Araştırma Makalesi
BibTex RIS Kaynak Göster

A Comparative Study of 3D Culture Methods in Lung Cancer Research: Finding the Optimal Path for Spheroid Formation

Yıl 2026, Cilt: 12 Sayı: 2026, - , 13.03.2026
https://doi.org/10.53394/akd.1593500
https://izlik.org/JA58ER36BF

Öz

ABSTRACT
Objective: Cancer, characterized by uncontrolled cell proliferation and invasion into surrounding tissues, is a leading cause of global mortality. Traditional two-dimensional (2D) cell culture systems fail to adequately replicate the tumor microenvironment (TME). In contrast, three-dimensional (3D) culture systems, which better simulate cell–cell and cell–extracellular matrix (ECM) interactions, have become powerful tools in biomedical research. This study aims to compare the spheroid formation capacity of A549 lung cancer cells using three different 3D culture methods: ultra-low attachment (ULA) plates, agarose hydrogel, and the hanging drop technique. The primary objective is to identify the most effective spheroid formation method for A549 cells and to provide findings that can guide future biomedical research, particularly in cancer modeling, drug screening studies, and investigations of the tumor microenvironment.
Materials and Methods: A549 cells were cultured using three different 3D culture methods: ultra-low attachment plates, agarose hydrogel, and the hanging drop method. In the ultra-low attachment method, spheroid formation was observed at cell densities of 5,000, 10,000, and 30,000 cells/ml. In the agarose hydrogel method, agarose concentrations of 1%, 1.5%, and 2% were used to evaluate cell aggregation and spheroid stability. In the hanging drop method, cells aggregated under the influence of gravity. Spheroid diameter and area were analyzed using ImageJ software.
Results: In this study, the spheroid formation capacity of A549 lung cancer cells was evaluated using three different three-dimensional (3D) culture methods. The ultra-low attachment (ULA) plate method allowed cell aggregation; however, the resulting structures were not large or compact enough to be classified as spheroids. The hanging drop method showed that cells formed small clusters by day 3 but failed to develop a compact and stable spheroid structure by day 7. The agarose hydrogel method, particularly at a 2% agarose concentration, demonstrated the highest spheroid formation capacity compared to the other methods. In this method, spheroid formation began at 72 hours depending on cell density, with significant growth observed at a density of 30,000 cells/ml (p < 0.0001). Trypan Blue staining results indicated that 2% agarose and cell densities of 10,000–30,000 cells/ml provided the highest cell viability. Specifically, 4,800 viable cells were counted at a density of 30,000 cells/ml, while 3,600 viable cells were observed at 10,000 cells/ml. These findings suggest that the agarose hydrogel method, especially at 2% agarose concentration and higher cell densities, offers optimal spheroid formation and cell viability for A549 lung cancer cells.
Conclusion: This study demonstrated that the agarose hydrogel method effectively promoted stable and organized spheroid formation in A549 lung cancer cells. Notably, the 2% agarose concentration was identified as the most effective condition for maintaining cell viability and optimizing spheroid size. In contrast, the ultra-low attachment (ULA) plate and hanging drop methods exhibited limited spheroid formation capacity, resulting in less compact and disorganized structures. These findings emphasize the critical role of three-dimensional (3D) cell culture methods in biomedical research, particularly for experimental tumor modeling and drug screening studies. In this context, the agarose hydrogel method, with its high spheroid formation capacity and ability to support cell viability, emerges as a promising 3D culture model that warrants further exploration in cancer research.

Kaynakça

  • 1. Brown TJ, Reiss KA, O'Hara MH. Advancements in systemic therapy for pancreatic cancer. Am Soc Clin Oncol Educ Book 2023; 43:e397082.
  • 2. Dela Cruz CS, Tanoue LT, Matthay RA. Lung cancer: epidemiology, etiology, and prevention. Clin Chest Med 2011; 32(4):605-44.
  • 3. Giard DJ, Aaronson SA, Todaro GJ, Arnstein P, Kersey JH, Dosik H, Parks WP. In vitro cultivation of human tumors: establishment of cell lines derived from a series of solid tumors. J Natl Cancer Inst 1973; 51(5):1417-23.
  • 4. Nazari M. Use of cell lines in cancer research. Cell Biol Rev 2020; 9(1):45-50.
  • 5. Dominiak A, Chełstowska B, Olejarz W, Nowicka G. Communication in the cancer microenvironment as a target for therapeutic interventions. Cancers 2020; 12(5):1232.
  • 6. Hoang T, Landi MT. Molecular pathogenesis of lung cancer. Lung Cancer 2022; 165:23-35.
  • 7. Bennati C, Paglialunga L, Ricciuti B, Metro G, Marcomigni L, Gili A, Crinò L. Targeting EGFR and ALK in NSCLC: current evidence and future perspective. Lung Cancer Manag 2016; 5(2):79-90.
  • 8. Atat OE, Farzaneh Z, Pourhamzeh M, Taki F, Abi-Habib R, Vosough M, El-Sibai M. 3D modeling in cancer studies. Hum Cell 2022; 35(1):23-36.
  • 9. Poornima K, Francis AP, Hoda M, Eladl MA, Subramanian S, Veeraraghavan VP, Rajagopalan R. Implications of three-dimensional cell culture in cancer therapeutic research. Front Oncol 2022; 12:891673.
  • 10. Duval K, Grover H, Han LH, Mou Y, Pegoraro AF, Fredberg J, Chen Z. Modeling physiological events in 2D vs. 3D cell culture. Physiology 2017; 32(4):266-77.
  • 11. Jubelin C, Muñoz-Garcia J, Griscom L, Cochonneau D, Ollivier E, Heymann MF, Vallette FM, Oliver L, Heymann D. Three-dimensional in vitro culture models in oncology research. Cell Biosci 2022; 12(1):155.
  • 12. Pinto M, Alves PM, Cardoso C. 3D models for studying cancer and drug resistance. Cancer Cell Int 2020; 20(1):123-34.
  • 13. Yun C, Kim SH, Kim KM, Yang MH, Byun MR, Kim JH, Jung YS. Advantages of using 3D spheroid culture systems in toxicological and pharmacological assessment for osteogenesis research. Int J Mol Sci 2024; 25(5):2512.
  • 14. El Harane S, Zidi B, El Harane N, Krause KH, Matthes T, Preynat-Seauve O. Cancer spheroids and organoids as novel tools for research and therapy: state of the art and challenges to guide precision medicine. Cells 2023; 12(7):1001.
  • 15. Abuwatfa WH, Pitt WG, Husseini GA. Scaffold-based 3D cell culture models in cancer research. J Biomed Sci 2024; 31(7):1-12.
  • 16. Dutta D, Heo I, Clevers H. Organoids: an in vitro model for cancer research. Cell 2017; 173(6):1310-25.
  • 17. Chehelgerdi M, Behdarvand Dehkordi F, Chehelgerdi M, Kabiri H, Salehian-Dehkordi H, Abdolvand M, Ranjbarnejad T. Exploring the promising potential of induced pluripotent stem cells in cancer research and therapy. Mol Cancer 2023; 22(1):189.
  • 18. Thakur G, Bok EY, Kim SB, Jo CH, Oh SJ, Baek JC, Rho GJ. Scaffold-free 3D culturing enhances pluripotency, immunomodulatory factors, and differentiation potential of Wharton’s jelly-mesenchymal stem cells. Eur J Cell Biol 2022; 101(3):151245.
  • 19. Kim W, Gwon Y, Park S, Kim H, Kim J. Therapeutic strategies of three-dimensional stem cell spheroids and organoids for tissue repair and regeneration. Bioact Mater 2023; 19:50-74.
  • 20. Demirel G, Koltuk G. The importance of 3D cell culture in drug discovery and development. Front Life Sci Relat Technol 2024; 5(3):224-30.
  • 21. Nazari SS. Generation of 3D tumor spheroids with encapsulating basement membranes for invasion studies. Curr Protoc Cell Biol 2020; 87(1):e105.
  • 22. Ivascu A, Kubbies M. Rapid generation of single-tumor spheroids for high-throughput cell function and toxicity analysis. J Biomol Screen 2006; 11(8):922-32.
  • 23. Saleh F, Harb A, Soudani N, Zaraket H. A three-dimensional A549 cell culture model to study respiratory syncytial virus infections. J Infect Public Health 2020; 13(8):1142-7.
  • 24. Horning JL, Sahoo SK, Vijayaraghavalu S, Dimitrijevic S, Vasir JK, Jain TK, Labhasetwar V. 3-D tumor model for in vitro evaluation of anticancer drugs. Mol Pharm 2008; 5(5):849-62.
  • 25. Lee JM, Dedhar S, Kalluri R, Thompson EW. The epithelial–mesenchymal transition: new insights in signaling, development, and disease. J Cell Biol 2006; 172(7):973-81.
  • 26. Kelm JM, Timmins NE, Brown CJ, Fussenegger M, Nielsen LK. Method for generation of homogeneous multicellular tumor spheroids applicable to a wide variety of cell types. Biotechnol Bioeng 2003; 83(2):173-80.
  • 27. Fennema E, Rivron N, Rouwkema J, van Blitterswijk C, De Boer J. Spheroid culture as a tool for creating 3D complex tissues. Trends Biotechnol 2013; 31(2):108-15.
  • 28. Froehlich K, Haeger JD, Heger J, Pastuschek J, Photini SM, Yan Y, Schmidt A. Generation of multicellular breast cancer tumor spheroids: comparison of different protocols. J Mammary Gland Biol Neoplasia 2016; 21:89-98.
  • 29. Vitacolonna M, Bruch R, Agaci A, Nuernberg E, Cesetti T, Keller F, Rudolf R. A multiparametric analysis reveals differential behavior of spheroid cultures on distinct ultra-low attachment plate types. Front Bioeng Biotechnol 2024; 12: 1422235.
  • 30. Langhans SA. Three-dimensional in vitro cell culture models in drug discovery and drug repositioning. Front Pharmacol 2018; 9:6.
  • 31. Nath S, Devi GR. Three-dimensional culture systems in cancer research: Focus on tumor spheroid model. Pharmacol Ther 2016; 163:94-108.
  • 32. Park K, Nam Y, Choi Y. An agarose gel-based neurosphere culture system leads to enrichment of neuronal lineage cells in vitro. In Vitro Cell Dev Biol Anim 2015; 51:455-62.
  • 33. Tanaka N, Moriguchi H, Sato A, Kawai T, Shimba K, Jimbo Y, Tanaka Y. Microcasting with agarose gel via degassed polydimethylsiloxane molds for repellency-guided cell patterning. RSC Adv 2016; 6(60):54754-62.
  • 34. Wang X, June RK, Pierce DM. A 3-D constitutive model for finite element analyses of agarose with a range of gel concentrations. J Mech Behav Biomed Mater 2021; 114:104150.
  • 35. López-Marcial GR, Zeng AY, Osuna C, Dennis J, García JM, O’Connell GD. Agarose-based hydrogels as suitable bioprinting materials for tissue engineering. ACS Biomater Sci Eng 2018; 4(10):3610-16.
  • 36. Ma R, Mandell J, Lu F, Heim T, Schoedel K, Duensing A, Weiss KR. Do patient-derived spheroid culture models have relevance in chondrosarcoma research? Clin Orthop Relat Res 2021; 479(3):477-90.
  • 37. Nath S, Devi GR. Three-dimensional culture systems in cancer research: Focus on tumor spheroid model. Pharmacol Ther 2016; 163:94-108.
  • 38. Bray F, Laversanne M, Sung H, Ferlay J, Siegel RL, Soerjomataram I, Jemal A. Global cancer statistics 2022: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer J Clin 2024; 74(3):229-63.
  • 39. Tomasetti C, Vogelstein B. Variation in cancer risk among tissues can be explained by the number of stem cell divisions. Science 2015; 347(6217):78-81.
  • 40. Fang Y, Eglen RM. Three-dimensional cell cultures in drug discovery and development. SLAS Discov 2017; 22(5):456-72.
  • 41. Tevis KM, Colson YL, Grinstaff MW. Embedded spheroids as models of the cancer microenvironment. Adv Biosyst 2017; 1(10):1700083.
  • 42. Edmondson R, Broglie JJ, Adcock AF, Yang L. Three-dimensional cell culture systems and their applications in drug discovery and cell-based biosensors. Assay Drug Dev Technol 2014; 12(4):207-18.
  • 43. Friedrich J, Seidel C, Ebner R, Kunz-Schughart LA. Spheroid-based drug screen: considerations and practical approach. Nat Protoc 2009; 4(3):309-24.
  • 44. Vinci M, Gowan S, Boxall F, Patterson L, Zimmermann M, Court W, Eccles SA. Advances in establishment and analysis of three-dimensional tumor spheroid-based functional assays for target validation and drug evaluation. BMC Biol 2012; 10:1-21.
  • 45. Timmins NE, Nielsen LK. Generation of multicellular tumor spheroids by the hanging-drop method. Tissue Eng 2007; 141-51.
  • 46. Long L, Huang G, Zhu H, Guo Y, Liu Y, Huo J. Down-regulation of miR-138 promotes colorectal cancer metastasis via directly targeting TWIST2. J Transl Med 2013; 11:1-10.
  • 47.Quarta A, Gallo N, Vergara D, Salvatore L, Nobile C, Ragusa A, Gaballo A. Investigation on the composition of agarose–collagen I blended hydrogels as matrices for the growth of spheroids from breast cancer cell lines. Pharmaceutics. 2021;13(7):963.

