAYFA BOYUTU
Sayfa A4 (21 cm x 29,7 cm) formatında olmalıdır.
KENAR BOŞLUKLARI
| Üst: 2,5 cm | Sol: 2,5 cm | Alt: 2,5 cm | Sağ: 2,5 cm | Cilt payı: 0 cm |
Yazı karakteri : Times New Roman
Yazı karakteri büyüklüğü : 12 punto
Paragraf : İki yana yaslı
Paragraf girintisi : 1,25 cm
Satır aralığı : 2
Satır numarası : Metnin tümünde satır numarası atanmalıdır
Sayfa numarası : Sayfaların altına gelecek şekilde otomatik numaralanmış
BAŞLIK SAYFASI
Başlık sayfası, makale dosyasından ayrı olarak sisteme yüklenmelidir. Başlık sayfasında sadece aşağıdaki bilgiler yer almalıdır.
- Başlık
Başlık kısa, bilgilendirici ve çalışmayı net olarak yansıtmalıdır. Kısaltma ve formül kullanımı önerilmez.
- Kısa başlık
Başlığı yansıtacak şekilde maksimum 75 karakterde kısa bir başlık verilmelidir.
- Yazarlar
Yazarların ad ve soyadları kısaltılmadan açık olarak yazılmalıdır. Makale yüklenmeden önce yazar isimlerinin doğruluğu kontrol edilmelidir.
- Kurum bilgisi
Kullanılan düzen: Üniversite/Enstitü, Fakülte, Bölüm, İl-ÜLKE
Örnek: Isparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi, Eğirdir Su Ürünleri Fakültesi, Su Ürünleri Yetiştiriciliği Bölümü, Isparta-Türkiye
- Sorumlu yazar
Makalenin tüm aşamalarından sorumlu olacak sorumlu yazar belirtilmelidir. Başlık sayfasında sorumlu yazarın iletişim bilgileri ve posta adresi verilmelidir.
*Sorumlu Yazar: Adı Soyadı, e-posta: …
- ORCID bilgileri
Tüm yazarların ORCID bilgileri belirtilmelidir. Lütfen ORCID tanımlaması yapmak için https://orcid.org adresini ziyaret ediniz.
MAKALE FORMATI
Araştırma makalesi, kısa makale, olgu sunumu ve derlemeler aşağıdaki formata uygun olarak hazırlanmalıdır.
ÖZET
Özet, çalışmanın amacını, kullanılan metotları, öne çıkan bulguları ve literatüre katkısını öz bir şekilde içermelidir. İngilizce dillerinde maksimum 300 kelime olacak şekilde yazılmalıdır.
ANAHTAR KELİMELER
Anahtar kelimeler başlıkta yer almayan, çalışmayı yansıtacak kelimelerden seçilmelidir. En az 3 (üç), en çok 5 (beş) kelime belirtilmeli; kelimeler aralarında virgül (,) son kelimeden sonra ise nokta (.) gelmelidir.
Anahtar kelimeler: CITES, akuaponik, üretim protokolü, mortalite, immünoloji.
ONDALIK GÖSTERİM
İngilizce makalelerde “.” (nokta) olmalıdır.
İngilizce: 10.25%
LATİNCE GÖSTERİM
Tür ismi, metinde ilk geçtiği yerde kısaltılmadan (Cyprinus carpio), sonrasında ise cinsi ismi kısaltılarak (C. carpio) verilmelidir.
TABLOLAR
Tablo başlığı, tablonun üstüne gelecek şekilde kısa ve öz olmalıdır. Tabloda yer alan kısaltmalar tablonun altında açıklanmalıdır. Tablo özel bir tasarım uygulanmamış, düz kılavuz şeklinde olmalıdır. İhtiyaç bulunması halinde tablo içi metinde yazı karakteri büyüklüğü 10 puntoya kadar düşürülebilir. Tablolara metin içinde Tablo 1, Tablo 2, … şeklinde atıf yapılmalıdır. Tablolar, alıntılandıkları yere en yakın yerde verilmelidir.
