Akut lenfoblastik lösemi hastalarında t(12;21) TEL-AML1 translokasyonunun gerçek zamanlı qRT-PZR ile 5 yıllık sonuçlarının değerlendirilmesi

Nur Selvi Günel; Burçin Tezcanlı Kayma; Vildan Bozok Çetintaş; Aslı Tetik Vardarlı; Sunde Yılmaz Süslüer; Duygu Aygüneş; Ayşegül Dalmizrak; Çağdaş Aktan; Ali Şahin Küçükaslan; Tuğçe Balcı; Çağla Kayabaşı; Besra Özmen Yelken; Çığır Biray Avcı; Buket Kosova; Zuhal Eroğlu; Serap Aksoylar; Nazan Çetingül; Can Balkan; Deniz Yılmaz; Yeşim Aydınok; Kaan Kavaklı; Mahmut Töbü; Murat Tombuloğlu; Filiz Büyükkeçeci; Fahri Şahin; Güray Saydam; Cumhur Gündüz

doi:10.5606/fng.btd.2016.033

Akut lenfoblastik lösemi hastalarında t(12;21) TEL-AML1 translokasyonunun gerçek zamanlı qRT-PZR ile 5 yıllık sonuçlarının değerlendirilmesi

Öz

Amaç: Bu çalışmada akut lenfoblastik lösemi (ALL) ön tanılı olgularda t(12;21) translokasyonu gerçek zamanlı kantitatif revers transkriptaz polimeraz zincir reaksiyonu (qRT-PZR) yöntemi kullanılarak kantite edildi.

Hastalar ve yöntemler: Ocak 2009 - Aralık 2013 tarihleri arasında Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı’na başvuran 175 pediatrik ve 138 erişkin olmak üzere toplam 313 olguya ait kan ve kemik iliği örneklerinde t(12;22) (p13;q22) translokasyonu RNA sonuçları kantitatif olarak değerlendirildi. Olgulara ait 75 kan ve 484 kemik iliği örneklerinden total RNA veya haberci RNA izole edildi. RNA izolasyonlarının ardından tamamlayıcı DNA sentezi gerçekleştirildi. t(12;21) (p13;q22) translokasyon çalışması LightCycler t(12;21) Kit’i ile füzyon transkripte özgül biçimde tasarlanmış primer ve problarla (Way2Gene) uygun olacak şekilde gerçekleştirildi. Son adım olarak, t(12;21) translokasyon sonuçlarının kantitatif olarak değerlendirilmesi gerçek zamanlı qRT-PZR yöntemi kullanılarak LightCycler2 ile gerçekleştirildi.

Bulgular: Otuz dört pediatrik olgu örneğinde (%19) ve 17 erişkin olgunun örneğinde (%12) TEL-AML-1 (ETV6-RUNX1) pozitif bulundu. TEL-AML1 (ETV6-RUNX1) kantitasyon değeri ortalaması pediatrik olgularda 0.90±3.21, erişkin olgularda ise 0.34±1.20 olarak belirlendi.

Sonuç: Elde ettiğimiz veriler, gerçek zamanlı qRT-PZR yöntemi ile ALL hastalarında yeni tanı döneminde ve tedavi sürecinde t(12;21) translokasyonunun kantitatif tayininin hem tanının kesinleştirilmesinde hem de moleküler remisyon sağlanmasına yönelik tedaviyi yönlendirmesinde değerli bir yöntem olduğunu desteklemektedir.

