Hidrazin Türevi Bir Schiff Baz Bileşiğinin DFT ve in Silico ADME/T Hesaplamaları

Gonca Özdemir Tarı

doi:10.31466/kfbd.1692215

TR EN

Hidrazin Türevi Bir Schiff Baz Bileşiğinin DFT ve in Silico ADME/T Hesaplamaları

Öz

Bu çalışma, daha önce X-ışını kristalografisi ile yapısı belirlenen hidrazin türevi bir Schiff baz bileşiğinin elektronik ve yapısal özelliklerinin Yoğunluk Fonksiyonel Teorisi (DFT) ile B3LYP/B3PW91 yöntemleri ve 6-31G++(d,p) temel baz seti ile incelenmesini içermektedir. Gaussian 03 programı kullanılarak gerçekleştirilen bu çalışmada, bileşiğin optimize geometrisi, öncü moleküler orbital enerjileri, moleküler elektrostatik potansiyel haritası, atomik yük dağılımları ve Fukui fonksiyonları belirlenmiştir. Çizgisel olmayan optik özelliklerin elde edilen yüksek β değeri bileşiğin etkili bir optik malzeme adayı olduğunu kanıtlar niteliktedir. Molekülün farmakokinetik ve toksisite özelliğe sahip olup olmadığını değerlendirmek amacıyla in silico ADME/T analizleri gerçekleştirilmiştir. Sonuç olarak, teorik çalışmaların sonuçları ile deneysel sonuçlar oldukça uyumlu olup bileşiğin elektronik yapısı ve reaktivitesi hakkında önemli bilgiler sunmaktadır.

Anahtar Kelimeler

Schiff Bazı, DFT Hesaplamaları, ADME/T Tahmini, Kimyasal Reaktivite

Kaynakça

Akbari, Z., Stagno, C., Iraci, N., Efferth, T., Omer, E. A., Piperno, A., ... & Micale, N. (2024). Biological evaluation, DFT, MEP, HOMO-LUMO analysis and ensemble docking studies of Zn (II) complexes of bidentate and tetradentate Schiff base ligands as antileukemia agents. Journal of Molecular Structure, 1301, 137400.
Albaaj, L. T. T., Hassan, Q. M., Dhumad, A. M., Sultan, H. A., & Emshary, C. A. (2024). Synthesis of a New Schiff Base: Nonlinear Optical Properties Investigations. Journal of Fluorescence, 1-14.
Banerjee, P., Kemmler, E., Dunkel, M., & Preissner, R. (2024). ProTox 3.0: a webserver for the prediction of toxicity of chemicals. Nucleic Acids Research, 52(W1), W513-W520.
Berber, H., & Uysal, Ü. D. (2021). 2-((2-Hidroksibenziliden)amino)-4-Nitrofenol Schiff Bazının Teorik Olarak İncelenmesi ve Bazı Quantum Kimyasal Parametrelerinin Hesaplanması. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 25(3), 685-698.
Daina, A., & Zoete, V. (2016). A boiled-egg to predict gastrointestinal absorption and brain penetration of small molecules. ChemMedChem, 11(11), 1117-1121.
Dilek, Ö. (2024). Imidazole Based Novel Schiff Base: Synthesis, Characterization, Quantum Chemical Calculations, In Silico Investigation of ADMEt Properties and Molecular Docking Simulations against VEGFR2 Protein. Bitlis Eren Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi, 13(1), 134–148.
Dennigton R. II, T. Keith, J. Millam, GaussView, Version 4.1.2, Semichem, Inc., Shawnee Mission, KS, 2007.
Ejidike, I. P., Direm, A., Parlak, C., Adeniyi, A. A., Azam, M., Ata, A., ... & Clayton, H. S. (2024). Spectroscopic characterization, DFT calculations, in vitro pharmacological potentials, and molecular docking studies of N, N, O-Schiff base and its trivalent metal complexes. Chemical Physics Impact, 8, 100549.
Eryilmaz, S., Gul, M., & Ozek Yildirim, A. (2024). Evaluation of Novel Hydrazone‐Imide Hybrid Compound as HNE Inhibitor In Silico: Synthesis, XRD and DFT Analysis. ChemistrySelect, 9(31), e202401982.
Inac, H., Ashfaq, M., Dege, N., Feizi-Dehnayebi, M., Munawar, K. S., Yağcı, N. K., ... & Tahir, M. N. (2024). Synthesis, spectroscopic characterizations, single crystal XRD, supramolecular assembly inspection via hirshfeld surface analysis, and DFT study of a hydroxy functionalized schiff base Cu (II) complex. Journal of Molecular Structure, 1295, 136751.

