Maş fasulyesi (Vigna radiata L.) tohumlarında fasulye adi mozayik virüsü’nün serolojik ve moleküler yöntemler ile belirlenmesi

Öz

Amaç: Bu çalışmada, maş fasulyesi tohumlarında Fasulye adi mozayik virüsü (Bean common mosaic virus; BCMV)’nün moleküler ve serolojik yöntemler ile ortaya konulması amaçlanmıştır. Materyal ve Yöntem: : Isparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Tarla Bitkileri Bölümü’nden temin edilen 100 adet maş fasulyesi tohumu ile çalışma yürütülmüştür. Tohum örneklerinde BCMV’nin tanılanması DAS-ELISA (Double Antibody Sandwich Enzyme Linked Immunosorbent Assay) ve RT-PCR (Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction) test yöntemleri kullanılarak yapılmıştır. Araştırma Bulguları DAS-ELISA sonuçlarına göre; tohum örneklerinde BCMV’nin bulunma oranı %9 olarak belirlenmiştir. RT-PCR çalışmalarında BCMV ile enfekteli 9 tohum örneği kullanılmıştır. RT-PCR testinde BCMV kılıf protein genine spesifik primer çiftleri kullanılarak yaklaşık 850 bç’lik bir kısım amplifiye edilmiş ve UV görüntülemede beklenen seviyede bant elde edilmiştir. Sonuç: Çalışma sonucunda ülkemizde ilk kez maş fasulyesi tohumlarında BCMV’nin tanılanması yapılmıştır.

Anahtar Kelimeler

• Maş Fasulyesi
• Fasulye adi mozayik virüsü
• DAS-ELISA
• RT-PCR

Determination of bean common mosaic virus in mung bean (Vigna radiata L.) seeds by serological and molecular methods

Abstract

Objective: In this study, it has been aimed to determine the status of Bean common mosaic virus (BCMV) in mung bean seeds by serological and molecular methods. Materials and Methods: Totally 100 mung bean seed samples from provided Isparta University of Applied Sciences, Agriculture Faculty, Department of Field Crops were used as materials in the study. BCMV was detected in seed samples by Double Antibody Sandwich Enzyme Linked Immunosorbent Assay (DAS-ELISA) and Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) methods. Results: results showed that BCMV was determined as 9%. Infected 9 seed samples were used for RT-PCR studies. RT-PCR test showed that bands about 850 bp were amplified from samples using primers spesific for coat protein gene (CP) of BCMV and the band at the expected level was obtained in UV imaging. Conclusion: The results showed the presence of BCMV for first time in mung bean seeds in Turkey.

Keywords

• Mung bean
• Bean common mosaic virus
• DAS-ELISA
• RT-PCR

Kaynakça

1. Anonymous, (1981). AVRDC Progress Report, Asian Vegetable Research and Development center, Taiwan, 143-167.
2. Bhadramurthy, V., & Bhat A.I., (2009). Biological and molecular characterization of Bean common mosaic virus associated with vanilla in India. Indian Journal of Virology, 20(2), 70-77.
3. Çiftçi, C.Y., (2004). Dünyada ve Türkiye’de Yemeklik Tane Baklagiller Tarımı. TMMOB Ziraat Mühendisleri Odası Teknik Yayınlar Dizisi, 5, 200.
4. Çulal-Kılıç, H., Yardımcı, N., Açıkyürek, S., & Uzal, A., (2015). Detection of BCMV, AMV and CMV by DAS-ELISA and Immunocapture-RT-PCR in bean growing areas in The West Mediterranean Region, Turkey. Fresenius Environmental Bulletin, 24(5), 1752-1756.
5. Çulal Kılıç, H., Kök, H., & Yardımcı, N., (2020). Bean Common Mosaic Virus and Bean Common Mosaic Necrosis Virus Infections in bean production areas in The Lakes Region of Turkey. Avrupa Bilim ve Teknoloji Dergisi, 19, 386-392.
6. Dalkılıç, M., (2010). Konya ekolojik şartlarında farklı zamanlarda ekilen maş fasulyesi [Vigna radiata (L.) Wilczek] genotiplerinin verim ve bazı tarımsal özelliklerinin belirlenmesi. Yüksek Lisans Tezi, Selçuk Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Konya, 51.
7. Das, A., Singh, P., Kushwah, N S., Thakur, S., Rathore, M., Pratap, A., & Singh, N.P., (2018). Genetic and genomic approaches for ımprovement in mungbean (Vigna radiata L.) in pulse Improvement. Wani S., Jain M. (Ed.). Springer, 175-189.
8. Deligöz I., & Arli Sokmen, M., (2008). Differentiation of Bean common cosaic virus (BCMV) and Bean common mosaic necrosis virus (BCMNV) strains infecting common bean in Samsun Province. Journal of Turkish Phytopathology, 37(1-3), 1-14.

