Klinik E.coli İzolatlarında Virulans Faktor Genlerinin ve Geniş Spekturumlu Beta Laktamazların Araştırılması
Öz
Bu çalışmanın amacı, 83 klinik E.coli izolatında pap, hly, cnf, sfa,aer ve afa virulans genlerinin ve geniş spekturumlu beta laktamaz direnç genlerinin varlığını araştırmaktır. 83 E. coli izolatında sfa, pap, hly, cnf, aerve afa virülans genleri ve TEM, SHV, CTX-M1 ve CTX-M9 geniş spekturumlu beta laktamaz genleri polimer zincir reaksiyonu (PZR) metodu ile araştırılmıştır. 83 izolatın, sefiksim, trimethoprim/sulfametaksazol, piperasilin/tazobaktam, amoksisilin/klavulanik asit, ampisilin, seftriakson, sefuroksim, sefuroksim aksetil, siprofloksasin, fosfomisin, gentamisin ve seftazidime karşı direnç oranları sırasıyla;%65, %54, %19, %38, %74, %75, %72, %75, %68, %2, %30, %49 olarak belirlenmiştir. CTX-M1, araştırılan genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) genleri arasında 83 suşun 51’inde belirlenmesiyle en sık görülen GSBL olmuştur. TEM tipi beta laktamaz 33 suşta, CTX-M9 ve SHV 1 izolatta tespit edilmiştir. İzolatlarda en yaygın virülans geni, 40 suşta tespit edilmesiyle aer geni, bunu izolatların 15'inde tespit edilen cnf geni takip etmiştir. Sfa, pap, afavehlyvirulans genleri sırasıyla izolatların %15.6'sında, %15.6'sında, % 9.6'sında ve %12.04’ünde görülmüştür. Ayrıca 83 E.coliizolatında on farklı virulans faktör gen paterni tespit edilmiştir. Virulans gen kombinasyonları, 27 suştaaer, 6 suştacnf-sfa-pap, 1 suştaaer-pap, 2 suştaaer-afa, 6 suştaafa, 3 suştasfa, 9 suştaaer-cnf-hly, 4 suştasfa-pap, 1 suştahly-papve 1 suştapap olarak gözlemlenmiştir. Sonuç olarak, İYE ile ilişkili bakteriyel patojenitenin araştırılması daha iyi bir tıbbi müdahaleye katkı sağlayacaktır.
Anahtar Kelimeler
Destekleyen Kurum
Proje Numarası
Teşekkür
Kaynakça
- Abe, C.M., Salvador, F.A., Falsetti, I.N., Vieira, M.A, Blanco, J., Blanco, J.E., Blanco, M., Machado, A.M., Elias, W.P., Hernandes, R.T., Gomes, T.A.,2008.Uropathogenic Escherichia coli (UPEC) strains may carry virulence properties of diarrhoeagenic E. coli. FEMS Immunol Med Microbiol, 52,397–406.
- Alyamani, E.J., Khiyami, M.A., Booq, R.Y., Alnafjan, B.M., Altammami, M.A., Bahwerth,FS.,2015.Molecular characterization of extended-spectrum beta-lactamases (ESBLs) produced by clinical isolates of Acinetobacterbaumannii in Saudi Arabia. Ann ClinMicrobiolAntimicrob,20,38.
- Arabi, S., Tohidi, F., Naderi, S., Nazemi, A., Jafarpour, M., Naghshbandi, R.,2012. The common fimbarie genotyping in Uropathogenic Escherichia coli. Ann Biol Res, 3,4951–4954.
- Bektaş, A., Güdücüoğlu, H., Gürsoy, N.C., Berktaş, M., Gültepe, B.S., Parlak, M., Otlu, B. ve Mehmet Sait Tekerekoğlu, M.S., 2018. Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının gsbl genlerinin araştırılması, Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 23,116-123.
- Bien, J., Sokolova, O., Bozko, P., 2012. Role of uropathogenic Escherichia coli virulence factors in development of urinary tract infection and kidney damage. Int J Nephrol, 2012,1–15.
- Bush, K., Jacoby, G.A.,2010.Updated functional classification of β-lactamases.Antimicrob Agents Chemother,54,969–976.
- Cicek Copur, A., Saral, A., OzadDuzgun, A., Yasar, E., Cizmeci, Z., OzlemBalci, P., Sari, F., Firat, M., Altintop,Y.A., Ak, S., Caliskan, A., Yildiz, N., Sancaktar, M., EsraBudak, E., Erturk, A., BirolOzgumus, O., Sandalli, C., 2013.Nationwide study of Escherichia coli producing extended-spectrum β-lactamases TEM, SHV and CTX-M in Turkey.J Antibiot (Tokyo), 66,647-50.
- Denk, A. ve Sağmak Tartar, A., 2015. İdrar kültürlerinden izole edilen toplum kökenli Escherichia coli suşlarında antibiyotik direnci, Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi, 29, 51-55.
- Doğru, A., Üçışık, A.C., Sargın, F., Aydın, Ö., Ergen, P. ve Tükenmez Tigen, E., 2014. İdrar örneklerinde üretilen Escherichia coli suşlarında genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz varlığı ve antibiyotik duyarlılıkları, Göztepe Tıp Dergisi, 29,219-224. Duman, Y., Güçlüer, N., Serindağ, A. ve Tekerekoğlu, M.S., 2010. Escherichia coli suşlarında antimikrobiyal duyarlılık ve genişlemiş spektrumlu-βeta laktamaz (GSBL) varlığı, Fırat Tıp Dergisi, 15, 197-200.
- Düzgün, Özad A., Okumuş, F., Saral, A., Çiçek, A.Ç., Cinemre, S., 2019. Determination of antibiotic resistance genes and virulence factors in Escherichia coli isolated from patients with urinary tract infection from Turkey. Revista da SociedadeBrasileira de Medicina Tropical.Basımda.