Frisch M. J. et al., Gaussian 03, Revision E.01, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2004.
Lipinski CA, Lombardo F, Dominy BW, Feeney PJ. Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings. Adv Drug Deliv Rev. 2001 Mar 1;46(1-3):3-26.
Özdemir Tarı G., Karadeniz Fen Bilimleri Dergisi, 12(1), 178-192, 2022. DOI: 10.31466/kfbd.1008650.
Gören, K., Bağlan, M., Yıldıko, Ü. ve Tahiroğlu, V. (2024). Anti-Kanser ve Anti-Üreaz Aktivitesi için Tiazolidinon-Bis Schiff Bazının Moleküler Yerleştirme ve DFT Analizi. Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 14(2), 822-834.
Kirca, B. K., Tari, G. Ö., Kaştaş, C. A., Odabaşoğlu, M., & Büyükgüngör, O. (2017). Crystal structure, spectral characterization, molecular modeling studies and structural effects of the proton transfer process for (E)-5-methoxy-2-[(3, 4-dimethylphenylimino) methyl] phenol. Macedonian Journal of Chemistry and Chemical Engineering.
Mirdan, G. A., Hassan, Q., Kadhum, M. Y., Emshary, C. A., Hussein, K. A., Sultan, H. A., ... & Abdullmajed, H. A. (2025). Study of DFT, synthesis, and nonlinear optical properties of a Schiff base compound. Journal of Fluorescence, 1-14.
Salihović, M., Pazalja, M., Halilović, S. Š., Veljović, E., Mahmutović-Dizdarević, I., Roca, S., ... & Trifunović, S. (2021). Synthesis, characterization, antimicrobial activity and DFT study of some novel Schiff bases. Journal of molecular structure, 1241, 130670.
Sarıoğlu, A. O., Türkmenoğlu, B., Kahraman, D. T., Güler, S., Sürmelihindi, B., & Morcali, M. H. (2025). Transition metal complexes of sulfonamide-based schiff base ligand: Synthesis, characterization, a biological assessment, DFT, and ADME studies. Journal of Molecular Structure, 1325, 140907.
SwissADME: a free web tool to evaluate pharmacokinetics, drug-likeness and medicinal chemistry friendliness of small molecules. Sci. Rep. (2017) 7:42717.
Padariya, A. D., Savaliya, N. K., Parekh, H. M., Bhatt, B. S., Bhatt, V. D., & Patel, M. N. (2025). Synthesis, characterization, and biological activities of novel organometallic compounds of rhenium (I) with 2-(2-benzylidenehydrazinyl) benzothiazole Schiff-base derivatives: Molecular docking, ADME, and DFT studies. Computational Biology and Chemistry, 115, 108313.
Tahir, M. N., Ashfaq, M., Munawar, K. S., Khan, A. U., Asghar, M. A., Ahamad, T., & Ojha, S. C. (2024). Synthesis, characterizations, Hirshfeld surface analysis, DFT, and NLO study of a schiff base derived from trifluoromethyl amine. ACS omega, 9(2), 2325-2338.
Tarı, G. Ö. (2024). Pirazol türevı bir bileşiğin kuramsal hesaplamaları ve hirshfeld yüzey analizi. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Mühendislik Bilimleri Dergisi, 27(2), 447-458.
Tarı, G. Ö., & Aydemir, E. (2023). Experimental and DFT study of (E)-4-bromo-2 (((3-chloro-4-(4-chlorophenoxy) phenyl) imino) methyl)-5-fluorophenol: Molecular and electronic properties in solvent media. Journal of Molecular Structure, 1277, 134880.
Tarı, G. Ö., & Demirtaş, G. 2-(2-İyodofenil) isoindolin-1, 3-dion) Molekülünün Hesaplamalı Kimya Yöntemiyle Yapısal Analizi. International Journal of Multidisciplinary Studies and Innovative Technologies, 6(1), 91-96.
Tarı, G. Ö. (2023). Synthesis, structural characterization by experimental and theoretical approaches of a new hydrazine derivative Schiff base compound. Molecular Crystals and Liquid Crystals, 766(1), 131-155.
Tarı, G. Ö., & Demirtaş, G. (E)-5-Fenil-N-(2-tiyenilmetilen)-1, 3, 4-tiyadiazol-2-amin’in Hirshfeld Yüzey Analizi ve Teorik Hesaplamaları. Avrupa Bilim ve Teknoloji Dergisi, (32), 761-769, 2021.
Uzun S. & Demircioğlu Z, Karadeniz Fen Bilimleri Dergisi, (2019) 9(2), 275-288. DOI: 10.31466/kfbd.611312.

