Araştırma Makalesi
BibTex RIS Kaynak Göster

CD19 EKSİKLİĞİ TANISINDA RFLP YÖNTEMİNİN KULLANIMI

Yıl 2021, Cilt: 31 Sayı: 4, 365 - 368, 15.12.2021
https://doi.org/10.54005/geneltip.977551

Öz

B lenfosit yüzeyinde bulunan CD19 molekülü olgun B hücrelerinde CD21, CD81, CD225 ile birlikte CD19 kompleksini oluşturur ve antijen uyarısı ile birlikte B lenfosit aktivasyonunu düzenler. CD19 molekülünü kodlayan gende oluşacak mutasyonlar, CD19 protein ekspresyonunu etkilemekte ve primer immün yetmezlik (PIY) tablosu ortaya çıkmaktadır. Bu çalışmada CD19 eksikliği tanısıyla izlediğimiz hastamızın 3 aylık bebeğinin, RFLP yöntemiyle aynı gen mutasyonu yönünden değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Çalışmaya bilinen CD19 mutasyonlu hasta, bu hastanın yeni doğan bebeği ile hastanın annesi ve iki sağlıklı kontrol dahil edilmiştir. Mutasyon analizi için ilk olarak CD19 genindeki mutasyon bölgesini kapsayan primerler dizayn edilip PZR-RFLP işlemi gerçekleştirilmiştir. Oluşan DNA fragmentleri agaroz jel elektoroforezinde görüntülenip genotiplemesi yapılmıştır. Hastamızın CD19 geninin ekzon 6’da saptanan çerçeve kayması mutasyonu (c.973_973insA) yönünden bebeğinin ve annesinin taşıyıcı olduğu PZR-RFLP yöntemi ile gösterilmiştir. PZR-RFLP yönteminin, bilinen mutasyonların belirlenmesinde kullanılabilecek ucuz, hızlı ve güvenilir bir yöntem olduğu kanısındayız.

Destekleyen Kurum

Necmettin Erbakan Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinatörlüğü

Proje Numarası

182018008

Teşekkür

Necmettin Erbakan Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinatörlüğü

Kaynakça

  • 1. Picard C, BobbyGaspar H, Al-Herz W, Bousfiha A, CasanovaJL,ChatilaT,Crow YJ, Cunningham-RundlesC,EtzioniA,FrancoJL, Holland SM,KleinC,MorioT,Ochs HD, OksenhendlerE,PuckJ,TangMLK,TangyeSG,TorgersonTR,SullivanKE.InternationalUnion of Immunological Societies:2017 PrimaryImmunodeficiencyDiseasesCommittee Report on InbornErrors of Immunity.JClin Immunol.2018 Jan;38(1):96-128.
  • 2. Ballow M. Primaryimmunodeficiencydisorders:antibodydeficiency. J AllergyClinImmunol 2002;109:581-91.
  • 3. Wang K, Wei G, Liu D. CD19: Abiomarkerfor B celldevelopment,lymphomadiagnosisandtherapy.ExpHematolOncol 2012; 29;1(1):36.
  • 4. Şekerel BE. Çocukluk Çağında Allerji Astım İmmünoloji.Bilnet Matbaacılık ve Ambalaj A.Ş. 2015;99-126.
  • 5. VanZelmMC.Reisli I. Van der Burg M.CastañoD. ve ark.An antibody-deficiencysyndromeduetomutations in the CD19 gene.NEng JMed.2006;354(18):1901-12.
  • 6. Reisli İ,ArtaçH,PekcanS,KaraR,YümlüK,KaragölC,ÇimenÖ,ŞenM,ArtaçM.CD19 molekül eksikliği:Bir köy taraması. Tur Arch Ped. 2009;44: 127-30.
  • 7. Dib C,Faure S, Fizames C, Samson D, Drouot N, VignalA, ve ark. A comprehensivegeneticmap of thehumangenomebased on 5,264 microsatellites. Nature. 1996;380(6570):152-54.
  • 8. Ota M.,Fukushima H., Kulski JK., Inoko H. Singlenucleotidepolymorphismdetectionbypolymerasechainreaction-restrictionfragmentlengthpolymorphism. NatProtocols. 2007;2(11):2857-64.
  • 9. Karaselek MA, Kapaklı H, Keleş S, Güner ŞN, Çelik ŞÇ, Kurar E, Reisli İ. Intrauterinedetection of DCLRE1C (Artemis) mutationbyrestrictionfragmentlengthpolymorphism. Pediatr AllergyImmunol. 2019;30(6):668-71.