Tablolar düzenlenebilir olmalıdır. Ekran görüntüsü veya resim formatındaki tablolar kabul edilmemektedir.
ŞEKİLLER
Şekil başlığı, şeklin altına ortalanmış olarak kısa ve öz olmalıdır. Şekiller minimum 300 DPI çözünürlükte olmalıdır. Şekillere metin içinde Şekil 1, Şekil 2, … şeklinde atıf yapılmalıdır. Şekiller, alıntılandıkları yere en yakın yerde verilmelidir.
TEŞEKKÜR
Bu bölümde finansal destek dışında çalışmanın yürütülmesine katkı sunanlar belirtilir.
Örnek: Yazarlar çalışmanın laboratuvar bölümünde yardım eden Ahmet Taş’a (Isparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi, Türkiye) teşekkür etmektedir.
FİNANS
Bu bölümde çalışmanın yürütülmesine finansal destek sağlayan kurumlar destek numarası kullanılarak belirtilir.
Örnek-1: Bu çalışma 3241-E2-14 proje numarası ile Isparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinasyon Birimi tarafından desteklenmiştir.
Örnek-2: Bu çalışmanın yürütülmesinde herhangi bir finans desteği alınmamıştır.
ÇIKAR ÇATIŞMASI BEYANI
Bu bölümde yazarların varsa çıkar çatışmaları belirtilir.
Örnek: Yazarlar, bu çalışmayı etkileyebilecek finansal çıkarlar veya kişisel ilişkiler olmadığını beyan eder.
YAZAR KATKILARI
Bu bölümde isim ve soy ismin ilk harfleri kullanılarak yazarların çalışmanın ilgili aşamalarına yaptıkları katkılar belirtilir.
Örnek:
Kurgu: BT; Metodoloji: CT, FU; Deneyin gerçekleştirilmesi: FM, CT, FU; Veri analizi: FU, TA; Makale yazımı: CT, FU, Denetleme: CT. Tüm yazarlar nihai taslağı onaylamıştır.
ETİK ONAY BEYANI
Bu bölümde çalışmanın yürütülmesinde alınan etik kurul onayının alındığı kurum, tarih ve numarası belirtilir. Omurgalı hayvanlarla yürütülen çalışmalarda Yerel Etik Kurul Onayı, anket/mülakat çalışmalarında ise Girişimsel Olmayan Araştırmalar Etik Kurulu Onayı gerektirdiği halde beyan edilmeyen makaleler bilimsel değerlendirmeye alınmamaktadır.
Örnek-1: Bu çalışmada deney hayvanları kullanılmaması nedeniyle Yerel Etik Kurul Onayı alınmamıştır.
Örnek-2: Bu çalışma Isparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi Hayvan Deneyleri Yerel Etik Kurul onayı ile yürütülmüştür (Tarih: 01.07.2010, No: 21438139-147).
VERİ KULLANILABİLİRLİK BEYANI
Bu bölümde makalede kullanılan verilerin anonim kullanılabilirliğine ilişkin beyanda bulunulmalıdır. Acta Aquatica Turcica dergisi, yazarları araştırma verilerini paylaşmaya teşvik etmektedir.
Örnek-1: Bu çalışmada kullanılan veriler Figshare platformunda https://doi.org/10.6084/m9.figshare.11815566.v1 DOI adresi ile erişime açıktır.
Örnek-2: Bu çalışmada kullanılan verilere ilgili yazardan talep üzerine erişilebilir. Veriler, gizlilik veya etik kısıtlamalar nedeniyle kamuya açık değildir.
Örnek-3: Bu çalışmada kullanılan veriler makul talep üzerine ilgili yazardan temin edilebilir.
Örnek-4: Bu çalışmada yeni veri oluşturulmadığı veya analiz edilmediği için veri paylaşımı bu makale için geçerli değildir.
Örnek-5: Araştırma verileri paylaşılmaz.
Örnek-6: Bu çalışmada kullanılan veriler bu makalenin ekinde mevcuttur.