Anahtar Kelimeler

Akut lenfoblastik lösemi,polimeraz zincir reaksiyonu,revers transkriptaz

Kaynakça

Linka Y, Ginzel S, Krüger M, Novosel A, Gombert M, Kremmer E, et al. The impact of TEL-AML1 (ETV6-RUNX1) expression in precursor B cells and implications for leukaemia using three different genome- wide screening methods. Blood Cancer J 2013;3:151.
Onciu M. Acute lymphoblastic leukemia. Hematol Oncol Clin North Am 2009;23:655-74.
Borst L, Wesolowska A, Joshi T, Borup R, Nielsen FC, Andersen MK, et al. Genome-wide analysis of cytogenetic aberrations in ETV6/RUNX1-positive childhood acute lymphoblastic leukaemia. Br J Haematol 2012;157:476-82.
Kantner HP, Warsch W, Delogu A, Bauer E, Esterbauer H, Casanova E, et al. ETV6/RUNX1 induces reactive oxygen species and drives the accumulation of DNA damage in B cells. Neoplasia 2013;15:1292-300.
Zelent A, Greaves M, Enver T. Role of the TEL- AML1 fusion gene in the molecular pathogenesis of childhood acute lymphoblastic leukaemia. Oncogene 2004;23:4275-83.
Stams WA, den Boer ML, Beverloo HB, Meijerink JP, van Wering ER, Janka-Schaub GE, et al. Expression levels of TEL, AML1, and the fusion products TEL-AML1 and AML1-TEL versus drug sensitivity and clinical outcome in t(12;21)-positive pediatric acute lymphoblastic leukemia. Clin Cancer Res 2005;11:2974-80.
Costa O, Schneider P, Coquet L, Chan P, Penther D, Legrand E, et al. Proteomic profile of pre - B2 lymphoblasts from children with acute lymphoblastic leukemia (ALL) in relation with the translocation (12; 21). Clin Proteomics 2014;11:31.
Iqbal Z. Molecular genetic studies on 167 pediatric ALL patients from different areas of Pakistan confirm a low frequency of the favorable prognosis fusion oncogene TEL-AML1 (t 12; 21) in underdeveloped countries of the region. Asian Pac J Cancer Prev 2014;15:3541-6.

Fueller E, Schaefer D, Fischer U, Krell PF, Stanulla M, Borkhardt A, et al. Genomic inverse PCR for exploration of ligated breakpoints (GIPFEL), a new method to detect translocations in leukemia. PLoS One 2014;9:104419.
Borowitz MJ, DiGiuseppe JA. Acute lymphoblastic leukemia. In: Knowles DM, editor. Neoplastic hematopathology. Philadelphia. Lippincott Williams & Wilkins; 2001. p. 1643-66.
Knowles DM. Lymphoblastic lymphoma. In: Knowles DM, editor. Neoplastic hematopathology. Philadelphia: Lippincott Williams & Wilkin; 2001. p. 915-52.
Yakut T, Gülten T. Çocukluk çağı lösemilerindeki genetik değiiklikler ve klinik önemi Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi 2005;31:57-66.
Aksu Uzunhan T, Karaka Z. Çocukluk çağı akut lenfoblastik lösemisi. Çocuk Dergisi 2012;12:6-15.
Seyfarth J, Madsen HO, Nyvold C, Ryder LP, Clausen N, Jonmundsson GK, et al. Post-induction residual disease in translocation t(12;21)-positive childhood ALL. Med Pediatr Oncol 2003;40:82-7.
Stock W, Estrov Z. Studies of minimal residual disease in acute lymphocytic leukemia. Hematol Oncol Clin North Am 2000;14:1289-305.
Salari F, Shahjahani M, Shahrabi S, Saki N. Minimal residual disease in acute lymphoblastic leukemia: optimal methods and clinical relevance, pitfalls and recent approaches. Med Oncol 2014;31:266.
Szczepanski T. Why and how to quantify minimal residual disease in acute lymphoblastic leukemia? Leukemia 2007;21:622-6.
Rahnemoon AR, Zaker F, Izadyar M, Ansari S, Poopak B, Tadavosyan Y. Prevalence of ETV6/ RUNX1 Fusion Gene in Pediatric Patients with Acute Lymphoblastic Leukemia in Iran. Iran J Pediatr 2013;23:681-6.
Gandemer V, Rio AG, de Tayrac M, Sibut V, Mottier S, Ly Sunnaram B, et al. Five distinct biological processes and 14 differentially expressed genes characterize TEL/AML1-positive leukemia. BMC Genomics 2007;8:385.

