Araştırma Makalesi
PDF Zotero Mendeley EndNote BibTex Kaynak Göster

Quantum Chemical Studies of 1-Naphthalen-2-yl-ethanone-o-propyl-oxime

Yıl 2020, Cilt 7, Sayı 100. Yıl Özel Sayı, 175 - 185, 23.03.2020
https://doi.org/10.35193/bseufbd.632396

Öz

In this work, quantum chemical properties of 1-naphthalen-2-yl-ethanone-O-propyl-oxime (NEOPO) molecule which may be biologically active have been presented as a structural, spectroscopic, electronic and molecular docking. All quantum chemical studies were performed by density functional theory (DFT) with the B3LYP / 6-311++G(d,p) method and basis set. The spectroscopic properties, atomic charges, HOMO-LUMO molecular orbitals, chemical reactivity and molecular electrostatic potential (MEP) were investigated as theoretically. The spectroscopic properties have been supported as experimentally. In addition, the Autodock/Vina program was used for molecular docking studies and the binding free energies were calculated as -27.20 and -34.73 kJ/mol for DNA-molecule and protein-molecule interactions, respectively.


Kaynakça

  • [1] Zhu, X.F. Shi, D.Q. (2009) Chin. J. Chem. 27, 565.
  • [2] Abele, E. Lukevics, E. (2000) Org. Prep. Proc. Int. 32, 237.
  • [3] Mobio, I.G. Soldatankov, A.T. Fedorov, V.O. (1989) Khim. Farm. Zh. 23 ,421.
  • [4] Krishnakumar, V. Prabavathi, N. Muthunatesan. S. (2008) Spectrochim. Acta A:Mol. Biomol. Spectr. 69, 528.
  • [5] Govindarajan, M. Karabacak. M. (2013) Spectrochim. Acta A: Mol. Biomol.Spectr. 101, 314.
  • [6] Akman, F. Durak, R. Kacal, M.R. Bezgin. F. (2016) X-Ray Spectr. 45, 103.
  • [7] Li, C. Zhang, H. Cui, Y. Zhang, S. Zhao, Z. Choi, M.C.K. Chan, A.S.C. (2003) Synthetic Communication 33, 543.
  • [8] Frisch, M. J. et al. (2010) Gaussian 09, Revision C.01, Gaussian, Inc., Wallingford CT.
  • [9] Becke, A.D. (1993) J Chem. Phys. 98, 5648.
  • [10] Foresman, J.B. Frisch, E. (1993) Exploring Chemistry with Electronic Structure Methods, Gaussian Inc., Pittsburgh, PA, USA.
  • [11] Sundaraganesan, N. Ilakiamani, S. Saleem, H. Wojciechowski, P.M. Michalska, D. (2005) Spectrochim. Acta. A 61, 2995.
  • [12] Jesus, A.J.L. Rosado, M.T.S. Reva, I. Fausto, R. Eusebio, M.E. Redinha, J.S. (2006) J. Phys. Chem. A 110, 4169.
  • [13] Trott, O. Olson, A.J. (2010) J. Comput. Chem. 31, 455.
  • [14] Kaya, Y. Yilmaz, V.T. Arslan, T. Buyukgungor, O. (2012) J. Mol. Struc. 1024, 65.
  • [15] Colthup, N.B. Daly, L.H. Wiberley, S.E. (1964) Introduction to Infrared and Raman Spectroscopy, Academic Press Inc., London.
  • [16] Kaya, Y. Yilmaz, V.T. (2014) Structural Chem. 25, 231.
  • [17] Parr, R.G. Yang, W. (1989) Density Functional Theory of Atoms and Molecules. New York:Oxford University Press.
  • [18] Bopp, F. Meixner, J. Kestin, J. (1967) Thermodynamics and StatisticalMechanics, fifth ed. Academic Press Inc. (London) Ltd., New York.

1-Naftalen-2-il-etanon-o-propil-oksimin Kuantum Kimyasal Çalışmaları

Yıl 2020, Cilt 7, Sayı 100. Yıl Özel Sayı, 175 - 185, 23.03.2020
https://doi.org/10.35193/bseufbd.632396

Öz

Bu çalışmada, biyolojik aktif özellik gösterebilen 1-naftalen-2-il-etanon-O-propil-oksim (NEOPO) molekülünün kuantum kimyasal özellikleri, yapısal, spektroskopik, elektronik ve moleküler yerleştirme olarak sunulmuştur. Tüm kuantum kimyasal çalışmalar B3LYP / 6-311 ++ G (d, p) yöntem ve temel seti ile yoğunluk fonksiyonel teorisi (DFT) ile gerçekleştirilmiştir. Spektroskopik özellikleri, atom yükleri, HOMO-LUMO moleküler orbitalleri, kimyasal reaktivite ve moleküler elektrostatik potansiyeli (MEP) teorik olarak araştırılmıştır. Spektroskopik özellikler deneysel olarak desteklenmiştir. Ayrıca, moleküler yerleştirme çalışmaları için Autodock / Vina programı kullanılmış ve bağlanma serbest enerjileri DNA-molekül ve protein-molekül etkileşimleri için sırasıyla -27.20 ve -34.73 kJ / mol olarak hesaplanmıştır.

