Derleme

Kantitatif RT-PCR (RT-qPCR) ile MikroRNA (miRNA) Ekspresyon Profillemesi

Cilt: 18 Sayı: 1 1 Nisan 2021
  • Özge Sidekli *
  • Özgecan Korkmaz Ağaoğlu
PDF İndir
TR EN

Kantitatif RT-PCR (RT-qPCR) ile MikroRNA (miRNA) Ekspresyon Profillemesi

Öz

Gen ekspresyonunun post-transkripsiyonel düzenleyicisi olarak bilinen miRNA’lar ökaryotik canlılarda çeşitli fizyolojik ve patolojik süreçlerde rol oynamaktadır. miRNA'ların rollerinin ortaya konulması ile birlikte miRNA’lar üzerine yapılan çalışmaların sayısı da gün geçtikçe artmaktadır. Yapılan çalışmalar ile birlikte miRNA'ların bütün hücre ve doku tiplerinde eksprese olduğu ortaya konmuştur. miRNA ekspresyon profilinin ortaya konması için çeşitli yöntemler öneril-mesine rağmen, yüksek duyarlılığı ve özgüllüğü nedeniyle RT-qPCR altın standart olarak kabul edilmektedir. Bu derle-mede; RT-qPCR ile miRNA ekspresyon profillemesi sürecindeki adımlar detaylı olarak özetlenmiş ve konu ile ilgili lite-ratür bilgisine yer verilmiştir.

Anahtar Kelimeler

Kaynakça

  1. Agarwal V, Bell GW, Nam JW, Bartel DP. Predicting effective microRNA target sites in mammalian mRNAs. Elife 2015; 12: 4.
  2. Andersen CL, Jensen JL, Orntoft TF. Normalization of real-time quantitative reverse transcription-PCR data: a model-based variance estimation approach to identify genes suited for normaliza-tion, applied to bladder and colon cancer data sets. Cancer Res 2004; 64: 5245-50.
  3. Androvic P, Valihrach L, Elling J, Sjoback R, Kubista M. Two-tailed RT-qPCR: a novel method for highly accurate miRNA quantification. Nucleic Acids Res 2017; 45: 144.
  4. Arroyo JD, Chevillet JR, Kroh EM, Ruf IK, Pritchard CC, Gibson DF, Mitchell PS, Bennett CF, Pogo-sova-Agadjanyan EL, Stirewalt DL, Tait JF, Tewari M. Argonaute2 complexes carry a popu-lation of circulating microRNAs independent of vesicles in human plasma. Proc Natl Acad Sci USA 2011; 108(12): 5003-08.
  5. Backes C, Haas J, Leidinger P, Frese K, Grossmann T, Ruprecht K, Meder B, Meese E, Keller A. miF-Rame: analysis and visualization of miRNA sequencing data in neurological disorders. J Transl Med 2015; 13: 224.
  6. Becker C, Hammerle-Fickinger A, Riedmaier I, Pfaffl MW. mRNA and microRNA quality control for RT-qPCR analysis. Methods 2010; 50: 237-43.
  7. Benes V, Castoldi M. Expression profiling of microR-NA using real-time quantitative PCR, how to use it and what is available. Methods 2010; 50: 244-9.
  8. Blondal T, Jensby Nielsen S, Baker A, Andreasen D, Mouritzen P, Wrang Teilum M, Dahlsveen IK Assessing sample and miRNA profile quality in serum and plasma or other biofluids. Methods 2013; 59: 1-6.

Ayrıntılar

Birincil Dil

Türkçe

Konular

-

Bölüm

Derleme

Yazarlar

Özgecan Korkmaz Ağaoğlu Bu kişi benim
Türkiye

Yayımlanma Tarihi

1 Nisan 2021

Gönderilme Tarihi

8 Ekim 2019

Kabul Tarihi

3 Mart 2020

Yayımlandığı Sayı

Yıl 2021 Cilt: 18 Sayı: 1

Kaynak Göster

APA
Sidekli, Ö., & Korkmaz Ağaoğlu, Ö. (2021). Kantitatif RT-PCR (RT-qPCR) ile MikroRNA (miRNA) Ekspresyon Profillemesi. Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 18(1), 48-56. https://doi.org/10.32707/ercivet.878031
AMA
1.Sidekli Ö, Korkmaz Ağaoğlu Ö. Kantitatif RT-PCR (RT-qPCR) ile MikroRNA (miRNA) Ekspresyon Profillemesi. Erciyes Üniv Vet Fak Derg. 2021;18(1):48-56. doi:10.32707/ercivet.878031
Chicago
Sidekli, Özge, ve Özgecan Korkmaz Ağaoğlu. 2021. “Kantitatif RT-PCR (RT-qPCR) ile MikroRNA (miRNA) Ekspresyon Profillemesi”. Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 18 (1): 48-56. https://doi.org/10.32707/ercivet.878031.
EndNote
Sidekli Ö, Korkmaz Ağaoğlu Ö (01 Nisan 2021) Kantitatif RT-PCR (RT-qPCR) ile MikroRNA (miRNA) Ekspresyon Profillemesi. Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 18 1 48–56.
IEEE
[1]Ö. Sidekli ve Ö. Korkmaz Ağaoğlu, “Kantitatif RT-PCR (RT-qPCR) ile MikroRNA (miRNA) Ekspresyon Profillemesi”, Erciyes Üniv Vet Fak Derg, c. 18, sy 1, ss. 48–56, Nis. 2021, doi: 10.32707/ercivet.878031.
ISNAD
Sidekli, Özge - Korkmaz Ağaoğlu, Özgecan. “Kantitatif RT-PCR (RT-qPCR) ile MikroRNA (miRNA) Ekspresyon Profillemesi”. Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 18/1 (01 Nisan 2021): 48-56. https://doi.org/10.32707/ercivet.878031.
JAMA
1.Sidekli Ö, Korkmaz Ağaoğlu Ö. Kantitatif RT-PCR (RT-qPCR) ile MikroRNA (miRNA) Ekspresyon Profillemesi. Erciyes Üniv Vet Fak Derg. 2021;18:48–56.
MLA
Sidekli, Özge, ve Özgecan Korkmaz Ağaoğlu. “Kantitatif RT-PCR (RT-qPCR) ile MikroRNA (miRNA) Ekspresyon Profillemesi”. Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, c. 18, sy 1, Nisan 2021, ss. 48-56, doi:10.32707/ercivet.878031.
Vancouver
1.Özge Sidekli, Özgecan Korkmaz Ağaoğlu. Kantitatif RT-PCR (RT-qPCR) ile MikroRNA (miRNA) Ekspresyon Profillemesi. Erciyes Üniv Vet Fak Derg. 01 Nisan 2021;18(1):48-56. doi:10.32707/ercivet.878031

Cited By