Ayrıntılar

Birincil Dil

Türkçe

Konular

-

Bölüm

Araştırma Makalesi

Yazarlar

Nur Selvi Günel

Burçin Tezcanlı Kayma Bu kişi benim

Vildan Bozok Çetintaş Bu kişi benim

Aslı Tetik Vardarlı Bu kişi benim

Sunde Yılmaz Süslüer Bu kişi benim

Duygu Aygüneş Bu kişi benim

Ayşegül Dalmizrak Bu kişi benim

Çağdaş Aktan Bu kişi benim

Ali Şahin Küçükaslan Bu kişi benim

Tuğçe Balcı Bu kişi benim

Çağla Kayabaşı Bu kişi benim

Besra Özmen Yelken Bu kişi benim

Çığır Biray Avcı Bu kişi benim

Buket Kosova Bu kişi benim

Zuhal Eroğlu Bu kişi benim

Serap Aksoylar Bu kişi benim

Nazan Çetingül Bu kişi benim

Can Balkan Bu kişi benim

Deniz Yılmaz Bu kişi benim

Yeşim Aydınok Bu kişi benim

Kaan Kavaklı Bu kişi benim

Mahmut Töbü Bu kişi benim

Murat Tombuloğlu Bu kişi benim

Filiz Büyükkeçeci Bu kişi benim

Fahri Şahin Bu kişi benim

Güray Saydam Bu kişi benim

Cumhur Gündüz Bu kişi benim

Yayımlanma Tarihi

1 Eylül 2016

Gönderilme Tarihi

1 Ağustos 2016

Kabul Tarihi

-

Yayımlandığı Sayı

Yıl 2016 Cilt: 2 Sayı: 3

DOI

https://doi.org/10.5606/fng.btd.2016.033

IZ

https://izlik.org/JA66TB24TT

Kaynak Göster

RIS / Bibtex

APA

Günel, N. S., Tezcanlı Kayma, B., Bozok Çetintaş, V., Tetik Vardarlı, A., Yılmaz Süslüer, S., Aygüneş, D., Dalmizrak, A., Aktan, Ç., Küçükaslan, A. Ş., Balcı, T., Kayabaşı, Ç., Özmen Yelken, B., Avcı, Ç. B., Kosova, B., Eroğlu, Z., Aksoylar, S., Çetingül, N., Balkan, C., Yılmaz, D., … Gündüz, C. (2016). Akut lenfoblastik lösemi hastalarında t(12;21) TEL-AML1 translokasyonunun gerçek zamanlı qRT-PZR ile 5 yıllık sonuçlarının değerlendirilmesi. İstanbul Bilim Üniversitesi Florence Nightingale Tıp Dergisi, 2(3), 181-185. https://doi.org/10.5606/fng.btd.2016.033

AMA

1.Günel NS, Tezcanlı Kayma B, Bozok Çetintaş V, vd. Akut lenfoblastik lösemi hastalarında t(12;21) TEL-AML1 translokasyonunun gerçek zamanlı qRT-PZR ile 5 yıllık sonuçlarının değerlendirilmesi. İstanbul Bilim Üniversitesi Florence Nightingale Tıp Dergisi. 2016;2(3):181-185. doi:10.5606/fng.btd.2016.033

Chicago

Günel, Nur Selvi, Burçin Tezcanlı Kayma, Vildan Bozok Çetintaş, vd. 2016. “Akut lenfoblastik lösemi hastalarında t(12;21) TEL-AML1 translokasyonunun gerçek zamanlı qRT-PZR ile 5 yıllık sonuçlarının değerlendirilmesi”. İstanbul Bilim Üniversitesi Florence Nightingale Tıp Dergisi 2 (3): 181-85. https://doi.org/10.5606/fng.btd.2016.033.

EndNote

Günel NS, Tezcanlı Kayma B, Bozok Çetintaş V, Tetik Vardarlı A, Yılmaz Süslüer S, Aygüneş D, Dalmizrak A, Aktan Ç, Küçükaslan AŞ, Balcı T, Kayabaşı Ç, Özmen Yelken B, Avcı ÇB, Kosova B, Eroğlu Z, Aksoylar S, Çetingül N, Balkan C, Yılmaz D, Aydınok Y, Kavaklı K, Töbü M, Tombuloğlu M, Büyükkeçeci F, Şahin F, Saydam G, Gündüz C (01 Eylül 2016) Akut lenfoblastik lösemi hastalarında t(12;21) TEL-AML1 translokasyonunun gerçek zamanlı qRT-PZR ile 5 yıllık sonuçlarının değerlendirilmesi. İstanbul Bilim Üniversitesi Florence Nightingale Tıp Dergisi 2 3 181–185.