Ayrıntılar

Birincil Dil

Türkçe

Konular

Klasik Fizik (Diğer), Malzeme Bilimi ve Teknolojileri

Bölüm

Araştırma Makalesi

Yazarlar

Gonca Özdemir Tarı ^*
0000-0001-5919-1778
Türkiye

Yayımlanma Tarihi

15 Eylül 2025

Gönderilme Tarihi

5 Mayıs 2025

Kabul Tarihi

9 Eylül 2025

Yayımlandığı Sayı

Yıl 2025 Cilt: 15 Sayı: 3

DOI

https://doi.org/10.31466/kfbd.1692215

IZ

https://izlik.org/JA72HY86AK

APA

Özdemir Tarı, G. (2025). Hidrazin Türevi Bir Schiff Baz Bileşiğinin DFT ve in Silico ADME/T Hesaplamaları. Karadeniz Fen Bilimleri Dergisi, 15(3), 1264-1280. https://doi.org/10.31466/kfbd.1692215

AMA

1.Özdemir Tarı G. Hidrazin Türevi Bir Schiff Baz Bileşiğinin DFT ve in Silico ADME/T Hesaplamaları. KFBD. 2025;15(3):1264-1280. doi:10.31466/kfbd.1692215

Chicago

Özdemir Tarı, Gonca. 2025. “Hidrazin Türevi Bir Schiff Baz Bileşiğinin DFT ve in Silico ADME/T Hesaplamaları”. Karadeniz Fen Bilimleri Dergisi 15 (3): 1264-80. https://doi.org/10.31466/kfbd.1692215.

EndNote

Özdemir Tarı G (01 Eylül 2025) Hidrazin Türevi Bir Schiff Baz Bileşiğinin DFT ve in Silico ADME/T Hesaplamaları. Karadeniz Fen Bilimleri Dergisi 15 3 1264–1280.

IEEE

[1]G. Özdemir Tarı, “Hidrazin Türevi Bir Schiff Baz Bileşiğinin DFT ve in Silico ADME/T Hesaplamaları”, KFBD, c. 15, sy 3, ss. 1264–1280, Eyl. 2025, doi: 10.31466/kfbd.1692215.

ISNAD

Özdemir Tarı, Gonca. “Hidrazin Türevi Bir Schiff Baz Bileşiğinin DFT ve in Silico ADME/T Hesaplamaları”. Karadeniz Fen Bilimleri Dergisi 15/3 (01 Eylül 2025): 1264-1280. https://doi.org/10.31466/kfbd.1692215.

JAMA

1.Özdemir Tarı G. Hidrazin Türevi Bir Schiff Baz Bileşiğinin DFT ve in Silico ADME/T Hesaplamaları. KFBD. 2025;15:1264–1280.

MLA

Özdemir Tarı, Gonca. “Hidrazin Türevi Bir Schiff Baz Bileşiğinin DFT ve in Silico ADME/T Hesaplamaları”. Karadeniz Fen Bilimleri Dergisi, c. 15, sy 3, Eylül 2025, ss. 1264-80, doi:10.31466/kfbd.1692215.

Vancouver

1.Gonca Özdemir Tarı. Hidrazin Türevi Bir Schiff Baz Bileşiğinin DFT ve in Silico ADME/T Hesaplamaları. KFBD. 01 Eylül 2025;15(3):1264-80. doi:10.31466/kfbd.1692215

Karadeniz Fen Bilimleri Dergisinde yayınlanan makaleler Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International kapsamında lisanslanmıştır.

Hidrazin Türevi Bir Schiff Baz Bileşiğinin DFT ve in Silico ADME/T Hesaplamaları

Hidrazin Türevi Bir Schiff Baz Bileşiğinin DFT ve in Silico ADME/T Hesaplamaları

Öz

Anahtar Kelimeler

DFT and in silico ADME/T Calculations of a Hydrazine Derivative Schiff Base Compound

Öz

Anahtar Kelimeler

Kaynakça

Ayrıntılar

Birincil Dil

Konular

Bölüm

Yazarlar

Yayımlanma Tarihi

Gönderilme Tarihi

Kabul Tarihi

Yayımlandığı Sayı

DOI

IZ

Kaynak Göster