ATIFLAR
Atıflar yıl sırasına göre ve aralarında noktalı virgül (;) olacak şekilde aşağıdaki formatlarda yazılır:
- Tek yazar:
a) Parantez içinde alıntı: (Yazar, yıl)
Ölçülen değer kabul edilebilir sınırlar içerisindedir (Küçük, 2008; Güçlü, 2018a; Güçlü, 2018b).
b) Anlatı alıntı: Yazar (yıl)
Küçük (2008)’e göre ölçülen değer kabul edilebilir sınırlar içindedir.
- İki yazar:
a) Parantez içinde alıntı: (Yazar-1 & Yazar-2, yıl)
Çözünmüş oksijen konsantrasyonu dikkate alınması gereken parametreler arasında yer almaktadır (Küçük & Güçlü, 2001; Ekici & Koca, 2021a; Ekici & Koca, 2021b).
b)Anlatı alıntı: Yazar-1 ve Yazar-2 (yıl)
Ekici ve Koca (2021b)’a göre çözünmüş oksijen konsantrasyonu dikkate alınması gereken parametreler arasında yer almaktadır.
- Üç ve daha çok yazar:
a) Parantez içinde alıntı: (Yazar vd., yıl)
Bu olgu dönemsel olarak tekrarlanabilmektedir (Yiğit vd., 2006a; Yiğit vd., 2006b; Boyacı vd., 2020)
b)Anlatı alıntı: Yazar vd. (yıl)
Boyacı vd. (2020)’e göre bu olgu dönemsel olarak tekrarlanabilmektedir.
KAYNAKLAR
Kaynaklar APA 7. versiyona göre yazılmalıdır (LİNK). Tüm yazarların isimleri verilmelidir, ancak 10. yazardan sonra “vd.” kısaltması da kabul edilmektedir. Özel kullanımlar hariç olmak üzere tüm eser türlerinde eser isminin sadece ilk harfi büyük, eserin yayınlandığı veya sunulduğu dergi, yayınevi, kongre isimlerinde geçen tüm kelimeler büyük harfle başlanarak yazılmalıdır.
1-Makale
Dergi ismi kısaltılmadan (italik), cilt (italik), sayı, sayfa numaraları ve aktif link içerecek şekilde DOI numarasına yer verilmelidir:
Petrauskienė, L., Utevska, O., & Utevsky, S. (2009). Can different species of medicinal leeches (Hirudo spp.) interbreed? Invertebrate Biology, 128(4), 324-331. https://doi.org/10.1111/j.1744-7410.2009.00180.x
Wagenaar, D. A., Hamilton, M. S., Huang, T., Kristan, W. B., & French, K. A. (2010). A hormone-activated central pattern generator for courtship. Current Biology, 20(6), 487-495. https://doi.org/10.1016/j.cub.2010.02.027
2-Kitap
Kitap başlığı italik olacak şekilde ve yayın kuruluş ismi olacak şekilde verilmelidir.
Nesemann, H., & Neubert, E. (1999). Annelida, Clitellata: Branchiobdellida, Acanthobdellea, Hirudinea. Spektrum Akademischer Verlag.
Sawyer, R. T. (1986). Leech biology and behavior. Oxford University Press.
3-Kitap bölümü
Bölüm başlığı normal, kitap başlığı italik olacak şekilde, editör(ler), bölümün sayfa numaraları, yayıncı kuruluş ve varsa aktif link içerek şekilde DOI numarasına yer verilmelidir:
Le Couteur, D., Kendig, H., Naganathan, V., & McLachlan, A. (2010). The ethics of prescribing medications to older people. In S. Koch, F. M. Gloth, & R. Nay (Eds.), Medication management in older adults (pp. 29-42). Springer. https://doi.org/10.1007/978-1-60327-457-9_3
McCormack, B., McCance, T., & Maben, J. (2013). Outcome evaluation in the development of person-centred practice. In B. McCormack, K. Manley, & A. Titchen (Eds.), Practice development in nursing and healthcare (pp. 190-211). John Wiley & Sons.
4-Web sitesi
Sayfa başlığı italik, websitesinin ismi ve sayfanın aktif linki olacak şekilde verilmelidir.
