Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu

Mehmet Timurkan; Hakan Aydın; Sema Belen

doi:10.17094/avbd.80527

Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu

Öz

Sığırların coronavirusları (BCoV) dünya genelinde sığırcılık işletmelerini etkileyerek ciddi solunum ve sindirim sistemi enfeksiyonlarına yol açmaktadır. Bu çalışmada, sığır yetiştiriciliği yapılan işletmelerinde coronavirusların varlığını/yaygınlığını göstermek ve tespit edilen virusların diğer coronaviruslarla ilişkisinin araştırılması amaçlanmıştır. Erzurum ili ve ilçelerinde solunum sistemi semptomları gösteren, farklı ırk ve yaş gruplarında 54 adet sığır çalışmaya dahil edildi. Materyal olarak hayvanlardan burun sıvabı ve mezbahada kesilen hayvanlardan pnömonili akciğer dokusu alındı. Toplanan örneklerde viral nükleik asit ekstraksiyonu, RT-PCR ve nested-PCR reaksiyonları gerçekleştirildi. Bölgeyi temsilen bir amplikon dizi analizine tabi tutuldu. Yöremize ait coronavirus suşu ile gen bankasından sağlanan aşı ve çeşitli coronavirus suşlarına ait nükleik asit dizilimi karşılaştırılarak karakterize edildi. Coronavirus yönünden yapılan moleküler incelemeler sonucunda solunum sistemi enfeksiyonu bulunan 54 sığırdan alınan akciğer doku ve sıvab örneğinin 11 (%20.4)’inde etken pozitif olarak belirlenmiştir. Ayrıca dizi analizi sonucu bölgede sirküle olan virusun Betacoronavirus A grubunda yer aldığı ve aşı suşuyla aynı clusterda yer aldığı tespit edilmiştir. Bu çalışma ile bölgemiz ve ülkemiz açısından mevcut durum güncellenerek epidemiyolojik verilere katkıda bulunulmuştur.

Anahtar Kelimeler

-

Ayrıntılar

Birincil Dil

Türkçe

Konular

-

Bölüm

-

Yazarlar

Mehmet Timurkan

Hakan Aydın Bu kişi benim

Sema Belen Bu kişi benim

Yayımlanma Tarihi

20 Aralık 2015

Gönderilme Tarihi

18 Aralık 2015

Kabul Tarihi

-

Yayımlandığı Sayı

Yıl 2015 Cilt: 10 Sayı: 3

DOI

https://doi.org/10.17094/avbd.80527

IZ

https://izlik.org/JA75PY22GC

Kaynak Göster

RIS / Bibtex

APA

Timurkan, M., Aydın, H., & Belen, S. (2015). Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi, 10(3). https://doi.org/10.17094/avbd.80527

AMA

1.Timurkan M, Aydın H, Belen S. Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi. 2015;10(3). doi:10.17094/avbd.80527

Chicago

Timurkan, Mehmet, Hakan Aydın, ve Sema Belen. 2015. “Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu”. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi 10 (3). https://doi.org/10.17094/avbd.80527.

EndNote

Timurkan M, Aydın H, Belen S (01 Aralık 2015) Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi 10 3

IEEE

[1]M. Timurkan, H. Aydın, ve S. Belen, “Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu”, Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi, c. 10, sy 3, Ara. 2015, doi: 10.17094/avbd.80527.

ISNAD

Timurkan, Mehmet - Aydın, Hakan - Belen, Sema. “Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu”. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi 10/3 (01 Aralık 2015). https://doi.org/10.17094/avbd.80527.

JAMA

1.Timurkan M, Aydın H, Belen S. Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi. 2015;10. doi:10.17094/avbd.80527.

MLA

Timurkan, Mehmet, vd. “Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu”. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi, c. 10, sy 3, Aralık 2015, doi:10.17094/avbd.80527.

Vancouver

1.Mehmet Timurkan, Hakan Aydın, Sema Belen. Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi. 01 Aralık 2015;10(3). doi:10.17094/avbd.80527

Cited By

Buzağı İshallerinde Coronavirusun Nukleoprotein Gen ve Rotavirusun VP7/VP4 Gen Bölgelerinin Kısmi Sekansı ve Filogenetik Analizi

Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi

https://doi.org/10.17094/ataunivbd.372439

Co-Infection of Bovine Papular Stomatitis Virus, Rotavirus and Cryptosporidium Spp. in a Calf

Acta Veterinaria

https://doi.org/10.2478/acve-2020-0039

Identification and molecular characterisation of bovine parainfluenza virus-3 and bovine respiratory syncytial virus - first report from Turkey

Journal of Veterinary Research

https://doi.org/10.2478/jvetres-2019-0022

Molecular characterization of BCoV infecting vaccinated and non-vaccinated cattle in Thrace district Türkiye and isolation of field strains

Virology Journal

https://doi.org/10.1186/s12985-025-03010-3