Akciğer Kanseri Araştırmalarında 3 Boyutlu Kültür Yöntemlerinin Karşılaştırmalı İncelemesi: Sferoid Oluşumu için En Uygun Yöntemin Belirlenmesi

Yıl 2026, Cilt: 12 Sayı: 2026, - , 13.03.2026
https://doi.org/10.53394/akd.1593500
https://izlik.org/JA58ER36BF

Öz

Amaç: Kanser, kontrolsüz hücre proliferasyonu ve çevre dokulara invazyon ile karakterize edilen, küresel ölçekte önemli bir mortalite nedenidir. Geleneksel iki boyutlu (2B) hücre kültürü sistemleri, tümör mikroçevresini (tumor microenvironment, TME) yeterince taklit edemezken, üç boyutlu (3B) kültür sistemleri, hücre-hücre ve hücre-ekstraselüler matriks (ECM) etkileşimlerini daha gerçekçi bir şekilde modelleyerek biyomedikal araştırmalarda önemli bir araç haline gelmiştir. Bu çalışmada, A549 akciğer kanseri hücrelerinin sferoid oluşturma kapasiteleri, üç farklı 3B kültür yöntemi — ultra düşük yapışma (ULA) yüzeyli kültür plakası, agaroz hidrojel ve asılı damla (hanging drop) teknikleri kullanılarak karşılaştırılmıştır. Çalışmanın temel amacı, A549 hücreleri için en etkili sferoid oluşturma yöntemini belirleyerek elde edilen bulguların gelecek biyomedikal araştırmalara özellikle kanser modelleme, ilaç tarama çalışmaları ve tümör mikroçevresi araştırmaları gibi uygulamalara rehberlik etmesini sağlamaktır.
Gereç ve Yöntemler: A549 hücreleri ultra düşük tutunma plakası, agaroz hidrojel ve asılı damla yöntemleri kullanılarak kültüre edilmiştir. Ultra düşük tutunma plakası yönteminde 5 x 103, 1 x 104 ve 3 x 104 hücre/ml yoğunluklarında sferoid oluşumu gözlemlenmiştir. Agaroz hidrojel yönteminde 1%, 1.5% ve 2% agaroz konsantrasyonları kullanılarak hücre agregasyonu ve sferoid stabilitesi değerlendirilmiştir. Asılı damla yönteminde hücreler yerçekimi etkisiyle kümelenmiş, sferoid çapı ve alanı ImageJ yazılımı ile analiz edilmiştir.
Bulgular: Bu çalışmada, üç farklı üç boyutlu (3B) kültür yöntemi kullanılarak A549 akciğer kanseri hücrelerinin sferoid oluşturma kapasiteleri değerlendirilmiştir. Ultra düşük tutunma (ULA) plakası yöntemi, hücre agregasyonuna olanak sağlamış ancak oluşan yapılar sferoid olarak sınıflandırılacak kadar büyük ve kompakt bir yapı oluşturamamıştır. Asılı damla (hanging drop) yöntemi, hücrelerin 3. günde küçük kümeler oluşturduğunu, ancak 7. güne kadar kompakt ve stabil bir sferoid yapısı geliştiremediğini göstermiştir. Agaroz hidrojel yöntemi ise özellikle %2 agaroz konsantrasyonunda, diğer yöntemlere kıyasla en yüksek sferoid oluşturma kapasitesini sergilemiştir. Bu yöntemde sferoid oluşumu hücre yoğunluğuna bağlı olarak 72. saatte başlamış ve 30.000 hücre/ml yoğunluğunda anlamlı bir büyüme gözlenmiştir (p < 0.0001). Trypan Blue boyama sonuçları, %2 agaroz ve 1 x 104 – 3 × 104 hücre/ml yoğunluklarında en yüksek hücre canlılığının elde edildiğini ortaya koymuştur. Bu bağlamda, 30.000 hücre/ml yoğunluğunda 4.800 canlı hücre, 10.000 hücre/ml yoğunluğunda ise 3.600 canlı hücre sayılmıştır. Bu bulgular A549 akciğer kanseri hücreleri için agaroz hidrojel yönteminin, özellikle %2 agaroz konsantrasyonu ve yüksek hücre yoğunluğunda optimum sferoid oluşumu ve hücre canlılığı sağladığını ortaya koymaktadır.
Sonuç: Bu çalışma, agaroz hidrojel yönteminin A549 akciğer kanseri hücrelerinde stabil ve organize sferoid oluşumu sağladığını göstermiştir. Özellikle %2 agaroz konsantrasyonu, hem hücre canlılığını koruma hem de sferoid büyüklüğünü optimize etme açısından en etkili koşul olarak belirlenmiştir. Ultra düşük tutunma (ULA) plakası ve asılı damla (hanging drop) yöntemleri ise sferoid oluşumu açısından sınırlı bir kapasite göstermiş ve daha az kompakt yapılar üretmiştir. Elde edilen bulgular, üç boyutlu (3B) hücre kültürü yöntemlerinin, özellikle deneysel tümör modellemesi ve ilaç tarama çalışmaları gibi biyomedikal araştırmalarda kritik bir rol oynadığını vurgulamaktadır. Bu bağlamda, agaroz hidrojel yöntemi, yüksek sferoid oluşum kapasitesi ve hücre canlılığı sağlaması nedeniyle, kanser araştırmalarında etkili bir 3B kültür modeli olarak değerlendirilmeye açık bir yöntem olarak öne çıkmaktadır.