THE USE OF RFLP METHOD IN THE DIAGNOSIS OF CD19 DEFICIENCY

Yıl 2021, Cilt: 31 Sayı: 4, 365 - 368, 15.12.2021
https://doi.org/10.54005/geneltip.977551

Öz

CD19 molecule on the B lymphocyte surface forms the CD19 complex together with CD21, CD81, CD225 in mature B cells and regulates B lymphocyte activation with antigen stimulation. Mutations that will occur in the gene encoding the CD19 molecule affect CD19 protein expression and the picture of primary immunodeficiency (PIY). In this study, we aimed to evaluate the 3-month-old baby of our patient, who was followed up with a diagnosis of CD19 deficiency, in terms of the same gene mutation using the RFLP method. The patient with known CD19 mutation, the newborn baby of this patient and the patient's mother were included in the study. First, primers covering the mutation region in the CD19 gene were designed for mutation analysis and the PCR-RFLP procedure was performed. The DNA fragments formed were imaged and genotyped in agarose gel electrophoresis. In terms of the frame shift mutation (c.973_973insA) of the CD19 gene detected in exon 6 of our patient, it was shown by the PCR-RFLP method that her baby and mother were carriers. It is concluded that the PCR-RFLP method is an inexpensive, fast and reliable method that can be used in the detection of known mutations.

Proje Numarası

182018008

Kaynakça

  • 1. Picard C, BobbyGaspar H, Al-Herz W, Bousfiha A, CasanovaJL,ChatilaT,Crow YJ, Cunningham-RundlesC,EtzioniA,FrancoJL, Holland SM,KleinC,MorioT,Ochs HD, OksenhendlerE,PuckJ,TangMLK,TangyeSG,TorgersonTR,SullivanKE.InternationalUnion of Immunological Societies:2017 PrimaryImmunodeficiencyDiseasesCommittee Report on InbornErrors of Immunity.JClin Immunol.2018 Jan;38(1):96-128.
  • 2. Ballow M. Primaryimmunodeficiencydisorders:antibodydeficiency. J AllergyClinImmunol 2002;109:581-91.
  • 3. Wang K, Wei G, Liu D. CD19: Abiomarkerfor B celldevelopment,lymphomadiagnosisandtherapy.ExpHematolOncol 2012; 29;1(1):36.
  • 4. Şekerel BE. Çocukluk Çağında Allerji Astım İmmünoloji.Bilnet Matbaacılık ve Ambalaj A.Ş. 2015;99-126.
  • 5. VanZelmMC.Reisli I. Van der Burg M.CastañoD. ve ark.An antibody-deficiencysyndromeduetomutations in the CD19 gene.NEng JMed.2006;354(18):1901-12.
  • 6. Reisli İ,ArtaçH,PekcanS,KaraR,YümlüK,KaragölC,ÇimenÖ,ŞenM,ArtaçM.CD19 molekül eksikliği:Bir köy taraması. Tur Arch Ped. 2009;44: 127-30.
  • 7. Dib C,Faure S, Fizames C, Samson D, Drouot N, VignalA, ve ark. A comprehensivegeneticmap of thehumangenomebased on 5,264 microsatellites. Nature. 1996;380(6570):152-54.
  • 8. Ota M.,Fukushima H., Kulski JK., Inoko H. Singlenucleotidepolymorphismdetectionbypolymerasechainreaction-restrictionfragmentlengthpolymorphism. NatProtocols. 2007;2(11):2857-64.
  • 9. Karaselek MA, Kapaklı H, Keleş S, Güner ŞN, Çelik ŞÇ, Kurar E, Reisli İ. Intrauterinedetection of DCLRE1C (Artemis) mutationbyrestrictionfragmentlengthpolymorphism. Pediatr AllergyImmunol. 2019;30(6):668-71.
Toplam 9 adet kaynakça vardır.

Ayrıntılar

Birincil Dil Türkçe
Konular Klinik Tıp Bilimleri
Bölüm Original Article
Yazarlar

Hatice Efe Bu kişi benim

Mehmet Karaselek 0000-0003-3201-8945

Hasan Kapaklı 0000-0001-7015-6762

Yahya Gül Bu kişi benim 0000-0002-9973-4471

Sevgi Keleş Bu kişi benim 0000-0001-7344-8947

Şükrü Güner 0000-0002-8860-6132

Ercan Kurar 0000-0002-9234-1560

İsmail Reisli 0000-0001-8247-6405

Proje Numarası 182018008
Yayımlanma Tarihi 15 Aralık 2021
Gönderilme Tarihi 24 Ağustos 2021
Yayımlandığı Sayı Yıl 2021 Cilt: 31 Sayı: 4

Kaynak Göster

Vancouver Efe H, Karaselek M, Kapaklı H, Gül Y, Keleş S, Güner Ş, Kurar E, Reisli İ. CD19 EKSİKLİĞİ TANISINDA RFLP YÖNTEMİNİN KULLANIMI. Genel Tıp Derg. 2021;31(4):365-8.