IEEE

[1]N. S. Günel vd., “Akut lenfoblastik lösemi hastalarında t(12;21) TEL-AML1 translokasyonunun gerçek zamanlı qRT-PZR ile 5 yıllık sonuçlarının değerlendirilmesi”, İstanbul Bilim Üniversitesi Florence Nightingale Tıp Dergisi, c. 2, sy 3, ss. 181–185, Eyl. 2016, doi: 10.5606/fng.btd.2016.033.

ISNAD

Günel, Nur Selvi - Tezcanlı Kayma, Burçin - Bozok Çetintaş, Vildan - Tetik Vardarlı, Aslı - Yılmaz Süslüer, Sunde - Aygüneş, Duygu - Dalmizrak, Ayşegül v.dğr. “Akut lenfoblastik lösemi hastalarında t(12;21) TEL-AML1 translokasyonunun gerçek zamanlı qRT-PZR ile 5 yıllık sonuçlarının değerlendirilmesi”. İstanbul Bilim Üniversitesi Florence Nightingale Tıp Dergisi 2/3 (01 Eylül 2016): 181-185. https://doi.org/10.5606/fng.btd.2016.033.

JAMA

1.Günel NS, Tezcanlı Kayma B, Bozok Çetintaş V, Tetik Vardarlı A, Yılmaz Süslüer S, Aygüneş D, Dalmizrak A, Aktan Ç, Küçükaslan AŞ, Balcı T, Kayabaşı Ç, Özmen Yelken B, Avcı ÇB, Kosova B, Eroğlu Z, Aksoylar S, Çetingül N, Balkan C, Yılmaz D, Aydınok Y, Kavaklı K, Töbü M, Tombuloğlu M, Büyükkeçeci F, Şahin F, Saydam G, Gündüz C. Akut lenfoblastik lösemi hastalarında t(12;21) TEL-AML1 translokasyonunun gerçek zamanlı qRT-PZR ile 5 yıllık sonuçlarının değerlendirilmesi. İstanbul Bilim Üniversitesi Florence Nightingale Tıp Dergisi. 2016;2:181–185.

MLA

Günel, Nur Selvi, vd. “Akut lenfoblastik lösemi hastalarında t(12;21) TEL-AML1 translokasyonunun gerçek zamanlı qRT-PZR ile 5 yıllık sonuçlarının değerlendirilmesi”. İstanbul Bilim Üniversitesi Florence Nightingale Tıp Dergisi, c. 2, sy 3, Eylül 2016, ss. 181-5, doi:10.5606/fng.btd.2016.033.

Vancouver

1.Nur Selvi Günel, Burçin Tezcanlı Kayma, Vildan Bozok Çetintaş, Aslı Tetik Vardarlı, Sunde Yılmaz Süslüer, Duygu Aygüneş, Ayşegül Dalmizrak, Çağdaş Aktan, Ali Şahin Küçükaslan, Tuğçe Balcı, Çağla Kayabaşı, Besra Özmen Yelken, Çığır Biray Avcı, Buket Kosova, Zuhal Eroğlu, Serap Aksoylar, Nazan Çetingül, Can Balkan, Deniz Yılmaz, Yeşim Aydınok, Kaan Kavaklı, Mahmut Töbü, Murat Tombuloğlu, Filiz Büyükkeçeci, Fahri Şahin, Güray Saydam, Cumhur Gündüz. Akut lenfoblastik lösemi hastalarında t(12;21) TEL-AML1 translokasyonunun gerçek zamanlı qRT-PZR ile 5 yıllık sonuçlarının değerlendirilmesi. İstanbul Bilim Üniversitesi Florence Nightingale Tıp Dergisi. 01 Eylül 2016;2(3):181-5. doi:10.5606/fng.btd.2016.033