Kaynakça

  • 1. Brown TJ, Reiss KA, O'Hara MH. Advancements in systemic therapy for pancreatic cancer. Am Soc Clin Oncol Educ Book 2023; 43:e397082.
  • 2. Dela Cruz CS, Tanoue LT, Matthay RA. Lung cancer: epidemiology, etiology, and prevention. Clin Chest Med 2011; 32(4):605-44.
  • 3. Giard DJ, Aaronson SA, Todaro GJ, Arnstein P, Kersey JH, Dosik H, Parks WP. In vitro cultivation of human tumors: establishment of cell lines derived from a series of solid tumors. J Natl Cancer Inst 1973; 51(5):1417-23.
  • 4. Nazari M. Use of cell lines in cancer research. Cell Biol Rev 2020; 9(1):45-50.
  • 5. Dominiak A, Chełstowska B, Olejarz W, Nowicka G. Communication in the cancer microenvironment as a target for therapeutic interventions. Cancers 2020; 12(5):1232.
  • 6. Hoang T, Landi MT. Molecular pathogenesis of lung cancer. Lung Cancer 2022; 165:23-35.
  • 7. Bennati C, Paglialunga L, Ricciuti B, Metro G, Marcomigni L, Gili A, Crinò L. Targeting EGFR and ALK in NSCLC: current evidence and future perspective. Lung Cancer Manag 2016; 5(2):79-90.
  • 8. Atat OE, Farzaneh Z, Pourhamzeh M, Taki F, Abi-Habib R, Vosough M, El-Sibai M. 3D modeling in cancer studies. Hum Cell 2022; 35(1):23-36.
  • 9. Poornima K, Francis AP, Hoda M, Eladl MA, Subramanian S, Veeraraghavan VP, Rajagopalan R. Implications of three-dimensional cell culture in cancer therapeutic research. Front Oncol 2022; 12:891673.
  • 10. Duval K, Grover H, Han LH, Mou Y, Pegoraro AF, Fredberg J, Chen Z. Modeling physiological events in 2D vs. 3D cell culture. Physiology 2017; 32(4):266-77.
  • 11. Jubelin C, Muñoz-Garcia J, Griscom L, Cochonneau D, Ollivier E, Heymann MF, Vallette FM, Oliver L, Heymann D. Three-dimensional in vitro culture models in oncology research. Cell Biosci 2022; 12(1):155.
  • 12. Pinto M, Alves PM, Cardoso C. 3D models for studying cancer and drug resistance. Cancer Cell Int 2020; 20(1):123-34.
  • 13. Yun C, Kim SH, Kim KM, Yang MH, Byun MR, Kim JH, Jung YS. Advantages of using 3D spheroid culture systems in toxicological and pharmacological assessment for osteogenesis research. Int J Mol Sci 2024; 25(5):2512.
  • 14. El Harane S, Zidi B, El Harane N, Krause KH, Matthes T, Preynat-Seauve O. Cancer spheroids and organoids as novel tools for research and therapy: state of the art and challenges to guide precision medicine. Cells 2023; 12(7):1001.
  • 15. Abuwatfa WH, Pitt WG, Husseini GA. Scaffold-based 3D cell culture models in cancer research. J Biomed Sci 2024; 31(7):1-12.
  • 16. Dutta D, Heo I, Clevers H. Organoids: an in vitro model for cancer research. Cell 2017; 173(6):1310-25.
  • 17. Chehelgerdi M, Behdarvand Dehkordi F, Chehelgerdi M, Kabiri H, Salehian-Dehkordi H, Abdolvand M, Ranjbarnejad T. Exploring the promising potential of induced pluripotent stem cells in cancer research and therapy. Mol Cancer 2023; 22(1):189.
  • 18. Thakur G, Bok EY, Kim SB, Jo CH, Oh SJ, Baek JC, Rho GJ. Scaffold-free 3D culturing enhances pluripotency, immunomodulatory factors, and differentiation potential of Wharton’s jelly-mesenchymal stem cells. Eur J Cell Biol 2022; 101(3):151245.
  • 19. Kim W, Gwon Y, Park S, Kim H, Kim J. Therapeutic strategies of three-dimensional stem cell spheroids and organoids for tissue repair and regeneration. Bioact Mater 2023; 19:50-74.
  • 20. Demirel G, Koltuk G. The importance of 3D cell culture in drug discovery and development. Front Life Sci Relat Technol 2024; 5(3):224-30.
  • 21. Nazari SS. Generation of 3D tumor spheroids with encapsulating basement membranes for invasion studies. Curr Protoc Cell Biol 2020; 87(1):e105.
  • 22. Ivascu A, Kubbies M. Rapid generation of single-tumor spheroids for high-throughput cell function and toxicity analysis. J Biomol Screen 2006; 11(8):922-32.
  • 23. Saleh F, Harb A, Soudani N, Zaraket H. A three-dimensional A549 cell culture model to study respiratory syncytial virus infections. J Infect Public Health 2020; 13(8):1142-7.
  • 24. Horning JL, Sahoo SK, Vijayaraghavalu S, Dimitrijevic S, Vasir JK, Jain TK, Labhasetwar V. 3-D tumor model for in vitro evaluation of anticancer drugs. Mol Pharm 2008; 5(5):849-62.
  • 25. Lee JM, Dedhar S, Kalluri R, Thompson EW. The epithelial–mesenchymal transition: new insights in signaling, development, and disease. J Cell Biol 2006; 172(7):973-81.
  • 26. Kelm JM, Timmins NE, Brown CJ, Fussenegger M, Nielsen LK. Method for generation of homogeneous multicellular tumor spheroids applicable to a wide variety of cell types. Biotechnol Bioeng 2003; 83(2):173-80.
  • 27. Fennema E, Rivron N, Rouwkema J, van Blitterswijk C, De Boer J. Spheroid culture as a tool for creating 3D complex tissues. Trends Biotechnol 2013; 31(2):108-15.
  • 28. Froehlich K, Haeger JD, Heger J, Pastuschek J, Photini SM, Yan Y, Schmidt A. Generation of multicellular breast cancer tumor spheroids: comparison of different protocols. J Mammary Gland Biol Neoplasia 2016; 21:89-98.
  • 29. Vitacolonna M, Bruch R, Agaci A, Nuernberg E, Cesetti T, Keller F, Rudolf R. A multiparametric analysis reveals differential behavior of spheroid cultures on distinct ultra-low attachment plate types. Front Bioeng Biotechnol 2024; 12: 1422235.
  • 30. Langhans SA. Three-dimensional in vitro cell culture models in drug discovery and drug repositioning. Front Pharmacol 2018; 9:6.
  • 31. Nath S, Devi GR. Three-dimensional culture systems in cancer research: Focus on tumor spheroid model. Pharmacol Ther 2016; 163:94-108.
  • 32. Park K, Nam Y, Choi Y. An agarose gel-based neurosphere culture system leads to enrichment of neuronal lineage cells in vitro. In Vitro Cell Dev Biol Anim 2015; 51:455-62.
  • 33. Tanaka N, Moriguchi H, Sato A, Kawai T, Shimba K, Jimbo Y, Tanaka Y. Microcasting with agarose gel via degassed polydimethylsiloxane molds for repellency-guided cell patterning. RSC Adv 2016; 6(60):54754-62.
  • 34. Wang X, June RK, Pierce DM. A 3-D constitutive model for finite element analyses of agarose with a range of gel concentrations. J Mech Behav Biomed Mater 2021; 114:104150.
  • 35. López-Marcial GR, Zeng AY, Osuna C, Dennis J, García JM, O’Connell GD. Agarose-based hydrogels as suitable bioprinting materials for tissue engineering. ACS Biomater Sci Eng 2018; 4(10):3610-16.
  • 36. Ma R, Mandell J, Lu F, Heim T, Schoedel K, Duensing A, Weiss KR. Do patient-derived spheroid culture models have relevance in chondrosarcoma research? Clin Orthop Relat Res 2021; 479(3):477-90.
  • 37. Nath S, Devi GR. Three-dimensional culture systems in cancer research: Focus on tumor spheroid model. Pharmacol Ther 2016; 163:94-108.
  • 38. Bray F, Laversanne M, Sung H, Ferlay J, Siegel RL, Soerjomataram I, Jemal A. Global cancer statistics 2022: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer J Clin 2024; 74(3):229-63.
  • 39. Tomasetti C, Vogelstein B. Variation in cancer risk among tissues can be explained by the number of stem cell divisions. Science 2015; 347(6217):78-81.
  • 40. Fang Y, Eglen RM. Three-dimensional cell cultures in drug discovery and development. SLAS Discov 2017; 22(5):456-72.
  • 41. Tevis KM, Colson YL, Grinstaff MW. Embedded spheroids as models of the cancer microenvironment. Adv Biosyst 2017; 1(10):1700083.
  • 42. Edmondson R, Broglie JJ, Adcock AF, Yang L. Three-dimensional cell culture systems and their applications in drug discovery and cell-based biosensors. Assay Drug Dev Technol 2014; 12(4):207-18.
  • 43. Friedrich J, Seidel C, Ebner R, Kunz-Schughart LA. Spheroid-based drug screen: considerations and practical approach. Nat Protoc 2009; 4(3):309-24.
  • 44. Vinci M, Gowan S, Boxall F, Patterson L, Zimmermann M, Court W, Eccles SA. Advances in establishment and analysis of three-dimensional tumor spheroid-based functional assays for target validation and drug evaluation. BMC Biol 2012; 10:1-21.
  • 45. Timmins NE, Nielsen LK. Generation of multicellular tumor spheroids by the hanging-drop method. Tissue Eng 2007; 141-51.
  • 46. Long L, Huang G, Zhu H, Guo Y, Liu Y, Huo J. Down-regulation of miR-138 promotes colorectal cancer metastasis via directly targeting TWIST2. J Transl Med 2013; 11:1-10.
  • 47.Quarta A, Gallo N, Vergara D, Salvatore L, Nobile C, Ragusa A, Gaballo A. Investigation on the composition of agarose–collagen I blended hydrogels as matrices for the growth of spheroids from breast cancer cell lines. Pharmaceutics. 2021;13(7):963.
Toplam 47 adet kaynakça vardır.

Ayrıntılar

Birincil Dil İngilizce
Konular Kanser Hücre Biyolojisi
Bölüm Araştırma Makalesi
Yazarlar

Zehra Varol 0000-0002-0733-6485

Medine Doğan Sarıkaya 0000-0003-0435-6066

Elif Afra Beşparmak 0000-0001-6200-876X

Muhammed Sabit Kıyıcı 0000-0002-1895-1301

Nilhan Öztürk 0000-0001-8308-1456

Seçil Yılmaz 0000-0001-9381-828X

Gönderilme Tarihi 29 Kasım 2024
Kabul Tarihi 26 Mart 2025
Yayımlanma Tarihi 13 Mart 2026
DOI https://doi.org/10.53394/akd.1593500
IZ https://izlik.org/JA58ER36BF
Yayımlandığı Sayı Yıl 2026 Cilt: 12 Sayı: 2026

Kaynak Göster

Vancouver 1.Zehra Varol, Medine Doğan Sarıkaya, Elif Afra Beşparmak, Muhammed Sabit Kıyıcı, Nilhan Öztürk, Seçil Yılmaz. A Comparative Study of 3D Culture Methods in Lung Cancer Research: Finding the Optimal Path for Spheroid Formation. Akd Tıp D. 01 Mart 2026;12(2026). doi:10.53394/akd.1593500

Amaç ve Kapsam

Derginin amacı, sağlık bilimleri ile ilgili alanlarda Akdeniz Tıp Fakültesi ve Türkiye’de yapılan araştırmaları ulusal ve uluslararası bilim çevrelerine sunarak, duyurulması ve paylaşılmasına katkı sağlamak, bu bağlamda Türkiye’nin tanıtılmasına katkıda bulunmaktır. Akdeniz Tıp Dergisi, öncelikle Türkiye ve dünyada konuyla ilgili tüm tıbbi kurum ve bilgi merkezlerine ücretsiz olarak basılı ya da elektronik ortamda dergiye kolayca erişilmeyi sağlamanın yanı sıra, ulusal ve uluslararası dizinlerde de yer almayı hedeflemektedir.