Kaynakça

  • [1] Zhu, X.F. Shi, D.Q. (2009) Chin. J. Chem. 27, 565.
  • [2] Abele, E. Lukevics, E. (2000) Org. Prep. Proc. Int. 32, 237.
  • [3] Mobio, I.G. Soldatankov, A.T. Fedorov, V.O. (1989) Khim. Farm. Zh. 23 ,421.
  • [4] Krishnakumar, V. Prabavathi, N. Muthunatesan. S. (2008) Spectrochim. Acta A:Mol. Biomol. Spectr. 69, 528.
  • [5] Govindarajan, M. Karabacak. M. (2013) Spectrochim. Acta A: Mol. Biomol.Spectr. 101, 314.
  • [6] Akman, F. Durak, R. Kacal, M.R. Bezgin. F. (2016) X-Ray Spectr. 45, 103.
  • [7] Li, C. Zhang, H. Cui, Y. Zhang, S. Zhao, Z. Choi, M.C.K. Chan, A.S.C. (2003) Synthetic Communication 33, 543.
  • [8] Frisch, M. J. et al. (2010) Gaussian 09, Revision C.01, Gaussian, Inc., Wallingford CT.
  • [9] Becke, A.D. (1993) J Chem. Phys. 98, 5648.
  • [10] Foresman, J.B. Frisch, E. (1993) Exploring Chemistry with Electronic Structure Methods, Gaussian Inc., Pittsburgh, PA, USA.
  • [11] Sundaraganesan, N. Ilakiamani, S. Saleem, H. Wojciechowski, P.M. Michalska, D. (2005) Spectrochim. Acta. A 61, 2995.
  • [12] Jesus, A.J.L. Rosado, M.T.S. Reva, I. Fausto, R. Eusebio, M.E. Redinha, J.S. (2006) J. Phys. Chem. A 110, 4169.
  • [13] Trott, O. Olson, A.J. (2010) J. Comput. Chem. 31, 455.
  • [14] Kaya, Y. Yilmaz, V.T. Arslan, T. Buyukgungor, O. (2012) J. Mol. Struc. 1024, 65.
  • [15] Colthup, N.B. Daly, L.H. Wiberley, S.E. (1964) Introduction to Infrared and Raman Spectroscopy, Academic Press Inc., London.
  • [16] Kaya, Y. Yilmaz, V.T. (2014) Structural Chem. 25, 231.
  • [17] Parr, R.G. Yang, W. (1989) Density Functional Theory of Atoms and Molecules. New York:Oxford University Press.
  • [18] Bopp, F. Meixner, J. Kestin, J. (1967) Thermodynamics and StatisticalMechanics, fifth ed. Academic Press Inc. (London) Ltd., New York.

Ayrıntılar

Birincil Dil İngilizce
Konular Temel Bilimler
Bölüm Makaleler
Yazarlar

Yunus KAYA (Sorumlu Yazar)
BURSA TEKNİK ÜNİVERSİTESİ
0000-0001-7228-2340
Türkiye


İlhan KÜÇÜK Bu kişi benim
BURSA TEKNİK ÜNİVERSİTESİ
0000-0001-7563-6503
Türkiye

Destekleyen Kurum Bursa Teknik Üniversitesi
Proje Numarası 171N10
Yayımlanma Tarihi 23 Mart 2020
Başvuru Tarihi 12 Ekim 2019
Kabul Tarihi 23 Aralık 2019
Yayınlandığı Sayı Yıl 2020, Cilt 7, Sayı 100. Yıl Özel Sayı

Kaynak Göster

APA Kaya, Y. & Küçük, İ. (2020). Quantum Chemical Studies of 1-Naphthalen-2-yl-ethanone-o-propyl-oxime . Bilecik Şeyh Edebali Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi , BŞEÜ Fen Bilimleri Dergisi 7. Cilt - Milli Mücadele ve TBMM'nin Açılışının 100. Yılı Anısına-100. Yıl Özel Sayısı , 175-185 . DOI: 10.35193/bseufbd.632396