9. Drijfhout, E., & Bos, L., (1977). Identification of two new strains of Bean common mosaic virus. Netherlands Journal of Plant Pathology, 8, 13-25
10. Drijfhout, E., (1994). Bean common mosaic. In: Compendium of bean diseases. Hall R. (Ed.). APS Press, The American Phytopathological Society, Minnesota, 37-39.
11. Grewal, J.S., (1988). Diseases of pulse crops. An overview. Indian Phytopathology, 41, 114.
12. Güzel, Ö., & Arlı-Sökmen, M., (2003). Determination of some viruses infecting common bean (Phaseoulus vulgaris L.) and their incidences in seed lots in Samsun Province. Journal of Turkish Phytopathology, 32( 2), 99-106.
13. Kaiser, W.J., & Mossahebi, G.H., (1974). Natural infection of mugbean by Bean common mosaic virus. Phytopathology, 64, 1209-1214.
14. Kaiser, W.J., Danesh, D., Okhovat, M., & Mossahebi, G.H., (1972). Virus Diseases of pulse crops in Iran. Bulletin, Faculty of Agriculture, University of Tehran, Karaj, Iran, 111.
15. Karaman, R., (2019). Maş fasulyesi (vigna radiata wilczek) genotiplerinin/yerel populasyonlarının Isparta koşullarında fenolojik, morfolojik, agronomik ve bazı teknolojik özellikler yönünden karakterizasyonu. Isparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi, Doktora Tezi, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, Isparta, 209.
16. Karasu, A., & Öz, M., (2008). Farklı olgunlaşma dönemlerinde hasat edilen fasulye (Phaseolus vulgaris L.) tohumlarının bazı özelliklerinin belirlenmesi. Uludağ Üniversitesi, Ziraat Fakültesi Dergisi, 22(1), 87-94.
17. Petrović, D., Ignjatov, M., Nikolić, Z., Vujaković, M., Vasić, M., Milošević, M., & Ajduković, T.K., (2010), Occurrence and distribution of viruses infecting the bean in Serbia. Archieve of Biological Science, 62(3), 595-601.
18. Saraçoğlu, K., & Erkan, S., (2016). Fasulye tohumlarındaki viral etmenlerin saptanmasında tanı yöntemlerinin duyarlılıklarının incelenmesi. Ege Üniversitesi, Ziraat Fakültesi Dergisi, 53(3), 309-315.
19. Singh, R.N., & Nene, Y.L., (1978). Further studies on the mosaic mottle disease of urdbean. Indian Phytopathology, 31, 159-162.
20. Singh, A., Mukherjee, V., & Kumar, S., (2018). Viral diseases in mung bean and their ıntegrated management. International Journal of Pure Applied Bioscience SPI, 6(1), 184-189.
21. Talens, L.T., & Talens, A., (1978). Mungbean viruses in the Philippines II. Host legume, symptomatology and effect of mungbean mottle virus growth of mungbean (Vigna radiata (L.) Willczek). The Philippines Journal of Crop Science, 3(4), 242-246.
22. Usta, M., & Güler, A., (2020). Molecular characterization of polyprotein genes of Two BCMV (Bean common mosaic potyvirus) isolates in Antalya (Turkey) and Their genomic divergence. Türk Tarım ve Doğa Bilimleri Dergisi, 7(2), 411-419.