Wikipedia. (2021). Toxicology. https://en.wikipedia.org/wiki/Toxicology
5- Tezler
Tez başlığı italik olacak şekilde, tez türü (Doktora, Yüksek lisans, Tıpta Uzmanlık) ve üniversite ismi belirtilmelidir.
Filik, N. (2020). Kültür balıklarından izole edilen Aeromonas hydrophila suşlarında fenolik bileşenlerin çevreyi algılama sistemi üzerine inhibisyon etkisi ve suşlar arasındaki klonal ilişkinin pulsed fıeld jel elektroforez yöntemiyle belirlenmesi [Doktora tezi, Isparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi].
Özdal, A. M. (2019). Effects on growth and coloration of red pepper suplementation as pigment sources to diets of jewel cichlid (Hemichromis guttatus) [Yüksek lisans tezi, Isparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi].
6- Konferans, sempozyum sunumları
Etkinlik tarihi, sunu başlığı (italik), sunum türü (Sözlü sunum, Poster sunum), etkinlik adı, şehir ve ülke verilmelidir.
Snoswell, C. (2016, Ekim 31 - Kasım 3). Models of care for store-and-forward teledermatology in Australia [Poster sunum]. 7th International Conference on Successes and Failures in Telehealth, Auckland, Yeni Zelanda.
7- Raporlar
Rapor başlığı, rapor numarası, kurum adı ve varsa erişim linki verilmelidir.
Chiswell, S. & Grant, B. (2019). New Zealand coastal sea surface temperature (Report No. CR388). Ministry for the Environment. https://environment.govt.nz/publications/new-zealand-coastal-sea-surface-temperature/
Fletcher Building Limited. (2019). Annual report 2019. https://fletcherbuilding.com/assets/4-investor-centre/annual-reports/2019-annual-report.pdf
NOT: Dergi yazım kurallarına uygun olarak hazırlanmayan makaleler değerlendirmeye alınmamaktadır.
Etik İlkeler ve Yayın Politikası
- Dergide su ürünleri alanında yapılmış orijinal araştırmalar, olgu sunumu, kısa araştırma ve derleme nitelikli eserler yayınlanır.
- Dergide yayınlanacak eserin daha önce hiçbir yayın organında yayınlanmamış ya da yayın hakkının verilmemiş olması gerekir. Eserin tüm sorumluluğu yazarlara aittir. Dergi editörü eserlerin teknik içerik ve baskı hatalarından sorumlu değildir. Basılmış olan eserlere telif ücreti ödenmez.
- Eserler bildirilmiş olan yazım kurallarına uyularak İngilizce dilinde yazılmalıdır. Yazım kurallarına uygun hazırlanmayıp sunulan makalelere, 1 defa yazım kurallarını düzeltmesi için uyarı verilir. 2. bir düzeltme hakkı verilmez ve makale "yazım kurallarından "RET" edilir.
- Yazarlar, makaleyi dergiye sunarken "Telif Hakları Bildirim Formu" nu doldurarak sisteme yüklemek zorundadır.
- Editör sürecine dahil edilen makale, alan editörü tarafından hakemleme sürecinden önce bilimsel içerik yönünden değerlendirilip "Ret" / "Kabul" edilebilir. Alan editörü tarafından "Kabul" edilen makaleler ise, incelenmek üzere konu uzmanı en az iki hakemin görüşüne sunulur. Hakem görüşlerinde ayrılık durumunda nihai karar için bir başka hakemin görüşüne ya da alan editörüne başvurulur. Yayınlanmak üzere gönderilen makalelerin dergide yayınlanabilmesi için Yayın Kurulunca bilimsel içerik ve şekil bakımından uygun görülmesi ve hakemler tarafından kabul edilmesi gerekir.
- Gönderilen makaleler, hakemleme sürecine girdikten sonra geri çekilemez ve dergi editör kurulunun izni olmadan başka bir dergiye sunulamaz. Yayının tüm hakları, "Acta Aquatica Turcica" ya aittir.
