Araştırma Makalesi

Bağrıbütün Kavununda Polimorfik Olan Bazı SSR Markörlerinin Belirlenmesi

Cilt: 10 Sayı: 2 15 Nisan 2020
Murat Güney *, Salih Kafkas , Gökçen Yakupoğlu , Muhammet Ali Gündeşli
PDF İndir
EN TR

Bağrıbütün Kavununda Polimorfik Olan Bazı SSR Markörlerinin Belirlenmesi

Öz

Bitki genetik kaynaklarının elden çıkması çok kolay ancak geri kazanımları neredeyse imkânsız olmaktadır. Genetik materyallerin toplanması ve muhafaza altına alınması gelecekte yapılacak olan ıslah programları için büyük önem arz etmektedir. Moleküler markörler kullanılarak, genotiplerin seleksiyonu, çoğaltılması, karakterizasyonu ve muhafazası mümkündür. DNA markör sistemleri farklı ekolojilerdeki genetik materyallerin karakterize edilmesini sağlamaktadır. Bu çalışmanın amacı, Yozgat’ın Aydıncık ilçesinde yetiştiriciliği yapılan eşsiz tat ve aromaya sahip Bağrıbütün kavununun SSR (Basit Dizi Tekrarları) moleküler markör tekniği ile DNA parmak izi çıkarılarak coğrafi işaretlemeye katkı sağlamaktır. 4 adet yerel Bağrıbütün kavunu genotipinin 24 adet polimorfik SSR primeri ile genetik karakterizasyonu ortaya konulmuştur. DNA parmak izinin çıkarılmasında kullanılan polimorfik SSR primerlerinden CMSSR12254, CMSSR10506, CMSSR07989 ve CMSSR08902 primerleri yüksek oranda polimorfizm göstermiştir. Bu SSR primleri ile kavun genetik kaynaklarının genetik ilişklileri daha kısa sürede ve daha güvenilir sonuçlarla belirlenebilecektir. 

Anahtar Kelimeler

Cucumis melo L.,DNA Parmak İzi,Kavun,SSR

Destekleyen Kurum

Yozgat Bozok Üniversitesi, Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi

Proje Numarası

6604-ZF/18-183

Teşekkür

Yozgat ili Aydıncık Belediyesi

Kaynakça

  1. Ahsyee, R.S., Calic, I., Zoric, M., Karagic, D., ve Surlan-Momirovic, G., 2014. Enetic Diversity in Red Clover (Trifolium pratense L.) using SSR Markers. Genetika, 46(3), 949–961.
  2. Çalışkan, M., 2005. Rapd Analizi ile Güllerde (Rosa spp.) Genetik Tanımlama. Ankara Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Doktora Tezi, Ankara (in Turkish).
  3. Çalışkan, O., Bayazit, S., Oktem, M., ve Ergul, A., 2017. Evaluation of the Genetic Diversity of Pomegranate Accessions from Turkey using New Microsatellite Markers. Turkish Journal of Agriculture and Forestry, 41(2), 142–153.
  4. Dervishi, A., Jakse, J., Ismaili, H., Javornik, B., ve Stajner, N., 2018. Comparative Assessment of Genetic Diversity in Albanian Olive (Olea europaea L.) using SSRs from Anonymous and Transcribed Genomic Regions. Tree Genetics & Genomes, 14(4), 53.
  5. Doyle, J.J. ve Doyle, J.L., 1987. A Rapid Isolation Procedure for Small Quantities of Fresh Leaf Tissue. Phytochemical Bulletin, 19, 11–15.
  6. Eser, B., Saygılı, H., Göçgol, A., ve İlker E., 2005. Tohum Bilimi ve Teknolojisi. Ege Üniversitesi Tohum Teknolojisi Uygulama ve Araştırma Merkezi İzmir, cilt 1 Yayın no:3 (in Turkish).
  7. Fergany, M., Kaur, B., Monforte, A. J., Pitrat, M., Rys, C., Lecoq, H., Dhillon, N.P.S. ve Dhaliwal, S.S., 2011. Variation in Melon (Cucumis melo L.) Landraces Adapted to the Humid Tropics of Southern India. Genetic Resources and Crop Evolution, 58(2), 225–243.
  8. Frary, A., Doğanlar, S., Taşkın, T., Tan, A., İnal, A. ve Mutlu, S., 2009. Ulusal Kavun (Cucumis melo L.) Kolleksiyonlardaki Genetik Çeşitliliğin Belirlenmesi. TUBİTAK, Proje No: 106O170, İzmir, 1–58 (in Turkish).
  9. Garcia-Gomez, B., Gonzalez-Alvarez, H., Martinez-Mora, C., Cenis, L. J., Perez-Hernandez, C. D. M., Martinez-Zubiaur, Y., ve Martinez-Gomez, P., 2019. The Molecular Characterization of an Extended Mulberry Germplasm by SSR Markers. Genetika, 51(2), 389–403.
  10. Gonzalo, M. J., Oliver, M., Garcia-Mas, J., Monfort, A., Dolcet-Sanjuan, R., Katzir, N., ... ve Monforte, A. J., 2005. Simple-Sequence Repeat Markers used in Merging Linkage Maps of Melon (Cucumis melo L.). Theoretical and Applied Genetics, 110(5), 802–811.

