Renk Momentleri ve Destek Vektör Makineleri Kullanarak Haploid Mısır Tohumlarının Tanımlanmasında Renk Uzaylarının Sınıflandırma Performansına Etkisinin Karşılaştırılması
Öz
Katlanmış haploid mısır ıslah tekniği gerek ıslah süresini kısaltması, gerekse %100 homozigot hatlar elde edilmesi açısından, geleneksel ıslah yöntemleri ile karşılaştırıldığında önemli avantajlar sağlar. Katlanmış haploid mısır ıslah yönteminde önemli işlerden biri melezleme sonucunda elde edilen haploid ve diploid tohumların ayrıştırılmasıdır. Günümüzde bu işlemin elle yapılıyor olması, emek ve zaman kaybının yanı sıra yüksek sınıflandırma hatalarına neden olmaktadır. Bu çalışmada, haploid mısır tohumlarının tanımlanması için bilgisayar görmesine dayalı bir yöntem önerilmiştir. 3000 mısır tohumundan oluşan veri seti üzerinde yürütülen çalışmada, k-ortalamalar kümeleme yöntemi ile mısır tohum embriyoları bölütlenmiştir. RGB, HSV ve Lab renk uzaylarında her renk kanalı için ilk dört dereceden renk momentleri çıkarılmıştır. Böylece her renk uzayı için 12 öznitelik kullanılmıştır. Elde edilen öznitelikler destek vektör makinesi ile sınıflandırılmıştır. Daha genel sonuçlar elde edebilmek için 10-kat çapraz doğrulama yöntemi 20 kez tekrar edilmiştir. Deneysel sonuçlara göre en iyi performans Lab renk uzayında %87,03 doğruluk, %80,15 duyarlılık ve %93,00 özgünlük değerleriyle ölçülmüştür.
Anahtar Kelimeler
Kaynakça
- Y. Altuntaş, Z. Cömert, and A. F. Kocamaz, “Identification of haploid and diploid maize seeds using convolutional neural networks and a transfer learning approach,” Comput. Electron. Agric., vol. 163, p. 104874, Aug. 2019.
- B. M. Prasanna, V. Chaikam, and G. Mahuku, Doubled Haploid Technology in Maize Breeding: Theory and Practice. Mexico: CIMMYT, 2012.
- H. H. Geiger, “Doubled Haploids,” in Handbook of Maize, New York, NY: Springer New York, 2009, pp. 641–657.
- C. Chidzanga, F. Muzawazi, J. Midzi, and T. Hove, “Production and use of haploids and doubled haploid in maize breeding : A review,” vol. 4, no. 4, pp. 201–213, 2017.
- F. K. Röber, G. A. Gordillo, and H. H. Geiger, “In vivo haploid induction in maize - Performance of new inducers and significance of doubled haploid lines in hybrid breeding,” Maydica, vol. 50, pp. 275–283, 2005.
- A. E. Melchinger, W. Schipprack, H. Friedrich Utz, and V. Mirdita, “In Vivo Haploid Induction in Maize: Identification of Haploid Seeds by Their Oil Content,” Crop Sci., vol. 54, no. 4, p. 1497, 2014.
- H. H. Geiger, G. Andrés Gordillo, and S. Koch, “Genetic Correlations among Haploids, Doubled Haploids, and Testcrosses in Maize,” Crop Sci., vol. 53, pp. 2313–2320, 2013.
- A. Smelser, M. Blanco, T. Lübberstedt, A. Schechert, A. Vanous, and C. Gardner, “Weighing in on a method to discriminate maize haploid from hybrid seed,” Plant Breed., vol. 134, no. 3, pp. 283–285, Jun. 2015.
Ayrıntılar
Birincil Dil
Türkçe
Konular
-
Bölüm
Araştırma Makalesi
Yazarlar
Yahya Altuntaş
*
0000-0002-7472-8251
Türkiye
Yayımlanma Tarihi
27 Eylül 2019
Gönderilme Tarihi
1 Temmuz 2019
Kabul Tarihi
22 Ağustos 2019
Yayımlandığı Sayı
Yıl 2019 Cilt: 31 Sayı: 2
Cited By
Effects of Donor x Inducer Interaction on the Success of Haploid Induction and Comparison of Haploid Seed Identification Methods in the In vivo Maternal Haploid Technique in Maize
Tarım Bilimleri Dergisi
https://doi.org/10.15832/ankutbd.824114Mısır Tohumu Embriyolarının Bölütlenmesinde Tam Evrişimsel Ağ Tabanlı Mimarilerin Tam Bağlı Şartlı Rastgele Alanlar ile Entegrasyonu
Afyon Kocatepe University Journal of Sciences and Engineering
https://doi.org/10.35414/akufemubid.1013047Deep Feature Extraction for Detection of Tomato Plant Diseases and Pests based on Leaf Images
Celal Bayar Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi
https://doi.org/10.18466/cbayarfbe.812375Classification of Haploid and Diploid Maize Seeds based on Pre-Trained Convolutional Neural Networks
Celal Bayar Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi
https://doi.org/10.18466/cbayarfbe.742889Osteoporoza Bağlı Kifozlu Hastalara Uygulanan Egzersizlerin Oluşturduğu Denge Değişikliklerine İlişkin Veriler Kullanılarak Yapay Sinir Ağlarının Diğer Sınıflandırma Algoritmalarıyla Karşılaştırılması
Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi
https://doi.org/10.21597/jist.743051Identification of haploid and diploid maize seeds using hybrid transformer model
Multimedia Systems
https://doi.org/10.1007/s00530-023-01174-yUse of machine learning models-based image analysis for classification of haploid and diploid maize
Crop Breeding and Applied Biotechnology
https://doi.org/10.1590/1984-70332023v23n4a44