HAYVAN DENEYLERİ YEREL ETİK KURUL ONAYI
15 Şubat 2014 ve 28914 sayılı Resmi Gazetede yayınlanan Hayvan Deneyleri Etik Kurullarının Çalışma Usul Ve Esaslarına Dair Yönetmeliğe (Link: https://www.resmigazete.gov.tr/eskiler/2014/02/20140215-6.htm) göre "Deney hayvanları" üzerinde yapılacak tüm prosedürlerin Hayvan Deneyleri Yerel Etik Kurulu tarafından onaylanmış olması zorunludur.
GİRİŞİMSEL OLMAYAN ARAŞTIRMALAR İÇİN ETİK KURULU ONAYI
AYRICA:
- Dergilerde yayımlanacak makalelerde etik kurul izini ve/veya yasal/özel izin alınmasının gerekip gerekmediği makalede belirtilmiş olmalıdır. Eğer bu izinlerin alınması gerekli ise, izinin hangi kurumdan, hangi tarihte ve hangi karar veya sayı numarası ile alındığı açıkça sunulmalıdır. Çalışma insan ve hayvan deneklerinin kullanımını gerektiriyor ise çalışmanın uluslararası deklerasyon, kılavuz vb. uygun gerçekleştirildiği beyan edilmelidir.
Ücret Politikası
Acta Aquatica Turcica makale yükleme, değerlendirme ve basım süreçlerinde yazarlardan herhangi bir ücret talep etmemektedir.
Dizinler
Atıf Dizinleri
Diğer Dizinler
Dergi Kurulları
Isparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi Eğirdir Su Ürünleri Fakültesi Adına Sahibi
Baş Editör
Dergi Yönetim Kurulu
Mizanpaj Editörleri
Section Editors
Prof. Dr. Ercüment Genç, Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Su Ürünleri Mühendisliği Bölümü’nde tam zamanlı profesör olarak görev yapmaktadır. 1995 yılından bu yana sorumlu su ürünleri yetiştiriciliği alanında aktif olarak çalışmakta olup, sürdürülebilir üretim sistemleri ve türlere özgü hastalık yönetimi konularında uzmanlaşmıştır.
2014 yılı Aralık ayından bu yana, Sucul Genetik Kaynakların Tescili Ulusal Komitesi'nde üye olarak görev almakta ve sucul biyoçeşitlilik ile genetik koruma konularında uzman görüş sunmaktadır. Ayrıca Tarım ve Gıda Etiği Derneği üyesi olup, Ankara Ziraat Mühendisleri Odası’na da kayıtlıdır.
Başlıca araştırma alanları arasında balık ve karides yetiştiriciliği, immün uyarıcı kullanımı, fonksiyonel beslenme, karaciğer ve bağırsak histopatolojisi, ve su ürünlerinde biyo-güvenlik uygulamaları yer almaktadır. Ayrıca, biyoyumak (biofloc) teknolojisinin, yoğun yetiştiricilikte besin geri dönüşümü ve su kalitesinin sürdürülebilir yönetimi açısından uygulanabilirliğine yönelik kapsamlı çalışmalar yürütmüştür.
ORCID ID: 0000-0001-7474-2208
Laith A. Jawad obtained a degree (M.Sc.) in fish taxonomy from the Zoology Department, University of Bristol, the UK in 1980. He continued as a fish taxonomist at Basrah University, Iraq, where he worked for more than 20 years before he immigrated to New Zealand in 1997. During this time, he started the biochemical taxonomy of fishes of Iraq and published over 595 scientific papers and book reviews in leading scientific journals. He is the author and co-author of several textbooks in biology published in Arabic. In 2016, he contributed five chapters to a book about coastal fishes,” Coastal fishes, habitat, behaviour and conservation”, published by Nova Publishers, Canada. He served as fish biodiversity and consultant at the Ministry of Agriculture and Fisheries in Oman for the period 2008-2012 during which he co-authored two papers describing two new fish species to science from the Omani waters and reported over 90 fish species as a new record to the Omani waters. He wrote a book about the dangerous fishes of the eastern and southern Arabian Peninsula that has been published by Springer, Germany. He authored a guide to the fishes of the southern coasts of Oman, which was published by the Ministry of Agriculture and Fisheries, Muscat, Oman in 2018. He also published over 100 papers on the fish fauna of Oman, Iraq, Kuwait, and Saudi Arabia. In 2013, he broadens his scientific contact and started to collaborate with over 50 scientists from over 40 countries around the world in research dealing with different aspects of fish taxonomy and ichthyology. Recently, he edited the three books for Springer in Germany and Switzerland and published in 2021 by Springer. These are: (1) The Arabian seas: Biodiversity, Environment Challenges and Conservation Measures; (2) Tigris and Euphrates Rivers: their environment from headwaters to mouth; and (3) Southern Iraq’s Marshes: their environment and conservation.
