1990 yılında İzmir'de doğmuştur. Ankara Üniversitesi SBF İktisat Bölümünden mezun olmuştur. Türk İşbirliği ve Koordinasyon Ajansı Başkanlığında 2015 yılında göreve başlamış, farklı yıllarda Orta Asya ve Kafkaslar Dairesi Başkanlığı ile Dış İlişkiler ve Ortaklıklar Dairesi Başkanlığı bünyesinde görev yapmıştır. 2016-2017 yılları arasında Moğolistan'da ve 2018-2020 yılları arasında da Pakistan'da Koordinatör Yardımcılığı görevlerinde bulunmuştur. 2020 yılından itibaren Personel ve Destek Hizmetleri Dairesi Başkanlığı Eğitim ve Yayın Biriminde görev yapmaktadır. TİKA'daki görevinden önce Liberte Yayın Grubu bünyesinde 2012-2014 yılları arasında Muhasebe ve Dağıtım Sorumlusu olarak görev yapan Ömer Gündoğdu, İngilizce bilmektedir. Evli ve bir çocuk babasıdır.