Akdeniz Tıp Dergisi, Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi’nin bilimsel yayın organı olup, etik ilke ve kurallara bağlı olarak yılda üç kez olmak üzere (Ocak, Mayıs, Eylül) dört ayda bir yayınlanan bilimsel ve hakemli, disiplinlerarası bir tıp dergisidir.
Akdeniz Tıp Dergisinin kısaltması Akd Tıp D / Akd Med J .dir.
Akdeniz Tıp Dergisi, TÜBİTAK-ULAKBİM Türk Tıp Dizini, TürkMedline, Sobiad, INDEX COPERNICUS ve academindex tarafından dizinlenmektedir.
Derginin amacı, sağlık bilimleri ile ilgili alanlarda Akdeniz Tıp Fakültesi ve Türkiye’de yapılan araştırmaları ulusal ve uluslararası bilim çevrelerine sunarak, duyurulması ve paylaşılmasına katkı sağlamak, bu bağlamda Türkiye’nin tanıtılmasına katkıda bulunmaktır. Akdeniz Tıp Dergisi, öncelikle Türkiye ve dünyada konuyla ilgili tüm tıbbi kurum ve bilgi merkezlerine ücretsiz olarak basılı ya da açık erişim ile elektronik ortamda dergiye kolayca erişilmeyi sağlamanın yanı sıra, ulusal ve uluslararası dizinlerde de yer almayı hedeflemektedir.
Bu hedefler doğrultusunda, Akdeniz Tıp Dergisi’nde yayınlanması istenilen makalelerin daha çok özgün araştırmaları (temel, klinik ve epidemiyolojik) içermesi gerekmektedir. Ayrıca editör görüşü, derleme, olgu sunumu, editöre mektup, teknik notlar, tıp eğitimi ile ilgili yazılar, tıp tarihçesi ile ilgili yazılar, biyografi yazıları da kabul edilmektedir. Gönderilen yazıların, daha önce yazılı olarak veya elektronik bir formatta yayınlanmamış veya yayınlanma amacıyla bir başka dergiye veya elektronik ortama gönderilmemiş olması gerekmektedir. Gönderilecek yazılarda, Türk dergilerinde yayınlanmış makalelere de atıf yapılması özellikle aranmaktadır.
Daha önceden basılı olarak yayınlanan Akdeniz Tıp Dergisi yayın hayatına elektronik olarak devam ettiğinden daha önceden 1300-1779 olan ISSN numarası 08.08.2019 tarihinden itibaren 2687-2781 şeklinde değişmiştir.
Derginin yayın dili Türkçe ve İngilizce’dir. Türkçe yazılarda, Türk dilinin bütünlüğünün korunmasına dikkat edilmeli ve Türk Dil Kurumu’nun güncel baskı Yazım Kılavuzu ve Türkçe Sözlüğü esas alınmalıdır. Tıp terimlerinin kullanılmasında olabildiğince "Türkçe Bilim Terimleri" nin kullanımına özen gösterilmelidir. Bunun için yazarlar Türk Dil Kurumu'nun "Hekimlik Terimleri Kılavuzu" veya diğer Tıp Terimleri Sözlüklerinden yararlanabilir.

Dergide yayınlanmak üzere editöre gönderilen yazılar A4 sayfasının bir yüzüne 12 punto, çift aralıkla ve kenarlarda 3’er cm boşluk bırakılarak Times Newroman karakterinde yazılmalıdır. Kullanılan kısaltmalar yazı içerisinde ilk geçtikleri yerde, parantez içinde, açık olarak yazılmalı, özel kısaltmalar yapılmamalıdır. Yazı içindeki 1-10 arası sayısal veriler yazıyla (Her iki tedavi grubunda, ......... ikinci gün .....), 10 ve üstü rakamla belirtilmelidir. Ancak, yanında tanımlayıcı bir takısı olan 1-10 arası sayılar rakamla (.... 1 yıl) cümle başındaki rakamlar da (On beş yaşında bir kız hasta......) yazıyla yazılmalıdır. Özgün araştırma makaleleri ve derleme yazılarında özel bir kelime sayısı sınırlandırılması yoktur. Olgu sunumları Öz/Abstract hariç 1000 sözcük ile sınırlandırılmalı ve en az sayıda şekil, tablo ve kaynak içermelidir. Editöre çeşitli konularda ve dergide yayınlanan yazılarla ilgili görüşler yazılabilir ve yazarlarından cevaplandırılması istenebilir. Editöre mektuplar (en fazla 1000 sözcük, tablosuz ve şekilsiz) olmalı ve mektup, tüm yazarlar tarafından imzalanmış olmalıdır. Bunların dergide yayınlanıp yayınlanmaması editörün yetkisindedir. Ayrıca dergide tıp alanındaki bilimsel toplantılar, tarih, konu ve konuşmacıları duyurmak amacı ile yayınlanabilir. Yazılar aşağıda belirtilen sıra izlenerek düzenlenmelidir.

Başlık Sayfası: Yazının Türkçe ve İngilizce başlığı, yazarların adları, görevleri (akademik unvanları) ve iletişim bilgileri (e-mail, telefon) ile, hangi kuruluştan gönderildiği, varsa çalışmayı destekleyen kurum yazılmalıdır. Tüm yazarların uluslararası geçerliliği bulunan "ORCID" bilgisine yer verilmelidir. Yazı daha önce herhangi bir toplantıda bildiri olarak sunulmuşsa, yeri ve tarihi belirtilmelidir. Ayrıca bu sayfada yazışma yapılacak yazarın adı, soyadı, adresi, telefon ve faks numaraları, e-posta adresi açıkça yazılmalıdır.

Öz: Ayrı bir sayfaya Türkçe ve İngilizce olarak hazırlanmalı, başlıklar dahil her biri 250 sözcüğü aşmamalıdır. Öz, makaleyi yansıtacak nitelikte olmalı, önemli sonuçlar verilmeli ve bunların kısaca yorumu yapılmalıdır. Özde açıklanmayan kısaltmalar kullanılmamalı, kaynak gösterilmemelidir. Türkçe ve İngilizce özler, bölümlü olmalı ve aşağıdaki gibi yapılandırılmalıdır: Amaç/Objective;Yöntem(ler)/Method(s); Bulgular/Results; Sonuç(lar) /Conclusion(s).

Anahtar Sözcükler: “Index Medicus: Medical Subject Headings” standartlarına uygun Türkçe ve İngilizce anahtar sözcükler verilmelidir. (http://www.nlm.nih.gov/mesh/authors.html) Tüm yazıların Türkçe ve İngilizce özlerinin altında, 3-10 adet anahtar sözcük yer almalıdır. Anahtar sözcüklerin belgeye erişimde en önemli öğe olduğu gözönünde tutulmalıdır.

Bölümler: Özgün araştırma makalelerinde giriş, gereç ve yöntem (çalışma tasarımı, olguların seçimi ve tanımlanması, teknik bilgi, istatistik vs), bulgular, tartışma ve sonuç bölümleri yer almalı, olgu sunumlarında ise giriş, olgu(ların) sunumu ve tartışma bölümleri yer almalıdır. Bu bölümlerden sonra, varsa araştırmaya veya makalenin hazırlanmasına katkıda bulunanlara ”teşekkür” yazılabilir. Teşekkürlere yazının sonunda kaynaklardan önce yer verilir. Bu bölümde kişisel, teknik ve gereç yardımı gibi nedenlerle yapılacak teşekkür ifadeleri yer alır.

Kaynaklar: Kaynaklar yazının sonunda (Kaynaklar/References) başlığı altında metindeki geçiş sırasına göre numaralandırılıp dizilmelidir. Metin içinde ise parantez içinde yazılmalıdır. Kaynakların listesiyle metin içinde yer alış sırası arasında bir uyumsuzluk bulunmamalıdır. Aslı görünmeden diğer bir kaynak aracılığı ile bilgi edinilen kaynaklar numaralandırılmaz, zorunlu hallerde parantez içinde verilir. Kaynakların doğruluğundan yazar(lar) sorumludur. Tüm kaynaklar metinde belirtilmelidir. Kaynaklar aşağıdaki örneklerdeki gibi gösterilmelidir. Tüm yazarlar belirtilmeli, “ve ark. - et al.” ibaresi kullanılmamalıdır. Dergilerin isimleri Index Medicus’a uygun olarak kısaltılmış biçimde verilir. Index’e girmeyen dergi isimlerinde kısaltma yapılmamalıdır.

Kaynakların Yazımı İçin Örnekler:

Dergiler için

Muzaale AD, Massie AB, Wang MC, Montgomery RA, McBride MA, Wainright JL, Segev DL. Risk of end-stage renal disease following live kidney donation. JAMA 2014; 311:579-86.

Kitaplar için

Chabner ba, Longo DL (eds): Cancer Chemotherapy and Biotherapy: Principles and Practice, 5th ed. Philadelphia, Lippincott Williams & Wilkins, 2011.

Kitaptan alınan bölümler için

Goadsby PJ. Pathophysiology of headache. In: Silberstein SD, Lipton RB, Dalessio DJ, eds. Wolff's headache and other head pain. 7th ed. Oxford, England: Oxford University Press, 2001:57-72.

Toplantı bildirileri için

Christensen S, Oppacher F. An analysis of Koza’s computational effort statistic for genetic programming. In: Foster JA, Lutton E, Miller J, Ryan C, Tettamanzi AG, editors. Genetic programming. EuroGP 2002: Proceedings of the 5th European Conference on Genetic Programming; 2002 Apr 3-5; Kinsdale, Ireland. Berlin: Springer; 2002. p. 182-91.

Çevrim-içi makaleler için

U.S. Renal Data System. USRDS 2007 annual data report. Bethesda, MD: National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases, National Institutes of Health, 2007 (http://www.usrds.org/atlas07.aspx).

Dergi ekleri için

Kidney Disease: Improving Global Outcomes (KDIGO) Acute Kidney Injury Work Group. KDIGO clinical practice guideline for acute kidney injury. Kidney Int Suppl 2012;2:1-138.

Index Medicus’ta yer almayan Türkçe kaynaklarda yukardaki örneklere uyulur, ancak dergi isimleri kısaltılmadan yazılır.

Tablolar: Tablolar, kaynaklar sayfasından sonra gelmeli, her bir tablo ayrı bir sayfada olacak şekilde yazılmalıdır. Tablolar, yazı içinde geçiş sırasına göre Romen rakamları ile numaralandırılmalıdır. Tablo başlıkları kısa, öz olmalı ve bu başlık tablonun üstünde yer almalıdır. Tablo açıklamaları ve kısaltmaları ise, tablonun altında yer almalıdır. Metin içinde her tabloya değinilmelidir.

Şekiller: Metinden ayrı sayfaya yerleştirilmelidir. Şekiller ya profesyonel olarak çizilmeli ve fotoğraflanmalı ya da fotoğraf kalitesinde dijital olarak gönderilmelidir. Şekillerin basıma uygun versiyonlarının yanı sıra, JPEG ya da GIF gibi elektronik versiyonlarda yüksek çözünürlükte görüntü oluşturacak biçimlerde elektronik dosyaları gönderilmeli ve yazarlar göndermeden önce bu dosyaların görüntü kalitelerini bilgisayar ekranında kontrol etmelidir. Semboller, oklar ya da harfler fonla kontrast oluşturmalıdır. Mikroskopik resimlerde büyütme oranı ve kullanılan boyama tekniği belirtilmelidir. Eğer insan fotoğrafı kullanılacaksa ya bu kişiler fotoğraftan tanınmamalıdır ya da yazılı izin alınmalıdır. (Etik bölümüne bakınız) Şekil ve resimlerin yazıları altta, (1,2,3,....) arabik rakamlar ile birlikte yazılmalıdır. Şekiller metinde geçiş sıralarına göre numaralandırılmalıdır. Şekillerin metin içindeki yerleri belirtilmelidir. Metin içinde her şekle değinilmelidir. Renkli şekiller Editör gerekli gördüğünde ya da sadece yazar ek masrafı karşılarsa basılabilir.