Lisans eğitimini Karadeniz Teknik Üniversitesi Sürmene Deniz Bilimleri Fakültesi Balıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Programı’nda, yüksek lisansını ise Balıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Anabilim Dalı’nda, Doktora eğitimini Ege Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Su Ürünleri Yetiştiriciliği Anabilim Dalı’nda tamamlamıştır. 1996 yılında Asistan, 2002 yılında Yardımcı Doçent, 2011 yılında Doçent ve 2016 yılında Profesör unvanlarını almıştır. Halen Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi Su Ürünleri Fakültesi Su Ürünleri Yetiştiriciliği Bölümü, Yetiştiricilik ABD’da öğretim üyesi olarak görev yapmaktadır. Uzmanlık alanları arasında su ürünleri yetiştiriciliği, balık besleme, yem teknolojisi, alternatif yem hammaddeleri, organik balık yetiştiriciliği ve su ürünleri ekonomisi gibi konular yer almaktadır.
Editorial Board
Ege Üniversitesi Su Ürünleri Fakültesi'nde Lisans ve Lisansüstü eğitimini 1984 -1995 yılları arasında tamamladı. Avlama Teknolojisi Anabilim Dalında görevli. 1999 yılında 5 aylık JICA bursu ile Japonya'da ve 2012 yılında 3 aylık YÖK bursu ile University of Florida'da misafir araştırıcı olarak bulundu. Yapay resif teknolojileri, avcılık teknolojisi ve son on yıldır akustik telemetri ile balık hareketlerinin izlenmesi konusunda çalışmalar yürütüyor.
Laith A. Jawad obtained a degree (M.Sc.) in fish taxonomy from the Zoology Department, University of Bristol, the UK in 1980. He continued as a fish taxonomist at Basrah University, Iraq, where he worked for more than 20 years before he immigrated to New Zealand in 1997. During this time, he started the biochemical taxonomy of fishes of Iraq and published over 595 scientific papers and book reviews in leading scientific journals. He is the author and co-author of several textbooks in biology published in Arabic. In 2016, he contributed five chapters to a book about coastal fishes,” Coastal fishes, habitat, behaviour and conservation”, published by Nova Publishers, Canada. He served as fish biodiversity and consultant at the Ministry of Agriculture and Fisheries in Oman for the period 2008-2012 during which he co-authored two papers describing two new fish species to science from the Omani waters and reported over 90 fish species as a new record to the Omani waters. He wrote a book about the dangerous fishes of the eastern and southern Arabian Peninsula that has been published by Springer, Germany. He authored a guide to the fishes of the southern coasts of Oman, which was published by the Ministry of Agriculture and Fisheries, Muscat, Oman in 2018. He also published over 100 papers on the fish fauna of Oman, Iraq, Kuwait, and Saudi Arabia. In 2013, he broadens his scientific contact and started to collaborate with over 50 scientists from over 40 countries around the world in research dealing with different aspects of fish taxonomy and ichthyology. Recently, he edited the three books for Springer in Germany and Switzerland and published in 2021 by Springer. These are: (1) The Arabian seas: Biodiversity, Environment Challenges and Conservation Measures; (2) Tigris and Euphrates Rivers: their environment from headwaters to mouth; and (3) Southern Iraq’s Marshes: their environment and conservation.