Kaynak Göster

APA
Güney, M., Kafkas, S., Yakupoğlu, G., & Gündeşli, M. A. (2020). Bağrıbütün Kavununda Polimorfik Olan Bazı SSR Markörlerinin Belirlenmesi. Gümüşhane Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi, 10(2), 474-479. https://doi.org/10.17714/gumusfenbil.628544
AMA
1.Güney M, Kafkas S, Yakupoğlu G, Gündeşli MA. Bağrıbütün Kavununda Polimorfik Olan Bazı SSR Markörlerinin Belirlenmesi. Gümüşhane Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi. 2020;10(2):474-479. doi:10.17714/gumusfenbil.628544
Chicago
Güney, Murat, Salih Kafkas, Gökçen Yakupoğlu, ve Muhammet Ali Gündeşli. 2020. “Bağrıbütün Kavununda Polimorfik Olan Bazı SSR Markörlerinin Belirlenmesi”. Gümüşhane Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi 10 (2): 474-79. https://doi.org/10.17714/gumusfenbil.628544.
EndNote
Güney M, Kafkas S, Yakupoğlu G, Gündeşli MA (01 Nisan 2020) Bağrıbütün Kavununda Polimorfik Olan Bazı SSR Markörlerinin Belirlenmesi. Gümüşhane Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi 10 2 474–479.
IEEE
[1]M. Güney, S. Kafkas, G. Yakupoğlu, ve M. A. Gündeşli, “Bağrıbütün Kavununda Polimorfik Olan Bazı SSR Markörlerinin Belirlenmesi”, Gümüşhane Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi, c. 10, sy 2, ss. 474–479, Nis. 2020, doi: 10.17714/gumusfenbil.628544.
ISNAD
Güney, Murat - Kafkas, Salih - Yakupoğlu, Gökçen - Gündeşli, Muhammet Ali. “Bağrıbütün Kavununda Polimorfik Olan Bazı SSR Markörlerinin Belirlenmesi”. Gümüşhane Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi 10/2 (01 Nisan 2020): 474-479. https://doi.org/10.17714/gumusfenbil.628544.
JAMA
1.Güney M, Kafkas S, Yakupoğlu G, Gündeşli MA. Bağrıbütün Kavununda Polimorfik Olan Bazı SSR Markörlerinin Belirlenmesi. Gümüşhane Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi. 2020;10:474–479.
MLA
Güney, Murat, vd. “Bağrıbütün Kavununda Polimorfik Olan Bazı SSR Markörlerinin Belirlenmesi”. Gümüşhane Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi, c. 10, sy 2, Nisan 2020, ss. 474-9, doi:10.17714/gumusfenbil.628544.
Vancouver
1.Murat Güney, Salih Kafkas, Gökçen Yakupoğlu, Muhammet Ali Gündeşli. Bağrıbütün Kavununda Polimorfik Olan Bazı SSR Markörlerinin Belirlenmesi. Gümüşhane Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi. 01 Nisan 2020;10(2):474-9. doi:10.17714/gumusfenbil.628544