Makalelerin Dergiye Gönderilmesi: Makaleler, yazının yayınlanmak üzere gönderildiğini ve Akdeniz Tıp Dergisi’nin hangi bölümü (özgün araştırma, olgu sunumu, derleme) için başvurulduğunu belirten bir mektup, yazının elektronik formunu içeren Microsoft Word 2003 ve üzerindeki versiyonları ile yazılmış elektronik dosyası ile tüm yazarların imzaladığı “Telif Hakkı Devri Formu” eklenerek gönderilmelidir. Yazıların alınmasının ardından yazarlara makalenin alındığı, bir makale numarası ile bildirilecektir. Tüm yazışmalarda bu makale numarası kullanılacaktır. Makalelerde aşağıdaki sıra takip edilmelidir ve her bölüm yeni bir sayfa ile başlamalıdır:

1.Başlık sayfası

2.ÖZ

3.Metin

4.Teşekkür

5.Kaynaklar

6.Tablo ve Şekiller.

Tüm sayfalar sırayla numaralandırılmalıdır. Akdeniz Tıp Dergisi, kendisine gönderilen yazıları, hem üç nüsha halinde, yazıcı çıktısı olarak ve hem de CD ve/veya E-posta uzantısı olarak elektronik makale gönderisi şeklinde kabul etmektedir. Elektronik gönderi, hem zaman kazandırıp posta ücretinden kurtarmakta, hem de değerlendirme süreci sırasında makalenin elektronik biçimi gönderildiğinden üstünlük sağlamaktadır. Çevrimiçi gönderim (on-line submission) ile birlikte Akdeniz Tıp Dergisi web sitesi (https://dergipark.org.tr/tr/pub/akd) nin ilgili kısımlarındaki talimatlarına uyarak da makale gönderilip, hakem süreçleri de bu yolla değerlendirilmektedir. Yazarların makalelerini göndermeden önce bir eksiklik olmadığından emin olmaları için aşağıda bir kontrol listesi bulunmaktadır.

Son Kontrol Listesi:

1.Editöre sunum sayfası; a) Makalenin kategorisi b) Başka bir dergiye gönderilmemiş olduğu bilgisi c) Sponsor veya ticari bir firma ile ilişkisi (varsa belirtiniz) d) İstatistik kontrolünün yapıldığı (araştırma makaleleri için) e) İngilizce yönünden kontrolünün yapıldığı

2.Telif hakları devri formu

3. Daha önce basılmış belge (yazı, resim, tablo) kullanılmış ise izin belgesi

4.İnsan öğesi bulunan çalışmalarda “gereç ve yöntemler” bölümünde HELSİNKİ Deklarasyonu ilkelerine uygunluk, etik kurul onayı ve hastalardan “bilgilendirilmiş olur” alındığının belirtilmesi.

5.Hayvan öğesi kullanılmış ise “gereç ve yöntemler” bölümünde “Guide for the Care and Use of Laboratory Animals” ilkelerine uygunluğunun belirtilmesi.

6.Kapak sayfası a) Makalenin Türkçe ve İngilizce başlığı (tercihen birer satır) b) Yazarlar ve kurumları c) Tüm yazarların yazışma adresi, iş telefonu, GSM numarası, E-posta adresleri (bu bilgiler yalnızca makalenin orijinal nüshasında olmalı, diğer üç kopya nüshada bulunmamalıdır.)

7.Özler: 250 sözcük (Türkçe ve İngilizce)

8.Anahtar sözcükler: 3-10 arası (Türkçe ve İngilizce)

9.Teşekkür

10.Kaynaklar

11.Tablolar – Şekiller

Açık Erişim ve Makale İşleme

Akdeniz Tıp Dergisi, bilimsel yayınlara açık erişim sağlar. Yayımlanan sayıya ve içeriğinde yer alan yazıların tam metinlerine ücretsiz ulaşılabilir. Yazar(lar)dan yazılarının yayımı için herhangi bir ücret talep edilmez.
Okuyucular dergi içeriğini akademik veya eğitsel kullanım amaçlı olarak ücretsiz indirebilirler. Dergi herkese, ücretsizdir. Bunu sağlayabilmek için dergi Akdeniz Üniversitesi’nin mali kaynaklarından, editörlerin ve hakemlerin süregelen gönüllü çabalarından yararlanmaktadır.
Yazıların tüm bilimsel sorumluluğu yazarlara aittir. Gönderilen yazılarda isim sıralaması ortak verilen bir karar olmalıdır. Sorumlu yazar, yazar sıralamasını “Yazar sorumluluk ve Yayın Hakkı Devir Formu”nu doldurup imzalayarak, tüm yazarlar adına kabul etmiş sayılır. Yazarlık için gerekli ölçütleri karşılamayan, ancak çalışmaya katkısı olan kişiler “Teşekkür” bölümünde sıralanabilir. Yazarlar, yayının özgün bir yazı olduğunu, daha önce herhangi bir yerde yayınlanmadığını ve değerlendirme süreci içerisinde başka herhangi bir yerde yayınlama girişiminde bulunmayacaklarına yönelik imzalı bir beyanda bulunmalıdırlar.
Yazarlar, bilimsel içerikte değişiklik yapılmaması koşuluyla, editörlük tarafından yapılacak değişiklik ve düzeltmeleri önceden kabul etmiş sayılırlar. Gönderilen yazılar yayınlansın veya yayınlanmasın iade edilmez, yalnız yayınlanmayan resimler ve şekiller istek üzerine yazarına gönderilebilir.
Gönderilen yazıların, dergi kurallarına göre hazırlanmış ve eksiksiz olarak sayfa düzenlemesine hazır duruma getirilmiş olması gerekir. Yayın kurulu yazım kurallarına uymayan yazıları yayınlamamak, düzeltilmek üzere yazara iade etmek ya da şekil açısından yeniden düzenlemek yetkisine sahiptir. Editör ve dil editörleri, yazım dili, imla düzeltmeleri ve kaynakların yazım kurallarına uygunluğunun denetimi ve ilgili diğer konularda değişiklik ve düzeltmelerin yapılmasında tam yetkilidir. Makalede daha önce yayınlanmış alıntı yazı, tablo, resim vb. var ise, makalenin sorumlu yazarı, ilgili yayın hakkı sahibinden ve yazarlarından yazılı izin almak, ayrıca bunu makalede belirtmek zorundadır.


Yayın Süreci ve Makale Değerlendirme Süresi
Akdeniz Tıp Dergisi’ne gönderilen makaleler öncelikle Editörler Kurulu tarafından nesnel bir değerlendirmeye alınarak gözden geçirilir. Editörler yazıları doğrudan doğruya reddetme veya yeniden düzenlenmesi için geri gönderme hakkına sahiptir. Bu aşamada yazının reddini gerektirecek bir neden yoksa, yazı konu ile ilgili iki ayrı danışmana gönderilir. Makale değerlendirmesi için davet edilen hakemlerin azami 7 gün içerisinde daveti kabul etmesi istenir. Alan değerlendirmesinden iki olumlu hakem raporu alan makale yayınlanmaya hak kazanır. Bir olumlu bir olumsuz hakem raporu alan makale, üçüncü bir hakeme gönderilir ve makalenin yayınlanıp yayınlanmaması üçüncü hakemin raporu ve/veya editör kararı doğrultusunda belirlenir. Daveti kabul eden hakemlerin değerlendirme süreleri azami 30 gündür. Hakemlerin değerlendirmeyi kabul etmemesi veya gün sonunda değerlendirme raporunu göndermemesi durumunda makale değerlendirilmek üzere yeni bir hakeme gönderilir. Hakemler, makaleyi değerlendirdikten sonra yorum ve önerilerini içeren değerlendirme formunu editöre gönderirler. Editör tarafından hakem yorum ve önerileri yazarlara iletilerek düzeltilmiş makaleyi tekrar sisteme yüklemeleri istenir. Yazarların düzeltme süresi azami 60 gündür. Hakemler düzeltme sonrası makaleyi tekrar görmek istemişse makale değerlendirilmek üzere hakemlere tekrar gönderilir. Bu süreç hakemlerin makalenin kabulü veya reddi yönünde görüşünü bildirmelerine kadar devam eder. Hakemlerden gelen görüşler, editör/ler tarafından en geç 15 gün içerisinde değerlendirilir. Bu inceleme sonucunda nihai kararını yazar(lar)a iletir.
Son yayın onayı kararını editörler verir. Yapılacak olan sayfa düzenlemeleri ve düzeltilerden sonra, sorumlu yazarlardan son kontrol istenecek ve yazılı olarak “yayım onayı” alınacaktır. Yayıma kabul edilen makaleler, kabul tarihi sırasına göre Erken Çevrim İçi makaleler kısmında yayımlanmaktadır. Bir makalenin erken görünümde olması bir sonraki sayıya dahil edileceğini göstermez. Erken görünüm sırasında yazarların makalelerini gözden geçirmeleri ve dergi yazım kuralları ve mizanpaj açısından düzeltme önerilerini yayın kuruluna bildirmeleri gerekmektedir. Yayımlanmak üzere kabul edilen makalelerin basımı 12-18 ay arasındadır. Bununla birlikte makalenin güncelliği, özgünlüğü, yayım için bekleyen makale sayısı gibi faktörlere bağlı olarak bu süre daha erken veya daha geç olabilmektedir. Dergi yayımlandıktan sonra makalelerde değişiklik yapılamamaktadır.
Yazılar körleme danışmanlık (peer-review) sistemi uyarınca, yazarların isimleri yazı metninden çıkartılarak danışmanlara gönderilir. Yazarlara da, yazının hangi danışmanlara gönderildiği ile ilgili bilgi verilmez. Danışmanlar ve Yayın Kurulu üyeleri, yazıları topluma açık bir şekilde tartışamaz. Bazı durumlarda, danışmanların bir yazıya ait yorumları, aynı yazıyı inceleyen diğer danışmanlara editör tarafından gönderilerek, danışmanların bu süreçte aydınlatılmaları sağlanabilir. Gönderilen yazıyı, verilen süre içerisinde değerlendirmeyen danışmanın yerine, başka bir danışmana da görev verilebilir.


