Y-kromozomu 17 STR markırının Türkiye’deki polimorfizmi
Öz
AMAÇ: Adli araştırmalarda, erkek ve kadın DNA örnekleri genellikle karışım halde bulunurlar. Bu tür örneklerin tiplendirilmesinde Y-STR kullanılmaktadır. Bu çalışmanın amacı Türkiye populasyonuna ait homojen dağılımın gösteren bir Y-STR haplotip veri tabanını oluşturmak ve diğer dünya popülasyonlarında önceden yapılmış Y-STR sonuçlarıyla karşılaştırmaktır. YÖNTEM: Kan veya ağız içi sürüntü örnekleri 218 sağlıklı, aralarında akrabalık ilişkisi bulunmayan ve çalışmaya gönüllü katılmayı kabul eden Türkiye’deki erkek bireylerden alınmıştır. 17 Y-STR lokuslarının haplotip ve alel sıkılıkları AmpFlSTR® Yfiler™ PCR Amplification Kiti kullanılarak çoğaltıldı ve ABI 3130 cihazında analiz edildi. Gen ve haplotip alel sıklıkları Arlequin Software 3.01 kullanılarak hesaplandı. Moleküler varyans analiz AMOVA sonuçları YHRD çevrimiçi araçları kullanılarak RST şeklinde değerlendirildi. BULGULAR: Türkiye popülasyonunda 218 örnekte aynı haplotipe rastlanmadı. En yüksek gen çeşitliliği DYS385 a /b lokusunda görülürken ve en düşük DYS391 lokusunda gözlendi. Çalışılan popülasyona en yakın popülasyonlar sırasıyla Güneydoğu Anadolu, Kıbrıslı Türkler ve Çukurova popülasyonları oldu. SONUÇ: Bu çalışma, adli uygulamalarda kullanılan yüksek ayrım gücüne sahip ve 17 Y-STR lokusunun Türk popülasyonuna ait son verilerini içermektedir.
Anahtar Kelimeler
Kaynakça
- Aras B, Polat RK. Turkey and the Middle East: frontiers of the new geographic imagination. Australian Journal of Inter- national Affairs 2007; 61 4 :471-88.
- Kaya I. Social Theory and Later Modernities: The Turkish Experience. Liverpool University Press. 2004;57-8.
- Underhill PA, Kivisild T. Use of Y chromosome and mito- chondrial DNA population structure in tracing human migra- tions. Annu Rev Genet 2007;41:539-64.
- Roewer L, Kayser M, de Knijff P, Anslinger K, Betz A, Caglià A, Corach D, Füredi S, Henke L, Hidding M et al. A new method for the evaluation of matches in non-recombining genomes: application to Y-chromosomal short tandem repeat STR hap- lotypes in European males. Forensic Sci Int 2000;114:31-43.
- Roewer L, Krawczak M, Willuweit S, Nagy M, Alves C, Amor- im A, Anslinger K, Augustin C, Betz A, Bosch E et al. Online ref- erence database of European Y-chromosomal short tandem repeat STR haplotypes. Forensic Sci Int 2001;118:103-11.
- Walsh PS, Metzger DA, Higuchi R. Chelex 100 as a medium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from fo- rensic material. Biotechniques 1991;10 4 :506-13.
- Gusmão L, Butler JM, Carracedo A, Gill P, Kayser M, Mayr WR, Morling N, Prinz M, Roewer L, Tyler-Smith C et al. DNA Commission of the International Society of Forensic Genet- ics ISFG : an update of the recommendations on the use of Y-STRs in forensic analysis. Forensic Sci Int 2006;157:187-97.
- Nei M. Molecular Evolutionary Genetics, Columbia Univer- sity Press, New York,1987;176-9.
Ayrıntılar
Birincil Dil
Türkçe
Konular
Adli Biyoloji
Bölüm
Araştırma Makalesi
Yazarlar
Gönül Filoğlu
Bu kişi benim
Havva Altuncul
Bu kişi benim
Özlem Bülbül
Bu kişi benim
Elif Mertoğlu
Bu kişi benim
Tolga Zorlu
Bu kişi benim
Gülten Rayimoğlu
Bu kişi benim
Cengiz Salih
Bu kişi benim
Yayımlanma Tarihi
31 Aralık 2016
Gönderilme Tarihi
1 Ocak 2016
Kabul Tarihi
15 Ocak 2016
Yayımlandığı Sayı
Yıl 2016 Cilt: 30 Sayı: 3