ETİK İLKELER
Akdeniz Tıp Dergisi, yazarlardan araştırma ve yayın etiğine uyumlu olunmasını istemektedir. İnsanlarda veya hayvanlarda gerçekleştirilen araştırmalarda ulusal ve uluslararası etik kılavuzlara uyum ve ilgili etik kurullardan izin esastır. Alınan “Etik Kurul Onayı” çevrimiçi olarak, https://dergipark.org.tr/tr/pub/akd adresine gönderilmelidir. Makalelerin etik kurallara uygunluğu yazarların sorumluluğundadır.


İnsanlar üzerinde yapılan araştırmalar:

Dergi, "İnsan" öğesinin içinde bulunduğu tüm çalışmalarda WMA"Helsinki Bildirgesi", "İyi Klinik Uygulamalar Kılavuzu" ve "İyi Laboratuvar Uygulamaları Kılavuzu"'nda belirtilen esaslara ve T.C. Sağlık Bakanlığı'nın ilgili yönetmeliklerine uygunluk ilkesini kabul eder. İnsanlar üzerinde yapılan araştırmalarda, "Klinik Araştırmalar Etik Kurul"undan izin alınması ve ilgili belgenin dergiye gönderilmesi zorunludur. Yazarlar, makalenin Gereç ve Yöntem bölümünde ilgili etik kuruldan ve çalışmaya katılmış insanlardan imzalı "Bilgilendirilmiş onam" (informed consent) belgesini aldıklarını belirtmek zorundadır. Olgu sunumlarında hastanın kimliğinin ortaya çıkmasına bakılmaksızın hastalardan veya gereği durumunda yasal temsilcisinden "Bilgilendirilmiş onam" (informed consent) belgesi alınmalı ve makalenin olgu sunumu başlığı altında yazılı olarak ifade edilmelidir. Hastadan veya yasal temsilcisinden alınan "Bilgilendirilmiş onam" belgesi dergiye yollanmalıdır.


Hayvanlar üzerinde yapılan araştırmalar:

Hayvanlar üzerinde yapılan araştırmalarda, "Deney Hayvanları Etik Kurul"undan izin alınması ve ilgili belgenin bir kopyasının dergiye gönderilmesi zorunludur. Araştırmanın Gereç ve Yöntem bölümünde, deneysel çalışmalarda tüm hayvanların "Laboratuvar Hayvanlarının Bakım ve Kullanımı Kılavuzu"na (Guide for the Care and Use of Laboratory Animals, www.nap.edu/catalog/5140.html) uygun olarak insancıl bir muameleye tabi tutulduğu ve Deney Hayvanları Etik Kurul onay raporu alındığı belirtilmelidir. Hayvanlar üzerinde yapılan çalışmalarda ağrı, acı ve rahatsızlık verilmemesi için neler yapıldığı açık bir şekilde belirtilmelidir. Etik Kurul onayının bir kopyasının dergiye gönderilmemesi durumunda yazı yayınlanmayacaktır.


İzinler: Akdeniz Tıp Dergisi, makalelerin Atıf-Gayri Ticari-Aynı Lisansla Paylaş 4.0 Uluslararası (CC BY) lisansına uygun bir şekilde paylaşılmasına izin verir. Buna göre yazarlar ve okurlar; uygun biçimde atıf vermek, materyali ticari amaçlarla kullanmamak ve uyarladıklarını aynı lisansla paylaşmak koşullarına uymaları halinde eserleri kopyalayabilir, çoğaltabilir ve uyarlayabilirler. Dergide yayımlanan yazılar için telif hakkı ödenmez.


Çıkar çatışmaları: Yazarlar, makaleleriyle ilgili çıkar çatışmalarını (varsa) bildirmelidirler. Eğer makalede dolaylı veya dolaysız ticari bağlantı (istihdam edilme, doğrudan ödemeler, hisse senedine sahip olma, firma danışmanlığı, patent lisans ayarlamaları, veya hizmet bedeli gibi) veya çalışma için maddi destek veren kurum mevcut ise yazarlar; kullanılan ticari ürün, ilaç, firma v.b ile ticari hiçbir ilişkisinin olmadığını ve varsa nasıl bir ilişkisinin olduğunu, editöre sunum sayfasında ve ayrıca makalede kaynaklar bölümünden önce "Çıkar çatışması" başlığı altında bildirmek zorundadır. http://icmje.org/conflicts-of-interest/


Yazarlık katkısı: Çok yazarlı makalelerde yazarların araştırmaya katkıları (fikir oluşturma, çalışma tasarımı, deneysel uygulamalar, istatistik, makalenin yazımı, v.b) açıklanmalı ve imzalı olarak editöre (yayın hakkı devir formu kapsamı içinde) sunulmalıdır. Yazarlık katkısı bilgisi, kaynaklar bölümünden önce makalede bildirilmek zorundadır.


Maddi destek: Araştırma için alınmış finansal destek, bağış ve diğer bütün faaliyetler (istatistiksel analiz, İngilizce/Türkçe değerlendirme) ve/veya teknik yardım varsa açıkça makalenin kaynaklar bölümünden önce bildirilmek zorundadır. Ayrıca yazarlar aşağıda belirtilen alanlarda, varsa çalışmaya sponsorluk edenlerin rollerini beyan etmelidirler: 1) Çalışmanın tasarımı, 2) Veri toplanması, analizi ve sonuçların yorumlanması, 3) Raporun yazılması, 4) Yayın için gönderilmesine karar verilmesi.


İntihal: Dergiye gönderilen tüm yazılar, değerlendirme sürecine alınmadan önce iThenticate veya Turnitin programından geçirilerek benzerlik raporu alınır. Benzerlik oranı %20'den fazla olan makaleler intihal olarak kabul edilir ve ret edilir. Akdeniz Tıp Dergisi Yayın Kurulu dergiye gönderilen çalışmalarla ilgili aşırma, atıf manipülasyonu ve veri sahteciliği iddia ve şüpheleri karşısında COPE kurallarına uygun olarak hareket edebilmektedir.


ETİK SORUMLULUKLAR
Bilimsel bir çalışma ortaya koyan tüm paydaşların (yazar, editör ve hakem), bilimin doğru bir şekilde ilerlemesine katkı sağlaması hedeflenir. Bu hedef gereğince hazırlanan bilimsel çalışmalarda bilimsel etik ilkelere uygunluk önemlidir.
Bu ilkeler, tarafımızca kabul edilmiştir ve paydaşlar tarafından da benimsenmesi önerilerek, bir kısmı aşağıda sunulmuştur.
Derginin editörlük ve yayın süreçleri International Committee of Medical Journal Editors (ICMJE), World Association of Medical Editors (WAME), Council of Science Editors (CSE), Committee on Publication Ethics (COPE), European Association of Science Editors (EASE) ve National Information Standards Organization (NISO) yönergelerine uygun olarak şekillenmektedir. Dergi, Principles of Transparaency and Best Practice in Scholarly Publishing (doaj.org./bestpractice) ilkelerini benimsemiştir.


Yazarların Etik Sorumlulukları
- Çalışmayla ilişkili verilerin doğruluğundan emin olmak, araştırmasına ilişkin kayıtlarını düzenli tutmak ve olası bir talep üzerine bu verilere erişim verebilmek.
- Gönderdiği makalenin başka bir yerde yayınlanmadığından veya kabul edilmediğinden emin olmak.
- Sunduğu içerik yayınlanmış veya sunulan başka içerikle eşleşirse, bu çakışmayı kabul etmek ve alıntı yapmak. Gerektiğinde, çalışmasıyla ilgili benzer içeriğe sahip olabilecek herhangi bir çalışma varsa bunun bir kopyasını editöre sunmak. Başka kaynaklardan herhangi bir içeriği çoğaltmak ya da kullanmak için izin almak, atıf göstermek.
- İnsan veya hayvan denek içeren tüm çalışmalar için ulusal ve uluslararası yasalara ve yönergelere uygun olmasını sağlamak, (örneğin, WMA Helsinki Bildirgesi, NIH Laboratuvar Hayvanlarının Kullanımına İlişkin Politika, Hayvanların Kullanımına İlişkin AB Direktifi) gerekli onayların alındığını belirtmek, denek mahremiyete saygı göstermek. Çalışmasına dair ilgili etik kurul onaylarını ve araştırma detaylarını çalışmanın “Gereç ve Yöntem” kısmında belirtmek.
- Herhangi bir çıkar çatışması durumunda, makalesiyle ilgili etik bir ihlal tespit ettiğinde bunu editör ve yayıncı ile paylaşmak, hata beyanı, zeyilname, tazminat bildirimi yayınlamak veya gerekli görüldüğü durumlarda çalışmayı geri çekmek.


Editörlerin Etik Görev ve Sorumlulukları
- Yazarların cinsiyet, dinî veya politik inançlar, etnik veya coğrafi kökenleri üzerine ayrım yapılmaksızın görevlerini yerine getirirken dengeli, objektif ve adil bir şekilde hareket etmek.
- Dergiye gönderilen çalışmaları içeriğine göre değerlendirmek, hiçbir yazara ayrıcalık göstermemek.
- Olası çıkar çatışmalarını önlemek adına gerekli önlemleri almak ve varsa mevcut beyanları değerlendirmek.
- Sponsorlu çalışmaları veya özel konulardaki çalışmaları diğer çalışmalarla aynı şekilde ele almak.
- Etik ihlali niteliğinde bir şikâyet olması durumunda, derginin politika ve kurallarına bağlı kalarak gerekli işlemleri uygulamak. Yazarlara, gelen şikayete cevap vermek için bir fırsat vermek, çalışma kime ait olursa olsun gerekli yaptırımları uygulamaktan kaçınmamak.
- Derginin amaç ve kapsamına uygun olmaması durumunda gelen çalışmayı reddetmek.


Hakemlerin Etik Sorumlulukları
- Editörün karar verme sürecine katkıda bulunmak için makaleyi objektif olarak zamanında incelemek ve sadece uzmanlık alanı ile ilgili çalışma değerlendirmeyi kabul etmek.
- Değerlendirmeyi nesnel bir şekilde sadece çalışmanın içeriği ile ilgili olarak yapmak. Dinî, siyasi ve ekonomik çıkarlar gözetmeden çalışmayı değerlendirmek.
- Yayınlanacak makalenin kalitesini yükseltmeye yardımcı olacak yönlendirmelerde bulunmak ve çalışmayı titizlikle incelemek. Yorumlarını yapıcı ve nâzik bir dille yazara iletmek.
- Editör ve yazar tarafından sağlanan bilgilerin gizliliğini korumak, gizlilik ilkesi gereği incelediği çalışmayı değerlendirme sürecinden sonra yok etmek, kör hakemliğe aykırı bir durum varsa editöre bildirmek ve çalışmayı değerlendirmemek.
- Olası çıkar çatışmalarının (mali, kurumsal, işbirlikçi ya da yazarlar arasındaki diğer ilişkiler) farkında olmak ve gerekirse bu yazı için yardımlarını geri çekmek konusunda editörü uyarmak.


Bilimsel araştırma ve yayın etiğine aykırı olduğu düşünülen eylemlerden bazıları:
• İntihal: Başkalarının özgün fikirlerini, metotlarını, verilerini veya eserlerini bilimsel kurallara uygun biçimde atıf yapmadan kısmen veya tamamen kendi eseri gibi göstermek.
• Sahtecilik: Bilimsel araştırmalarda gerçekte var olmayan veya tahrif edilmiş verileri kullanmak.
• Çarpıtma: Araştırma kayıtları veya elde edilen verileri tahrif etmek, araştırmada kullanılmayan cihaz veya materyalleri kullanılmış gibi göstermek, destek alınan kişi ve kuruluşların çıkarları doğrultusunda araştırma sonuçlarını tahrif etmek veya şekillendirmek.
• Tekrar yayım: Mükerrer yayınlarını akademik atama ve yükselmelerde ayrı yayınlar olarak sunmak.
• Dilimleme: Bir araştırmanın sonuçlarını, araştırmanın bütünlüğünü bozacak şekilde ve uygun olmayan biçimde parçalara ayırıp birden fazla sayıda yayımlayarak bu yayınları akademik atama ve yükselmelerde ayrı yayınlar olarak sunmak.
• Haksız yazarlık: Aktif katkısı olmayan kişileri yazarlar arasına dâhil etmek veya olan kişileri dâhil etmemek, yazar sıralamasını gerekçesiz ve uygun olmayan bir biçimde değiştirmek, aktif katkısı olanların isimlerini sonraki baskılarda eserden çıkartmak, aktif katkısı olmadığı halde nüfuzunu kullanarak ismini yazarlar arasına dâhil ettirmek.
• Destek alınarak yürütülen araştırmalar sonucu yapılan yayınlarda destek veren kişi, kurum veya kuruluşlar ile bunların katkılarını belirtmemek.
• Henüz sunulmamış veya savunularak kabul edilmemiş tez veya çalışmaları, sahibinin izni olmadan kaynak olarak kullanmak.
• İnsan ve hayvanlar üzerinde yapılan araştırmalarda etik kurallara uymamak, yayınlarında hasta haklarına saygı göstermemek, hayvan sağlığına ve ekolojik dengeye zarar vermek, gerekli izinleri almamak.
• Bilimsel araştırma için sağlanan veya ayrılan kaynakları, mekânları, imkânları ve cihazları amaç dışı kullanmak.
• Akademik atama ve yükseltmelerde bilimsel araştırma ve yayınlara ilişkin yanlış veya yanıltıcı beyanda bulunmak.

Akdeniz Tıp Dergisi, bilimsel yayınlara açık erişim sağlar. Yayımlanan sayıya ve içeriğinde yer alan yazıların tam metinlerine ücretsiz ulaşılabilir. Yazar(lar)dan yazılarının yayımı için herhangi bir ücret talep edilmez.
Okuyucular dergi içeriğini akademik veya eğitsel kullanım amaçlı olarak ücretsiz indirebilirler. Dergi herkese, ücretsizdir.

Sahibi

Yetişkin Eğitimi, Halk Sağlığı, Tıp Eğitimi

Baş Editör ve Editör

Hücre Gelişimi, Proliferasyon ve Ölümü, Gen İfadesi, Moleküler Genetik, Hayvan Hücresi ve Moleküler Biyoloji, Tıbbi Genetik (Kanser Genetiği hariç), Gen ve Moleküler Tedavi, Rejeneratif Tıp (kök hücreler dahil)

Cerrahi Bilimler Editörü

Üroloji, Sağlık Bilimleri

Klinik Bilimler Editörü

Acil Tıp, Sağlık Bilimleri

Temel Bilimler Editörü

She graduated from the Department of Biology, Faculty of Science, Hacettepe University in 2002. She completed his master's degree in 2002 and his doctorate in 2012 at the Department of Histology and Embryology, Faculty of Medicine, Akdeniz University. In her master's thesis, she examined the distribution of cell cycle regulators in normal and diabetic rat placentas during specific stages of pregnancy. After completing her master's degree, she worked for 11 months at the Institute for Cancer Research and Molecular Medicine, Faculty of Medicine, Norges Teknisk-Naturvitenskapelige Universitet (NTNU) with a research grant from Norway. There, she conducted studies on the relationship between preeclamptic placentas and the immune system. Under the scope of the 2214-Doctoral Students Overseas Research Grant awarded by TÜBİTAK, she conducted her doctoral thesis research at the University of Cincinnati College of Medicine, Cincinnati Children's Hospital, Department of Reproductive Biology, United States, where she investigated the interactions between FKBP52 and PRDX6 in the mouse uterus throughout pregnancy. Her research topics include the placenta, uterine receptivity, embryo implantation, and inflammasomes. She has numerous international publications and presentations, and her h-index is 16 according to WOS. She was promoted to associate professor in 2015 and to professor in 2024. She currently works at the Department of Histology and Embryology, Faculty of Medicine, Akdeniz University.

Histoloji ve Embriyoloji, Sağlık Bilimleri

İstatistik Editörü

Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi İngilizce bölümünden mezun olan Dr. Gülkesen, Patoloji uzmanıdır. Akdeniz Üniversitesi'nde tıp bilişimi yüksek lisansı, ODTÜ'de tıp bilişimi doktorası yapmıştır. 2003 yılında Heidelberg Üniversitesi Tıp Bilişimi bölümünde 3 ay konuk araştırmacı, 2017'de Almanya'daki Peter L. Reichertz Tıp Bilişimi Enstitüsü'nde bir yıl Kıdemli Araştırmacı olarak çalışmıştır. Bir teknokent şirketi olan Myra Enformasyon Teknolojileri'nde kurucu ortak, Kıdemli Veri Analisti ve Sistem Analisti olarak görev yapmıştır. Ayrıca Dr. Gülkesen, AB'nin Horizon 2020 ve 7. Çerçeve Programı da dahil olmak üzere önde gelen Avrupa ve uluslararası projelerinde ulusal koordinatör, araştırmacı, danışman rolleri üstlenmiştir.
COVID-19 salgını sırasında DSÖ'nün uzaktan sağlık hizmetleri ile ilgili bir projesinde danışmanlık yapmıştır. Journal of Medical Systems dergisinde dokuz yıl editör yardımcılığı görevini sürdürmüştür. Tıp Bilişimi Derneği'nde Başkanlık dahil çeşitli pozisyonlarda görev almış ve bu dönemde İki uluslararası ve çok sayıda ulusal toplantıda başkanlık ve kongre sekreterliği yapmıştır. Tıp Bilişimi lisansüstü programlarında Biyoistatistik, Sağlık Bilgi sistemleri, Klinik Karar Destek Sistemleri, Elektronik Sağlık Kayıtları ve Yapay Zeka derslerini vermektedir. İyi derecede İngilizce, orta düzeyde Almanca ve Japonca bilen Dr. Gülkesen, Tai-chi ve qigong eğitmenidir.

Biyoistatistik, Sağlık Bilişimi ve Bilişim Sistemleri

İngilizce Dil Editörleri

İNGİLİZCE, İleri seviye, C1/C2; İTALYANCA, Orta seviye, B1/B2

Lisans, Ankara Üniversitesi, Makine Fakültesi, 2012

Doktora, Akdeniz Üniversitesi, Tıbbi Genetik

Uzmanlık Alanı, Nörobilim, Epigenetik, Nöromüsküler bozukluklar, FSHD, Fasiyoskapulohumeral Kas Distrofisi

Yükselen Bilim İnsanı Ödülü, 2023, Milano, İtalya FSHD konferansı

Epigenetik , Tıbbi Genetik (Kanser Genetiği hariç), Nöroloji ve Nöromüsküler Hastalıklar, Sağlık Bilimleri, Fitoterapi, Tıbbi Bitkiler, Geleneksel, Tamamlayıcı ve Bütünleştirici Tıp (Diğer)
Kulak Burun Boğaz, Sağlık Bilimleri, Tıp Eğitimi
Nakil İmmünolojisi, Otoimmünite, Temel İmmünoloji

Sosyal Medya, Index ve Dizin Editörü

Türkçe Dil Editörü

Sağlık Bilimleri Eğitimi ve Program Geliştirme: Tıp, Hemşirelik ve Sağlık Bilimleri

Mizanpaj Editörü

Grafik Tasarımı

Yayın Kurulu

Bakteriyoloji, Mikoloji, Tıbbi Mikrobiyoloji (Diğer)
Halk Sağlığı, Koruyucu Sağlık Hizmetleri, Tıp Eğitimi
Çocuk Metabolizma Hastalıkları
Anesteziyoloji
Anatomi, Spor Biliminde Biyomekanik

2025- Devam ediyor. Prof. Dr.
Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Üroloji, Türkiye
2020-2025 Doç. Dr.
Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Üroloji, Türkiye
2018-2020 Dr. Öğretim Üyesi
Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Üroloji, Türkiye
2013 – 2016 Tıpta Yandal Uzmanlık
Bursa Uludağ Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Çocuk Ürolojisi, Türkiye
2002 – 2007 Tıpta Uzmanlık
Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Üroloji, Türkiye
1995 – 2001 Doktora
Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Türkiye
Yaptığı Tezler
2007 Tıpta Uzmanlık
Laparoskopik radikal prostatektomi uygulanan hastaların cerrahi, onkolojik ve fonksiyonel sonuçlarının değerlendirilmesi
Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Üroloji

Çocuk Ürolojisi, Sağlık Bilimleri
Genel Cerrahi

 Özlem Çakın , MD
Associate Professor, Intensive Care
CV – 31st. August 2023

Position
21.03.2022- Asisstans professor Akdeniz University Medical School
Chaiman Department of Internal Medicine/Intersive Care

Address
Akdeniz University Medical School
Hospital Block-A, Pinarbasi District Block-A
07070 Konyaalti, Antalya, Türkiye
Contact Information
Cell: +905425455656
: +90 2422494400
E-mail: ozlemcakin@akdeniz.edu.tr
: zlmckndr@gmail.com

ORCID: 0000-0002-0907-4095
Publons / Web of Science Researcher ID: HJA-4954-2022
ScopusID: 24461367300

Yoğun Bakım
Bebek ve Çocuk Sağlığı, Yenidoğan

Prof Dr Pamukkale Üniversitesi Tıp Fakültesi

KBB Uzmanlık,  Eğitimde Ölçme Değerlendirme MEd, Tıp Eğitimi MSc, Tıp Eğitimi ve Bilişimi PhD


Kulak Burun Boğaz, Tıp Eğitimi
Göz Hastalıkları ve Göz Ölçümleri, Göz Hastalıkları
Acil Tıp, Sağlık Bilimleri

ÖZGEÇMİŞ
Adı Soyadı: Cumhur İbrahim Başsorgun
Doğum Tarihi: 30 Ekim 1973
Akademik Unvanı: Prof.Dr.
İş Telefonu: 0242496384
Cep Telefonu: 05317927200
İş Adresi: Akdeniz Üniversitesi Hastanesi Tıbbi Patoloji AD. Konyaaltı/ Antalya
Uzmanlık Alanı: Tıbbi Patoloji


Öğrenim Durumu:
Derece Bölüm/Program Üniversite Yıl
Lisans-Y. Lisans Tıp Fakültesi Gazi Üniversitesi 1991-1998
Tıpta Uzmanlık Patoloji Bölümü Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi 2003-2008
Doç. Patoloji Bölümü Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi 2017-2022
Prof. Patoloji Bölümü Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi 2022-….

Tıpta Uzmanlık Tezi Başlığı ve Tez Danışmanı:
Tez Başlığı: Akciğer Karsinomlarında Floresan in situ Hibridizasyon Yöntemi ile Saptanan Telomer ve İmmunohistokimyasal olarak C-Kit, Ki-67, P-16 Ekspresyonunun Değerlendirilmesi.
Tez Danışmanı: Prof. Dr. Gülay ÖZBİLİM


Görevler:
Görev Unvanı Görev Yeri Yıl
Araş.Gör. (Asistan Dr.) Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi 2003-2008
Uzman Dr. S.B. Ardahan Devlet Hastanesi 2008-2010
Uzman Dr. Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi 2010-2011
Yard.Doç.Dr. Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi 2011-2017
Doç.Dr. Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi 2017-2022
Prof.Dr. Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi 2022-….

Patoloji

Dr. Volkan Doğru, öncelikli ilgi alanı Crohn hastalığı ve ülseratif kolit gibi inflamatuvar bağırsak hastalıklarının (İBH) tedavisi olan Türk/Avrupa yeterlik sertifikalı bir kolorektal cerrahtır. İBH’nin yanı sıra divertikülit, kolorektal kanser, anal fistül ve hemoroidal hastalık gibi diğer kolorektal hastalıkların tedavisinde de geniş deneyime sahiptir. Antalya'da Akdeniz Üniversitesi Hastanesi'nde görev yapmakta olup, burada önemli akademik ve yöneticilik sorumlulukları üstlenmektedir. Dr. Doğru, Türk Kolon ve Rektum Cerrahisi Derneği ve Avrupa Koloproktoloji Derneği üyesidir. Güncel akademik faaliyetleri arasında, İBH tedavilerinin geliştirilip cerrahi sonuçların iyileştirilmesine yönelik araştırmalar, tıbbi makaleler için hakemlik görevleri ve mesleki eğitim faaliyetleri bulunmaktadır.

Genel Cerrahi
Genomik, Moleküler Genetik, Tıbbi Genetik (Kanser Genetiği hariç), Kanser Genetiği, Kanser Hücre Biyolojisi, Kanser Tanısı
Hücre Gelişimi, Proliferasyon ve Ölümü, Hücre Metabolizması, Reseptörler ve Membran Biyolojisi, Tıbbi Biyokimya ve Metabolomik
Histoloji ve Embriyoloji
Bulaşıcı Ajanlar

Uluslararası Yayın ve Danışma Kurulu

Aile Hekimliği, Tıp Eğitimi
Nakil İmmünolojisi
Aile ve İlişkiler Sosyolojisi, Göç Sosyolojisi, Sağlık Sosyolojisi

Dr. El Asmar earned her MD degree from the University of Saint Joseph (USJ) in 1989 and she specialized in Occupational Medicine and Homeopathy at the USJ Faculty of Medicine- Beirut. She was awarded a Master of Health Professions Education (MHPE) with a focus on Assessment and Accreditation from Keele University in the UK in 2018. Dr. El Asmar played an essential role in the development and expansion of the medical school's curriculum. As one of the founding members, she has continually shown a deep dedication to improving medical education and the educational experience for students. She spearheaded the clinical skills thread in the medical curriculum and was instrumental in the creation of OSCE assessments. She assumed many leadership positions at the school and excelled as the Primary Care Clerkship Director and later on as the Director of Medicine Year II and Director of the Clinical Simulation Center that was reaccredited by the Royal College of Physicians and Surgeons. In her capacity as co-chair of the Accreditation Steering Committee, Dr. El Asmar was essential to the accomplishment of our medical school's accreditation by TEPDAD in September 2021.Later on, she became one member of the TEPDAD team, and helped in the accreditation process of several schools in Lebanon and the MENA region. In 2023 she was appointed as the Acting Assistant Dean for Medical Education. Dr. El Asmar is passionate about medical education, particularly curriculum and simulation-based education. She earned a diploma in Clinical Simulation in 2019 and later taught it as an instructor. In 2017, she completed a simulation research primer with SIM-ONE Canada. In 2023, she earned a certificate in Scientific Research from the LAU Gilbert and Rose-Marie Chagoury School of Medicine, in collaboration with George Washington University School of Medicine and Health Sciences. In September 2025, she was appointed as Associate Professor of Medicine, Lebanese American University and Assistant Dean for Medical Education.

Tıp Eğitimi

Effie Polyzogopoulou, is an Associate Professor of Emergency Medicine in the National and Kapodistrian University of Athens.
She was trained in Emergency Medicine in the United States at New York Presbyterian Queens Hospital, NYC, USA.
She is the Chair of the Ultrasound Section at the European Society for Emergency Medicine (EUSEM), Course Director in EUSEM Emergency Ultrasound pre-courses, Founder and Director of the National Emergency Ultrasound Courses for many years.
She is the director of the Emergency Medicine Supraspecialty Training Program at Attikon University Hospital in Athens, Greece, and Vice Chair of the University Emergency Department.
She is an Examiner in the European Board Examination in Emergency Medicine (EBEEM)and a member of the Emergency Medicine Examination Reference Group for Europe (EMERGE).
She is the Country Lead for Greece in the European Society for Emergency Medicine (EUSEM) Research Network.
She is a member of the Acute Heart Failure Committee of the European Society of Cardiology (ESC)- Heart Failure Association (HFA) (2020-2024).
She is an invited speaker in many European, International and National Emergency Medicine and Cardiology Congresses.
She has a special interest in Emergency Ultrasonography. Her current research work and scientific interest are focused on Emergency Ultrasonography/Echocardiography, Medical Education, Acute Cardiovascular Care.
She had a leading role in Emergency Medicine in Greece as a member of the Ministry of Health Working Group for the Supraspecialty of Emergency Medicine in Greece and a member of the Education Committee for the Emergency Medicine Greek Supraspecialty Curriculum.

Acil Tıp

Dr. Ozan Akca, Mersin, Türkiye doğumludur (1964).  Tıp eğitimi ile uzmanlık eğitimini İstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi’nde almıştır. 1996 yılında uzmanlık eğitimini takiben, Dr. Akca, Dr. Daniel I. Sessler ve Dr. Andrea Kurz’un mentörlüğünde Viyana Üniversitesi’nde (Avusturya) araştırma bursu yapmıştır.
2000 yılında Dr. Akca, Amerika Birleşik Devletleri’ne davet edilmiş ve Kaliforniya Üniversitesi San Francisco’da (UCSF) yardımcı doçent olarak görev almıştır. Daha sonra Louisville Üniversitesi’nde (UofL) Anesteziyoloji ve Perioperatif Tıp Bölümü’nde yardımcı doçent olarak çalışmıştır. Dr. Akca, aynı zamanda Nörobilim Yoğun Bakım Ünitesi Direktörü ve Outcomes Research Institute’ün yardımcı direktörü olarak görev yapmıştır. Alanına olan bağlılığı sonucunda Amerikan Anesteziyoloji Kurulu (ABA) Diplomatı olmuş, ayrıca Nörokritik Bakım alanında üst ihtisas yapmıştır. Dr. Akca, UofL’de Anestezi ve Perioperatif Tip Bolumu.nde Araştırmadan Sorumlu Kursu Başkan Yardımcılığı görevine atanmıştır. 2007 yılında doçentliğe, 2015 yılında profesörlüğe yükselmiş ve 2021’de UofL tarafından Emeritus Profesör unvanı verilmiştir.
2021 yılında Dr. Akca, akademik kariyerini genişleterek Johns Hopkins Üniversitesi Anesteziyoloji ve Yoğun Bakım Anabilim Dalı’na profesör olarak katılmıştır. Johns Hopkins’te Nöroanestezi ve Nörokritik Bakım bölümlerine katkıda bulunmaktadır. Ayrıca Anesthesia & Analgesia, Journal of Clinical Anesthesia, Balkan Medical Journal ve Türk Yoğun Bakım Derneği Dergisi gibi önde gelen uzmanlık ve genel tıp dergilerinin editör kurullarında görev yapmaktadır.

Anesteziyoloji

Assoc. Prof. Dr. Samir Cavadli is the Head of the Department of Medical and Health Sciences Education at Azerbaijan Medical University. He is a specialist in clinical microbiology, with expertise in microbiological diagnostics, bacteriology, parasitology, and mycology. His academic work particularly focuses on medical education, competency-based medical education (CBME), simulation-enhanced teaching methods, structured clinical skills assessment systems such as OSCE/OSPI, and innovative pedagogical approaches in health professions education.
He actively contributes to the development and implementation of clinical skills training programs for undergraduate medical and nursing students. His professional activities include quality assurance in medical education, faculty development initiatives, and educational reforms aligned with international standards. He participates in national and international academic projects and conducts multidisciplinary research in health professions education.
His research interests include clinical microbiology, parasitology, mycology, antimicrobial resistance, simulation-based education, assessment methodologies in medical education, educational technologies, artificial intelligence–supported learning environments, and communication skills training in clinical education.

Bakteriyoloji, Mikoloji, Parazitoloji, Mikrobiyoloji (Diğer), Bulaşıcı Hastalıklar, Klinik Mikrobiyoloji, Sağlık Bilimleri Eğitimi ve Program Geliştirme: Tıp, Hemşirelik ve Sağlık Bilimleri, Tıp Eğitimi
Genel Cerrahi
Bilgi Temsili ve Akıl Yürütme, Biyomedikal Bilimler ve Teknolojiler